logo

Genes within 1Mb (chr12:102594370:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00748 0.0661 0.09 B L1
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0737 0.115 0.09 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 7.77e-01 0.0198 0.0699 0.09 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 2.67e-01 0.112 0.101 0.09 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 1.61e-01 0.111 0.0787 0.09 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0211 0.0897 0.09 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 1.72e-01 -0.195 0.142 0.09 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 1.20e-01 0.189 0.121 0.09 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 8.01e-01 0.0345 0.137 0.09 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0122 0.127 0.09 B L1
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 9.16e-01 0.0111 0.105 0.09 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 2.98e-02 -0.307 0.14 0.09 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 4.95e-02 0.192 0.0974 0.09 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 8.83e-01 -0.011 0.0744 0.09 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 2.50e-01 0.158 0.137 0.09 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 3.22e-01 0.128 0.129 0.09 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 9.33e-02 -0.235 0.14 0.09 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.69e-01 0.0395 0.0921 0.09 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 9.43e-01 0.00658 0.0912 0.09 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 2.93e-01 0.137 0.13 0.09 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 5.38e-01 0.0912 0.148 0.09 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 3.29e-01 0.144 0.147 0.086 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 2.37e-01 -0.159 0.134 0.086 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.73e-01 0.0624 0.148 0.086 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0439 0.141 0.086 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0834 0.116 0.086 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 9.72e-01 0.0047 0.132 0.086 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 5.33e-01 0.0959 0.154 0.086 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0811 0.122 0.09 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 3.31e-01 -0.1 0.103 0.09 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 2.59e-01 -0.146 0.129 0.09 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 2.66e-01 0.13 0.116 0.09 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 4.94e-03 0.265 0.0934 0.09 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0405 0.131 0.088 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0741 0.122 0.088 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 7.64e-01 0.0266 0.0883 0.088 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 5.21e-01 0.0633 0.0984 0.088 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 3.82e-01 0.122 0.14 0.088 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 2.64e-01 -0.184 0.164 0.088 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0242 0.0503 0.09 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0444 0.0959 0.09 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 1.01e-01 -0.23 0.139 0.09 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.53e-01 0.0456 0.101 0.09 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 1.75e-01 0.139 0.102 0.09 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 4.03e-01 0.103 0.123 0.09 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 8.19e-02 0.253 0.145 0.09 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 3.88e-01 0.0882 0.102 0.09 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 4.67e-01 0.0866 0.119 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0319 0.0307 0.092 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0549 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 5.94e-02 0.222 0.117 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 2.05e-01 -0.212 0.167 0.092 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 9.48e-01 0.0103 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 5.37e-01 0.0989 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 7.08e-01 0.0493 0.132 0.092 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0541 0.14 0.092 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 3.73e-01 -0.118 0.132 0.092 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0143 0.124 0.092 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 1.77e-01 0.0883 0.0653 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 4.50e-01 0.123 0.163 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 6.97e-03 0.235 0.0861 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 8.75e-01 0.0204 0.13 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 3.34e-01 0.129 0.134 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 3.81e-01 -0.126 0.143 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 2.79e-01 0.163 0.151 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 9.87e-01 0.00227 0.144 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 3.94e-01 -0.135 0.158 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 5.87e-01 0.0826 0.152 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 3.54e-02 0.126 0.0596 0.091 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 4.59e-01 -0.118 0.159 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 3.02e-01 0.107 0.104 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 4.21e-01 0.114 0.142 0.091 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0405 0.139 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0602 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 5.70e-02 -0.284 0.148 0.091 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 1.64e-01 -0.209 0.15 0.091 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0988 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 4.50e-01 -0.105 0.139 0.091 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 1.98e-01 -0.106 0.0821 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0545 0.149 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 5.12e-01 0.0509 0.0775 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0827 0.11 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0222 0.11 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 1.51e-01 -0.171 0.119 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 5.35e-01 -0.101 0.162 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 1.77e-02 0.369 0.154 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 2.55e-01 0.179 0.157 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0619 0.148 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0411 0.0734 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 8.75e-01 0.0236 0.15 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0686 0.0804 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 2.52e-02 0.278 0.123 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 9.52e-02 0.23 0.137 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0236 0.137 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0925 0.144 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0671 0.156 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 3.56e-01 -0.154 0.166 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 9.21e-01 0.0143 0.143 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 2.76e-01 -0.17 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 3.20e-01 -0.156 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 1.09e-01 0.219 0.136 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 1.15e-01 0.241 0.152 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 3.56e-01 0.131 0.142 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0413 0.12 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 3.46e-02 -0.292 0.137 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 2.54e-01 0.122 0.107 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0143 0.0883 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 2.68e-01 0.158 0.142 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 6.65e-02 0.23 0.125 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 8.12e-02 -0.252 0.144 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 3.44e-02 0.237 0.111 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 6.56e-01 0.0385 0.0863 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 3.56e-01 0.135 0.146 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 1.99e-01 -0.192 0.149 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 7.88e-02 -0.252 0.143 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0656 0.138 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 6.08e-01 0.0651 0.127 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0782 0.156 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 5.51e-01 0.0826 0.138 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0969 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.29e-01 0.0549 0.114 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00316 0.13 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 5.62e-01 0.0937 0.161 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 4.47e-01 0.119 0.155 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 1.35e-01 0.216 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 8.63e-02 -0.246 0.143 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.91e-01 0.0515 0.129 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 3.62e-01 0.0896 0.0981 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 8.67e-01 0.0255 0.152 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 4.27e-01 -0.119 0.149 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 4.33e-02 0.313 0.154 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 4.33e-01 -0.109 0.139 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0214 0.144 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0443 0.138 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 9.57e-01 0.0081 0.151 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 1.22e-01 0.229 0.148 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 7.16e-01 0.0563 0.154 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 6.52e-01 -0.066 0.146 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0838 0.156 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0471 0.14 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 5.25e-01 0.0983 0.154 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 1.95e-01 -0.2 0.153 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0283 0.0544 0.091 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0233 0.153 0.091 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 3.41e-01 -0.142 0.148 0.091 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 2.44e-01 0.154 0.131 0.091 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 4.12e-01 0.11 0.134 0.091 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 6.80e-01 0.0629 0.152 0.091 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 4.24e-02 0.288 0.141 0.091 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0651 0.149 0.091 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 6.30e-02 0.245 0.131 0.091 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 6.38e-01 0.0787 0.167 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 5.70e-01 0.0688 0.121 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0683 0.14 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 1.06e-01 0.232 0.143 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0446 0.152 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 3.22e-02 -0.342 0.158 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 1.05e-01 -0.237 0.145 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 2.25e-01 -0.173 0.143 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 3.25e-01 0.107 0.108 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 1.79e-01 0.167 0.124 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 2.59e-01 -0.17 0.151 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 7.90e-01 0.0454 0.17 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 5.27e-02 0.295 0.151 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 4.55e-01 -0.117 0.157 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 9.85e-01 0.00231 0.126 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0113 0.156 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 4.09e-01 -0.133 0.16 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 9.45e-01 0.0108 0.158 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0542 0.145 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 1.10e-01 -0.216 0.135 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0588 0.103 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0939 0.114 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 1.88e-01 0.195 0.148 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 2.31e-01 -0.192 0.159 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0739 0.115 0.093 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0215 0.156 0.093 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 1.52e-01 0.172 0.12 0.093 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 4.98e-01 -0.118 0.173 0.093 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0609 0.141 0.093 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 5.97e-01 -0.076 0.143 0.093 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 9.79e-02 -0.275 0.165 0.093 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 4.74e-02 -0.293 0.146 0.093 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 8.94e-01 0.0204 0.153 0.093 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 1.56e-01 0.2 0.14 0.093 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 2.22e-01 0.0674 0.055 0.089 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 6.33e-02 0.206 0.111 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 3.80e-01 -0.13 0.147 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0502 0.109 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 3.44e-01 0.121 0.128 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 9.17e-01 0.0115 0.11 0.089 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 1.70e-01 0.194 0.141 0.089 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 2.48e-01 0.118 0.102 0.089 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0629 0.111 0.089 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 2.86e-01 0.165 0.154 0.09 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 6.06e-02 -0.301 0.159 0.09 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 5.45e-01 -0.085 0.14 0.09 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 4.28e-01 -0.102 0.128 0.09 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 1.68e-01 0.18 0.13 0.09 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 2.07e-01 0.186 0.147 0.085 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0452 0.144 0.085 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 5.20e-01 0.12 0.186 0.085 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 8.53e-01 0.0305 0.164 0.085 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0981 0.128 0.085 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0607 0.114 0.085 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 7.94e-02 0.255 0.145 0.085 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00969 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0921 0.104 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 1.69e-01 -0.189 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 2.05e-01 0.152 0.119 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 1.52e-01 0.146 0.102 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0622 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0454 0.115 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 7.77e-01 0.0396 0.14 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 3.31e-01 -0.138 0.142 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 1.94e-02 0.258 0.109 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 7.42e-02 -0.34 0.189 0.091 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 1.09e-01 -0.286 0.178 0.091 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 9.09e-01 0.0154 0.135 0.091 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0491 0.174 0.091 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 4.61e-02 0.351 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0998 0.174 0.091 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 1.36e-01 -0.259 0.173 0.091 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 1.39e-01 0.235 0.158 0.091 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 4.15e-02 -0.315 0.154 0.087 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 8.85e-01 0.0206 0.142 0.087 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 3.12e-01 -0.169 0.166 0.087 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 2.22e-01 0.191 0.156 0.087 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 7.34e-01 0.0464 0.136 0.087 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 1.51e-01 0.224 0.155 0.084 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 6.22e-01 0.0712 0.144 0.084 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 5.33e-01 -0.108 0.173 0.084 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 1.57e-01 0.197 0.139 0.084 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 6.39e-01 0.061 0.13 0.084 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0163 0.186 0.082 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 5.83e-02 -0.305 0.16 0.082 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 4.82e-01 -0.12 0.171 0.082 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 4.66e-01 -0.114 0.156 0.082 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00249 0.121 0.082 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 9.70e-01 0.00602 0.161 0.082 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0511 0.16 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 6.05e-02 0.143 0.0758 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 9.92e-01 0.00164 0.154 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 1.82e-02 0.19 0.0797 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0625 0.127 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 5.45e-01 0.0669 0.11 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0566 0.132 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 7.14e-01 0.0559 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00924 0.119 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0909 0.159 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 9.14e-01 -0.017 0.158 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 112626 sc-eQTL 1.38e-01 -0.13 0.0873 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0638 0.143 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 6.98e-01 0.0276 0.0708 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 3.37e-01 0.0974 0.101 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 4.25e-01 0.0848 0.106 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 7.88e-01 -0.03 0.111 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 854898 sc-eQTL 2.13e-01 -0.2 0.16 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -901640 sc-eQTL 1.23e-01 0.235 0.152 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 8.71e-01 0.0266 0.164 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 396785 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0168 0.149 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000275 0.127 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 1.95e-01 -0.133 0.102 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 1.28e-01 -0.201 0.131 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 7.22e-01 0.0413 0.116 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 9.82e-03 0.245 0.0938 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 4.66e-01 -0.109 0.149 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 7.11e-01 0.0483 0.13 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0393 0.157 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 2.33e-01 0.156 0.13 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 7.14e-01 0.0413 0.113 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 474250 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0712 0.139 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 897423 sc-eQTL 1.41e-01 -0.199 0.135 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 763411 sc-eQTL 4.68e-01 0.0674 0.0927 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 532221 sc-eQTL 9.45e-01 0.00745 0.107 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 716790 sc-eQTL 4.76e-01 0.103 0.144 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 474185 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0599 0.169 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 474250 eQTL 0.0344 0.0716 0.0338 0.0 0.0 0.0707
ENSG00000136048 DRAM1 716790 eQTL 0.0348 0.0582 0.0275 0.0 0.0 0.0707

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000179088 \N -901640 2.76e-07 1.34e-07 5.72e-08 1.9e-07 9.87e-08 8.45e-08 1.6e-07 5.53e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.52e-07 1.08e-07 1.53e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.5e-08 4.12e-08 1.4e-07 6.75e-08 4.89e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.45e-07 2.91e-08 1.63e-07 1.25e-07 1.18e-07 9.92e-08 1.2e-07 9.88e-08 1.02e-07 3.39e-08 3.68e-08 8.23e-08 3.52e-08 3.14e-08 5.3e-08 8.89e-08 6.71e-08 4.19e-08 5.3e-08 1.4e-07 5.08e-08 1.43e-08 3.4e-08 1.8e-08 1e-07 2e-09 4.82e-08