Genes within 1Mb (chr12:102676014:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 6.12e-01 0.0279 0.0549 0.128 B L1
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 7.09e-01 0.0357 0.0955 0.128 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 8.89e-01 0.00809 0.0581 0.128 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0561 0.084 0.128 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0464 0.0657 0.128 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 3.81e-01 0.0654 0.0744 0.128 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 4.63e-01 0.0871 0.118 0.128 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0246 0.101 0.128 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 3.33e-02 -0.241 0.112 0.128 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 7.55e-01 -0.033 0.106 0.128 B L1
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 5.92e-02 0.163 0.0862 0.128 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 3.86e-01 0.102 0.117 0.128 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0332 0.0813 0.128 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 5.30e-01 0.0387 0.0615 0.128 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 2.74e-01 -0.124 0.113 0.128 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 3.11e-01 -0.108 0.106 0.128 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 3.67e-01 0.104 0.115 0.128 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0972 0.0755 0.128 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 6.58e-01 0.0332 0.0749 0.128 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0198 0.107 0.128 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 3.20e-01 0.121 0.122 0.128 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0193 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 7.05e-01 0.0418 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 2.77e-01 -0.132 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0421 0.116 0.131 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 3.87e-01 0.0828 0.0956 0.131 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 1.77e-02 0.255 0.107 0.131 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 5.97e-01 0.0667 0.126 0.131 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 3.32e-01 0.0977 0.101 0.128 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 4.95e-02 0.167 0.0845 0.128 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0346 0.107 0.128 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 8.72e-01 0.0156 0.0966 0.128 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 5.70e-01 0.0447 0.0787 0.128 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 9.50e-01 0.00698 0.111 0.129 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0555 0.103 0.129 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 1.78e-01 -0.1 0.0743 0.129 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 6.15e-01 0.0419 0.0832 0.129 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 1.29e-01 -0.18 0.118 0.129 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 9.74e-01 0.00452 0.139 0.129 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 9.98e-01 0.000101 0.0421 0.128 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 1.33e-01 0.12 0.0797 0.128 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 9.96e-02 0.192 0.116 0.128 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 8.54e-01 0.0156 0.0845 0.128 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0802 0.0853 0.128 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0529 0.102 0.128 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 6.03e-01 0.0633 0.122 0.128 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 7.61e-01 0.026 0.0854 0.128 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0563 0.0993 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0243 0.0255 0.143 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 4.58e-01 0.0983 0.132 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0592 0.0977 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 9.08e-01 0.016 0.139 0.143 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 9.97e-02 0.217 0.131 0.143 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 3.83e-01 0.116 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0673 0.109 0.143 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 1.46e-01 -0.168 0.115 0.143 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0398 0.11 0.143 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 3.72e-01 0.0922 0.103 0.143 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0165 0.0548 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 5.84e-01 0.0748 0.136 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 9.31e-01 0.0064 0.0733 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000353 0.108 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 5.84e-01 0.0614 0.112 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 4.24e-01 0.0961 0.12 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0504 0.126 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00972 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0237 0.133 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 9.81e-01 0.00298 0.127 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0375 0.0503 0.127 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 5.73e-01 0.0751 0.133 0.127 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0446 0.0868 0.127 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 3.45e-01 -0.112 0.119 0.127 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 1.77e-01 -0.157 0.116 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 1.24e-01 0.187 0.121 0.127 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 2.57e-01 0.142 0.125 0.127 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0725 0.126 0.127 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 6.72e-01 0.0543 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0727 0.117 0.127 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 4.38e-02 -0.139 0.0684 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 3.41e-01 -0.119 0.125 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 4.02e-01 0.0545 0.0649 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 7.64e-01 0.0277 0.0919 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0446 0.0921 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 9.80e-01 0.00254 0.0999 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 6.15e-01 0.0683 0.136 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 9.15e-01 0.014 0.131 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 8.79e-02 -0.225 0.131 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0789 0.124 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0673 0.0604 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 1.74e-01 0.168 0.124 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00826 0.0664 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0269 0.103 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 3.19e-01 -0.114 0.114 