logo

Genes within 1Mb (chr12:102514572:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 5.71e-01 0.033 0.0581 0.096 B L1
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 1.70e-01 0.139 0.101 0.096 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 1.49e-01 0.0887 0.0612 0.096 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 9.80e-01 0.00222 0.089 0.096 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0842 0.0694 0.096 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 1.21e-01 0.122 0.0785 0.096 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 6.15e-01 0.0631 0.125 0.096 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 9.41e-01 0.00792 0.107 0.096 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 1.41e-01 0.176 0.12 0.096 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 3.40e-01 0.107 0.112 0.096 B L1
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 2.25e-01 -0.113 0.0927 0.096 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 3.81e-01 0.11 0.125 0.096 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0261 0.087 0.096 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.46e-03 -0.207 0.0643 0.096 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 7.21e-01 0.0434 0.121 0.096 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0297 0.115 0.096 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 5.43e-01 0.0759 0.125 0.096 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.63e-02 -0.163 0.0812 0.096 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 2.02e-01 -0.103 0.0807 0.096 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 6.71e-01 0.0493 0.116 0.096 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0425 0.132 0.096 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0344 0.131 0.095 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 3.44e-03 0.347 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 9.78e-01 0.00362 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 5.26e-01 0.0797 0.126 0.095 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 3.87e-01 0.0897 0.104 0.095 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 1.54e-01 -0.167 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0204 0.137 0.095 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0546 0.112 0.096 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0796 0.0949 0.096 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.81e-01 -0.084 0.119 0.096 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 2.72e-02 -0.237 0.106 0.096 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0403 0.0877 0.096 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 2.19e-01 -0.147 0.119 0.094 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 3.66e-01 0.1 0.111 0.094 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0908 0.0801 0.094 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.59e-02 -0.215 0.0883 0.094 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 1.44e-01 0.186 0.127 0.094 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0144 0.15 0.094 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 1.16e-01 0.0699 0.0443 0.096 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 3.11e-01 0.086 0.0847 0.096 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0431 0.124 0.096 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0939 0.0892 0.096 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 2.76e-02 -0.199 0.0895 0.096 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 8.58e-01 0.0194 0.109 0.096 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 1.48e-02 -0.312 0.127 0.096 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0687 0.0903 0.096 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 1.56e-01 -0.149 0.105 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 7.51e-01 0.00914 0.0288 0.097 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 2.24e-01 -0.181 0.149 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 7.06e-01 0.0417 0.11 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0688 0.157 0.097 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0188 0.149 0.097 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0593 0.15 0.097 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 7.26e-01 0.0431 0.123 0.097 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0404 0.131 0.097 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0641 0.124 0.097 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0325 0.116 0.097 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 9.19e-01 0.00595 0.0586 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0431 0.146 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 7.62e-01 0.0237 0.0784 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 3.78e-01 0.102 0.116 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.98e-01 -0.154 0.119 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 2.49e-01 0.148 0.128 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 4.73e-01 -0.097 0.135 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 3.47e-01 0.121 0.129 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 7.31e-01 0.0488 0.142 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00878 0.136 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0744 0.0532 0.097 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 6.35e-01 0.067 0.141 0.097 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 1.91e-01 -0.121 0.0918 0.097 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0772 0.126 0.097 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 2.29e-01 -0.148 0.123 0.097 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0329 0.129 0.097 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 5.42e-01 0.0811 0.133 0.097 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0962 0.134 0.097 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 3.91e-01 0.117 0.136 0.097 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 8.16e-01 0.0289 0.124 0.097 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0628 0.0737 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 4.05e-01 0.111 0.133 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 6.80e-02 0.126 0.0689 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 8.16e-01 0.0229 0.0982 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0733 0.0984 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 1.06e-01 0.172 0.106 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 2.87e-01 0.154 0.145 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0257 0.14 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 4.93e-01 0.097 0.141 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0684 0.132 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 5.06e-02 -0.127 0.0647 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0562 0.134 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 4.02e-01 0.0601 0.0715 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0845 0.111 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0214 0.123 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 2.79e-02 0.267 0.121 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0718 0.128 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 7.40e-01 0.0459 0.138 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 4.08e-01 -0.123 0.148 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 6.41e-02 0.236 0.127 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0107 0.15 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 3.49e-01 0.14 0.149 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 1.89e-01 0.172 0.13 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 3.11e-01 0.148 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0155 0.136 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0746 0.108 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 4.30e-01 0.0985 0.125 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 8.13e-01 0.0229 0.0963 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 7.62e-03 -0.21 0.0781 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 6.32e-01 0.0614 0.128 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 2.65e-01 -0.126 0.112 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 7.15e-01 0.0475 0.13 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 8.85e-01 0.0146 0.101 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.04e-02 -0.197 0.0761 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 4.27e-01 -0.104 0.131 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0981 0.133 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 9.37e-01 0.0101 0.128 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.46e-01 0.0942 0.123 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 9.86e-01 0.00193 0.113 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 2.72e-01 -0.153 0.139 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 1.23e-01 0.189 0.122 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 7.18e-01 0.0455 0.126 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 1.47e-01 -0.146 0.1 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0201 0.115 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 5.46e-01 0.0861 0.142 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0377 0.138 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0106 0.136 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 6.46e-01 0.0622 0.135 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.49e-01 -0.092 0.121 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.32e-01 -0.139 0.0918 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 3.14e-01 -0.143 0.142 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0966 0.14 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 3.46e-01 -0.135 0.142 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 7.67e-01 0.038 0.128 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0134 0.132 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 9.56e-01 0.00701 0.127 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 5.70e-01 0.0787 0.138 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 7.10e-01 0.0508 0.136 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 4.26e-01 -0.108 0.135 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 7.97e-01 -0.033 0.128 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 2.76e-02 -0.3 0.135 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 4.66e-01 0.0897 0.123 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 6.36e-02 0.251 0.134 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000159 0.135 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 2.53e-01 -0.055 0.0481 0.097 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 8.45e-02 -0.233 0.134 0.097 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0823 0.132 0.097 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 2.77e-01 0.127 0.117 0.097 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0845 0.119 0.097 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 7.90e-01 0.036 0.135 0.097 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 1.68e-01 -0.174 0.126 0.097 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 2.49e-01 -0.152 0.132 0.097 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 1.52e-01 -0.167 0.116 0.097 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 3.93e-02 -0.307 0.148 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 9.28e-01 0.00977 0.108 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 7.43e-01 0.0411 0.125 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 6.47e-02 -0.238 0.128 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 4.26e-01 0.108 0.136 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 4.92e-01 0.0987 0.143 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 2.46e-01 0.152 0.131 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 3.95e-02 0.263 0.127 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 7.61e-02 -0.172 0.0963 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.26e-01 -0.171 0.111 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 3.30e-03 0.395 0.133 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 8.77e-01 0.0237 0.153 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 6.35e-01 0.0649 0.136 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 6.03e-01 0.0728 0.14 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0371 0.112 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 7.07e-01 0.0524 0.14 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 4.63e-01 -0.105 0.143 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0386 0.141 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 2.40e-01 -0.156 0.133 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.125 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.66e-01 -0.069 0.0946 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 4.69e-03 -0.293 0.103 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0948 0.136 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 2.32e-02 -0.333 0.145 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 4.48e-01 0.0842 0.11 0.089 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 8.34e-02 0.257 0.147 0.089 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 3.06e-01 0.118 0.115 0.089 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.57e-01 0.124 0.166 0.089 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 2.39e-01 -0.159 0.135 0.089 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0265 0.137 0.089 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 4.57e-01 0.119 0.159 0.089 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 9.35e-01 0.0116 0.142 0.089 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0568 0.146 0.089 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 8.70e-01 0.0221 0.135 0.089 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 4.84e-02 0.0965 0.0486 0.093 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 6.94e-01 0.039 0.0989 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 9.09e-01 0.0149 0.131 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.09e-01 0.0802 0.0969 0.093 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 3.64e-01 -0.103 0.114 0.093 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 5.90e-01 0.0526 0.0976 0.093 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 2.37e-01 -0.149 0.125 0.093 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 4.93e-01 0.0621 0.0904 0.093 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0457 0.0989 0.093 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 4.83e-01 -0.096 0.137 0.096 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 4.25e-01 0.114 0.142 0.096 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0697 0.124 0.096 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0793 0.114 0.096 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 1.32e-01 0.174 0.115 0.096 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0724 0.139 0.088 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 7.69e-02 0.239 0.134 0.088 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 4.18e-01 0.142 0.175 0.088 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 8.52e-01 0.0287 0.154 0.088 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0297 0.12 0.088 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 8.39e-01 0.0219 0.108 0.088 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00653 0.137 0.088 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 2.15e-01 0.157 0.126 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0693 0.0954 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0144 0.127 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 5.56e-02 -0.21 0.109 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0527 0.0938 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0501 0.137 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 3.28e-01 -0.103 0.105 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00817 0.128 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 6.03e-02 -0.244 0.129 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0914 0.101 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0244 0.172 0.094 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0746 0.162 0.094 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 2.30e-02 -0.275 0.12 0.094 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 7.32e-02 -0.281 0.156 0.094 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 8.64e-01 0.0274 0.16 0.094 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 2.96e-02 -0.34 0.155 0.094 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0626 0.157 0.094 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 3.99e-01 -0.121 0.143 0.094 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 9.75e-01 0.00442 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 1.14e-01 0.204 0.129 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 6.55e-02 -0.279 0.151 0.096 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.51e-02 -0.344 0.14 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 8.43e-01 0.0247 0.124 0.096 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 5.61e-02 -0.26 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 2.08e-01 -0.159 0.126 0.09 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 8.97e-02 -0.256 0.15 0.09 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0527 0.122 0.09 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0675 0.114 0.09 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0607 0.179 0.082 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0394 0.156 0.082 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 3.03e-01 -0.17 0.164 0.082 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0678 0.151 0.082 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0415 0.116 0.082 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0814 0.155 0.082 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 1.54e-01 0.22 0.154 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0309 0.068 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0377 0.137 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0362 0.0718 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 7.57e-01 0.035 0.113 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.88e-01 -0.129 0.0978 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 6.28e-01 0.0571 0.118 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 8.51e-01 0.0255 0.136 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 8.45e-01 0.0208 0.106 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 3.54e-01 0.131 0.142 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 6.36e-01 0.0666 0.141 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 32828 sc-eQTL 7.65e-02 -0.138 0.0774 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 2.26e-01 0.155 0.127 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 1.60e-01 0.0884 0.0627 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0268 0.0902 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0783 0.0942 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 2.86e-02 0.215 0.0978 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 775100 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00947 0.143 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -981438 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0169 0.136 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 7.27e-01 0.0508 0.145 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 316987 sc-eQTL 3.88e-01 0.114 0.132 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 7.52e-01 0.0369 0.117 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 2.23e-01 -0.115 0.0941 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0282 0.122 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 4.52e-02 -0.213 0.106 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0908 0.0875 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 9.46e-02 -0.221 0.132 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 3.71e-01 -0.104 0.116 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 8.53e-03 -0.366 0.138 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 9.14e-02 -0.196 0.116 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0167 0.1 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 394452 sc-eQTL 9.84e-01 0.00255 0.126 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 817625 sc-eQTL 2.34e-01 0.146 0.122 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 683613 sc-eQTL 1.80e-01 -0.113 0.0838 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 452423 sc-eQTL 1.03e-01 -0.158 0.0964 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 636992 sc-eQTL 1.98e-01 0.168 0.13 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 394387 sc-eQTL 3.16e-01 -0.154 0.153 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 817625 eQTL 1.28e-02 -0.0967 0.0388 0.0 0.0 0.114
ENSG00000120860 WASHC3 452423 pQTL 0.00246 -0.0439 0.0145 0.0 0.0 0.113
ENSG00000120860 WASHC3 452423 eQTL 2.99e-09 -0.113 0.0189 0.0 0.0 0.114
ENSG00000258230 AC063950.1 740817 eQTL 0.0294 -0.0924 0.0423 0.0 0.0 0.114

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 817625 2.76e-07 1.34e-07 5.03e-08 1.83e-07 1.01e-07 9.91e-08 1.6e-07 5.53e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.57e-07 1.05e-07 1.59e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.23e-08 4.01e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.3e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.91e-08 1.63e-07 1.25e-07 1.1e-07 9.92e-08 1.23e-07 9.49e-08 1.06e-07 3.08e-08 3.96e-08 8.56e-08 5.99e-08 3.28e-08 5.29e-08 8.63e-08 6.71e-08 4.55e-08 4.92e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.16e-08 3.83e-08 1.87e-08 1.21e-07 1.88e-09 5e-08
ENSG00000120860 WASHC3 452423 7.76e-07 4.63e-07 1.05e-07 3.58e-07 9.82e-08 1.71e-07 4.93e-07 1.09e-07 3.82e-07 2.16e-07 5.29e-07 3.36e-07 6.77e-07 1.1e-07 1.71e-07 2.05e-07 2.07e-07 3.58e-07 1.77e-07 1.28e-07 1.89e-07 3.15e-07 3.11e-07 1.29e-07 6.59e-07 2.4e-07 2.24e-07 2.24e-07 3e-07 4.72e-07 2.54e-07 7.49e-08 5.68e-08 1.39e-07 2.61e-07 8.75e-08 1.05e-07 7.86e-08 4.44e-08 5.32e-08 8.42e-08 4.42e-07 1.7e-08 1.75e-08 1.15e-07 1.84e-08 7.25e-08 3.25e-09 5.15e-08