Genes within 1Mb (chr12:102606740:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 3.07e-01 0.0797 0.0779 0.06 B L1
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 4.21e-01 0.109 0.136 0.06 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00273 0.0825 0.06 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0831 0.119 0.06 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 5.04e-01 0.0625 0.0933 0.06 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 1.95e-01 -0.137 0.106 0.06 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 3.50e-01 -0.157 0.168 0.06 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 2.11e-01 0.18 0.143 0.06 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 6.83e-01 -0.066 0.161 0.06 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 2.37e-01 0.178 0.15 0.06 B L1
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0182 0.125 0.06 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 3.86e-01 0.147 0.169 0.06 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0365 0.117 0.06 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 2.46e-01 0.103 0.0886 0.06 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 4.78e-02 0.323 0.162 0.06 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 3.91e-01 0.132 0.153 0.06 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 2.44e-01 0.194 0.166 0.06 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 1.88e-01 0.144 0.109 0.06 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 3.57e-01 0.0997 0.108 0.06 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 4.36e-01 0.121 0.155 0.06 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 2.54e-01 0.2 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0558 0.173 0.063 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0595 0.158 0.063 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 9.41e-01 0.0129 0.174 0.063 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 7.60e-01 0.0507 0.166 0.063 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0884 0.137 0.063 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0706 0.155 0.063 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 6.14e-02 -0.337 0.179 0.063 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0123 0.146 0.06 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 4.68e-02 0.245 0.122 0.06 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 9.83e-01 0.00337 0.155 0.06 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 8.90e-01 0.0194 0.14 0.06 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 2.48e-01 0.132 0.114 0.06 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 1.77e-01 0.211 0.156 0.06 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 5.79e-01 0.0807 0.145 0.06 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 8.33e-01 0.0222 0.105 0.06 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 9.97e-01 0.000371 0.117 0.06 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0927 0.167 0.06 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 7.87e-01 0.0529 0.196 0.06 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 9.78e-01 0.00165 0.0594 0.06 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 8.54e-01 0.0208 0.113 0.06 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 4.23e-01 0.132 0.165 0.06 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 8.01e-01 0.03 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 7.73e-02 0.213 0.12 0.06 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 1.34e-01 -0.216 0.144 0.06 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 7.39e-01 0.0572 0.172 0.06 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 1.64e-01 0.168 0.12 0.06 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0346 0.14 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 7.53e-01 0.0121 0.0384 0.059 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 2.96e-02 0.431 0.196 0.059 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 6.00e-01 0.0774 0.147 0.059 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 1.31e-01 0.315 0.208 0.059 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 4.33e-01 -0.156 0.199 0.059 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 2.15e-01 -0.248 0.199 0.059 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 6.51e-01 0.0743 0.164 0.059 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 1.06e-01 0.281 0.173 0.059 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 4.18e-01 -0.134 0.165 0.059 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 5.93e-01 0.0831 0.155 0.059 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0549 0.0778 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 3.97e-01 -0.164 0.194 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 9.76e-01 0.00317 0.104 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 3.65e-02 -0.321 0.152 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0243 0.159 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 4.26e-01 -0.136 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 5.49e-01 -0.108 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 1.25e-01 0.262 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0417 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 8.90e-02 -0.306 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 1.16e-01 0.113 0.0714 0.06 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 4.71e-01 0.137 0.189 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 2.87e-01 -0.132 0.123 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 2.96e-01 -0.177 0.169 0.06 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 3.98e-01 0.14 0.165 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 4.66e-01 -0.127 0.173 0.06 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 1.27e-01 -0.272 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 6.47e-01 0.0824 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 4.62e-01 0.134 0.183 0.06 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 8.84e-01 0.0243 0.166 0.06 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 4.19e-01 0.0797 0.0984 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 5.31e-01 0.112 0.178 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 6.73e-01 0.0392 0.0927 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 2.22e-01 -0.16 0.131 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 3.14e-01 0.132 0.131 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 3.76e-01 -0.126 0.142 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 3.85e-01 -0.168 0.193 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 1.48e-01 0.27 0.186 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0991 0.188 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 1.54e-01 0.251 0.176 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 3.42e-01 0.0833 0.0874 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 6.84e-01 0.0732 0.179 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 6.29e-01 0.0464 0.0961 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 5.23e-01 0.0953 0.149 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 1.86e-01 -0.218 0.164 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0318 0.164 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0533 