logo

Genes within 1Mb (chr12:102567076:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0035 0.0581 0.124 B L1
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0784 0.101 0.124 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 8.62e-01 0.0107 0.0614 0.124 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00894 0.0889 0.124 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 5.51e-01 0.0415 0.0695 0.124 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 2.84e-01 0.0844 0.0786 0.124 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 6.72e-01 0.0532 0.125 0.124 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 8.55e-02 -0.184 0.106 0.124 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0547 0.12 0.124 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 3.09e-01 0.114 0.112 0.124 B L1
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 4.72e-01 0.0662 0.092 0.124 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 3.84e-01 0.108 0.124 0.124 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 4.80e-01 -0.061 0.0861 0.124 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 3.28e-02 -0.139 0.0646 0.124 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 8.28e-01 0.0262 0.12 0.124 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 4.60e-01 0.0845 0.114 0.124 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 2.60e-01 0.139 0.123 0.124 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 9.63e-02 -0.135 0.0807 0.124 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0231 0.0804 0.124 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 4.60e-01 0.0852 0.115 0.124 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 2.20e-01 0.16 0.13 0.124 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 2.51e-02 -0.287 0.127 0.126 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 1.49e-01 0.17 0.117 0.126 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 1.52e-01 -0.186 0.129 0.126 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 3.88e-01 0.107 0.124 0.126 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 1.14e-01 -0.161 0.102 0.126 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 9.84e-01 0.00233 0.116 0.126 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 7.95e-01 -0.035 0.135 0.126 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0171 0.108 0.124 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 4.62e-01 0.0673 0.0912 0.124 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 3.62e-01 -0.104 0.114 0.124 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 9.99e-01 -7.6e-05 0.103 0.124 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 1.06e-02 -0.214 0.083 0.124 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 7.56e-01 0.0365 0.117 0.124 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 6.21e-02 0.202 0.108 0.124 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0166 0.0789 0.124 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 8.40e-02 -0.152 0.0873 0.124 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 4.41e-01 0.0965 0.125 0.124 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 4.82e-01 -0.103 0.147 0.124 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00256 0.044 0.124 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0519 0.0839 0.124 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 1.03e-01 0.2 0.122 0.124 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 1.71e-01 -0.121 0.0881 0.124 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.31e-01 0.043 0.0895 0.124 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00856 0.107 0.124 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 2.91e-01 -0.134 0.127 0.124 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 3.42e-01 0.0851 0.0893 0.124 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 5.30e-01 0.0653 0.104 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000376 0.0272 0.13 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0376 0.141 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 6.33e-01 0.0499 0.104 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 2.49e-01 -0.171 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 9.59e-01 0.00724 0.141 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0576 0.142 0.13 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 4.57e-01 0.0867 0.116 0.13 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00889 0.124 0.13 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 2.28e-01 0.141 0.117 0.13 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00185 0.11 0.13 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000515 0.0569 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 1.75e-01 -0.192 0.141 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 7.03e-01 0.0291 0.0761 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 9.40e-01 0.00851 0.113 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0537 0.116 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 9.79e-01 0.00329 0.125 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 1.76e-01 0.177 0.131 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 2.57e-03 -0.374 0.123 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00201 0.138 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 3.00e-01 -0.137 0.132 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0184 0.0523 0.125 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 6.04e-01 0.0718 0.138 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0418 0.0902 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 6.99e-01 0.0479 0.124 0.125 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 5.00e-01 0.0815 0.121 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 8.49e-01 -0.024 0.127 0.125 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 8.00e-01 -0.033 0.13 0.125 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 4.60e-02 -0.26 0.13 0.125 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 5.18e-01 0.0863 0.133 0.125 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00583 0.121 0.125 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 3.33e-01 0.072 0.0742 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0584 0.135 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 3.99e-01 0.059 0.0699 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0691 0.0989 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 9.43e-01 0.00714 0.0993 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 9.50e-01 0.00675 0.108 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 2.05e-01 0.185 0.146 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 7.07e-02 -0.254 0.14 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 3.16e-01 -0.143 0.142 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0939 0.133 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 8.74e-01 0.0103 0.0651 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0348 0.133 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 7.02e-01 0.0274 0.0714 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 7.51e-01 0.0352 0.111 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.25e-01 0.0601 0.123 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0256 0.122 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 3.61e-01 -0.117 0.128 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0692 0.138 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 4.80e-01 -0.104 0.147 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 2.46e-01 0.148 0.127 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 3.29e-01 0.138 0.141 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 8.01e-01 0.0357 0.141 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 2.08e-01 -0.155 0.123 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 1.86e-01 -0.182 0.137 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 5.62e-01 0.0744 0.128 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 4.82e-01 0.0743 0.106 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 5.74e-01 0.0686 0.122 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0532 0.0939 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 9.66e-02 -0.128 0.077 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 7.36e-01 0.0422 0.125 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 9.47e-01 0.00738 0.112 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 3.58e-01 0.119 0.129 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 4.42e-01 0.0769 0.0998 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 1.76e-01 -0.104 0.0764 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 5.10e-01 0.0857 0.13 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 9.74e-01 0.00423 0.132 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 9.43e-02 0.212 0.126 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0634 0.122 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0229 0.112 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 9.64e-01 0.00631 0.138 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0538 0.122 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 3.98e-01 0.106 0.125 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 5.71e-01 -0.057 0.1 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 4.81e-01 0.0808 0.115 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 8.24e-01 0.0317 0.143 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0882 0.138 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 2.44e-01 0.149 0.128 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 6.13e-01 0.0643 0.127 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 2.59e-01 -0.129 0.114 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0522 0.0868 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 5.29e-01 0.0845 0.134 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 6.50e-01 0.0602 0.132 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 2.30e-01 0.169 0.14 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 3.82e-01 0.11 0.126 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0278 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 3.45e-01 0.118 0.125 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0772 0.136 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 6.94e-01 0.0529 0.134 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 9.26e-01 0.013 0.139 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 3.49e-01 0.123 0.131 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 2.44e-01 -0.164 0.14 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 2.01e-01 0.162 0.126 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 9.66e-01 0.00604 0.139 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.139 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 3.96e-01 0.0413 0.0485 0.123 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 1.62e-01 0.19 0.136 0.123 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 3.32e-01 0.129 0.132 0.123 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 1.79e-01 -0.158 0.117 0.123 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.99e-01 0.0462 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 7.86e-01 0.0369 0.136 0.123 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 5.15e-01 0.0829 0.127 0.123 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 5.90e-01 0.0717 0.133 0.123 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 9.86e-01 0.00202 0.118 0.123 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 6.67e-01 0.0632 0.147 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 2.83e-02 0.232 0.105 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 6.40e-01 0.0575 0.123 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 9.99e-01 0.000145 0.127 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00357 0.133 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 4.95e-01 0.0961 0.141 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 5.96e-01 0.0689 0.13 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 1.45e-01 0.185 0.126 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0657 0.0959 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 3.34e-01 -0.107 0.11 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 6.09e-01 0.0687 0.134 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 5.34e-01 -0.094 0.151 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0393 0.132 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 5.65e-01 0.0777 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0268 0.109 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0528 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0606 0.138 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 1.01e-01 -0.223 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 6.08e-01 0.0668 0.13 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 9.40e-02 0.204 0.121 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00212 0.0926 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0507 0.102 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0503 0.133 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 2.76e-01 0.157 0.144 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0235 0.114 0.104 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0964 0.153 0.104 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 9.17e-02 0.2 0.117 0.104 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 9.54e-03 -0.437 0.166 0.104 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 1.44e-01 -0.203 0.138 0.104 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 6.22e-01 0.0696 0.141 0.104 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 2.38e-01 0.193 0.163 0.104 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 4.26e-01 0.117 0.146 0.104 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 3.15e-01 0.151 0.15 0.104 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 2.79e-01 -0.15 0.138 0.104 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0758 0.047 0.124 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0468 0.0954 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 1.86e-01 0.167 0.126 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 1.24e-01 -0.144 0.093 0.124 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0542 0.11 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 7.83e-01 -0.026 0.0942 0.124 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0646 0.121 0.124 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 3.27e-01 0.0855 0.0871 0.124 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 4.22e-01 0.0767 0.0953 0.124 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0182 0.136 0.124 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 1.93e-01 0.184 0.141 0.124 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 9.26e-01 0.0114 0.124 0.124 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0712 0.113 0.124 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 3.20e-01 -0.114 0.115 0.124 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 5.89e-01 0.0668 0.123 0.129 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 6.85e-01 0.0489 0.12 0.129 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 3.62e-02 -0.324 0.153 0.129 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.54e-01 0.0615 0.137 0.129 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 3.25e-01 -0.105 0.107 0.129 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0436 0.0955 0.129 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 9.47e-01 0.00806 0.122 0.129 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 2.01e-01 -0.156 0.122 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.092 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 7.31e-02 -0.219 0.121 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 2.56e-01 0.121 0.106 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 2.27e-01 -0.109 0.0903 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 4.75e-02 0.262 0.131 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00541 0.102 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 1.68e-01 0.17 0.123 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0586 0.126 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 2.28e-02 -0.222 0.097 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 1.24e-01 -0.259 0.167 0.127 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 3.96e-01 0.134 0.158 0.127 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 3.51e-01 -0.111 0.119 0.127 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 3.11e-01 0.156 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 5.51e-01 0.0934 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0927 0.154 0.127 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 6.73e-02 -0.28 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 3.79e-01 -0.124 0.14 0.127 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0391 0.133 0.129 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 1.83e-01 0.162 0.122 0.129 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0267 0.143 0.129 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0379 0.134 0.129 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 1.84e-01 -0.156 0.117 0.129 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 3.32e-01 -0.128 0.131 0.127 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 1.66e-01 0.168 0.121 0.127 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0355 0.145 0.127 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 4.22e-02 -0.238 0.116 0.127 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 7.50e-01 -0.035 0.109 0.127 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 4.22e-02 -0.333 0.162 0.119 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 1.14e-01 0.226 0.142 0.119 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 9.33e-01 0.0128 0.152 0.119 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0718 0.138 0.119 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 7.61e-01 0.0326 0.107 0.119 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00599 0.143 0.119 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0179 0.142 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 5.99e-01 -0.035 0.0665 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 4.02e-01 -0.112 0.133 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 9.55e-01 0.00401 0.0703 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0281 0.111 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00134 0.0961 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 6.74e-01 0.0485 0.115 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 6.09e-01 0.068 0.133 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 7.39e-03 -0.276 0.102 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 7.42e-01 0.0457 0.139 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 3.75e-01 -0.122 0.137 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 85332 sc-eQTL 2.05e-01 0.0996 0.0783 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 3.32e-01 -0.125 0.128 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 7.44e-01 0.0207 0.0635 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 7.54e-01 0.0286 0.0909 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 6.36e-01 0.045 0.0951 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 8.09e-01 0.0242 0.0997 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 827604 sc-eQTL 5.45e-01 0.087 0.144 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -928934 sc-eQTL 1.61e-01 -0.192 0.136 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 3.45e-01 -0.138 0.146 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 369491 sc-eQTL 4.43e-01 0.102 0.133 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 7.94e-01 0.0294 0.113 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 4.99e-01 0.0617 0.0911 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0719 0.117 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 4.33e-01 0.0811 0.103 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 1.69e-02 -0.201 0.0836 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 2.81e-01 -0.14 0.129 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 2.26e-01 0.137 0.113 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 3.10e-01 -0.139 0.137 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 1.93e-01 -0.148 0.113 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 1.10e-01 -0.156 0.0974 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446956 sc-eQTL 4.40e-01 0.0954 0.123 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870129 sc-eQTL 7.99e-02 0.211 0.12 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0226 0.0826 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504927 sc-eQTL 2.34e-01 -0.113 0.0949 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689496 sc-eQTL 5.98e-01 0.0674 0.128 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 446891 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0654 0.15 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 eQTL 2.24e-03 -0.0643 0.021 0.0029 0.0 0.117
ENSG00000183395 PMCH 369243 pQTL 0.032 0.0928 0.0432 0.0 0.0 0.122

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N 446956 1.21e-06 1.81e-06 3.32e-07 1.15e-06 2.28e-07 4.73e-07 1.32e-06 1.09e-07 1.42e-06 4.19e-07 1.86e-06 6.02e-07 3.49e-06 2.89e-07 8.18e-07 7.41e-07 8.06e-07 7.21e-07 3.74e-07 3.96e-07 3.24e-07 1.69e-06 7.52e-07 1.21e-07 2.26e-06 2.38e-07 5.49e-07 7.19e-07 1.37e-06 1.07e-06 8.1e-07 7.49e-08 5.39e-08 4.83e-07 4.22e-07 1.44e-07 1.01e-07 6.46e-08 3.18e-07 3.02e-07 4.63e-08 1.8e-05 6.21e-08 9.64e-08 1.49e-07 1.23e-07 9.07e-08 1.98e-09 4.83e-08
ENSG00000111670 GNPTAB 736117 8.48e-07 8.78e-07 1e-07 4.26e-07 1.09e-07 1.77e-07 7.02e-07 5.85e-08 4.43e-07 2.12e-07 1.19e-06 2.28e-07 2.01e-06 1.52e-07 4.19e-07 1.76e-07 2.07e-07 4.07e-07 9.97e-08 7.29e-08 1.6e-07 4.99e-07 2.81e-07 3.17e-08 9.26e-07 1.86e-07 1.48e-07 2.83e-07 3.88e-07 2.89e-07 3.67e-07 3.93e-08 4.37e-08 1.21e-07 2.61e-07 3.11e-08 6.24e-08 9.23e-08 3.82e-08 2.15e-08 5.77e-08 5.64e-06 2.62e-08 4.22e-08 3.55e-08 1.27e-08 1.22e-07 3.95e-09 4.85e-08