logo

Genes within 1Mb (chr12:102526138:C:CGCCT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 4.93e-01 0.029 0.0423 0.229 B L1
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00532 0.0736 0.229 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 1.69e-01 0.0616 0.0446 0.229 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 8.40e-01 -0.013 0.0648 0.229 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.69e-01 0.0696 0.0504 0.229 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0468 0.0574 0.229 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0495 0.0912 0.229 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 4.11e-02 -0.159 0.0772 0.229 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 5.28e-02 -0.169 0.0866 0.229 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 5.48e-01 0.0491 0.0815 0.229 B L1
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0369 0.0677 0.229 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 3.92e-02 0.188 0.0906 0.229 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0267 0.0634 0.229 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.99e-01 0.0616 0.0478 0.229 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 7.73e-01 0.0255 0.0885 0.229 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 5.06e-01 0.0555 0.0834 0.229 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 5.56e-02 0.173 0.0897 0.229 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0131 0.0594 0.229 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 5.12e-02 0.114 0.0582 0.229 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 9.53e-01 0.00492 0.0842 0.229 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0747 0.0953 0.229 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00877 0.0955 0.232 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0323 0.0873 0.232 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0231 0.096 0.232 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00258 0.0917 0.232 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0894 0.0754 0.232 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 6.85e-01 0.0348 0.0855 0.232 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 6.64e-01 0.0433 0.0997 0.232 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0754 0.0782 0.229 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.25e-01 0.0529 0.0663 0.229 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00371 0.0832 0.229 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.60e-02 0.18 0.0741 0.229 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0593 0.0611 0.229 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 1.27e-02 -0.213 0.0846 0.227 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 3.27e-02 0.169 0.0788 0.227 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0345 0.0577 0.227 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 5.84e-01 0.0353 0.0644 0.227 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 3.12e-01 0.0927 0.0914 0.227 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 2.80e-01 -0.116 0.107 0.227 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 4.74e-01 0.0233 0.0326 0.229 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 6.76e-01 -0.026 0.0621 0.229 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 3.88e-01 0.0784 0.0906 0.229 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 2.07e-01 0.0825 0.0652 0.229 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0481 0.0662 0.229 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 7.45e-01 0.0259 0.0794 0.229 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 5.30e-02 0.182 0.0934 0.229 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 1.06e-01 -0.107 0.0658 0.229 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 2.13e-01 0.0958 0.0767 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 6.95e-01 0.00789 0.0201 0.24 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00706 0.104 0.24 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0527 0.0768 0.24 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 2.47e-02 -0.244 0.108 0.24 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.13e-01 -0.164 0.103 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 8.73e-01 0.0167 0.104 0.24 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 1.84e-01 0.114 0.0854 0.24 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0415 0.0911 0.24 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0577 0.0863 0.24 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 2.13e-01 -0.101 0.0808 0.24 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 1.30e-01 0.0637 0.042 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 3.26e-01 -0.103 0.105 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 2.48e-02 0.126 0.0557 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0678 0.0832 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 5.19e-01 0.0555 0.086 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 5.81e-01 0.0511 0.0923 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 7.27e-01 0.034 0.0971 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 2.60e-01 -0.105 0.0925 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 5.93e-01 0.0545 0.102 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 6.03e-01 0.0509 0.0977 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 3.72e-02 -0.0801 0.0382 0.228 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 8.90e-02 0.173 0.101 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0497 0.0665 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0262 0.0911 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 9.58e-01 0.00472 0.089 0.228 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 1.36e-01 0.139 0.0928 0.228 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0144 0.0961 0.228 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0683 0.0964 0.228 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0841 0.0981 0.228 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 8.23e-01 0.02 0.0895 0.228 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0498 0.0543 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 9.78e-01 0.00272 0.0984 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 5.75e-02 0.0969 0.0507 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 8.97e-01 0.00939 0.0724 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 4.88e-01 0.0503 0.0725 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0749 0.0785 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0435 0.107 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 6.94e-02 -0.187 0.102 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0531 0.104 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00459 0.0974 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 9.56e-01 0.00266 0.0477 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0178 0.0977 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 3.39e-02 0.11 0.0517 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 6.75e-01 0.034 0.081 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 9.50e-01 0.00567 0.0898 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0828 0.0888 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 7.50e-01 0.0299 0.0936 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0679 0.101 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 3.77e-02 -0.224 0.107 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0315 0.0931 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0893 0.103 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 9.37e-01 0.00821 0.103 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0641 0.0903 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0119 0.101 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 6.36e-01 0.0445 0.0938 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0889 0.078 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 5.23e-02 0.175 0.0894 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0237 0.0695 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 2.90e-01 0.0607 0.0572 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 5.24e-01 0.0589 0.0924 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 9.01e-01 0.0101 0.0814 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 1.10e-02 0.237 0.0925 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0466 0.0727 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 4.10e-01 0.0461 0.0558 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 7.90e-01 0.0252 0.0946 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0286 0.0969 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 1.74e-01 0.127 0.0929 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 3.33e-01 0.087 0.0896 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0126 0.0823 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0195 0.101 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 2.67e-01 0.0976 0.0877 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 1.15e-01 0.142 0.0897 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0537 0.072 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 4.77e-01 0.0585 0.0822 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0641 0.102 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0599 0.0987 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 1.37e-01 0.139 0.0931 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 7.95e-02 0.163 0.0923 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 7.18e-01 0.0301 0.0835 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.41e-01 0.0934 0.0632 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 1.79e-01 -0.132 0.0976 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 2.01e-01 -0.123 0.0963 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0782 0.104 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 9.10e-01 0.0105 0.0935 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 4.00e-01 0.0814 0.0966 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0533 0.0927 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 7.46e-01 0.0328 0.101 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 7.90e-02 -0.174 0.0988 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 2.56e-01 -0.115 0.101 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 1.33e-01 0.143 0.0952 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0369 0.102 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 6.39e-01 0.0431 0.0919 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 4.16e-01 0.0825 0.101 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0838 0.101 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 5.36e-01 0.0215 0.0347 0.227 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0161 0.0975 0.227 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.55e-02 0.189 0.0941 0.227 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 8.06e-01 0.0207 0.0842 0.227 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 6.93e-01 0.0338 0.0856 0.227 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 8.53e-01 -0.018 0.0971 0.227 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 1.73e-02 0.215 0.0898 0.227 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0849 0.095 0.227 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 4.92e-01 0.058 0.0842 0.227 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0914 0.109 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.43e-01 0.0607 0.0789 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0786 0.0911 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 3.55e-02 -0.197 0.0931 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 5.69e-02 0.188 0.0982 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0545 0.105 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 1.82e-02 -0.224 0.0942 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 3.11e-01 0.0946 0.0931 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0372 0.0705 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 5.01e-01 0.0546 0.0811 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0839 0.0984 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0744 0.111 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 9.45e-01 0.00705 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 9.83e-02 0.173 0.104 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0385 0.0841 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 5.13e-01 0.0683 0.104 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0538 0.107 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0943 0.105 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 4.06e-02 -0.2 0.0971 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 7.20e-02 0.165 0.091 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 2.51e-01 -0.08 0.0695 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.79e-01 0.103 0.0767 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 4.30e-01 0.0791 0.1 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 9.58e-01 0.00572 0.108 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0401 0.0757 0.237 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 2.48e-01 0.118 0.101 0.237 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 2.26e-01 0.0957 0.0786 0.237 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 8.50e-02 -0.195 0.112 0.237 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 4.00e-01 0.078 0.0924 0.237 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 4.17e-01 0.0764 0.0937 0.237 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 3.46e-01 -0.103 0.109 0.237 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0414 0.0974 0.237 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 8.06e-01 0.0247 0.1 0.237 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0678 0.0924 0.237 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 4.08e-01 0.0296 0.0357 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 6.80e-01 0.0298 0.0721 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.61e-01 0.0705 0.0954 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 7.62e-02 0.125 0.0701 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.90e-01 -0.109 0.0826 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 8.59e-01 0.0126 0.0711 0.226 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 6.06e-01 0.0473 0.0916 0.226 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0685 0.0658 0.226 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 7.90e-02 0.126 0.0716 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 8.86e-01 0.0142 0.0993 0.229 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 1.45e-01 0.15 0.103 0.229 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 2.61e-01 -0.101 0.09 0.229 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 2.37e-01 0.0975 0.0823 0.229 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0697 0.0838 0.229 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 5.29e-01 0.059 0.0935 0.227 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0666 0.0912 0.227 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 9.15e-01 0.0126 0.118 0.227 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0252 0.104 0.227 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 3.77e-02 -0.168 0.0801 0.227 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 6.30e-01 0.0349 0.0725 0.227 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0937 0.0921 0.227 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 1.65e-01 -0.126 0.09 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.76e-01 0.0486 0.0681 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 9.99e-01 0.00013 0.0905 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.60e-01 0.11 0.0783 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00732 0.067 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0642 0.0984 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 7.89e-01 0.0202 0.0755 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 6.50e-01 0.0417 0.0918 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 5.34e-02 0.18 0.0927 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0406 0.0728 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 9.94e-03 -0.317 0.121 0.23 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 3.00e-01 -0.121 0.116 0.23 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 4.06e-02 0.179 0.0866 0.23 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 3.75e-01 0.101 0.113 0.23 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 5.09e-01 0.0762 0.115 0.23 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0974 0.113 0.23 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0867 0.113 0.23 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 2.33e-01 -0.124 0.103 0.23 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 1.50e-01 -0.145 0.0999 0.224 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 6.23e-01 0.0452 0.0918 0.224 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 2.79e-01 -0.117 0.108 0.224 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 6.41e-01 0.0472 0.101 0.224 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 2.54e-01 -0.101 0.088 0.224 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 8.00e-03 0.253 0.0945 0.231 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 6.51e-01 0.0403 0.0888 0.231 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 7.15e-01 -0.039 0.106 0.231 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 2.00e-01 0.11 0.0857 0.231 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0516 0.08 0.231 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0307 0.117 0.226 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0194 0.102 0.226 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0315 0.108 0.226 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00929 0.0988 0.226 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0496 0.0763 0.226 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 7.60e-01 0.0311 0.102 0.226 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 8.99e-01 0.0129 0.101 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 7.13e-01 -0.018 0.0488 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 5.86e-01 0.0535 0.0981 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.00e-01 0.0435 0.0515 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 1.67e-01 -0.112 0.0808 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 8.45e-01 0.0138 0.0706 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 2.27e-01 0.102 0.0842 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 7.08e-01 0.0365 0.0973 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0749 0.0761 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0713 0.102 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 8.01e-01 0.0255 0.101 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 44394 sc-eQTL 7.16e-01 -0.021 0.0577 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0473 0.0943 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 4.57e-02 0.0928 0.0461 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 5.49e-01 0.04 0.0667 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 1.25e-01 0.107 0.0694 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0864 0.0729 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 786666 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0123 0.106 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -969872 sc-eQTL 3.10e-02 -0.215 0.0992 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 1.05e-01 -0.174 0.107 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 328553 sc-eQTL 5.12e-01 0.0642 0.0978 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 8.91e-02 -0.142 0.0829 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 5.29e-01 0.0425 0.0674 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 8.23e-01 0.0194 0.0868 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 3.64e-02 0.159 0.0756 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0178 0.0627 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 2.94e-01 0.0996 0.0947 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 5.17e-01 0.0538 0.0828 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0599 0.1 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 9.72e-02 0.138 0.0827 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 1.03e-01 -0.117 0.0713 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 406018 sc-eQTL 2.45e-02 -0.204 0.09 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 829191 sc-eQTL 1.01e-01 0.145 0.0883 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 695179 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0314 0.0608 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 463989 sc-eQTL 3.16e-01 0.0704 0.07 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 648558 sc-eQTL 6.20e-01 0.0467 0.0942 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 405953 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0687 0.111 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120860 WASHC3 463989 eQTL 4.74e-05 0.061 0.0149 0.0 0.0 0.228
ENSG00000185480 PARPBP 405953 eQTL 3.99e-08 -0.15 0.0271 0.00134 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 WASHC3 463989 1.87e-06 2.34e-06 3.26e-07 1.35e-06 1.78e-07 6.38e-07 1.27e-06 1.45e-07 1.42e-06 2.88e-07 1.97e-06 1.3e-06 3.53e-06 1.54e-06 9.24e-07 4.11e-07 7.78e-07 2.2e-06 5.88e-07 1.63e-07 4.99e-07 1.95e-06 1.77e-06 3.12e-07 2.26e-06 2.55e-07 6.16e-07 3.24e-07 1.63e-06 1.09e-06 1.29e-06 4.09e-08 4.42e-08 3.82e-07 4.4e-07 4.86e-07 9.77e-08 8.33e-08 5.98e-08 8.34e-08 4.6e-08 9.18e-06 6.04e-08 1.13e-08 3.48e-08 1.2e-07 9.73e-08 3.78e-09 5.49e-08
ENSG00000185480 PARPBP 405953 2.77e-06 2.62e-06 2.91e-07 1.74e-06 2.98e-07 7.82e-07 1.48e-06 2.62e-07 1.67e-06 3.09e-07 2.77e-06 1.3e-06 4.32e-06 2.22e-06 1.35e-06 6.89e-07 8.37e-07 2.68e-06 8.15e-07 2.68e-07 7.96e-07 2.75e-06 2.54e-06 5.98e-07 2.41e-06 3.79e-07 7.97e-07 4.75e-07 1.73e-06 1.32e-06 2.02e-06 2.93e-08 8.37e-08 6.68e-07 5.25e-07 6.32e-07 1.12e-07 9.84e-08 6.01e-08 5.8e-08 3.92e-08 1.3e-05 6.12e-08 1.75e-08 6.59e-08 2.14e-07 1.11e-07 1.93e-09 5.43e-08