logo

Genes within 1Mb (chr12:102641351:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 7.35e-01 0.0228 0.0675 0.081 B L1
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 6.88e-02 0.213 0.117 0.081 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 8.43e-01 0.0141 0.0714 0.081 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0925 0.103 0.081 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 2.44e-01 0.0942 0.0806 0.081 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 1.06e-01 -0.148 0.0911 0.081 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0757 0.146 0.081 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00131 0.124 0.081 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 2.65e-01 -0.155 0.139 0.081 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 4.11e-01 -0.107 0.13 0.081 B L1
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 9.96e-01 0.000596 0.107 0.081 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0473 0.144 0.081 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 3.22e-01 0.0988 0.0995 0.081 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0339 0.0754 0.081 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0336 0.139 0.081 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 5.56e-01 0.0784 0.133 0.081 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 3.04e-01 -0.148 0.144 0.081 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 1.65e-02 0.226 0.0935 0.081 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 5.45e-01 0.0568 0.0936 0.081 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 3.34e-01 -0.13 0.134 0.081 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 1.85e-01 -0.202 0.152 0.081 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 2.85e-01 0.158 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 4.42e-01 0.104 0.135 0.081 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00773 0.149 0.081 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 2.69e-01 0.157 0.142 0.081 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 2.44e-01 -0.137 0.117 0.081 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0656 0.133 0.081 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 3.16e-01 0.155 0.154 0.081 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0232 0.127 0.081 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 5.92e-01 0.0575 0.107 0.081 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 8.09e-01 0.0326 0.134 0.081 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 8.00e-02 -0.212 0.12 0.081 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 6.94e-01 0.039 0.0989 0.081 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 1.12e-01 0.213 0.133 0.082 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0297 0.124 0.082 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 1.67e-01 0.125 0.0897 0.082 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0937 0.1 0.082 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 5.79e-01 0.0795 0.143 0.082 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 2.72e-01 0.184 0.167 0.082 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 2.81e-01 0.0557 0.0515 0.081 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 9.46e-02 -0.164 0.0977 0.081 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 4.21e-01 0.115 0.143 0.081 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 6.84e-02 0.188 0.103 0.081 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 2.87e-01 -0.112 0.105 0.081 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00996 0.126 0.081 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 3.19e-02 -0.319 0.148 0.081 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0723 0.105 0.081 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 7.45e-02 -0.217 0.121 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 2.65e-02 0.072 0.0322 0.087 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0337 0.169 0.087 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00188 0.125 0.087 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 3.31e-01 -0.173 0.177 0.087 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 5.75e-01 0.0949 0.169 0.087 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 8.30e-02 -0.294 0.168 0.087 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 4.28e-01 -0.111 0.139 0.087 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 9.49e-01 0.00941 0.148 0.087 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 1.32e-01 0.211 0.14 0.087 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 4.55e-01 0.0987 0.132 0.087 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0337 0.0666 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 5.25e-01 0.106 0.166 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 2.07e-01 0.112 0.0888 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0391 0.132 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 3.84e-01 0.118 0.136 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 2.64e-01 -0.163 0.146 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0974 0.153 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 5.20e-01 0.0945 0.147 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 4.29e-01 -0.128 0.161 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 2.37e-02 -0.348 0.153 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0595 0.0613 0.082 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 3.17e-01 0.162 0.162 0.082 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 4.95e-01 0.0725 0.106 0.082 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0351 0.145 0.082 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 6.11e-01 0.0721 0.142 0.082 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 4.87e-01 -0.103 0.148 0.082 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 3.04e-02 0.33 0.151 0.082 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 2.11e-01 -0.192 0.153 0.082 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 9.29e-01 0.0139 0.156 0.082 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 2.81e-01 0.153 0.142 0.082 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 2.33e-01 0.102 0.0851 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 9.19e-01 0.0157 0.154 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 6.81e-01 -0.033 0.0803 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0121 0.114 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 2.79e-01 0.123 0.114 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0744 0.123 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 5.35e-01 -0.104 0.168 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0346 0.162 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 8.21e-01 0.0369 0.163 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0504 0.153 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 8.74e-02 0.128 0.0747 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 5.04e-01 0.103 0.154 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 1.29e-01 -0.125 