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0434 0.113 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 8.02e-01 0.0299 0.119 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 8.28e-01 -0.028 0.128 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 1.99e-01 -0.176 0.137 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 8.77e-02 -0.202 0.118 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0475 0.133 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 2.42e-01 0.156 0.133 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 7.33e-01 0.0398 0.117 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 4.22e-01 -0.105 0.13 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0644 0.121 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 4.24e-01 0.0804 0.1 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 3.70e-01 0.104 0.116 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 6.79e-01 0.037 0.0893 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00778 0.0736 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 2.63e-01 -0.133 0.118 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 6.28e-01 0.0507 0.104 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 2.71e-01 0.132 0.12 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 9.21e-01 0.00922 0.0932 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 2.68e-01 0.0794 0.0714 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 3.03e-01 -0.125 0.121 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 1.08e-01 0.203 0.126 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 4.64e-01 0.0892 0.121 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0416 0.117 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 6.75e-01 0.045 0.107 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 3.13e-01 0.133 0.132 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0638 0.113 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 5.23e-01 0.0744 0.116 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 1.69e-01 -0.128 0.0926 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 8.73e-01 0.017 0.106 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 4.52e-01 0.0993 0.132 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 3.47e-01 0.12 0.127 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 7.57e-01 0.0378 0.122 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 3.33e-01 0.117 0.121 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 4.46e-01 0.0831 0.109 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 9.51e-01 0.00509 0.0829 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 5.74e-01 -0.072 0.128 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 8.55e-01 0.0231 0.126 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 1.61e-01 -0.189 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 4.02e-01 0.101 0.121 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0924 0.125 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 3.83e-01 0.105 0.12 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 1.52e-01 -0.187 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 2.39e-01 -0.152 0.128 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 9.24e-02 -0.211 0.125 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 2.44e-01 0.139 0.119 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0362 0.128 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 9.17e-01 -0.012 0.114 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0195 0.126 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 3.66e-01 0.114 0.125 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0437 0.0456 0.128 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 3.64e-01 0.116 0.128 0.128 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 1.07e-01 0.201 0.124 0.128 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0986 0.11 0.128 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 7.15e-01 0.0411 0.113 0.128 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0519 0.128 0.128 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 5.18e-01 0.0773 0.12 0.128 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 3.75e-01 0.111 0.125 0.128 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 2.20e-02 -0.252 0.109 0.128 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 6.99e-01 -0.056 0.144 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0304 0.105 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 2.39e-01 -0.142 0.12 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 2.55e-01 -0.142 0.124 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 1.09e-01 -0.209 0.13 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 3.50e-01 -0.129 0.138 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0754 0.122 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0346 0.119 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 1.16e-01 -0.142 0.0898 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 8.69e-01 0.0172 0.104 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 4.03e-01 0.106 0.126 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 3.25e-01 -0.14 0.142 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 2.30e-01 -0.163 0.135 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 6.05e-02 0.26 0.138 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 4.99e-01 0.0755 0.112 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 1.21e-01 -0.215 0.138 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0804 0.142 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 6.73e-01 0.0592 0.14 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 1.44e-01 0.185 0.126 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 7.23e-01 0.042 0.118 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0218 0.0898 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00355 0.0993 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 1.02e-02 -0.33 0.127 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 2.19e-01 0.171 0.139 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0736 0.102 0.133 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 2.32e-01 0.165 0.137 0.133 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 3.25e-01 -0.106 0.107 0.133 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0951 0.154 0.133 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 2.20e-01 0.154 0.125 0.133 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0145 0.127 0.133 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 7.90e-01 0.0395 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 7.15e-02 0.237 0.13 0.133 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0957 0.135 0.133 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00238 0.125 0.133 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 2.90e-01 0.0491 0.0463 0.13 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0117 0.0936 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0152 0.124 0.13 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0211 0.0918 0.13 