logo

Genes within 1Mb (chr12:102361911:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 2.60e-01 0.0501 0.0443 0.214 B L1
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 4.38e-01 0.0599 0.0772 0.214 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 7.12e-01 0.0173 0.047 0.214 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 6.75e-01 0.0285 0.068 0.214 B L1
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 5.03e-01 0.0446 0.0664 0.214 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 1.91e-03 -0.163 0.052 0.214 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 2.18e-02 0.138 0.0596 0.214 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 5.03e-01 0.0642 0.0958 0.214 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 3.61e-01 0.0839 0.0916 0.214 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 7.79e-02 0.151 0.085 0.214 B L1
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 8.49e-01 0.0139 0.0727 0.214 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0689 0.098 0.214 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 5.50e-01 0.0407 0.068 0.214 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0119 0.0736 0.214 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 9.35e-08 -0.266 0.0481 0.214 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0505 0.0879 0.214 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0996 0.0951 0.214 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0693 0.0624 0.214 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 2.74e-01 0.0954 0.0869 0.214 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 5.04e-04 -0.213 0.0602 0.214 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 6.54e-01 0.0397 0.0887 0.214 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 9.53e-01 0.00595 0.1 0.214 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.54e-01 0.0543 0.0917 0.214 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 2.67e-01 -0.112 0.101 0.214 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.112 0.214 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0418 0.0963 0.214 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 3.56e-01 0.0735 0.0794 0.214 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 3.33e-01 0.102 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 1.86e-01 -0.111 0.0834 0.214 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 3.74e-01 -0.063 0.0708 0.214 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0596 0.0888 0.214 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0494 0.0912 0.214 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 5.51e-05 -0.318 0.0773 0.214 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00618 0.0655 0.214 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0278 0.0896 0.212 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 8.78e-01 0.0128 0.0832 0.212 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 3.79e-01 -0.053 0.0602 0.212 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0491 0.0891 0.212 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 6.76e-04 -0.226 0.0654 0.212 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 4.03e-01 0.08 0.0955 0.212 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 7.21e-01 0.0401 0.112 0.212 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 5.64e-01 0.0196 0.0339 0.214 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 1.13e-01 0.102 0.0642 0.214 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 1.80e-01 -0.126 0.0939 0.214 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0533 0.0679 0.214 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 9.43e-01 0.00557 0.0775 0.214 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 7.15e-03 -0.184 0.0677 0.214 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 7.42e-01 0.0272 0.0826 0.214 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 4.94e-01 0.0471 0.0687 0.214 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0419 0.08 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0316 0.0213 0.217 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 5.50e-01 0.0665 0.111 0.217 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 6.94e-01 0.0324 0.0822 0.217 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 5.72e-01 0.0661 0.117 0.217 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 1.17e-01 0.182 0.116 0.217 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 3.17e-02 -0.238 0.11 0.217 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 4.65e-01 0.0817 0.111 0.217 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0306 0.0917 0.217 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0769 0.0921 0.217 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 6.80e-01 0.0358 0.0867 0.217 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 3.54e-01 0.0413 0.0445 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0869 0.111 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0594 0.0594 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0881 0.0879 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0435 0.11 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 2.06e-02 -0.21 0.0899 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 1.57e-01 0.138 0.0972 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 5.42e-01 0.0627 0.103 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0376 0.108 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 8.93e-02 0.175 0.103 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 9.94e-01 0.000329 0.0416 0.216 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0178 0.11 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0236 0.0717 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0552 0.0981 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0772 0.107 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 7.23e-02 -0.172 0.0951 0.216 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 9.42e-01 0.0073 0.101 0.216 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 2.66e-01 -0.115 