0.0821 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0633 0.128 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 9.60e-01 0.00715 0.142 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0648 0.14 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 5.69e-02 -0.281 0.147 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0867 0.159 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0201 0.171 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 3.63e-01 -0.134 0.147 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 9.96e-01 0.000808 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 9.66e-01 0.00701 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 3.91e-02 0.298 0.144 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 7.90e-01 0.0434 0.162 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 2.64e-01 -0.168 0.15 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0337 0.125 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0349 0.144 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 4.97e-01 0.0752 0.111 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0617 0.0913 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0363 0.147 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 1.15e-01 -0.203 0.128 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 5.29e-01 -0.094 0.149 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 6.15e-01 0.0582 0.115 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0215 0.0887 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 2.79e-01 0.163 0.15 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 1.39e-02 0.376 0.151 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 5.84e-01 0.081 0.148 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 9.97e-01 0.000473 0.142 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 2.39e-01 0.154 0.13 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 2.78e-01 0.174 0.16 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0709 0.14 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 4.88e-02 -0.282 0.142 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 1.71e-02 0.273 0.113 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 6.19e-01 0.0654 0.131 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 8.54e-01 -0.03 0.163 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00115 0.157 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 3.78e-01 0.132 0.15 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00985 0.149 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 2.35e-01 0.159 0.133 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 6.76e-01 0.0425 0.102 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 6.64e-02 -0.288 0.156 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 2.85e-01 -0.166 0.155 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0136 0.166 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 5.30e-01 0.0934 0.148 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 2.80e-01 0.166 0.153 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0286 0.148 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 4.77e-01 -0.114 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 4.36e-01 -0.123 0.158 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 3.32e-01 -0.16 0.164 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 9.20e-01 0.0156 0.156 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00922 0.167 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 5.25e-01 0.0953 0.15 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 7.06e-01 0.0625 0.165 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 8.70e-01 0.0269 0.165 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 5.19e-02 0.108 0.0555 0.082 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0796 0.157 0.082 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 1.07e-01 0.246 0.152 0.082 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 1.61e-01 0.19 0.135 0.082 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 1.64e-01 -0.192 0.137 0.082 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 8.30e-01 0.0337 0.157 0.082 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 1.00e-01 -0.241 0.146 0.082 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0272 0.153 0.082 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 6.86e-01 -0.055 0.136 0.082 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 3.47e-01 0.16 0.17 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 3.78e-01 0.109 0.123 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 3.40e-01 0.136 0.142 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 8.29e-01 0.0317 0.147 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 1.04e-01 -0.251 0.153 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0278 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 2.19e-01 0.182 0.148 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0244 0.145 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 2.78e-01 0.119 0.109 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 3.50e-01 -0.118 0.126 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 2.87e-01 0.163 0.153 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 5.28e-01 0.109 0.172 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 9.08e-01 0.0184 0.158 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0897 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 2.76e-01 0.142 0.13 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0163 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 4.79e-01 0.118 0.166 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 8.90e-01 0.0227 0.164 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 8.32e-01 -0.032 0.151 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 7.93e-01 0.0371 0.141 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 6.65e-02 0.196 0.106 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 7.66e-01 0.0353 0.118 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 4.03e-01 0.129 0.154 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 1.54e-01 0.237 0.166 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 4.64e-01 0.0934 0.127 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 9.35e-01 0.014 0.172 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0731 0.133 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 5.53e-01 0.114 0.191 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0114 0.156 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 2.26e-01 -0.191 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 6.75e-01 0.0772 0.184 0.081 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 1.99e-01 0.21 0.163 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0322 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 4.75e-01 0.111 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 3.45e-01 0.0544 0.0576 0.08 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0986 0.116 0.08 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0442 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 4.64e-01 0.0836 0.114 0.08 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 3.42e-01 0.127 0.134 0.08 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 1.05e-01 -0.186 0.114 0.08 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 3.64e-01 -0.134 0.148 0.08 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0183 0.106 0.08 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0534 0.116 0.08 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 5.80e-01 0.0866 0.156 0.081 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0122 0.163 0.081 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 3.71e-02 0.295 0.141 0.081 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 1.67e-01 -0.18 0.129 0.081 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 1.86e-01 -0.174 0.132 0.081 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 8.07e-01 0.035 0.143 0.088 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 3.73e-02 0.289 0.138 0.088 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 8.99e-01 0.0228 0.18 0.088 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 2.33e-01 0.189 0.158 0.088 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0187 0.124 0.088 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 3.32e-01 -0.107 0.11 0.088 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 3.56e-01 -0.13 0.141 0.088 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0639 0.145 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 9.28e-01 0.00985 0.109 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 9.51e-01 0.00884 0.145 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 3.24e-02 -0.268 0.124 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00513 0.107 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0536 0.159 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0284 0.122 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 6.26e-01 0.0722 0.148 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 7.79e-01 0.0423 0.151 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 7.70e-01 0.0343 0.117 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 2.90e-01 -0.217 0.204 0.07 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 1.85e-01 0.255 0.191 0.07 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 1.35e-02 0.354 0.142 0.07 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 6.21e-01 0.0925 0.187 0.07 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0513 0.19 0.07 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 8.39e-01 -0.038 0.187 0.07 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 4.34e-01 0.146 0.186 0.07 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 2.95e-01 -0.179 0.17 0.07 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 8.74e-01 0.0252 0.159 0.08 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0512 0.145 0.08 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 1.08e-01 0.273 0.169 0.08 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 7.20e-01 0.0573 0.159 0.08 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0874 0.139 0.08 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 8.42e-01 0.0317 0.159 0.084 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 6.32e-01 0.0704 0.147 0.084 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0327 0.176 0.084 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 2.36e-01 -0.168 0.142 0.084 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 8.17e-01 0.0307 0.132 0.084 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 1.36e-01 0.278 0.185 0.082 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00952 0.163 0.082 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 2.37e-01 0.203 0.171 0.082 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 5.72e-01 0.0889 0.157 0.082 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 1.46e-01 -0.176 0.121 0.082 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0332 0.162 0.082 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 3.93e-02 0.331 0.159 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 6.46e-01 -0.036 0.0782 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 2.11e-01 0.196 0.157 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 3.18e-01 0.0826 0.0825 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 3.81e-01 -0.114 0.13 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 4.57e-01 0.0842 0.113 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 1.99e-01 -0.174 0.135 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 4.44e-01 0.119 0.156 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00703 0.122 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00231 0.163 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 4.66e-01 -0.118 0.162 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 159607 sc-eQTL 4.54e-02 0.181 0.0897 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 5.67e-01 0.0849 0.148 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 1.67e-01 -0.101 0.0728 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0379 0.105 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 2.91e-01 0.116 0.109 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 3.25e-01 -0.113 0.115 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 901879 sc-eQTL 9.67e-02 -0.275 0.165 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -854659 sc-eQTL 9.41e-01 0.0116 0.158 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0086 0.169 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 443766 sc-eQTL 4.53e-01 -0.115 0.153 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0384 0.134 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 7.97e-01 0.0278 0.108 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 7.50e-01 0.0443 0.139 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 5.61e-02 -0.233 0.121 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 7.54e-01 0.0315 0.1 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 2.61e-01 0.17 0.151 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 9.46e-01 0.00895 0.132 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 7.90e-01 0.0428 0.16 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0783 0.133 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0648 0.115 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 521231 sc-eQTL 1.96e-01 0.184 0.142 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 944404 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0263 0.139 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 sc-eQTL 2.57e-01 0.108 0.095 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 579202 sc-eQTL 4.02e-01 -0.092 0.11 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 763771 sc-eQTL 1.20e-01 0.229 0.147 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 521166 sc-eQTL 1.43e-01 0.254 0.173 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111670 GNPTAB 810392 eQTL 3.23e-02 0.0547 0.0255 0.00122 0.0 0.0726

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina