logo

Genes within 1Mb (chr12:102396414:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 2.35e-01 0.0537 0.0451 0.212 B L1
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 4.15e-01 0.0643 0.0787 0.212 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 6.65e-01 0.0207 0.0479 0.212 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 6.95e-01 0.0272 0.0693 0.212 B L1
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 4.52e-01 0.0509 0.0676 0.212 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 4.02e-03 -0.155 0.0532 0.212 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 1.66e-02 0.146 0.0607 0.212 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 4.08e-01 0.081 0.0976 0.212 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 4.16e-01 0.0762 0.0934 0.212 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 1.22e-01 0.135 0.0868 0.212 B L1
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.15e-01 0.0173 0.074 0.212 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0695 0.0998 0.212 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 6.31e-01 0.0333 0.0692 0.212 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 8.77e-01 0.0117 0.0749 0.212 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.57e-07 -0.267 0.0491 0.212 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0539 0.0898 0.212 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0891 0.0972 0.212 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0823 0.0637 0.212 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 3.56e-01 0.0821 0.0888 0.212 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 6.99e-04 -0.212 0.0615 0.212 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 7.43e-01 0.0298 0.0906 0.212 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0202 0.102 0.212 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.35e-01 0.0902 0.0933 0.212 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 2.20e-01 -0.126 0.102 0.212 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 2.76e-01 0.124 0.114 0.212 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0119 0.0982 0.212 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 4.31e-01 0.0638 0.0809 0.212 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 4.35e-01 0.0834 0.107 0.212 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0859 0.0851 0.212 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.98e-01 -0.061 0.0721 0.212 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0779 0.0904 0.212 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0474 0.0929 0.212 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.14e-04 -0.31 0.0789 0.212 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0387 0.0666 0.212 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0209 0.0912 0.21 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 8.88e-01 0.012 0.0847 0.21 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0694 0.0612 0.21 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0619 0.0907 0.21 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 7.97e-04 -0.227 0.0666 0.21 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 4.89e-01 0.0675 0.0973 0.21 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 7.09e-01 0.0426 0.114 0.21 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 5.61e-01 0.02 0.0344 0.212 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.42e-02 0.113 0.0651 0.212 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 2.80e-01 -0.103 0.0955 0.212 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0393 0.069 0.212 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0122 0.0786 0.212 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 6.10e-03 -0.19 0.0687 0.212 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 8.88e-01 0.0118 0.0838 0.212 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 4.73e-01 0.0501 0.0698 0.212 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0503 0.0812 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0335 0.0217 0.212 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 4.44e-01 0.0867 0.113 0.212 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 7.26e-01 0.0293 0.0836 0.212 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 6.63e-01 0.0518 0.119 0.212 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 1.43e-01 0.173 0.118 0.212 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 2.62e-02 -0.25 0.111 0.212 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 4.05e-01 0.0946 0.113 0.212 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0302 0.0932 0.212 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0745 0.0937 0.212 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 6.97e-01 0.0344 0.0881 0.212 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 3.01e-01 0.0469 0.0452 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0583 0.113 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0558 0.0605 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0938 0.0893 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0291 0.112 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 2.68e-02 -0.204 0.0915 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 9.40e-02 0.166 0.0986 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 4.16e-01 0.0849 0.104 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0607 0.109 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 1.64e-01 0.146 0.105 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 9.30e-01 0.00374 0.0424 0.213 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0302 0.112 0.213 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0406 0.073 0.213 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0674 0.0999 0.213 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0539 0.109 0.213 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 3.86e-02 -0.201 0.0967 0.213 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 9.15e-01 0.011 0.102 0.213 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 2.32e-01 -0.126 0.105 0.213 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0295 0.108 0.213 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0462 0.0981 0.213 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0833 0.0573 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 5.97e-01 0.0551 0.104 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.23e-01 0.0536 0.0541 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0324 0.0766 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 1.04e-02 0.259 0.1 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 9.13e-03 -0.199 0.0756 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 6.67e-01 0.0359 0.0833 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 1.35e-01 0.169 0.113 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 5.96e-01 0.0585 0.11 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0641 0.103 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 6.06e-02 -0.0943 0.05 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 5.03e-01 0.0693 0.103 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0248 0.0553 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 3.62e-01 0.0782 0.0855 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0428 0.109 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 9.55e-01 0.00533 0.095 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 7.40e-03 0.25 0.0925 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0639 0.099 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0973 0.114 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 6.64e-02 0.18 0.0977 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 5.24e-01 0.0734 0.115 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0405 0.115 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 4.28e-01 0.08 0.101 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 6.10e-01 -0.06 0.117 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 7.62e-01 0.0342 0.113 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0237 0.0858 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0686 0.0989 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 6.82e-01 0.0313 0.0763 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 7.36e-01 0.0305 0.0901 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.09e-05 -0.271 0.0601 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 9.00e-02 0.149 0.0873 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0995 0.101 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 1.71e-01 0.107 0.0781 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0306 0.0919 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 7.71e-04 -0.2 0.0587 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0683 0.104 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 6.11e-02 -0.188 0.0998 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00194 0.0969 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0327 0.099 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 5.79e-02 -0.168 0.088 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 7.68e-01 0.0281 0.0953 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 9.90e-01 0.00121 0.0977 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00822 0.0782 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 7.98e-01 0.0268 0.105 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0979 0.0889 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 8.51e-01 0.0209 0.111 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 7.06e-01 0.0388 0.103 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 1.50e-01 -0.147 0.101 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 9.29e-01 0.00813 0.0915 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 8.38e-01 0.0217 0.106 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 6.39e-04 -0.235 0.0677 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0586 0.107 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0155 0.109 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0264 0.0974 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0469 0.101 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 2.66e-01 0.12 0.108 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 7.99e-01 0.0247 0.0967 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 9.99e-01 0.000155 0.105 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 2.74e-01 -0.116 0.106 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0384 0.1 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 2.25e-03 -0.325 0.105 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 7.64e-01 0.0331 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 6.65e-01 0.0418 0.0964 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 2.34e-01 0.127 0.106 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 5.27e-01 0.0242 0.0383 0.214 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 6.60e-01 0.0474 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 8.18e-02 -0.182 0.104 0.214 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 5.04e-01 0.0621 0.0927 0.214 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0648 0.113 0.214 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 3.01e-02 -0.204 0.0933 0.214 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 2.67e-01 0.119 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 6.86e-01 0.0425 0.105 0.214 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0312 0.0928 0.214 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 7.73e-02 -0.201 0.113 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0971 0.0823 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 8.04e-01 0.0237 0.0954 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 8.81e-02 -0.185 0.108 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 8.56e-02 -0.169 0.0977 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 3.20e-01 0.103 0.103 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 4.78e-01 0.0776 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 3.53e-02 0.212 0.1 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 4.60e-01 0.0732 0.0988 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 3.43e-02 -0.158 0.074 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0121 0.1 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 4.59e-03 -0.242 0.0844 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 3.65e-01 0.0946 0.104 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00746 0.118 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 5.73e-01 0.0586 0.104 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0569 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0903 0.0854 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 9.81e-02 0.189 0.114 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 5.64e-01 0.0613 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0955 0.109 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0376 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0458 0.102 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0553 0.0954 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 7.77e-01 0.0206 0.0725 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 3.16e-01 -0.102 0.101 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 5.23e-03 -0.222 0.0787 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00479 0.104 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0595 0.113 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 6.98e-01 0.0315 0.081 0.196 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 3.30e-01 0.106 0.109 0.196 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 4.24e-01 0.0678 0.0844 0.196 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 3.13e-01 0.123 0.121 0.196 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 9.46e-02 -0.143 0.0848 0.196 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0994 0.0987 0.196 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 1.09e-01 0.161 0.0994 0.196 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 2.63e-01 0.131 0.116 0.196 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 1.66e-01 0.148 0.106 0.196 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 3.77e-01 0.0875 0.0987 0.196 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0204 0.0373 0.211 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 4.39e-01 0.0583 0.0751 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 7.99e-01 0.0254 0.0997 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 8.31e-01 0.0157 0.0738 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0484 0.0796 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 6.33e-02 -0.16 0.0859 0.211 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 2.98e-01 0.0773 0.0741 0.211 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 1.06e-02 0.175 0.0677 0.211 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 4.61e-01 0.0556 0.0752 0.211 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.26e-01 0.0236 0.107 0.212 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.98e-01 -0.094 0.111 0.212 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 1.31e-01 -0.147 0.0966 0.212 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 5.34e-01 -0.068 0.109 0.212 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.55e-01 -0.126 0.0884 0.212 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 7.25e-01 0.0365 0.103 0.217 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.67e-01 0.091 0.101 0.217 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 7.71e-01 -0.038 0.13 0.217 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0223 0.122 0.217 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 3.41e-01 -0.109 0.115 0.217 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 3.96e-01 0.076 0.0894 0.217 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 1.26e-01 0.156 0.101 0.217 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00226 0.0971 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0163 0.0732 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0807 0.0969 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 8.46e-01 -0.019 0.0978 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.32e-01 -0.127 0.0839 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0674 0.0718 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 3.03e-01 -0.108 0.105 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0683 0.0803 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 8.90e-01 0.0136 0.0978 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00651 0.108 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.46e-03 -0.313 0.0972 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0355 0.0776 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 7.16e-01 0.0487 0.133 0.224 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 5.42e-01 0.0763 0.125 0.224 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 7.40e-02 -0.168 0.0932 0.224 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 4.22e-01 0.105 0.13 0.224 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.12e-01 -0.193 0.121 0.224 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00804 0.124 0.224 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 1.29e-01 -0.184 0.12 0.224 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.111 0.224 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0215 0.107 0.216 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 9.89e-01 0.00135 0.0975 0.216 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 2.41e-01 -0.134 0.114 0.216 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0575 0.111 0.216 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.98e-05 -0.448 0.102 0.216 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 7.84e-01 0.0257 0.0936 0.216 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000411 0.106 0.208 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 1.62e-01 -0.137 0.0973 0.208 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0326 0.117 0.208 