logo

Genes within 1Mb (chr12:102339371:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 3.63e-01 0.0398 0.0436 0.226 B L1
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.06e-01 0.0287 0.076 0.226 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 4.49e-01 0.035 0.0462 0.226 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 5.68e-01 0.0382 0.0668 0.226 B L1
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.11e-01 0.0243 0.0653 0.226 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 3.21e-03 -0.153 0.0512 0.226 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 2.50e-02 0.132 0.0586 0.226 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 3.00e-01 0.0978 0.094 0.226 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 2.97e-01 0.0942 0.09 0.226 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 1.45e-01 0.122 0.0838 0.226 B L1
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.04e-01 0.0271 0.0714 0.226 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 7.09e-01 -0.036 0.0964 0.226 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 5.62e-01 0.0388 0.0668 0.226 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00248 0.0723 0.226 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 4.20e-07 -0.249 0.0477 0.226 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00791 0.0863 0.226 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0612 0.0934 0.226 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0777 0.0612 0.226 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 4.26e-01 0.0682 0.0854 0.226 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 4.13e-04 -0.212 0.059 0.226 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 4.16e-01 0.0708 0.0869 0.226 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 9.50e-01 0.00613 0.0985 0.223 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 4.39e-01 0.0697 0.09 0.223 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 2.25e-01 -0.12 0.0987 0.223 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.23e-01 0.0389 0.11 0.223 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0946 0.223 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 4.79e-01 0.0553 0.078 0.223 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 4.55e-01 0.0769 0.103 0.223 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 1.02e-01 -0.134 0.0814 0.226 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 7.84e-01 -0.019 0.0693 0.226 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 2.35e-01 -0.103 0.0866 0.226 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0684 0.0891 0.226 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.13e-03 -0.253 0.0765 0.226 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 7.79e-01 0.018 0.064 0.226 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0272 0.0883 0.225 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 7.37e-01 0.0276 0.082 0.225 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0542 0.0593 0.225 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0302 0.0879 0.225 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.28e-03 -0.211 0.0646 0.225 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 4.58e-01 0.0701 0.0941 0.225 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 9.15e-01 0.0118 0.111 0.225 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 5.01e-01 0.0224 0.0333 0.226 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 1.62e-01 0.0887 0.0632 0.226 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 2.76e-01 -0.101 0.0924 0.226 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0802 0.0667 0.226 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.42e-01 0.0251 0.0761 0.226 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 9.64e-03 -0.174 0.0666 0.226 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0286 0.0811 0.226 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 2.64e-01 0.0755 0.0674 0.226 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0191 0.0786 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0299 0.0209 0.23 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 5.55e-01 0.0644 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 6.08e-01 0.0414 0.0805 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 5.42e-01 0.0699 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 1.24e-01 0.176 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 4.91e-02 -0.214 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 8.79e-01 0.0137 0.0899 0.23 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0248 0.0905 0.23 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 3.51e-01 0.0794 0.0848 0.23 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 2.60e-01 0.0494 0.0437 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0841 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0328 0.0586 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0802 0.0865 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0173 0.108 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 4.65e-02 -0.178 0.0887 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 3.35e-01 0.0925 0.0958 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 5.39e-01 0.0621 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0603 0.106 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 6.16e-02 0.189 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 6.88e-01 0.0163 0.0405 0.228 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0377 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 9.38e-01 0.00541 0.0699 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0652 0.0956 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0775 0.104 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 7.11e-02 -0.168 0.0927 0.228 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0217 0.0979 0.228 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 2.97e-01 -0.105 0.101 0.228 