logo

Genes within 1Mb (chr12:102567006:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 9.37e-01 0.00589 0.0747 0.075 B L1
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 3.85e-01 0.113 0.13 0.075 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0216 0.079 0.075 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 3.06e-01 -0.117 0.114 0.075 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0564 0.0894 0.075 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 2.31e-01 -0.121 0.101 0.075 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00475 0.161 0.075 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 9.93e-01 0.00115 0.138 0.075 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 2.62e-01 -0.173 0.154 0.075 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 6.78e-01 0.0598 0.144 0.075 B L1
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 7.27e-01 0.041 0.117 0.075 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.69e-01 0.142 0.158 0.075 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0855 0.11 0.075 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0327 0.0831 0.075 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 2.85e-01 0.164 0.153 0.075 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 2.41e-01 -0.168 0.143 0.075 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.70e-01 0.14 0.155 0.075 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 2.57e-01 -0.116 0.102 0.075 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 7.59e-01 0.0311 0.101 0.075 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 9.39e-01 0.0111 0.145 0.075 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0086 0.164 0.075 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 6.42e-01 0.0739 0.159 0.077 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 1.56e-01 -0.206 0.145 0.077 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0619 0.16 0.077 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 1.55e-01 0.217 0.152 0.077 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 7.23e-01 0.0447 0.126 0.077 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 9.48e-01 0.00937 0.143 0.077 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 1.02e-02 -0.424 0.163 0.077 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0307 0.136 0.075 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 1.39e-01 0.171 0.115 0.075 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0455 0.145 0.075 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 4.08e-01 0.108 0.13 0.075 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0172 0.107 0.075 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 4.40e-01 -0.111 0.144 0.075 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.80e-01 0.118 0.134 0.075 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 4.33e-01 0.0761 0.0969 0.075 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 1.01e-01 -0.177 0.107 0.075 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 6.64e-01 -0.067 0.154 0.075 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 7.59e-02 0.32 0.179 0.075 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0397 0.0555 0.075 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00669 0.106 0.075 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 8.93e-01 0.0208 0.155 0.075 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 2.28e-01 0.134 0.111 0.075 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 2.16e-01 -0.14 0.113 0.075 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 8.19e-01 0.031 0.135 0.075 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 4.88e-01 0.112 0.16 0.075 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 7.68e-01 0.0333 0.113 0.075 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 3.00e-01 0.136 0.131 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 4.80e-01 0.025 0.0353 0.074 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 4.13e-01 0.15 0.183 0.074 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 7.23e-01 0.048 0.135 0.074 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 4.99e-01 -0.13 0.192 0.074 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 5.35e-01 0.114 0.183 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 4.72e-01 0.132 0.184 0.074 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 1.99e-01 -0.194 0.15 0.074 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 2.95e-01 0.168 0.16 0.074 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 2.76e-01 0.166 0.152 0.074 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 1.72e-01 -0.195 0.142 0.074 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0947 0.0758 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 4.67e-01 -0.138 0.189 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 7.68e-01 -0.03 0.102 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 9.20e-03 -0.389 0.148 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 2.81e-01 -0.167 0.155 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0653 0.167 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 3.05e-01 0.18 0.175 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 5.02e-01 0.112 0.167 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0571 0.184 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0154 0.176 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 2.77e-01 0.0759 0.0696 0.073 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 4.03e-01 -0.154 0.184 0.073 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 5.14e-01 0.0785 0.12 0.073 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 7.86e-01 0.0449 0.165 0.073 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 1.26e-01 0.246 0.16 0.073 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0567 0.169 0.073 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 2.09e-01 -0.218 0.173 0.073 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 2.33e-01 -0.208 0.174 0.073 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 4.96e-01 -0.121 0.177 0.073 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 1.59e-01 0.228 0.161 0.073 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0169 0.0962 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 5.89e-01 0.0941 0.174 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0831 0.0903 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0844 0.128 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 6.46e-01 0.0591 0.128 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 8.79e-02 -0.237 0.138 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 9.75e-01 0.00586 0.189 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0766 0.182 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 3.04e-01 -0.189 0.183 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 2.20e-01 0.211 0.172 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0261 0.0827 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 2.80e-02 0.371 0.168 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 9.79e-01 0.00234 0.0908 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 4.49e-01 0.107 0.141 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 9.03e-01 0.019 0.156 