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0245 0.106 0.216 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0509 0.0963 0.216 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0835 0.056 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 5.55e-01 0.0602 0.102 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 3.59e-01 0.0487 0.0529 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0517 0.0749 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 1.80e-02 0.234 0.098 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 3.33e-03 -0.219 0.0737 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 5.30e-01 0.0513 0.0814 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 1.27e-01 0.168 0.11 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 7.27e-01 0.0376 0.108 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0407 0.101 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 5.68e-02 -0.0943 0.0492 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 4.38e-01 0.0789 0.102 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0304 0.0544 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 4.11e-01 0.0694 0.0843 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0216 0.107 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00573 0.0936 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 5.32e-03 0.256 0.091 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0774 0.0974 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0626 0.112 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 1.05e-01 0.157 0.0964 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 6.00e-01 0.059 0.112 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0622 0.113 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 4.51e-01 0.0742 0.0983 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0537 0.115 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 7.44e-01 0.036 0.11 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 7.59e-01 -0.026 0.0845 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.05e-01 -0.065 0.0973 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 7.84e-01 0.0206 0.0751 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0163 0.0887 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 7.38e-06 -0.272 0.0591 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 6.16e-02 0.16 0.0853 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 2.99e-01 -0.103 0.099 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 1.98e-01 0.0987 0.0765 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 8.42e-01 -0.018 0.0899 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 4.13e-04 -0.206 0.0573 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0673 0.103 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 8.65e-02 -0.169 0.0981 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00298 0.0951 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0371 0.0972 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 4.02e-02 -0.178 0.0862 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 6.69e-01 0.04 0.0934 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0164 0.0959 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 9.00e-01 0.00965 0.0767 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 6.03e-01 0.0534 0.102 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 2.30e-01 -0.105 0.0872 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 7.08e-01 0.0408 0.109 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00201 0.101 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 1.29e-01 -0.152 0.0997 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 8.50e-01 0.017 0.09 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 9.38e-01 0.00805 0.104 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 5.96e-04 -0.232 0.0665 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 4.16e-01 -0.086 0.105 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0226 0.107 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0443 0.0958 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 6.65e-01 -0.043 0.0991 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 2.90e-01 0.112 0.106 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 8.12e-01 0.0226 0.0951 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 8.43e-01 0.0205 0.104 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 2.88e-01 -0.111 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0613 0.0985 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 4.56e-03 -0.297 0.103 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 5.75e-01 0.0608 0.108 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 5.92e-01 0.0508 0.0946 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 2.57e-01 0.118 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 6.23e-01 0.0185 0.0375 0.216 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 7.64e-01 0.0316 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.13e-02 -0.199 0.102 0.216 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 6.67e-01 0.0392 0.0909 0.216 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0504 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 2.96e-02 -0.2 0.0914 0.216 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 2.30e-01 0.126 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 6.28e-01 0.0498 0.103 0.216 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0135 0.091 0.216 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0996 0.081 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 7.45e-01 0.0306 0.0939 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 8.61e-02 -0.183 0.106 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 1.07e-01 -0.156 0.0962 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 2.43e-01 0.119 0.102 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 5.32e-01 0.0673 0.108 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 5.42e-02 0.191 0.0985 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 4.98e-01 0.0658 0.097 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 5.09e-02 -0.143 0.0728 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00241 0.0986 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 3.80e-03 -0.242 0.0828 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 2.94e-01 0.108 0.102 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 9.80e-01 0.00296 0.116 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 4.73e-01 0.0731 0.102 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0683 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 2.57e-01 -0.095 0.0836 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 9.09e-02 0.189 0.111 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 5.38e-01 0.0642 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0925 0.107 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0358 0.105 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0583 0.1 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0585 0.0936 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 5.05e-01 0.0475 0.0711 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0897 0.0997 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 4.51e-03 -0.221 0.0771 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 8.47e-01 0.0197 0.102 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0531 0.111 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 8.76e-01 0.0123 0.0788 0.2 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 2.78e-01 0.115 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 3.22e-01 0.0815 0.0819 0.2 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 2.61e-01 0.133 0.118 0.2 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 7.33e-02 -0.149 0.0823 0.2 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0983 0.0959 0.2 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 9.80e-02 0.161 0.0966 0.2 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 3.11e-01 0.115 0.113 0.2 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 1.22e-01 0.16 0.103 0.2 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 4.68e-01 0.07 0.0961 0.2 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0213 0.0368 0.213 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 5.99e-01 0.0391 0.0742 0.213 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 9.67e-01 0.00408 0.0984 0.213 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 8.38e-01 0.0149 0.0728 0.213 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0265 0.0786 0.213 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 4.13e-02 -0.174 0.0846 0.213 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 4.16e-01 0.0597 0.0732 0.213 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 1.66e-02 0.162 0.067 0.213 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 4.82e-01 0.0523 0.0742 0.213 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 9.17e-01 0.011 0.105 0.214 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 4.09e-01 -0.09 0.109 0.214 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 2.32e-01 -0.114 0.0949 0.214 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0357 0.107 0.214 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 1.60e-01 -0.122 0.0867 0.214 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 6.05e-01 0.0523 0.101 0.22 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.25e-01 0.0627 0.0985 0.22 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 8.42e-01 0.0253 0.127 0.22 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0418 0.119 0.22 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 1.65e-01 -0.156 0.112 0.22 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 2.66e-01 0.0972 0.0871 0.22 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 1.14e-01 0.157 0.099 0.22 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0283 0.0953 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0407 0.0718 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0873 0.0952 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0281 0.0961 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 8.07e-02 -0.144 0.0823 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0377 0.0706 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 2.95e-01 -0.108 0.103 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0459 0.0789 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 8.41e-01 0.0193 0.096 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 8.06e-01 0.026 0.106 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 1.59e-03 -0.305 0.0954 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0159 0.0762 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 7.59e-01 0.0399 0.13 0.227 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 6.55e-01 0.0544 0.122 0.227 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 7.32e-02 -0.164 0.0907 0.227 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 3.81e-01 0.111 0.127 0.227 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 1.63e-01 -0.165 0.118 0.227 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 7.35e-01 0.0408 0.12 0.227 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 1.39e-01 -0.174 0.117 0.227 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 2.61e-01 -0.122 0.108 0.227 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0205 0.104 0.218 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 9.73e-01 0.00327 0.0952 0.218 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 3.96e-01 -0.095 0.112 0.218 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0631 0.108 0.218 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 2.56e-05 -0.432 0.1 0.218 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 6.72e-01 0.0387 0.0915 0.218 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0096 0.104 0.21 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 2.34e-01 -0.114 0.0956 0.21 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00671 0.115 0.21 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0636 0.0965 0.21 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 5.21e-04 -0.318 0.0901 0.21 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0122 0.0865 0.21 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 9.54e-01 0.007 0.122 0.215 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0989 0.106 0.215 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 1.86e-02 -0.263 0.11 0.215 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 1.96e-01 0.152 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 7.71e-01 -0.03 0.103 0.215 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0547 0.0794 0.215 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 4.21e-01 0.0849 0.105 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 2.27e-01 0.0628 0.0518 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0727 0.104 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0387 0.0548 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0514 0.0862 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 8.75e-01 0.0158 0.1 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 8.59e-04 -0.247 0.0731 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 3.66e-01 0.0813 0.0897 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0257 0.104 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0148 0.108 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 1.21e-01 0.166 0.107 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -119833 sc-eQTL 3.61e-02 -0.125 0.0591 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 3.68e-01 0.0879 0.0975 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 8.55e-01 0.00881 0.0482 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 8.29e-01 0.0149 0.0691 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 2.63e-02 0.213 0.0953 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 3.08e-02 -0.155 0.0714 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 4.84e-02 0.149 0.075 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 622439 sc-eQTL 4.17e-01 0.0887 0.109 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 7.38e-01 0.0372 0.111 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 164326 sc-eQTL 2.44e-01 0.118 0.101 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 2.12e-01 -0.109 0.0873 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0615 0.0707 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0484 0.0911 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 9.41e-01 0.00679 0.0922 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 6.79e-03 -0.216 0.0788 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0491 0.0657 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0256 0.101 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 2.39e-01 -0.104 0.0878 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 1.93e-01 -0.139 0.106 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0418 0.102 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 3.32e-06 -0.401 0.084 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 9.08e-01 0.00885 0.0763 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 241791 sc-eQTL 3.01e-01 0.0987 0.0953 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 664964 sc-eQTL 7.40e-01 0.031 0.0932 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0534 0.0637 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 954139 sc-eQTL 8.75e-01 0.0143 0.0909 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 299762 sc-eQTL 1.03e-02 -0.187 0.0724 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 484331 sc-eQTL 8.88e-01 0.014 0.0988 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 241726 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0245 0.116 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 664964 eQTL 1.84e-04 -0.11 0.0294 0.0 0.0 0.219
ENSG00000111670 GNPTAB 530952 eQTL 2.96e-02 -0.0355 0.0163 0.0 0.0 0.219
ENSG00000120860 WASHC3 299762 pQTL 0.000164 -0.0409 0.0108 0.0 0.0 0.212
ENSG00000120860 WASHC3 299762 eQTL 3.9799999999999998e-25 -0.148 0.0139 0.00701 0.00496 0.219
ENSG00000136048 DRAM1 484331 eQTL 0.0214 0.0383 0.0166 0.0 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -119833 4.3e-06 4.81e-06 7.79e-07 2.42e-06 1.12e-06 1.03e-06 3.49e-06 9.52e-07 4.15e-06 2.02e-06 4.38e-06 3.43e-06 7.58e-06 2.04e-06 1.3e-06 2.48e-06 2.06e-06 2.77e-06 1.3e-06 9.53e-07 2.28e-06 4.23e-06 3.6e-06 1.63e-06 5.18e-06 1.31e-06 2.15e-06 1.82e-06 4.26e-06 3.8e-06 2.17e-06 5.76e-07 7.75e-07 1.76e-06 1.99e-06 9.97e-07 9.66e-07 4.72e-07 1.23e-06 3.8e-07 3.75e-07 5.47e-06 4.46e-07 1.74e-07 4.19e-07 3.58e-07 6.79e-07 2.41e-07 1.94e-07
ENSG00000111666 CHPT1 664964 3.02e-07 1.56e-07 5.64e-08 2.24e-07 1.03e-07 8.33e-08 2.1e-07 5.56e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.61e-07 1.23e-07 2.24e-07 8e-08 5.43e-08 7.98e-08 4.31e-08 1.64e-07 7.12e-08 5.35e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.58e-07 3.49e-08 2.02e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.26e-07 1.32e-07 1.05e-07 1.14e-07 4.4e-08 3.29e-08 9.8e-08 3.97e-08 2.79e-08 3.91e-08 8.57e-08 6.39e-08 5.56e-08 4.53e-08 1.6e-07 5.22e-08 1.1e-08 3.32e-08 1.19e-08 9.29e-08 2e-09 4.8e-08
ENSG00000120860 WASHC3 299762 1.29e-06 9.1e-07 2.75e-07 5.92e-07 2.1e-07 4.23e-07 1.13e-06 3.28e-07 1.14e-06 3.76e-07 1.35e-06 5.97e-07 1.83e-06 2.55e-07 4.33e-07 6.35e-07 7.77e-07 5.68e-07 3.95e-07 5.57e-07 3.61e-07 1.05e-06 7.76e-07 5.36e-07 1.94e-06 2.99e-07 6.21e-07 7.22e-07 1.02e-06 1.02e-06 5.45e-07 7.32e-08 1.79e-07 4.54e-07 4.2e-07 3.91e-07 4.16e-07 1.5e-07 1.83e-07 9.13e-08 3e-07 1.57e-06 5.65e-08 2.61e-08 1.82e-07 7.84e-08 1.71e-07 8.51e-08 5.39e-08
ENSG00000136048 DRAM1 484331 5.85e-07 3.55e-07 7.76e-08 3.05e-07 1.07e-07 1.5e-07 4.09e-07 8.37e-08 2.76e-07 1.65e-07 3.97e-07 2.55e-07 5.39e-07 1.01e-07 1.18e-07 1.46e-07 1.17e-07 2.96e-07 9.69e-08 8.41e-08 1.65e-07 2.63e-07 2.67e-07 9.63e-08 4.54e-07 2.07e-07 1.78e-07 2.13e-07 2.31e-07 2.26e-07 1.93e-07 7.6e-08 5.64e-08 1.21e-07 2.35e-07 5.7e-08 9.52e-08 6.46e-08 6.08e-08 5.72e-08 6.39e-08 3.66e-07 3.09e-08 2.07e-08 8.59e-08 1.32e-08 9.19e-08 2.94e-09 4.61e-08