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0335 0.103 0.228 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0406 0.0939 0.228 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0776 0.0552 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 8.89e-01 0.014 0.1 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 2.98e-01 0.0543 0.052 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0251 0.0738 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 5.97e-02 0.184 0.097 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 2.75e-03 -0.22 0.0725 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 4.71e-01 0.0578 0.0801 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 7.45e-02 0.194 0.108 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 8.14e-01 0.0249 0.106 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 6.08e-01 -0.051 0.0993 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 1.34e-01 -0.073 0.0485 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 3.91e-01 0.0858 0.0997 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0224 0.0535 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 3.65e-01 0.0751 0.0827 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.48e-01 -0.034 0.105 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0294 0.0919 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 8.39e-03 0.238 0.0895 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0663 0.0957 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0223 0.11 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.0948 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 5.38e-01 0.0683 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0459 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 3.03e-01 0.0997 0.0966 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 9.19e-01 0.0115 0.113 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 4.09e-01 0.0895 0.108 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00823 0.0829 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0263 0.0956 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 9.03e-01 0.00904 0.0737 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0195 0.087 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 9.68e-06 -0.263 0.058 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 6.94e-02 0.154 0.0841 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 3.01e-01 -0.101 0.0975 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 1.41e-01 0.111 0.0753 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0135 0.0886 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 9.24e-04 -0.19 0.0567 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0867 0.1 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 7.28e-02 -0.173 0.0961 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0177 0.0932 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 9.35e-01 0.0078 0.0953 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 2.64e-02 -0.189 0.0844 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 4.51e-01 0.0694 0.0918 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00495 0.0943 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00166 0.0754 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.78e-01 0.0284 0.101 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 2.11e-01 -0.108 0.0857 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 4.88e-01 0.0742 0.107 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.37e-01 0.0332 0.0987 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 2.35e-01 -0.116 0.0978 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 8.56e-01 0.016 0.0881 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 8.71e-01 0.0166 0.102 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.55e-03 -0.21 0.0654 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0904 0.103 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0331 0.105 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0503 0.0942 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0495 0.0975 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 2.01e-01 0.133 0.104 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 7.90e-01 0.0249 0.0936 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 6.85e-01 0.0415 0.102 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 3.40e-01 -0.098 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0239 0.0971 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 6.77e-03 -0.279 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 5.30e-01 0.067 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 7.82e-01 0.0258 0.0932 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 2.21e-01 0.126 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 7.46e-01 0.012 0.0371 0.227 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.24e-01 0.0368 0.104 0.227 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 1.21e-01 -0.157 0.101 0.227 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 7.19e-01 0.0323 0.0898 0.227 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00785 0.11 0.227 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 3.09e-02 -0.196 0.0903 0.227 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 3.45e-01 0.0978 0.103 0.227 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 7.52e-01 0.0322 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 9.79e-01 0.00237 0.0899 0.227 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 6.68e-02 -0.203 0.11 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0551 0.0804 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0131 0.093 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 3.91e-02 -0.218 0.105 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 2.65e-01 -0.107 0.0956 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 3.16e-01 0.101 0.101 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 6.86e-01 0.0431 0.106 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 3.77e-02 0.203 0.0968 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 4.00e-01 0.0804 0.0954 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 3.95e-02 -0.148 0.0715 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.07e-01 0.0366 0.097 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 7.52e-03 -0.221 0.0818 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 3.73e-01 0.09 0.101 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 9.77e-01 0.00325 0.114 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 3.86e-01 0.0866 0.0997 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0282 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0853 0.0821 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 8.15e-02 0.191 0.109 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 6.67e-01 0.044 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0774 0.105 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0118 0.103 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0644 0.0987 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 7.37e-01 -0.031 0.0924 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 5.94e-01 0.0375 0.0701 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0975 0.0982 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.35e-02 -0.19 0.0764 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 9.76e-01 0.00308 0.101 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0701 0.109 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0206 0.078 0.211 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 3.31e-01 0.102 0.105 0.211 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 1.95e-01 0.106 0.0809 0.211 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.211 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 1.25e-01 -0.127 0.0818 0.211 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0878 0.0951 0.211 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 1.13e-01 0.153 0.0958 0.211 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 1.17e-01 0.161 0.102 0.211 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 3.67e-01 0.086 0.0951 0.211 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0131 0.0362 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 5.32e-01 0.0456 0.0729 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 8.82e-01 0.0144 0.0968 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0119 0.0716 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0425 0.0772 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.11e-01 -0.134 0.0835 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 6.43e-01 0.0334 0.072 0.226 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 1.14e-02 0.168 0.0657 0.226 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 4.55e-01 0.0546 0.0729 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.44e-01 0.0339 0.104 0.226 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0955 0.108 0.226 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 2.06e-01 -0.119 0.0939 0.226 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0261 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.0858 0.226 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 4.83e-01 0.0697 0.0992 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 4.90e-01 0.0669 0.0967 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 8.29e-01 0.027 0.125 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0935 0.117 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0782 0.11 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 3.24e-01 0.0848 0.0857 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 1.78e-01 0.132 0.0975 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0387 0.0931 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000506 0.0703 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 1.03e-01 -0.152 0.0926 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0376 0.0939 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0795 0.0808 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0116 0.069 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 2.02e-01 -0.129 0.101 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 8.63e-01 0.0134 0.0774 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0941 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.03e-01 0.0396 0.104 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 8.83e-03 -0.249 0.0943 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 8.20e-01 -0.017 0.0747 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 7.10e-01 0.0475 0.127 0.239 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 6.11e-01 0.0609 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 6.85e-02 -0.163 0.089 0.239 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 4.19e-01 0.101 0.124 0.239 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.62e-01 -0.162 0.116 0.239 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 6.99e-01 0.0459 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 7.15e-02 -0.208 0.115 0.239 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 1.96e-01 -0.137 0.106 0.239 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0442 0.102 0.231 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 6.19e-01 0.0466 0.0935 0.231 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0921 0.11 0.231 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 6.60e-01 -0.047 0.106 0.231 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.76e-04 -0.38 0.0994 0.231 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 3.91e-01 0.0772 0.0898 0.231 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0501 0.102 0.224 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0586 0.094 0.224 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.113 0.224 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0893 0.0945 0.224 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.52e-03 -0.286 0.0888 0.224 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0253 0.0848 0.224 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 9.36e-01 0.00959 0.12 0.223 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0779 0.104 0.223 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 1.27e-02 -0.273 0.108 0.223 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 3.27e-01 0.114 0.115 0.223 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0459 0.101 0.223 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0495 0.0779 0.223 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 4.01e-01 0.087 0.103 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 2.02e-01 0.0649 0.0508 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0789 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00632 0.0539 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0636 0.0845 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 7.92e-01 0.026 0.0985 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 2.19e-03 -0.223 0.072 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 5.07e-01 0.0585 0.0881 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 8.80e-01 0.0154 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 9.26e-01 0.0099 0.106 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 7.31e-02 0.188 0.105 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -142373 sc-eQTL 4.18e-02 -0.119 0.0581 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 5.56e-01 0.0567 0.096 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 6.22e-01 0.0234 0.0474 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 7.26e-01 0.0238 0.0679 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 6.97e-02 0.171 0.0941 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.75e-02 -0.168 0.0701 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 5.16e-02 0.144 0.0738 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 599899 sc-eQTL 2.91e-01 0.113 0.107 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 6.95e-01 0.0429 0.109 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 141786 sc-eQTL 4.26e-01 0.0794 0.0995 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 1.84e-01 -0.114 0.0854 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0159 0.0693 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 2.50e-01 -0.103 0.0889 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 9.39e-01 0.00686 0.0902 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 4.10e-02 -0.16 0.0777 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 6.75e-01 -0.027 0.0644 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0766 0.0992 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0429 0.0867 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 2.59e-01 -0.119 0.105 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0626 0.1 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 3.20e-05 -0.355 0.0836 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 5.92e-01 0.0403 0.0751 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 219251 sc-eQTL 2.77e-01 0.102 0.0936 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 642424 sc-eQTL 5.95e-01 0.0487 0.0915 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0527 0.0626 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 931599 sc-eQTL 6.82e-01 0.0366 0.0892 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 277222 sc-eQTL 1.70e-02 -0.172 0.0713 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 461791 sc-eQTL 9.18e-01 0.00996 0.0971 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 219186 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0399 0.114 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 642424 eQTL 2.63e-04 -0.106 0.0289 0.0 0.0 0.228
ENSG00000111670 GNPTAB 508412 eQTL 2.03e-02 -0.0372 0.016 0.0 0.0 0.228
ENSG00000120860 WASHC3 277222 pQTL 0.000481 -0.0374 0.0107 0.0 0.0 0.22
ENSG00000120860 WASHC3 277222 eQTL 1.11e-22 -0.138 0.0137 0.0 0.0 0.228
ENSG00000136048 DRAM1 461791 eQTL 0.00405 0.0469 0.0163 0.0 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -142373 4.04e-06 4.18e-06 6.67e-07 2.02e-06 8.7e-07 9.87e-07 2.48e-06 1.01e-06 2.81e-06 1.66e-06 3.71e-06 2.45e-06 6.3e-06 1.34e-06 9.92e-07 2.34e-06 1.77e-06 2.37e-06 1.42e-06 1.05e-06 1.97e-06 3.74e-06 3.51e-06 1.8e-06 4.81e-06 1.32e-06 1.84e-06 1.63e-06 3.8e-06 3.61e-06 2e-06 4.69e-07 6.09e-07 1.74e-06 1.81e-06 8.52e-07 9.21e-07 4.52e-07 1.29e-06 3.82e-07 2.92e-07 4.63e-06 4.62e-07 1.86e-07 4.32e-07 3.21e-07 8.16e-07 2.07e-07 1.76e-07
ENSG00000111666 CHPT1 642424 3.71e-07 2.17e-07 6.72e-08 2.53e-07 1.08e-07 1.03e-07 2.74e-07 6.75e-08 1.98e-07 1.15e-07 2.07e-07 1.52e-07 3.18e-07 8.66e-08 6.6e-08 1.1e-07 6.17e-08 2.43e-07 7.53e-08 6.29e-08 1.39e-07 1.98e-07 1.89e-07 3.83e-08 2.86e-07 1.71e-07 1.33e-07 1.47e-07 1.44e-07 1.81e-07 1.35e-07 4.77e-08 3.74e-08 9.9e-08 8.75e-08 3.57e-08 5.54e-08 6.32e-08 4.75e-08 6.67e-08 4.47e-08 2.15e-07 3.53e-08 7.23e-09 4.06e-08 1.01e-08 8.21e-08 2.2e-09 4.72e-08
ENSG00000120860 WASHC3 277222 1.27e-06 1.08e-06 2.56e-07 1.13e-06 3.45e-07 6.31e-07 1.55e-06 4.04e-07 1.41e-06 5.9e-07 1.89e-06 7.53e-07 2.43e-06 2.92e-07 5.69e-07 9.78e-07 9.2e-07 8e-07 8.61e-07 6.33e-07 7.59e-07 1.75e-06 1.04e-06 5.54e-07 2.26e-06 6.58e-07 9.35e-07 7.45e-07 1.45e-06 1.2e-06 7.47e-07 1.89e-07 2.19e-07 6.44e-07 5.3e-07 4.77e-07 7.14e-07 2.42e-07 4.82e-07 2.93e-07 2.83e-07 1.68e-06 1.24e-07 6.48e-08 2.96e-07 1.48e-07 2.19e-07 5.35e-08 1.25e-07
ENSG00000136048 DRAM1 461791 8.48e-07 6.04e-07 1.27e-07 4.31e-07 9.33e-08 2.16e-07 5.49e-07 1.45e-07 4.61e-07 2.62e-07 7.15e-07 3.65e-07 8.37e-07 1.48e-07 2.18e-07 2.83e-07 3.52e-07 4.2e-07 2.25e-07 1.53e-07 2.17e-07 3.95e-07 3.87e-07 1.76e-07 8.99e-07 2.6e-07 2.94e-07 2.7e-07 4.06e-07 6.35e-07 3.13e-07 7.12e-08 5.77e-08 1.64e-07 3.48e-07 1.16e-07 1.01e-07 9.71e-08 6.58e-08 3.12e-08 8.35e-08 6.11e-07 4.24e-08 2e-08 1.33e-07 1.42e-08 1.21e-07 1.17e-08 5.43e-08