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 8.09e-01 0.0374 0.154 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0757 0.163 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 5.52e-01 -0.104 0.175 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 3.02e-01 0.193 0.187 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0388 0.162 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 5.71e-01 -0.102 0.18 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 6.46e-01 0.083 0.18 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 2.87e-01 0.168 0.157 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 9.97e-01 0.000572 0.176 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 1.73e-01 -0.223 0.163 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0623 0.135 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.20e-01 0.155 0.155 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0623 0.12 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 9.79e-01 0.00258 0.0988 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 3.60e-01 0.146 0.159 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 5.04e-01 0.0944 0.141 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 5.50e-01 0.0971 0.162 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 1.85e-01 -0.167 0.125 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 5.81e-01 0.0534 0.0966 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 1.00e+00 2.46e-05 0.164 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 6.44e-01 0.079 0.171 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 1.25e-01 0.252 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0345 0.158 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 3.92e-01 -0.124 0.145 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 6.81e-01 0.0735 0.178 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0941 0.152 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 5.67e-01 0.0891 0.155 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0596 0.124 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 8.92e-01 0.0192 0.142 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 1.62e-01 -0.246 0.176 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 1.95e-01 -0.221 0.17 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 5.97e-01 -0.084 0.159 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.36e-01 0.152 0.158 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 3.01e-01 -0.147 0.141 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 2.28e-01 0.13 0.107 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 5.14e-02 0.323 0.165 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 9.48e-01 0.0108 0.164 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00136 0.178 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 7.86e-01 0.0432 0.159 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0516 0.165 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 2.75e-01 -0.173 0.158 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 3.56e-01 -0.159 0.172 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 6.20e-02 -0.316 0.168 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 4.90e-01 0.118 0.171 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.93e-01 0.138 0.161 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 5.80e-01 0.0958 0.173 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 8.55e-01 0.0283 0.155 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 9.84e-01 0.00335 0.171 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 3.14e-01 -0.172 0.17 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 8.24e-01 0.0134 0.0602 0.076 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 6.40e-01 0.079 0.169 0.076 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 2.99e-01 0.171 0.164 0.076 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 5.30e-01 0.0916 0.146 0.076 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 3.17e-02 -0.317 0.147 0.076 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 6.17e-01 0.0842 0.168 0.076 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 1.14e-01 0.248 0.157 0.076 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 7.56e-01 0.0512 0.165 0.076 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 4.02e-01 0.122 0.146 0.076 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 2.45e-01 0.214 0.184 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.83e-01 0.116 0.133 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 1.37e-01 -0.229 0.153 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0501 0.159 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0453 0.167 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 3.15e-01 0.177 0.176 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 8.45e-01 0.0312 0.159 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 2.68e-01 0.172 0.155 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 1.32e-01 0.177 0.117 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0873 0.135 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 2.13e-01 -0.205 0.164 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 6.38e-02 0.342 0.184 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 2.73e-02 -0.362 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0848 0.169 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00742 0.136 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 3.60e-01 -0.154 0.168 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 2.99e-01 0.18 0.173 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 1.23e-01 0.263 0.17 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 1.56e-01 -0.227 0.16 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 4.32e-01 0.118 0.15 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 2.06e-01 0.144 0.113 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 3.36e-01 -0.121 0.126 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 9.74e-01 0.00531 0.164 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0162 0.177 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 1.78e-01 0.189 0.139 0.063 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0413 0.189 0.063 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 3.90e-01 -0.126 0.146 0.063 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 2.06e-01 -0.266 0.209 0.063 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 3.42e-01 0.163 0.171 0.063 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0943 0.174 0.063 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 2.85e-01 -0.216 0.201 0.063 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 7.10e-01 0.0674 0.181 0.063 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0576 0.185 0.063 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0277 0.172 0.063 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0481 0.0588 0.076 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 7.17e-01 0.043 0.119 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00525 0.157 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 5.16e-01 0.0757 0.116 0.076 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 4.06e-01 0.114 0.136 0.076 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 3.47e-01 -0.11 0.117 0.076 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0366 0.151 0.076 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 4.70e-01 0.0786 0.108 0.076 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.118 0.076 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 8.66e-01 0.0291 0.172 0.075 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 1.91e-01 0.234 0.179 0.075 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0266 0.157 0.075 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0996 0.143 0.075 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 3.01e-01 -0.151 0.145 0.075 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 2.35e-01 0.196 0.165 0.073 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 2.59e-01 -0.182 0.161 0.073 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0732 0.208 0.073 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 1.49e-02 0.443 0.18 0.073 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 9.27e-01 0.0131 0.143 0.073 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 8.02e-01 0.032 0.128 0.073 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0989 0.163 0.073 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0927 0.155 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 1.70e-01 0.16 0.116 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 5.12e-01 0.102 0.155 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 3.44e-01 0.127 0.134 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00382 0.115 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 4.35e-01 -0.131 0.168 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 2.49e-01 0.149 0.129 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 2.75e-01 -0.171 0.157 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 2.59e-01 0.18 0.159 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 8.07e-01 0.0305 0.125 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 3.00e-01 0.235 0.226 0.067 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 2.62e-01 0.239 0.212 0.067 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0247 0.161 0.067 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 6.20e-01 0.103 0.207 0.067 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0674 0.211 0.067 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 2.94e-01 0.218 0.206 0.067 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 3.25e-01 0.204 0.206 0.067 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 2.24e-01 0.23 0.189 0.067 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 8.05e-01 -0.041 0.166 0.073 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 8.79e-01 0.0231 0.152 0.073 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0643 0.178 0.073 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 5.99e-01 0.0877 0.167 0.073 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 5.36e-01 0.0902 0.146 0.073 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 5.75e-01 0.0924 0.164 0.077 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 1.03e-01 0.247 0.151 0.077 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 5.75e-01 0.102 0.182 0.077 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 8.97e-01 0.0191 0.147 0.077 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 3.18e-01 0.137 0.136 0.077 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 5.19e-01 -0.134 0.208 0.073 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 4.84e-01 0.127 0.181 0.073 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 4.62e-01 -0.141 0.192 0.073 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 1.29e-01 0.266 0.174 0.073 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 1.75e-01 0.184 0.135 0.073 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 5.33e-01 0.113 0.18 0.073 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 1.66e-01 -0.249 0.179 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0195 0.087 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 3.48e-01 -0.164 0.175 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 4.65e-01 0.0673 0.0919 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 1.09e-01 -0.231 0.144 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000955 0.126 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0621 0.151 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 7.69e-01 -0.051 0.173 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 8.46e-01 0.0265 0.136 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0828 0.182 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 8.53e-01 0.0333 0.18 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 85262 sc-eQTL 6.99e-01 0.0391 0.101 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 2.71e-01 0.182 0.165 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0596 0.0816 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0104 0.117 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 4.62e-01 0.0901 0.122 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 2.21e-01 -0.157 0.128 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 827534 sc-eQTL 9.96e-01 0.000851 0.185 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -929004 sc-eQTL 7.21e-01 -0.063 0.176 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0837 0.189 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 369421 sc-eQTL 3.45e-01 0.162 0.171 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 4.22e-01 -0.115 0.143 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 9.57e-02 0.192 0.115 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00961 0.149 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 2.73e-01 0.143 0.13 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 9.38e-01 0.00837 0.107 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 3.89e-01 0.138 0.16 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 1.04e-01 0.228 0.139 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0279 0.17 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 5.11e-01 0.0926 0.141 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 3.20e-01 0.121 0.121 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 446886 sc-eQTL 1.67e-01 -0.21 0.151 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 870059 sc-eQTL 2.79e-01 0.161 0.148 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 736047 sc-eQTL 2.24e-01 0.123 0.101 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 504857 sc-eQTL 1.35e-01 -0.175 0.117 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 689426 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0892 0.157 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 446821 sc-eQTL 5.51e-02 0.354 0.184 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 \N 504857 1.27e-06 1.01e-06 3.3e-07 1e-06 2.28e-07 5.32e-07 1.38e-06 3.45e-07 1.25e-06 4.11e-07 1.83e-06 5.79e-07 2.12e-06 2.76e-07 5.36e-07 6.35e-07 8.49e-07 6.91e-07 7.4e-07 6.84e-07 3.95e-07 1.28e-06 7.95e-07 4.62e-07 2.28e-06 2.89e-07 6.75e-07 6.93e-07 1.18e-06 1.2e-06 7.03e-07 3.9e-08 2.31e-07 5.78e-07 5.2e-07 3.36e-07 4.75e-07 1.69e-07 3.33e-07 2.51e-07 1.67e-07 1.91e-06 5.66e-08 1.66e-07 1.59e-07 1.26e-07 1.71e-07 8.88e-08 5.63e-08