0.172 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 7.84e-01 0.0509 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 2.39e-01 0.233 0.198 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 1.89e-01 0.225 0.17 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 2.25e-01 -0.229 0.188 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 5.56e-01 -0.111 0.189 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 1.67e-01 -0.228 0.164 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 1.03e-01 -0.3 0.183 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 6.23e-01 0.0843 0.171 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 6.97e-01 0.056 0.144 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 5.06e-01 0.11 0.165 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 3.39e-01 -0.122 0.127 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 3.83e-02 0.217 0.104 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 3.08e-02 0.365 0.168 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 3.53e-01 -0.142 0.152 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 1.52e-01 0.252 0.175 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0734 0.136 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 8.44e-01 0.0207 0.105 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 4.89e-01 0.123 0.177 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 3.65e-01 -0.163 0.18 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 1.21e-01 0.268 0.173 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 9.96e-02 0.275 0.166 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 4.90e-01 0.106 0.153 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 3.40e-02 0.398 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 2.60e-01 0.186 0.164 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 2.19e-01 0.208 0.168 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 4.76e-01 0.0965 0.135 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 5.71e-01 0.0875 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0205 0.192 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 9.67e-01 0.00771 0.185 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 9.46e-01 0.0118 0.174 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 1.64e-01 0.24 0.172 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 4.12e-01 -0.127 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 2.09e-01 0.148 0.117 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 2.03e-01 0.231 0.181 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 2.00e-01 0.23 0.179 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0151 0.191 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 9.25e-01 0.0161 0.171 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 8.88e-02 0.3 0.175 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 4.48e-01 -0.129 0.169 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 6.29e-01 0.0894 0.185 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 5.47e-01 -0.11 0.182 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 1.95e-01 0.243 0.187 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 6.89e-01 0.0711 0.178 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 2.42e-01 0.223 0.19 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 1.21e-01 0.264 0.17 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 5.71e-01 -0.107 0.188 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 9.27e-02 0.315 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0714 0.0639 0.061 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 2.35e-01 0.213 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 4.58e-01 0.13 0.175 0.061 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 3.28e-01 0.152 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 9.14e-02 0.266 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 5.11e-01 0.118 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 3.91e-01 0.144 0.168 0.061 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 9.26e-02 0.294 0.174 0.061 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 7.12e-01 0.0573 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 2.81e-01 0.217 0.201 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 5.11e-01 0.0959 0.146 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 9.88e-01 0.00245 0.168 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 3.23e-01 -0.171 0.173 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 6.69e-01 0.0783 0.183 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 5.19e-01 0.124 0.193 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 4.63e-01 0.127 0.173 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0769 0.169 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 7.62e-01 0.0387 0.128 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 6.03e-01 0.0766 0.147 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 9.04e-01 0.0216 0.179 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 9.04e-01 0.0242 0.201 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 5.26e-01 0.118 0.186 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 2.68e-01 -0.211 0.19 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 5.23e-01 0.098 0.153 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 4.73e-01 -0.137 0.19 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 2.38e-01 -0.23 0.195 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 4.73e-01 -0.138 0.192 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 6.56e-01 0.0785 0.176 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 4.98e-01 0.112 0.164 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 3.58e-01 0.115 0.125 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 3.75e-01 0.122 0.138 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 7.43e-01 -0.059 0.18 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 4.35e-01 0.152 0.194 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 2.97e-01 -0.146 0.139 0.063 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0871 0.188 0.063 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0119 0.146 0.063 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 4.68e-01 0.153 0.21 0.063 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 4.93e-01 0.118 0.171 0.063 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 5.83e-01 0.0955 0.174 0.063 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 3.69e-02 0.418 0.198 0.063 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 5.92e-01 0.0967 0.18 0.063 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0409 0.185 0.063 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 5.53e-01 -0.102 0.171 0.063 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0335 0.0645 0.061 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0201 0.13 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 3.02e-01 0.178 0.172 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00739 0.128 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 1.47e-01 0.217 0.149 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 4.64e-02 -0.255 0.127 0.061 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 7.03e-01 0.0631 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0388 0.119 0.061 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0586 0.13 0.061 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0884 0.187 0.06 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 5.63e-01 0.113 0.195 0.06 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 6.56e-01 0.076 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 3.20e-01 -0.155 0.156 0.06 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 8.40e-01 0.032 0.158 0.06 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 9.19e-02 0.294 0.174 0.061 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 1.26e-01 -0.261 0.17 0.061 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 2.24e-01 0.268 0.219 0.061 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 4.49e-01 -0.147 0.194 0.061 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0142 0.151 0.061 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 2.85e-01 0.145 0.135 0.061 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 7.67e-01 0.0514 0.173 0.061 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0324 0.165 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 2.30e-02 0.281 0.123 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0629 0.165 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 9.14e-01 0.0155 0.143 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 2.15e-01 0.151 0.122 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 9.49e-01 0.0115 0.181 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 2.76e-03 0.412 0.136 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 6.16e-01 0.0849 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 2.97e-01 -0.179 0.172 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 9.75e-01 0.00429 0.134 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 1.11e-01 0.393 0.245 0.052 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 9.95e-01 0.00154 0.232 0.052 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 7.05e-01 0.0662 0.175 0.052 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 9.57e-01 0.0121 0.226 0.052 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 2.13e-01 -0.286 0.228 0.052 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 3.45e-01 -0.213 0.225 0.052 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0172 0.225 0.052 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 6.21e-01 -0.102 0.206 0.052 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 1.00e-01 0.296 0.18 0.06 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000526 0.165 0.06 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 6.66e-01 0.0841 0.194 0.06 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0545 0.182 0.06 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 9.01e-01 0.0198 0.159 0.06 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 9.88e-01 0.00275 0.182 0.061 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0375 0.168 0.061 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 3.87e-01 0.175 0.201 0.061 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 6.01e-01 0.0853 0.163 0.061 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0738 0.152 0.061 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 2.07e-01 -0.277 0.218 0.065 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0144 0.191 0.065 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0124 0.202 0.065 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 3.54e-01 0.171 0.184 0.065 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0593 0.143 0.065 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 9.27e-01 0.0173 0.19 0.065 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 2.66e-02 -0.418 0.187 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 8.91e-01 0.0124 0.09 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 6.66e-01 0.0782 0.181 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0601 0.095 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 6.16e-02 -0.279 0.148 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 7.03e-01 0.0496 0.13 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 2.63e-01 -0.174 0.155 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 1.66e-01 -0.248 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 1.71e-01 0.192 0.14 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0861 0.188 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 2.85e-01 -0.199 0.186 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 124996 sc-eQTL 3.59e-01 0.0957 0.104 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 6.76e-01 0.0714 0.171 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 7.50e-01 0.0269 0.0843 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0832 0.121 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 7.61e-01 0.0386 0.126 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0958 0.132 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 867268 sc-eQTL 4.58e-01 -0.142 0.191 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -889270 sc-eQTL 1.55e-01 0.258 0.181 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 6.85e-01 0.0791 0.195 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 409155 sc-eQTL 4.21e-02 0.359 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0977 0.153 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 5.70e-03 0.339 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 8.62e-01 0.0277 0.159 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 8.64e-01 -0.024 0.14 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 2.55e-01 0.131 0.115 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 4.04e-01 0.144 0.173 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 6.21e-01 0.0748 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0162 0.183 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 8.95e-01 0.0201 0.152 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 6.46e-01 0.0601 0.131 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 486620 sc-eQTL 2.82e-01 0.178 0.165 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 909793 sc-eQTL 8.97e-01 0.0209 0.162 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 775781 sc-eQTL 7.27e-01 0.0387 0.111 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 544591 sc-eQTL 6.60e-01 0.0562 0.128 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 729160 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0862 0.171 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 486555 sc-eQTL 8.03e-01 0.0503 0.202 0.06 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 909793 eQTL 1.51e-03 0.176 0.0553 0.0 0.0 0.0569
ENSG00000120860 WASHC3 544591 eQTL 0.0437 0.0555 0.0275 0.0 0.0 0.0569
ENSG00000185480 PARPBP 486555 eQTL 0.00117 -0.163 0.0501 0.0 0.0 0.0569


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 WASHC3 544591 7.76e-07 3.77e-07 1.24e-07 3.56e-07 9.45e-08 1.57e-07 4.42e-07 1.01e-07 3.51e-07 2.12e-07 4.64e-07 3.11e-07 5.54e-07 1.01e-07 1.71e-07 2.05e-07 2.53e-07 3.67e-07 1.97e-07 1.39e-07 1.91e-07 3.15e-07 3.03e-07 1.29e-07 5.15e-07 2.39e-07 2.52e-07 2.19e-07 3.27e-07 4.27e-07 2.11e-07 6.2e-08 5.19e-08 1.19e-07 2.55e-07 1.16e-07 1.03e-07 8.21e-08 5.28e-08 3.05e-08 8.61e-08 3.43e-07 3.55e-08 1.78e-08 1.47e-07 1.59e-08 8.13e-08 1.18e-08 5.86e-08