logo

Genes within 1Mb (chr12:102464310:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 1.91e-01 0.066 0.0503 0.165 B L1
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.61e-01 0.123 0.0874 0.165 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 4.83e-01 0.0375 0.0533 0.165 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0137 0.0772 0.165 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 2.82e-03 -0.179 0.0592 0.165 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 5.72e-02 0.13 0.068 0.165 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 1.59e-01 0.153 0.108 0.165 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 3.52e-01 0.0971 0.104 0.165 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 1.50e-01 0.14 0.0968 0.165 B L1
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0831 0.0816 0.165 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0502 0.11 0.165 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0705 0.0764 0.165 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.73e-04 -0.214 0.0561 0.165 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.96e-01 -0.127 0.0983 0.165 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 4.84e-01 -0.075 0.107 0.165 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 2.99e-02 -0.152 0.0694 0.165 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 3.96e-02 -0.142 0.0688 0.165 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 6.07e-01 0.0513 0.0995 0.165 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0313 0.112 0.164 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 4.20e-01 0.0828 0.102 0.164 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 2.86e-01 -0.12 0.113 0.164 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 7.84e-01 0.0295 0.108 0.164 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 1.66e-01 0.123 0.0885 0.164 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000741 0.117 0.164 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0934 0.0936 0.165 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0602 0.0793 0.165 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 9.28e-01 0.00902 0.0996 0.165 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 5.44e-03 -0.248 0.0883 0.165 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 7.55e-01 0.0229 0.0733 0.165 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.75e-01 -0.136 0.1 0.163 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 8.73e-01 0.015 0.0934 0.163 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 8.60e-02 -0.116 0.0672 0.163 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.02e-03 -0.245 0.0735 0.163 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 3.35e-01 0.104 0.107 0.163 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 5.08e-01 0.0834 0.126 0.163 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 2.34e-01 0.0445 0.0373 0.165 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 7.71e-02 0.126 0.0708 0.165 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 1.33e-01 -0.156 0.104 0.165 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0711 0.075 0.165 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 2.37e-03 -0.229 0.0744 0.165 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0176 0.0912 0.165 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 8.47e-01 0.0147 0.076 0.165 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0649 0.0882 0.165 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0249 0.0239 0.158 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 4.98e-01 0.0842 0.124 0.158 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 7.15e-01 0.0335 0.0917 0.158 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 9.41e-01 0.00967 0.13 0.158 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 8.78e-02 -0.211 0.123 0.158 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 6.05e-01 0.0644 0.124 0.158 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0714 0.102 0.158 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 1.05e-01 -0.166 0.102 0.158 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0416 0.0967 0.158 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 2.29e-01 0.0603 0.05 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00683 0.125 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0723 0.0669 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0741 0.099 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 4.12e-03 -0.291 0.1 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 1.99e-02 0.255 0.108 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 6.40e-01 0.0541 0.115 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 2.25e-01 -0.147 0.121 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 7.25e-02 0.208 0.115 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 6.04e-01 0.024 0.0462 0.166 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0356 0.122 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 1.69e-01 -0.11 0.0794 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 2.31e-01 -0.131 0.109 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 4.39e-02 -0.214 0.106 0.166 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 4.41e-01 0.0862 0.112 0.166 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0439 0.115 0.166 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0848 0.118 0.166 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 9.86e-01 0.00195 0.107 0.166 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 6.46e-02 -0.118 0.0636 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 2.34e-01 0.138 0.116 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 3.26e-01 0.0593 0.0602 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 6.50e-01 0.0387 0.0853 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.46e-02 -0.208 0.0844 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 2.28e-01 0.112 0.0924 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 1.53e-01 0.18 0.125 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 3.32e-01 0.119 0.122 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0054 0.115 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 4.01e-02 -0.114 0.055 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 8.10e-01 0.0274 0.114 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00533 0.0609 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0495 0.0944 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 9.14e-01 0.0114 0.105 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 6.81e-02 0.189 0.103 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 7.41e-01 0.0362 0.109 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0911 0.126 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 1.16e-01 0.17 0.108 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00835 0.125 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0736 0.125 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 3.22e-01 0.108 0.109 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 2.37e-01 0.145 0.122 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 2.83e-01 -0.102 0.095 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0562 0.11 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0459 0.0846 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.50e-03 -0.219 0.0682 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 6.52e-01 0.044 0.0975 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0976 0.112 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 9.58e-01 0.00458 0.0871 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 3.55e-03 -0.193 0.0656 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.28e-01 -0.175 0.114 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 7.80e-02 -0.194 0.11 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0854 0.106 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.0969 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 6.28e-01 0.0511 0.105 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 8.51e-01 0.0203 0.108 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0722 0.0863 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0834 0.0985 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 9.20e-01 0.0124 0.123 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00107 0.114 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 1.99e-01 -0.145 0.113 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 5.82e-01 -0.056 0.102 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 3.23e-02 -0.165 0.0765 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 9.85e-01 0.00223 0.119 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 9.27e-01 0.011 0.12 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0483 0.108 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.111 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 5.90e-01 0.0578 0.107 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 7.58e-01 0.036 0.117 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 2.77e-01 -0.126 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 3.35e-01 -0.106 0.109 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 3.81e-03 -0.337 0.115 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 8.63e-01 0.0182 0.105 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 1.85e-01 0.154 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0458 0.0413 0.167 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 4.92e-01 -0.08 0.116 0.167 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 5.41e-02 -0.217 0.112 0.167 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 4.28e-01 0.0796 0.1 0.167 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 9.09e-03 -0.264 0.1 0.167 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 7.32e-01 0.0398 0.116 0.167 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 2.03e-01 -0.144 0.113 0.167 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 9.73e-01 0.00346 0.1 0.167 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.31e-02 -0.31 0.124 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 2.52e-01 -0.104 0.0906 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 7.47e-01 0.034 0.105 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 3.07e-02 -0.233 0.107 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 3.70e-01 0.102 0.114 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 1.73e-01 0.164 0.12 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 5.86e-02 0.211 0.111 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 6.40e-01 0.0512 0.109 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 1.12e-02 -0.208 0.0813 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 9.58e-03 -0.245 0.0935 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 3.22e-01 0.114 0.115 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 9.42e-01 0.00944 0.13 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 8.04e-01 0.0287 0.116 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0372 0.119 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 1.85e-01 -0.126 0.095 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 8.34e-01 0.0248 0.118 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 2.83e-01 -0.131 0.121 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00683 0.12 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.62e-01 -0.158 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0321 0.106 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0567 0.0802 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 6.84e-03 -0.238 0.0872 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 7.31e-01 0.0398 0.115 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 3.26e-01 -0.123 0.124 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 7.17e-01 0.0335 0.092 0.159 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.33e-01 0.186 0.123 0.159 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 6.61e-01 0.0423 0.0961 0.159 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 3.06e-01 0.141 0.138 0.159 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0705 0.112 0.159 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 1.90e-01 0.149 0.113 0.159 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 4.18e-01 0.107 0.132 0.159 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 7.21e-01 0.0435 0.122 0.159 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 5.64e-01 0.065 0.112 0.159 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 5.53e-01 0.0247 0.0415 0.163 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 8.92e-01 0.0114 0.0837 0.163 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 8.01e-01 -0.028 0.111 0.163 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 6.41e-01 0.0383 0.082 0.163 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.83e-01 -0.128 0.096 0.163 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 4.40e-01 0.0639 0.0825 0.163 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 1.44e-02 0.186 0.0755 0.163 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0077 0.0837 0.163 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0167 0.117 0.165 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 4.96e-01 -0.083 0.122 0.165 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 6.74e-02 -0.194 0.106 0.165 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0776 0.0974 0.165 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 6.62e-01 0.0512 0.117 0.163 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 4.82e-01 0.0803 0.114 0.163 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 2.99e-01 0.153 0.147 0.163 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0987 0.13 0.163 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.101 0.163 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 4.03e-01 0.0968 0.115 0.163 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 6.26e-01 0.0517 0.106 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00798 0.08 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 5.21e-01 0.0683 0.106 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.26e-01 -0.141 0.0917 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0184 0.0786 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 2.29e-01 -0.138 0.115 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0779 0.088 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 8.76e-01 0.0168 0.107 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 2.26e-02 -0.248 0.108 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000621 0.0851 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 6.10e-01 0.0776 0.152 0.17 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0227 0.142 0.17 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 3.77e-02 -0.222 0.106 0.17 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 2.52e-01 -0.159 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0644 0.141 0.17 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0295 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 1.31e-01 -0.191 0.126 0.17 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 9.85e-01 0.00223 0.119 0.167 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 5.97e-01 0.0577 0.109 0.167 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 1.29e-01 -0.194 0.127 0.167 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.34e-03 -0.38 0.117 0.167 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 4.61e-01 0.0773 0.105 0.167 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 4.99e-01 -0.079 0.117 0.161 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 2.74e-01 -0.118 0.108 0.161 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 3.75e-01 -0.115 0.129 0.161 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.99e-01 -0.134 0.104 0.161 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 2.81e-01 0.105 0.0969 0.161 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.88e-01 -0.184 0.139 0.164 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 3.56e-01 -0.113 0.122 0.164 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 1.19e-03 -0.412 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 9.15e-01 0.0127 0.118 0.164 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 1.13e-01 -0.144 0.0904 0.164 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 7.28e-01 0.0422 0.121 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 1.26e-01 0.0892 0.0582 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0291 0.117 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0671 0.0616 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0704 0.097 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 3.20e-04 -0.3 0.0819 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 7.69e-02 0.178 0.1 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 9.88e-01 0.00171 0.117 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 2.71e-01 -0.134 0.122 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 1.08e-01 0.194 0.12 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -17434 sc-eQTL 1.33e-02 -0.166 0.0665 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 1.22e-01 0.17 0.11 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 4.09e-01 0.0451 0.0544 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0148 0.0781 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 8.07e-02 -0.142 0.0811 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 6.68e-02 0.157 0.0849 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 724838 sc-eQTL 2.17e-01 0.152 0.123 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 6.38e-01 0.0592 0.126 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 266725 sc-eQTL 2.17e-01 0.141 0.114 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0586 0.098 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0517 0.0792 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 7.63e-01 0.0309 0.102 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 2.45e-02 -0.201 0.0887 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0279 0.0736 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0775 0.113 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0952 0.099 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 8.58e-02 -0.206 0.119 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.71e-02 -0.236 0.0983 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 1.73e-01 0.117 0.0856 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 344190 sc-eQTL 8.05e-01 0.0266 0.107 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 767363 sc-eQTL 7.41e-01 0.0348 0.105 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 633351 sc-eQTL 7.38e-02 -0.128 0.0713 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 402161 sc-eQTL 1.07e-02 -0.21 0.0815 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 586730 sc-eQTL 8.83e-01 0.0164 0.111 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 344125 sc-eQTL 7.48e-01 -0.042 0.131 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 767363 eQTL 2.65e-03 -0.096 0.0319 0.0 0.0 0.176
ENSG00000120860 WASHC3 402161 pQTL 0.000152 -0.0442 0.0116 0.0 0.0 0.173
ENSG00000120860 WASHC3 402161 eQTL 1.25e-12 -0.111 0.0154 0.0 0.0 0.176

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -17434 4.97e-05 3.76e-05 9.55e-06 1.55e-05 5.74e-06 1.24e-05 4.07e-05 3.8e-06 3.23e-05 1.55e-05 3.26e-05 1.86e-05 4.74e-05 1.5e-05 8e-06 2.25e-05 2.66e-05 2.39e-05 7.83e-06 5.73e-06 1.5e-05 3.78e-05 3.24e-05 9.15e-06 5.46e-05 8.26e-06 1.62e-05 1.19e-05 3.09e-05 2.88e-05 1.73e-05 1.64e-06 1.96e-06 7.07e-06 1.25e-05 6.24e-06 3.2e-06 3.11e-06 4.29e-06 2.93e-06 1.72e-06 4.06e-05 5.53e-06 5.27e-07 2.95e-06 3.65e-06 4.14e-06 1.64e-06 1.46e-06
ENSG00000111666 CHPT1 767363 2.76e-07 1.33e-07 3.71e-08 2.35e-07 1.03e-07 8.21e-08 1.99e-07 5.33e-08 1.45e-07 4.57e-08 1.57e-07 8.55e-08 2.24e-07 7.64e-08 6.17e-08 7.37e-08 3.93e-08 1.27e-07 5.97e-08 4.07e-08 1.22e-07 1.27e-07 1.44e-07 4.26e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.11e-07 1.04e-07 1.12e-07 1.1e-07 9.7e-08 3.89e-08 3.09e-08 1.03e-07 3.12e-08 2.79e-08 5.01e-08 9.49e-08 6.71e-08 3.82e-08 3.92e-08 1.5e-07 4.04e-08 1.73e-08 7.26e-08 1.8e-08 1.26e-07 4.6e-09 4.74e-08
ENSG00000120860 WASHC3 402161 1.28e-06 8.81e-07 1.23e-07 1.14e-06 2.48e-07 4.43e-07 1.08e-06 8.86e-08 7.15e-07 2.37e-07 1.08e-06 3.91e-07 1.75e-06 2.09e-07 3.27e-07 2.18e-07 5.06e-07 5.16e-07 2.88e-07 1.28e-07 3.24e-07 5.34e-07 5.49e-07 1.23e-07 1.14e-06 2.54e-07 2.56e-07 4.92e-07 6.76e-07 4.9e-07 3.1e-07 6.78e-08 5.48e-08 6.16e-07 4.25e-07 4.75e-07 8.28e-08 7.75e-08 8.61e-08 9.81e-09 3.64e-08 1.22e-06 4.71e-08 1.91e-07 9.95e-08 1.24e-07 1.04e-07 1.93e-09 5e-08
ENSG00000136048 \N 586730 4.89e-07 2.89e-07 6.04e-08 3.99e-07 9.93e-08 1.57e-07 4.14e-07 5.53e-08 2.01e-07 7.6e-08 2.38e-07 1.31e-07 5.81e-07 8.55e-08 6.12e-08 7.98e-08 5.42e-08 2.43e-07 7.11e-08 4.95e-08 1.35e-07 1.81e-07 2e-07 2.79e-08 2.48e-07 1.31e-07 1.12e-07 1.7e-07 1.4e-07 1.06e-07 1.21e-07 3.87e-08 3.43e-08 1.77e-07 1.97e-07 9.51e-08 4.41e-08 8.61e-08 4.75e-08 8.3e-08 5.37e-08 2.9e-07 5.2e-08 1.92e-08 3.83e-08 1.75e-08 1.21e-07 4.14e-09 4.91e-08
ENSG00000257202 \N 539591 6.97e-07 4e-07 6.45e-08 4.37e-07 9.45e-08 1.97e-07 5.28e-07 5.85e-08 2.56e-07 1.03e-07 3.32e-07 1.57e-07 7.93e-07 1.01e-07 7.98e-08 9.6e-08 8.42e-08 2.93e-07 9.69e-08 5.87e-08 1.68e-07 2.24e-07 2.56e-07 3.4e-08 3.41e-07 1.56e-07 1.22e-07 1.97e-07 1.98e-07 1.33e-07 1.27e-07 3.1e-08 3.29e-08 2.19e-07 3.05e-07 1.8e-07 5.02e-08 8.37e-08 5.25e-08 5.88e-08 5.8e-08 4.04e-07 4.87e-08 4.15e-08 2.64e-08 1.33e-08 1e-07 3.99e-09 4.79e-08