logo

Genes within 1Mb (chr12:102365488:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 3.63e-01 0.0398 0.0436 0.226 B L1
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.06e-01 0.0287 0.076 0.226 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 4.49e-01 0.035 0.0462 0.226 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 5.68e-01 0.0382 0.0668 0.226 B L1
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.11e-01 0.0243 0.0653 0.226 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 3.21e-03 -0.153 0.0512 0.226 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 2.50e-02 0.132 0.0586 0.226 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 3.00e-01 0.0978 0.094 0.226 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 2.97e-01 0.0942 0.09 0.226 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 1.45e-01 0.122 0.0838 0.226 B L1
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.04e-01 0.0271 0.0714 0.226 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 7.09e-01 -0.036 0.0964 0.226 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 5.62e-01 0.0388 0.0668 0.226 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00248 0.0723 0.226 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 4.20e-07 -0.249 0.0477 0.226 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00791 0.0863 0.226 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0612 0.0934 0.226 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0777 0.0612 0.226 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 4.26e-01 0.0682 0.0854 0.226 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 4.13e-04 -0.212 0.059 0.226 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 4.16e-01 0.0708 0.0869 0.226 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 9.50e-01 0.00613 0.0985 0.223 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 4.39e-01 0.0697 0.09 0.223 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 2.25e-01 -0.12 0.0987 0.223 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.23e-01 0.0389 0.11 0.223 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0946 0.223 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 4.79e-01 0.0553 0.078 0.223 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 4.55e-01 0.0769 0.103 0.223 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 1.02e-01 -0.134 0.0814 0.226 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 7.84e-01 -0.019 0.0693 0.226 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 2.35e-01 -0.103 0.0866 0.226 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0684 0.0891 0.226 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.13e-03 -0.253 0.0765 0.226 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 7.79e-01 0.018 0.064 0.226 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0272 0.0883 0.225 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 7.37e-01 0.0276 0.082 0.225 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0542 0.0593 0.225 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0302 0.0879 0.225 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.28e-03 -0.211 0.0646 0.225 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 4.58e-01 0.0701 0.0941 0.225 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 9.15e-01 0.0118 0.111 0.225 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 5.01e-01 0.0224 0.0333 0.226 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 1.62e-01 0.0887 0.0632 0.226 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 2.76e-01 -0.101 0.0924 0.226 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0802 0.0667 0.226 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.42e-01 0.0251 0.0761 0.226 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 9.64e-03 -0.174 0.0666 0.226 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0286 0.0811 0.226 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 2.64e-01 0.0755 0.0674 0.226 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0191 0.0786 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0299 0.0209 0.23 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 5.55e-01 0.0644 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 6.08e-01 0.0414 0.0805 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 5.42e-01 0.0699 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 1.24e-01 0.176 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 4.91e-02 -0.214 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 8.79e-01 0.0137 0.0899 0.23 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0248 0.0905 0.23 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 3.51e-01 0.0794 0.0848 0.23 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 2.60e-01 0.0494 0.0437 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0841 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0328 0.0586 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0802 0.0865 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0173 0.108 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 4.65e-02 -0.178 0.0887 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 3.35e-01 0.0925 0.0958 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 5.39e-01 0.0621 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0603 0.106 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 6.16e-02 0.189 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 6.88e-01 0.0163 0.0405 0.228 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0377 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 9.38e-01 0.00541 0.0699 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0652 0.0956 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0775 0.104 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 7.11e-02 -0.168 0.0927 0.228 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0217 0.0979 0.228 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 2.97e-01 -0.105 0.101 0.228 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0335 0.103 0.228 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0406 0.0939 0.228 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0776 0.0552 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 8.89e-01 0.014 0.1 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 2.98e-01 0.0543 0.052 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0251 0.0738 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 5.97e-02 0.184 0.097 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 2.75e-03 -0.22 0.0725 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 4.71e-01 0.0578 0.0801 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 7.45e-02 0.194 0.108 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 8.14e-01 0.0249 0.106 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 6.08e-01 -0.051 0.0993 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 1.34e-01 -0.073 0.0485 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 3.91e-01 0.0858 0.0997 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0224 0.0535 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 3.65e-01 0.0751 0.0827 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.48e-01 -0.034 0.105 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0294 0.0919 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 8.39e-03 0.238 0.0895 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0663 0.0957 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0223 0.11 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.0948 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 5.38e-01 0.0683 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0459 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 3.03e-01 0.0997 0.0966 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 9.19e-01 0.0115 0.113 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 4.09e-01 0.0895 0.108 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00823 0.0829 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0263 0.0956 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 9.03e-01 0.00904 0.0737 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0195 0.087 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 9.68e-06 -0.263 0.058 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 6.94e-02 0.154 0.0841 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 3.01e-01 -0.101 0.0975 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 1.41e-01 0.111 0.0753 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0135 0.0886 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 9.24e-04 -0.19 0.0567 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0867 0.1 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 7.28e-02 -0.173 0.0961 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0177 0.0932 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 9.35e-01 0.0078 0.0953 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 2.64e-02 -0.189 0.0844 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 4.51e-01 0.0694 0.0918 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00495 0.0943 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00166 0.0754 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.78e-01 0.0284 0.101 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 2.11e-01 -0.108 0.0857 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 4.88e-01 0.0742 0.107 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.37e-01 0.0332 0.0987 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 2.35e-01 -0.116 0.0978 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 8.56e-01 0.016 0.0881 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 8.71e-01 0.0166 0.102 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.55e-03 -0.21 0.0654 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0904 0.103 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0331 0.105 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0503 0.0942 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0495 0.0975 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 2.01e-01 0.133 0.104 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 7.90e-01 0.0249 0.0936 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 6.85e-01 0.0415 0.102 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 3.40e-01 -0.098 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0239 0.0971 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 6.77e-03 -0.279 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 5.30e-01 0.067 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 7.82e-01 0.0258 0.0932 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 2.21e-01 0.126 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 7.46e-01 0.012 0.0371 0.227 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.24e-01 0.0368 0.104 0.227 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 1.21e-01 -0.157 0.101 0.227 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 7.19e-01 0.0323 0.0898 0.227 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00785 0.11 0.227 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 3.09e-02 -0.196 0.0903 0.227 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 3.45e-01 0.0978 0.103 0.227 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 7.52e-01 0.0322 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 9.79e-01 0.00237 0.0899 0.227 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 6.68e-02 -0.203 0.11 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0551 0.0804 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0131 0.093 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 3.91e-02 -0.218 0.105 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 2.65e-01 -0.107 0.0956 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 3.16e-01 0.101 0.101 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 6.86e-01 0.0431 0.106 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 3.77e-02 0.203 0.0968 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 4.00e-01 0.0804 0.0954 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 3.95e-02 -0.148 0.0715 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.07e-01 0.0366 0.097 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 7.52e-03 -0.221 0.0818 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 3.73e-01 0.09 0.101 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 9.77e-01 0.00325 0.114 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 3.86e-01 0.0866 0.0997 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0282 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0853 0.0821 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 8.15e-02 0.191 0.109 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 6.67e-01 0.044 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0774 0.105 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0118 0.103 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0644 0.0987 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 7.37e-01 -0.031 0.0924 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 5.94e-01 0.0375 0.0701 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0975 0.0982 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.35e-02 -0.19 0.0764 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 9.76e-01 0.00308 0.101 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0701 0.109 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0206 0.078 0.211 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 3.31e-01 0.102 0.105 0.211 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 1.95e-01 0.106 0.0809 0.211 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.211 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 1.25e-01 -0.127 0.0818 0.211 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0878 0.0951 0.211 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 1.13e-01 0.153 0.0958 0.211 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 1.17e-01 0.161 0.102 0.211 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 3.67e-01 0.086 0.0951 0.211 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0131 0.0362 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 5.32e-01 0.0456 0.0729 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 8.82e-01 0.0144 0.0968 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0119 0.0716 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0425 0.0772 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.11e-01 -0.134 0.0835 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 6.43e-01 0.0334 0.072 0.226 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 1.14e-02 0.168 0.0657 0.226 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 4.55e-01 0.0546 0.0729 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.44e-01 0.0339 0.104 0.226 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0955 0.108 0.226 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 2.06e-01 -0.119 0.0939 0.226 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0261 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.0858 0.226 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 4.83e-01 0.0697 0.0992 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 4.90e-01 0.0669 0.0967 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 8.29e-01 0.027 0.125 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0935 0.117 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0782 0.11 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 3.24e-01 0.0848 0.0857 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 1.78e-01 0.132 0.0975 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0387 0.0931 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000506 0.0703 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 1.03e-01 -0.152 0.0926 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0376 0.0939 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0795 0.0808 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0116 0.069 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 2.02e-01 -0.129 0.101 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 8.63e-01 0.0134 0.0774 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0941 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.03e-01 0.0396 0.104 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 8.83e-03 -0.249 0.0943 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 8.20e-01 -0.017 0.0747 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 7.10e-01 0.0475 0.127 0.239 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 6.11e-01 0.0609 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 6.85e-02 -0.163 0.089 0.239 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 4.19e-01 0.101 0.124 0.239 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.62e-01 -0.162 0.116 0.239 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 6.99e-01 0.0459 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 7.15e-02 -0.208 0.115 0.239 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 1.96e-01 -0.137 0.106 0.239 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0442 0.102 0.231 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 6.19e-01 0.0466 0.0935 0.231 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0921 0.11 0.231 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 6.60e-01 -0.047 0.106 0.231 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.76e-04 -0.38 0.0994 0.231 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 3.91e-01 0.0772 0.0898 0.231 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0501 0.102 0.224 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0586 0.094 0.224 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.113 0.224 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0893 0.0945 0.224 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.52e-03 -0.286 0.0888 0.224 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0253 0.0848 0.224 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 9.36e-01 0.00959 0.12 0.223 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0779 0.104 0.223 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 1.27e-02 -0.273 0.108 0.223 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 3.27e-01 0.114 0.115 0.223 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0459 0.101 0.223 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0495 0.0779 0.223 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 4.01e-01 0.087 0.103 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 2.02e-01 0.0649 0.0508 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0789 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00632 0.0539 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0636 0.0845 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 7.92e-01 0.026 0.0985 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 2.19e-03 -0.223 0.072 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 5.07e-01 0.0585 0.0881 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 8.80e-01 0.0154 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 9.26e-01 0.0099 0.106 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 7.31e-02 0.188 0.105 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -116256 sc-eQTL 4.18e-02 -0.119 0.0581 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 5.56e-01 0.0567 0.096 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 6.22e-01 0.0234 0.0474 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 7.26e-01 0.0238 0.0679 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 6.97e-02 0.171 0.0941 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.75e-02 -0.168 0.0701 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 5.16e-02 0.144 0.0738 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 626016 sc-eQTL 2.91e-01 0.113 0.107 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 6.95e-01 0.0429 0.109 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 167903 sc-eQTL 4.26e-01 0.0794 0.0995 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 1.84e-01 -0.114 0.0854 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0159 0.0693 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 2.50e-01 -0.103 0.0889 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 9.39e-01 0.00686 0.0902 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 4.10e-02 -0.16 0.0777 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 6.75e-01 -0.027 0.0644 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0766 0.0992 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0429 0.0867 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 2.59e-01 -0.119 0.105 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0626 0.1 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 3.20e-05 -0.355 0.0836 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 5.92e-01 0.0403 0.0751 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 245368 sc-eQTL 2.77e-01 0.102 0.0936 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 668541 sc-eQTL 5.95e-01 0.0487 0.0915 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0527 0.0626 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 957716 sc-eQTL 6.82e-01 0.0366 0.0892 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 303339 sc-eQTL 1.70e-02 -0.172 0.0713 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 487908 sc-eQTL 9.18e-01 0.00996 0.0971 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 245303 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0399 0.114 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 668541 eQTL 2.77e-04 -0.105 0.0289 0.0 0.0 0.228
ENSG00000111670 GNPTAB 534529 eQTL 2.09e-02 -0.037 0.016 0.0 0.0 0.228
ENSG00000120860 WASHC3 303339 pQTL 0.000457 -0.0375 0.0107 0.0 0.0 0.22
ENSG00000120860 WASHC3 303339 eQTL 9.359999999999999e-23 -0.138 0.0137 0.0 0.00107 0.228
ENSG00000136048 DRAM1 487908 eQTL 0.00429 0.0466 0.0163 0.0 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -116256 3.64e-06 5.07e-06 4.43e-07 2.61e-06 4.41e-07 7.26e-07 2.45e-06 7.37e-07 2.42e-06 1.42e-06 3.95e-06 3.41e-06 5.38e-06 2.45e-06 9.3e-07 1.65e-06 1.17e-06 2.25e-06 1.22e-06 7.99e-07 9.48e-07 3.2e-06 3.2e-06 1.06e-06 4.54e-06 1.26e-06 1.65e-06 1.73e-06 2.85e-06 2.22e-06 2.01e-06 2.42e-07 3.98e-07 1.18e-06 1.95e-06 1.01e-06 7.76e-07 4.03e-07 1.11e-06 3.28e-07 2.88e-07 3.87e-06 5.57e-07 1.06e-07 3.97e-07 3.67e-07 4.15e-07 2.65e-07 3e-07
ENSG00000111666 CHPT1 668541 2.74e-07 1.42e-07 4.47e-08 2.24e-07 8.83e-08 1e-07 1.53e-07 5.4e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.55e-07 9.19e-08 1.47e-07 7.64e-08 6.17e-08 7.17e-08 3.94e-08 1.21e-07 5.82e-08 4.45e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.42e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.09e-07 1.12e-07 1.02e-07 3.7e-08 3.3e-08 8e-08 2.97e-08 3.65e-08 5.7e-08 9.26e-08 6.37e-08 5.13e-08 5.41e-08 1.33e-07 5.27e-08 2.48e-08 4.67e-08 1.84e-08 1.24e-07 3.89e-09 4.73e-08
ENSG00000120860 WASHC3 303339 1.05e-06 9.1e-07 1.23e-07 6.49e-07 1.07e-07 2.63e-07 6.33e-07 1.73e-07 6.27e-07 3.1e-07 1.07e-06 5.81e-07 1.1e-06 2.68e-07 2.86e-07 2.36e-07 2.98e-07 4.11e-07 2.57e-07 1.39e-07 2.01e-07 4.79e-07 4.74e-07 2.17e-07 1.39e-06 2.42e-07 4.83e-07 3.89e-07 5.16e-07 5.67e-07 4.47e-07 8.37e-08 5.68e-08 1.79e-07 3.96e-07 1.58e-07 1.83e-07 8.15e-08 7.63e-08 4.12e-08 1.09e-07 8.45e-07 4.59e-08 2.03e-08 1.14e-07 2.68e-08 7.89e-08 7.25e-09 5.69e-08
ENSG00000136048 DRAM1 487908 3.1e-07 3.12e-07 6.41e-08 3.56e-07 1.01e-07 8.63e-08 2.4e-07 5.78e-08 1.66e-07 1.03e-07 2.07e-07 1.57e-07 2.45e-07 8.85e-08 5.69e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.72e-07 7.39e-08 5.2e-08 1.22e-07 1.56e-07 1.75e-07 3.58e-08 2.36e-07 1.22e-07 1.25e-07 1.36e-07 1.37e-07 1.05e-07 1.35e-07 3.54e-08 3.59e-08 9.52e-08 1.39e-07 3.05e-08 5.76e-08 8.57e-08 6.33e-08 7.55e-08 5.1e-08 1.63e-07 3.99e-08 1.32e-08 3.36e-08 6.68e-09 1.11e-07 1.92e-09 5.01e-08