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 8.07e-01 -0.024 0.0984 0.208 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.14e-03 -0.304 0.0921 0.208 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0136 0.0881 0.208 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0242 0.126 0.212 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 5.73e-01 -0.062 0.11 0.212 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 2.56e-02 -0.258 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 1.53e-01 0.174 0.121 0.212 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0391 0.106 0.212 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0415 0.082 0.212 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 5.02e-01 0.0731 0.109 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 1.93e-01 0.0687 0.0526 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0621 0.106 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0409 0.0558 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0647 0.0876 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 6.99e-01 0.0395 0.102 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 7.75e-04 -0.253 0.0743 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 2.36e-01 0.108 0.0911 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0125 0.105 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0316 0.11 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 2.01e-01 0.14 0.109 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -85330 sc-eQTL 4.07e-02 -0.124 0.0604 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 4.25e-01 0.0796 0.0996 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 7.68e-01 0.0145 0.0492 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 7.10e-01 0.0262 0.0705 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 2.92e-02 0.214 0.0973 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 6.06e-02 -0.138 0.0731 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 6.08e-02 0.145 0.0767 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 656942 sc-eQTL 4.18e-01 0.0903 0.111 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 8.12e-01 0.027 0.114 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 198829 sc-eQTL 2.52e-01 0.119 0.103 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 3.30e-01 -0.087 0.0891 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0549 0.0721 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0571 0.0929 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00173 0.094 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 9.61e-03 -0.21 0.0805 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0807 0.0669 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0164 0.103 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 1.48e-01 -0.13 0.0896 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 8.83e-02 -0.185 0.108 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0167 0.104 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 6.95e-06 -0.397 0.0861 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 9.88e-01 0.00116 0.078 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 276294 sc-eQTL 2.36e-01 0.116 0.0971 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 699467 sc-eQTL 7.11e-01 0.0353 0.0951 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0704 0.065 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 988642 sc-eQTL 9.75e-01 0.00292 0.0927 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 334265 sc-eQTL 1.03e-02 -0.191 0.0739 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 518834 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00532 0.101 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 276229 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0281 0.119 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 699467 eQTL 4.76e-04 -0.102 0.0291 0.0 0.0 0.224
ENSG00000111670 GNPTAB 565455 eQTL 1.41e-02 -0.0396 0.0161 0.0 0.0 0.224
ENSG00000120860 WASHC3 334265 pQTL 0.00232 -0.0326 0.0107 0.0 0.0 0.217
ENSG00000120860 WASHC3 334265 eQTL 3.67e-22 -0.137 0.0138 0.0 0.0 0.224
ENSG00000136048 DRAM1 518834 eQTL 0.0177 0.039 0.0164 0.0 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -85330 9.14e-06 1.27e-05 1.04e-06 4.56e-06 1.89e-06 3.86e-06 9.48e-06 1.49e-06 7.77e-06 4.26e-06 1.2e-05 3.63e-06 1.58e-05 3.81e-06 2.66e-06 4.71e-06 3.84e-06 4.11e-06 2.58e-06 1.99e-06 3.42e-06 7.94e-06 6.94e-06 1.91e-06 1.31e-05 2.31e-06 4.15e-06 2.21e-06 7.08e-06 6.77e-06 5.79e-06 4.86e-07 5.38e-07 2.75e-06 3.81e-06 1.6e-06 1.33e-06 6.03e-07 1.37e-06 9.15e-07 2.54e-07 1.48e-05 1.57e-06 1.55e-07 7.74e-07 1.62e-06 1.14e-06 6.91e-07 4.98e-07
ENSG00000111666 CHPT1 699467 7.87e-07 8.69e-07 1.2e-07 3.22e-07 9.26e-08 2.64e-07 5.54e-07 7.79e-08 5.3e-07 2.16e-07 7.32e-07 2.98e-07 9.97e-07 2.14e-07 4.4e-07 1.39e-07 1.73e-07 4.11e-07 2.56e-07 1.3e-07 1.89e-07 3.76e-07 2.67e-07 1.15e-07 1.16e-06 1.9e-07 3.04e-07 2.19e-07 3.83e-07 2.89e-07 4.02e-07 5.08e-08 4.23e-08 2.08e-07 3.68e-07 1.52e-07 8.28e-08 5.36e-08 4.23e-08 3.12e-08 5.37e-08 5.87e-07 5.84e-08 1.56e-08 1.1e-07 4.53e-08 8.21e-08 1.11e-08 5.15e-08
ENSG00000120860 WASHC3 334265 1.65e-06 3.09e-06 2.2e-07 1.8e-06 4.51e-07 8.22e-07 1.19e-06 3.81e-07 1.66e-06 6.82e-07 2.02e-06 9.11e-07 3.48e-06 1.38e-06 1.26e-06 9.19e-07 1.12e-06 1.13e-06 5.86e-07 5.47e-07 7.61e-07 1.96e-06 1.09e-06 5.38e-07 2.84e-06 4.39e-07 1.03e-06 8.64e-07 1.75e-06 1.21e-06 1.29e-06 3.07e-07 1.94e-07 1.09e-06 9.17e-07 6.2e-07 7.83e-07 2.26e-07 5.05e-07 2.01e-07 8.55e-08 2.88e-06 4.47e-07 9.69e-08 2.86e-07 3.35e-07 1.87e-07 2.65e-07 2.61e-07
ENSG00000136048 DRAM1 518834 1.25e-06 1.08e-06 2.79e-07 1.1e-06 1.96e-07 4.57e-07 9.92e-07 2.06e-07 1.2e-06 3.09e-07 1.37e-06 5.51e-07 1.97e-06 2.86e-07 3.66e-07 3.41e-07 6.98e-07 5.71e-07 5.34e-07 4.38e-07 2.57e-07 9.14e-07 5.41e-07 3.21e-07 2.06e-06 2.71e-07 6.13e-07 4.75e-07 8.56e-07 8.36e-07 6.29e-07 5.45e-08 5.42e-08 6.95e-07 5.32e-07 4.74e-07 4.74e-07 9.84e-08 1.54e-07 4.09e-08 4.53e-08 1.53e-06 1.68e-07 5.64e-09 1.93e-07 1.12e-07 1.03e-07 8.37e-08 9.23e-08