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 3.28e-01 -0.106 0.108 0.13 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 9.42e-01 0.00672 0.0924 0.13 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 8.91e-01 0.0164 0.119 0.13 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0648 0.0855 0.13 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 5.81e-01 0.0517 0.0936 0.13 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0584 0.127 0.128 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 7.14e-01 0.0486 0.133 0.128 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00487 0.116 0.128 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 6.76e-01 0.0444 0.106 0.128 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0772 0.108 0.128 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 3.29e-01 -0.116 0.118 0.132 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0482 0.116 0.132 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 2.65e-03 -0.444 0.146 0.132 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 8.94e-01 0.0175 0.132 0.132 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 4.93e-01 0.0704 0.102 0.132 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 7.49e-02 0.163 0.0911 0.132 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 5.97e-01 -0.062 0.117 0.132 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 2.98e-01 0.12 0.115 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 4.19e-02 0.176 0.0861 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0603 0.115 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 7.39e-01 0.0334 0.1 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0337 0.0854 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 2.01e-01 0.16 0.125 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 6.67e-01 0.0415 0.0962 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0515 0.117 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0382 0.119 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 3.52e-01 0.0865 0.0927 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 4.11e-01 0.14 0.169 0.121 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 7.39e-01 0.0531 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 1.56e-01 0.17 0.119 0.121 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 2.86e-01 -0.165 0.154 0.121 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 2.18e-01 0.193 0.156 0.121 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 2.29e-01 -0.186 0.154 0.121 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0639 0.154 0.121 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 2.78e-01 -0.153 0.141 0.121 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 9.21e-01 0.0126 0.126 0.129 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 2.33e-01 0.138 0.115 0.129 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0992 0.136 0.129 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 7.91e-01 0.0337 0.127 0.129 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0623 0.111 0.129 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0872 0.126 0.129 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 4.23e-01 0.0933 0.116 0.129 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 1.29e-01 0.212 0.139 0.129 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 2.66e-01 -0.125 0.112 0.129 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00983 0.105 0.129 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 2.72e-01 -0.169 0.154 0.133 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 1.44e-01 0.196 0.133 0.133 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 5.65e-01 0.0818 0.142 0.133 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0371 0.13 0.133 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 2.87e-01 0.107 0.1 0.133 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 1.59e-01 0.188 0.133 0.133 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 8.99e-01 0.0169 0.133 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0484 0.0629 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 3.46e-01 0.119 0.126 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0107 0.0665 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0368 0.105 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0102 0.0909 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 1.49e-01 0.157 0.108 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 5.73e-01 0.0707 0.125 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0211 0.0983 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0254 0.131 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0533 0.13 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 194270 sc-eQTL 4.83e-02 -0.144 0.0724 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0138 0.12 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 6.22e-01 0.0291 0.059 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0303 0.0845 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0354 0.0883 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0194 0.0926 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 936542 sc-eQTL 3.56e-01 0.123 0.133 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -819996 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00286 0.127 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 4.15e-02 -0.277 0.135 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 478429 sc-eQTL 1.29e-01 -0.188 0.123 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 7.97e-02 0.186 0.106 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 1.40e-01 0.127 0.0855 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0914 0.11 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 9.90e-01 0.00128 0.0974 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 7.73e-01 0.0231 0.0799 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 2.26e-01 -0.148 0.122 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 4.00e-01 0.0897 0.106 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 4.32e-01 0.102 0.129 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 8.86e-01 0.0154 0.107 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00761 0.0923 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 555894 sc-eQTL 9.31e-01 0.0101 0.117 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 979067 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00316 0.114 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 845055 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0988 0.0777 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 613865 sc-eQTL 5.45e-01 0.0545 0.0899 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 798434 sc-eQTL 2.64e-01 -0.135 0.12 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 555829 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00425 0.142 0.129 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136011 STAB2 -911259 pQTL 0.0494 -0.0573 0.0292 0.0 0.0 0.161
ENSG00000136048 DRAM1 798434 eQTL 0.04 -0.0369 0.018 0.0 0.0 0.163


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina