logo

Genes within 1Mb (chr12:102631010:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 5.32e-01 0.0458 0.0732 0.073 B L1
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 7.68e-02 0.225 0.127 0.073 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 1.00e+00 -2.88e-05 0.0775 0.073 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0428 0.112 0.073 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 5.92e-01 0.047 0.0876 0.073 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 2.42e-01 -0.116 0.0991 0.073 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 7.57e-01 -0.049 0.158 0.073 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 5.82e-01 0.0744 0.135 0.073 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0923 0.151 0.073 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 2.65e-01 -0.157 0.141 0.073 B L1
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 7.22e-01 0.0412 0.115 0.073 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0325 0.156 0.073 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 3.73e-01 0.0963 0.108 0.073 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0795 0.0817 0.073 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0351 0.151 0.073 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 6.28e-01 0.0705 0.145 0.073 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 2.66e-01 -0.175 0.157 0.073 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 3.26e-02 0.22 0.102 0.073 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 4.70e-01 0.074 0.102 0.073 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 4.34e-01 -0.115 0.146 0.073 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 2.81e-01 -0.179 0.166 0.073 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 3.33e-01 0.156 0.161 0.072 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 5.10e-01 0.0973 0.147 0.072 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 9.07e-01 -0.019 0.162 0.072 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 3.17e-01 0.155 0.155 0.072 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 3.45e-01 -0.121 0.128 0.072 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0372 0.145 0.072 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 1.61e-01 0.236 0.168 0.072 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00135 0.138 0.073 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 5.61e-01 0.0681 0.117 0.073 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 7.44e-01 0.048 0.147 0.073 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 1.35e-02 -0.325 0.131 0.073 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 3.77e-01 0.0953 0.108 0.073 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 1.92e-01 0.189 0.144 0.073 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0939 0.135 0.073 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 2.45e-01 0.113 0.0973 0.073 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0853 0.109 0.073 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 6.81e-01 0.0636 0.155 0.073 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 2.22e-01 0.222 0.181 0.073 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 4.62e-01 0.0413 0.0561 0.073 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 2.27e-01 -0.129 0.107 0.073 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 4.23e-01 0.125 0.156 0.073 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 1.57e-01 0.16 0.112 0.073 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 1.40e-01 -0.168 0.114 0.073 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0573 0.137 0.073 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 4.12e-02 -0.33 0.161 0.073 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0391 0.114 0.073 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 7.59e-02 -0.235 0.132 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 2.49e-02 0.0798 0.0353 0.077 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0413 0.186 0.077 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 6.66e-01 0.0593 0.137 0.077 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 4.16e-01 -0.159 0.194 0.077 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 4.60e-01 0.137 0.185 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 6.99e-02 -0.336 0.184 0.077 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 2.55e-01 -0.174 0.152 0.077 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 9.23e-01 0.0158 0.162 0.077 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 6.33e-02 0.285 0.152 0.077 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 5.66e-01 0.083 0.145 0.077 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0237 0.0725 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 2.21e-01 0.221 0.18 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 3.69e-01 0.0871 0.0967 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0547 0.143 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 8.50e-01 0.028 0.148 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0456 0.159 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 3.30e-01 -0.163 0.167 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 6.51e-01 0.0723 0.159 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 4.54e-01 -0.131 0.175 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 1.51e-02 -0.406 0.166 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0678 0.0668 0.073 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 2.59e-01 0.2 0.176 0.073 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 6.07e-01 0.0594 0.115 0.073 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 6.37e-01 0.0747 0.158 0.073 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 7.74e-01 0.0444 0.154 0.073 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 3.65e-01 -0.147 0.161 0.073 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 6.94e-02 0.302 0.165 0.073 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 2.44e-01 -0.195 0.167 0.073 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000838 0.17 0.073 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 4.80e-01 0.11 0.155 0.073 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.0927 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0398 0.168 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0571 0.0871 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 9.27e-01 0.0114 0.123 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 2.68e-01 0.137 0.123 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0204 0.134 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0169 0.182 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 4.94e-01 0.12 0.176 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 5.51e-01 0.106 0.177 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0728 0.166 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 2.64e-01 0.0915 0.0817 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 9.25e-01 0.0158 0.168 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 4.73e-02 -0.178 0.0891 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 8.96e-01 0.0183 0.139 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00715 0.154 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0426 0.153 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 1.45e-01 -0.234 0.16 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0127 0.174 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0548 0.186 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 2.03e-01 -0.204 0.159 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0778 0.183 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 6.62e-01 0.0801 0.183 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 1.87e-01 0.211 0.16 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00655 0.179 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 2.75e-01 -0.181 0.166 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 9.03e-01 0.0166 0.136 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0268 0.156 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 5.62e-01 0.07 0.12 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 4.04e-01 -0.083 0.0992 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0557 0.16 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 1.10e-01 -0.223 0.139 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0631 0.161 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 5.38e-01 0.0771 0.125 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 2.78e-01 -0.104 0.0958 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 2.03e-01 0.207 0.162 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 5.09e-03 0.464 0.164 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 7.29e-01 0.0558 0.161 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0299 0.155 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 3.48e-01 0.133 0.141 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 9.06e-02 0.295 0.173 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 2.89e-01 -0.161 0.151 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 4.90e-02 -0.305 0.154 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 3.71e-02 0.259 0.123 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 7.46e-01 0.0461 0.142 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0366 0.177 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 7.97e-01 0.0439 0.171 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 3.24e-01 0.162 0.163 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0137 0.163 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 1.44e-01 0.214 0.145 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 6.72e-01 0.0471 0.111 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 3.69e-01 -0.154 0.171 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 3.49e-01 -0.159 0.169 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 6.88e-01 0.0734 0.183 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 4.99e-01 0.111 0.164 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 4.58e-01 0.126 0.169 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 8.54e-01 0.0299 0.163 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0439 0.177 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 3.08e-01 -0.178 0.174 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 3.33e-01 -0.177 0.183 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 9.36e-01 0.0139 0.173 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0882 0.186 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 9.32e-01 0.0142 0.167 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0598 0.184 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 7.42e-01 0.0602 0.183 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 4.24e-01 0.0487 0.0607 0.074 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000149 0.171 0.074 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 1.84e-01 0.221 0.166 0.074 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 3.04e-01 0.151 0.147 0.074 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 7.13e-02 -0.27 0.149 0.074 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 6.97e-01 0.0663 0.17 0.074 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 1.49e-01 -0.229 0.159 0.074 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 9.14e-01 0.018 0.167 0.074 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 5.20e-01 -0.095 0.147 0.074 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 3.37e-01 0.179 0.186 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 7.07e-01 0.0506 0.135 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 3.55e-01 0.144 0.155 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 8.13e-01 0.038 0.16 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 9.00e-02 -0.286 0.168 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 8.12e-01 0.0425 0.178 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 3.15e-01 0.162 0.161 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0378 0.157 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 3.20e-01 0.118 0.119 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0804 0.137 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 2.69e-01 0.184 0.166 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 8.68e-01 0.0311 0.187 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00774 0.17 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 5.11e-01 -0.115 0.174 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 1.51e-01 0.201 0.14 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0585 0.174 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 7.02e-01 0.0686 0.179 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 8.40e-01 0.0355 0.176 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0413 0.164 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0105 0.153 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 2.03e-01 0.148 0.116 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 9.42e-01 0.00939 0.129 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 5.73e-01 0.0945 0.168 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 3.45e-02 0.381 0.179 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 7.90e-01 0.0356 0.133 0.074 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 9.49e-01 0.0114 0.18 0.074 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0464 0.139 0.074 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 3.78e-01 0.177 0.2 0.074 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0523 0.163 0.074 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 1.12e-01 -0.262 0.164 0.074 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 5.19e-01 0.124 0.192 0.074 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 1.09e-01 0.274 0.17 0.074 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0377 0.176 0.074 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 6.09e-01 0.0836 0.163 0.074 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 4.78e-01 0.0444 0.0626 0.072 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0419 0.126 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 4.88e-01 -0.116 0.167 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 7.33e-01 0.0423 0.124 0.072 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 3.63e-01 0.132 0.145 0.072 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 9.18e-02 -0.21 0.124 0.072 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 1.70e-01 -0.22 0.16 0.072 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0168 0.116 0.072 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0755 0.126 0.072 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 4.16e-01 0.138 0.17 0.073 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0189 0.177 0.073 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 8.55e-02 0.265 0.153 0.073 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 1.01e-01 -0.232 0.14 0.073 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 1.63e-01 -0.2 0.143 0.073 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 8.92e-01 0.021 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 4.18e-02 0.306 0.149 0.078 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 8.49e-01 0.0371 0.195 0.078 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 1.85e-01 0.227 0.171 0.078 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 5.63e-01 0.0775 0.134 0.078 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0917 0.12 0.078 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0237 0.153 0.078 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0557 0.158 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00557 0.119 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 8.41e-01 0.0317 0.158 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 5.98e-03 -0.375 0.135 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 7.28e-01 0.0409 0.117 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0646 0.174 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00749 0.133 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 5.61e-01 0.0944 0.162 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 9.83e-01 0.0035 0.165 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 5.20e-01 0.0828 0.129 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 2.71e-01 -0.255 0.231 0.061 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 3.54e-01 0.202 0.217 0.061 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 4.70e-02 0.324 0.162 0.061 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 4.69e-01 0.153 0.211 0.061 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0612 0.215 0.061 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 5.19e-01 -0.137 0.211 0.061 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 5.48e-01 0.127 0.211 0.061 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 4.87e-01 -0.135 0.193 0.061 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 8.71e-01 0.0284 0.174 0.071 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0337 0.159 0.071 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 9.81e-02 0.309 0.186 0.071 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 9.27e-01 0.0162 0.175 0.071 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 6.49e-01 0.0696 0.153 0.071 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 7.64e-01 0.0521 0.173 0.075 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 7.33e-01 0.0546 0.16 0.075 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0908 0.191 0.075 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 5.99e-02 -0.29 0.153 0.075 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 7.73e-01 0.0416 0.144 0.075 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 1.42e-01 0.298 0.202 0.076 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0789 0.177 0.076 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 1.85e-01 0.248 0.186 0.076 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 7.22e-01 0.0609 0.171 0.076 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 1.40e-01 -0.195 0.131 0.076 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0465 0.176 0.076 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 4.81e-02 0.345 0.173 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0243 0.0847 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 5.44e-02 0.326 0.169 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 4.76e-01 0.0638 0.0894 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0656 0.141 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 8.29e-01 0.0265 0.122 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 3.44e-01 -0.139 0.146 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 7.50e-01 0.0539 0.169 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00654 0.132 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000307 0.177 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 3.08e-01 -0.179 0.175 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 149266 sc-eQTL 4.10e-01 0.0809 0.0981 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 8.39e-01 0.0326 0.161 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 1.17e-01 -0.124 0.0789 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00767 0.114 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 2.65e-01 0.133 0.119 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0529 0.125 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 891538 sc-eQTL 2.42e-01 -0.21 0.179 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -865000 sc-eQTL 3.19e-01 0.17 0.171 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 8.44e-01 0.036 0.183 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 433425 sc-eQTL 2.57e-01 -0.189 0.166 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 8.43e-01 -0.029 0.146 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 7.60e-01 0.0362 0.118 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 6.44e-01 0.0704 0.152 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 1.40e-02 -0.327 0.132 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 4.72e-01 0.0791 0.11 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 2.22e-01 0.201 0.164 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0104 0.144 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 9.24e-01 0.0166 0.174 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 1.85e-01 -0.191 0.144 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 1.00e+00 6.63e-05 0.124 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 510890 sc-eQTL 3.30e-01 0.151 0.154 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 934063 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0742 0.151 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 sc-eQTL 3.61e-01 0.0943 0.103 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 568861 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0916 0.119 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 753430 sc-eQTL 1.66e-01 0.221 0.159 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 510825 sc-eQTL 1.35e-01 0.28 0.187 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111670 GNPTAB 800051 eQTL 2.08e-02 0.0621 0.0268 0.00148 0.0 0.0648

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina