Genes within 1Mb (chr12:102560220:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 8.45e-01 0.014 0.0719 0.073 B L1
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0189 0.125 0.073 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 8.75e-01 -0.012 0.0761 0.073 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0572 0.11 0.073 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 6.92e-01 0.0341 0.0861 0.073 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 8.99e-01 0.0124 0.0977 0.073 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0118 0.155 0.073 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 1.92e-02 -0.309 0.131 0.073 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 2.35e-01 -0.176 0.148 0.073 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 5.46e-02 0.265 0.137 0.073 B L1
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 1.83e-01 -0.153 0.114 0.073 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.51e-01 0.0926 0.155 0.073 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0709 0.107 0.073 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0388 0.0814 0.073 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 1.74e-01 0.204 0.15 0.073 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0854 0.143 0.073 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 2.04e-01 0.197 0.154 0.073 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0733 0.102 0.073 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 8.66e-02 0.172 0.1 0.073 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 6.03e-01 0.0751 0.144 0.073 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 1.16e-01 0.257 0.163 0.073 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 1.71e-01 -0.212 0.154 0.077 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 2.59e-01 0.16 0.141 0.077 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 5.21e-01 -0.1 0.156 0.077 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 9.33e-01 0.0126 0.149 0.077 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 4.34e-01 -0.096 0.122 0.077 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 8.92e-01 0.0188 0.139 0.077 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0562 0.162 0.077 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0491 0.132 0.073 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 3.28e-01 0.109 0.111 0.073 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 6.53e-01 -0.063 0.14 0.073 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 3.93e-01 0.108 0.126 0.073 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 2.06e-01 -0.13 0.103 0.073 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0158 0.145 0.073 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 1.61e-01 0.188 0.134 0.073 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 8.48e-01 0.0188 0.0974 0.073 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 1.43e-01 -0.159 0.108 0.073 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 6.16e-01 0.0777 0.154 0.073 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0378 0.181 0.073 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0272 0.0546 0.073 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0947 0.104 0.073 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 4.32e-01 0.119 0.152 0.073 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0158 0.11 0.073 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 4.82e-01 0.0781 0.111 0.073 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 9.82e-01 0.00304 0.133 0.073 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0952 0.158 0.073 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0301 0.111 0.073 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0146 0.129 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 7.76e-01 0.00937 0.033 0.077 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 4.89e-01 -0.118 0.171 0.077 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0248 0.126 0.077 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 7.91e-02 -0.314 0.178 0.077 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 4.01e-01 -0.144 0.171 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 3.62e-01 -0.157 0.171 0.077 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 4.62e-01 0.104 0.141 0.077 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0788 0.15 0.077 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 9.89e-01 0.00197 0.142 0.077 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 2.71e-01 -0.147 0.133 0.077 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0503 0.0703 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 1.21e-01 -0.271 0.174 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 8.06e-01 0.0231 0.0941 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 6.41e-01 0.065 0.139 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0316 0.144 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 8.00e-01 0.0392 0.154 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 4.29e-01 0.128 0.162 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 1.74e-01 -0.21 0.154 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 9.06e-01 0.0202 0.17 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0736 0.163 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0674 0.0641 0.073 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 2.57e-01 0.192 0.169 0.073 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0635 0.111 0.073 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 9.72e-01 0.00537 0.152 0.073 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 7.52e-01 0.0468 0.148 0.073 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 4.55e-01 0.116 0.155 0.073 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 8.26e-01 0.0352 0.16 0.073 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 9.20e-02 -0.27 0.16 0.073 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 6.91e-01 0.0649 0.163 0.073 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0309 0.149 0.073 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 4.95e-01 0.0624 0.0913 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 5.50e-01 0.099 0.165 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 6.70e-01 0.0367 0.0859 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0823 0.121 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 4.22e-01 0.0979 0.122 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 5.96e-01 0.0701 0.132 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0953 0.179 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 2.05e-02 -0.4 0.171 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 3.50e-01 -0.163 0.174 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 2.49e-01 0.189 0.163 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 8.33e-01 0.0172 0.0812 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 3.90e-01 -0.143 0.166 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0108 0.089 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 7.13e-01 0.0509 0.138 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 6.88e-01 0.0615 0.153 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 3.70e-01 -0.136 0.151 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 6.40e-01 0.0747 0.159 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 1.34e-01 -0.258 0.171 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 4.62e-01 -0.135 0.184 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 7.49e-01 0.0508 0.159 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 3.09e-01 0.179 0.175 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 4.58e-01 0.131 0.176 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 9.59e-01 0.00798 0.154 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0749 0.172 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 3.56e-01 0.148 0.16 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 3.62e-01 -0.121 0.133 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 8.08e-01 0.0374 0.153 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0294 0.118 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 7.36e-01 0.0329 0.0975 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 3.44e-01 0.149 0.157 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 2.04e-01 -0.175 0.138 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.76e-01 0.0893 0.159 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 9.72e-01 0.00428 0.124 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0546 0.0949 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 4.95e-01 0.11 0.161 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 2.39e-01 -0.193 0.164 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 1.04e-01 0.256 0.157 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 9.32e-01 -0.013 0.152 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 9.19e-01 0.0142 0.139 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 5.02e-01 0.115 0.172 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0887 0.153 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.89e-01 0.0849 0.157 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0528 0.125 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 3.52e-01 0.133 0.143 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0325 0.178 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 7.32e-01 0.059 0.172 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 6.63e-01 0.0693 0.159 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.50e-01 0.0945 0.158 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0962 0.142 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 2.25e-01 0.131 0.107 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 9.36e-01 0.0135 0.166 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 4.80e-01 0.116 0.164 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0855 0.179 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.07e-01 0.106 0.16 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 8.11e-01 0.0398 0.166 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 2.92e-01 0.168 0.159 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 8.25e-01 0.0384 0.173 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 7.31e-02 -0.305 0.169 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0493 0.169 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.25e-01 0.102 0.159 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 1.56e-01 -0.242 0.17 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 1.45e-03 0.483 0.149 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 3.96e-01 0.143 0.169 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 4.24e-01 0.135 0.168 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 9.73e-01 0.00202 0.0607 0.071 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 4.84e-01 0.119 0.17 0.071 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 4.08e-01 0.137 0.166 0.071 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0832 0.147 0.071 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 3.32e-01 0.145 0.149 0.071 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 8.77e-01 0.0263 0.17 0.071 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 3.63e-01 0.145 0.159 0.071 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 4.31e-01 -0.131 0.166 0.071 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 5.66e-01 0.0844 0.147 0.071 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 9.37e-01 0.0143 0.18 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 2.46e-02 0.291 0.128 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 6.19e-01 0.0748 0.15 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 3.95e-01 -0.132 0.155 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 6.23e-01 0.0803 0.163 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 2.87e-01 0.183 0.172 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0113 0.16 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.23e-01 0.0999 0.156 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 8.62e-01 0.0205 0.118 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 3.47e-01 -0.128 0.136 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 7.95e-01 0.043 0.165 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 9.91e-01 0.00221 0.186 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 7.40e-01 0.0551 0.166 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.63e-01 0.0988 0.17 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 4.40e-01 0.106 0.137 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0772 0.17 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 5.27e-01 -0.111 0.175 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 1.88e-01 -0.226 0.171 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0716 0.162 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 2.54e-01 0.172 0.151 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00142 0.115 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 8.45e-01 0.0249 0.127 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 4.69e-01 -0.12 0.165 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 9.55e-01 0.0101 0.179 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0747 0.144 0.056 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 7.08e-01 0.0729 0.194 0.056 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 1.96e-01 0.194 0.149 0.056 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 2.91e-01 -0.228 0.215 0.056 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 5.86e-01 -0.096 0.176 0.056 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0495 0.179 0.056 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 9.83e-01 0.00438 0.208 0.056 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 7.23e-01 0.0658 0.185 0.056 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 6.36e-01 0.0901 0.19 0.056 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 4.25e-01 -0.14 0.176 0.056 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0633 0.0588 0.072 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0337 0.119 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 2.06e-01 0.199 0.157 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0185 0.117 0.072 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 7.70e-01 -0.04 0.137 0.072 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 2.77e-01 -0.128 0.117 0.072 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0139 0.151 0.072 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 8.17e-01 0.0252 0.109 0.072 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000262 0.119 0.072 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0576 0.167 0.073 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 4.49e-01 0.132 0.174 0.073 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 5.50e-01 0.0909 0.152 0.073 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 5.48e-01 0.0836 0.139 0.073 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0168 0.141 0.073 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 4.93e-01 0.103 0.15 0.078 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 8.27e-01 0.032 0.147 0.078 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 5.07e-01 -0.126 0.189 0.078 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 4.32e-01 -0.131 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 8.24e-02 -0.225 0.129 0.078 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 6.57e-01 0.0518 0.116 0.078 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0166 0.148 0.078 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 1.10e-01 -0.237 0.148 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 3.63e-01 0.102 0.112 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 4.80e-01 -0.105 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 2.93e-01 0.136 0.129 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0038 0.11 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 3.56e-02 0.338 0.16 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 5.87e-01 0.0674 0.124 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 3.77e-01 0.133 0.15 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 2.50e-01 0.176 0.153 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 2.01e-01 -0.153 0.119 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 6.04e-03 -0.581 0.209 0.064 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0563 0.201 0.064 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 4.71e-01 0.109 0.151 0.064 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 4.17e-01 0.159 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 6.28e-01 0.0965 0.198 0.064 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00929 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0498 0.195 0.064 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 3.51e-02 -0.374 0.176 0.064 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0594 0.161 0.076 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 3.23e-01 0.145 0.147 0.076 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0683 0.172 0.076 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 4.63e-01 -0.119 0.161 0.076 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 1.78e-02 -0.333 0.139 0.076 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 2.58e-01 -0.181 0.159 0.077 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 1.94e-01 0.191 0.147 0.077 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0569 0.176 0.077 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0973 0.142 0.077 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0366 0.133 0.077 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 9.65e-02 -0.333 0.199 0.071 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 4.02e-01 0.147 0.175 0.071 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00369 0.185 0.071 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0346 0.169 0.071 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0613 0.131 0.071 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 7.49e-01 0.0558 0.174 0.071 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0622 0.174 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0933 0.0813 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0944 0.164 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 8.01e-01 0.0217 0.0861 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0369 0.135 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0329 0.118 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 3.13e-01 0.142 0.141 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 6.23e-01 0.0798 0.162 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 9.73e-02 -0.211 0.126 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0493 0.17 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 4.50e-01 -0.128 0.168 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 78476 sc-eQTL 2.67e-01 0.108 0.0973 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00795 0.16 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000808 0.0788 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00581 0.113 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 3.53e-01 0.11 0.118 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00247 0.124 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 820748 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0571 0.178 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -935790 sc-eQTL 1.57e-02 -0.408 0.167 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 2.10e-01 -0.228 0.181 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 362635 sc-eQTL 1.40e-01 0.244 0.165 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 9.34e-01 0.0114 0.137 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 4.57e-01 0.0825 0.111 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0316 0.143 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 1.19e-01 0.195 0.125 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0783 0.103 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 1.65e-01 -0.221 0.159 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 1.11e-01 0.222 0.138 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 5.20e-01 -0.109 0.169 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0887 0.14 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 5.64e-02 -0.23 0.12 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 440100 sc-eQTL 7.11e-01 0.0565 0.153 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 863273 sc-eQTL 3.12e-01 0.15 0.149 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 729261 sc-eQTL 8.20e-01 0.0233 0.102 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 498071 sc-eQTL 3.91e-01 -0.101 0.117 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 682640 sc-eQTL 7.67e-01 0.0469 0.158 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 440035 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0586 0.186 0.073 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N 440100 8.15e-07 4.78e-07 1.07e-07 3.48e-07 9.45e-08 1.97e-07 5.2e-07 1.21e-07 3.94e-07 2.28e-07 5.29e-07 3.61e-07 6.77e-07 1.1e-07 2.07e-07 2.14e-07 2.77e-07 3.67e-07 1.77e-07 1.41e-07 1.92e-07 3.65e-07 3.08e-07 1.36e-07 6.65e-07 2.34e-07 2.58e-07 2.54e-07 3.43e-07 4.61e-07 2.31e-07 6.56e-08 5.19e-08 1.39e-07 3.04e-07 7.98e-08 1.15e-07 9.58e-08 5.67e-08 3.58e-08 1.01e-07 4.16e-07 2.47e-08 1.9e-08 1.27e-07 1.25e-08 1.21e-07 1.79e-08 5.43e-08