logo

Genes within 1Mb (chr12:102312759:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 2.60e-01 0.0501 0.0443 0.214 B L1
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 4.38e-01 0.0599 0.0772 0.214 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 7.12e-01 0.0173 0.047 0.214 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 6.75e-01 0.0285 0.068 0.214 B L1
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 5.03e-01 0.0446 0.0664 0.214 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 1.91e-03 -0.163 0.052 0.214 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 2.18e-02 0.138 0.0596 0.214 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 5.03e-01 0.0642 0.0958 0.214 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 3.61e-01 0.0839 0.0916 0.214 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 7.79e-02 0.151 0.085 0.214 B L1
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 8.49e-01 0.0139 0.0727 0.214 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0689 0.098 0.214 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 5.50e-01 0.0407 0.068 0.214 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0119 0.0736 0.214 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 9.35e-08 -0.266 0.0481 0.214 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0505 0.0879 0.214 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0996 0.0951 0.214 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0693 0.0624 0.214 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 2.74e-01 0.0954 0.0869 0.214 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 5.04e-04 -0.213 0.0602 0.214 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 6.54e-01 0.0397 0.0887 0.214 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 9.53e-01 0.00595 0.1 0.214 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.54e-01 0.0543 0.0917 0.214 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 2.67e-01 -0.112 0.101 0.214 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.112 0.214 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0418 0.0963 0.214 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 3.56e-01 0.0735 0.0794 0.214 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 3.33e-01 0.102 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 1.86e-01 -0.111 0.0834 0.214 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 3.74e-01 -0.063 0.0708 0.214 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0596 0.0888 0.214 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0494 0.0912 0.214 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 5.51e-05 -0.318 0.0773 0.214 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00618 0.0655 0.214 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0278 0.0896 0.212 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 8.78e-01 0.0128 0.0832 0.212 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 3.79e-01 -0.053 0.0602 0.212 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0491 0.0891 0.212 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 6.76e-04 -0.226 0.0654 0.212 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 4.03e-01 0.08 0.0955 0.212 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 7.21e-01 0.0401 0.112 0.212 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 5.64e-01 0.0196 0.0339 0.214 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 1.13e-01 0.102 0.0642 0.214 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 1.80e-01 -0.126 0.0939 0.214 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0533 0.0679 0.214 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 9.43e-01 0.00557 0.0775 0.214 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 7.15e-03 -0.184 0.0677 0.214 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 7.42e-01 0.0272 0.0826 0.214 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 4.94e-01 0.0471 0.0687 0.214 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0419 0.08 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0316 0.0213 0.217 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 5.50e-01 0.0665 0.111 0.217 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 6.94e-01 0.0324 0.0822 0.217 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 5.72e-01 0.0661 0.117 0.217 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 1.17e-01 0.182 0.116 0.217 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 3.17e-02 -0.238 0.11 0.217 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 4.65e-01 0.0817 0.111 0.217 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0306 0.0917 0.217 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0769 0.0921 0.217 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 6.80e-01 0.0358 0.0867 0.217 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 3.54e-01 0.0413 0.0445 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0869 0.111 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0594 0.0594 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0881 0.0879 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0435 0.11 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 2.06e-02 -0.21 0.0899 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 1.57e-01 0.138 0.0972 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 5.42e-01 0.0627 0.103 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0376 0.108 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 8.93e-02 0.175 0.103 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 9.94e-01 0.000329 0.0416 0.216 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0178 0.11 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0236 0.0717 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0552 0.0981 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0772 0.107 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 7.23e-02 -0.172 0.0951 0.216 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 9.42e-01 0.0073 0.101 0.216 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 2.66e-01 -0.115 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0245 0.106 0.216 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0509 0.0963 0.216 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0835 0.056 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 5.55e-01 0.0602 0.102 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 3.59e-01 0.0487 0.0529 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0517 0.0749 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 1.80e-02 0.234 0.098 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 3.33e-03 -0.219 0.0737 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 5.30e-01 0.0513 0.0814 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 1.27e-01 0.168 0.11 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 7.27e-01 0.0376 0.108 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0407 0.101 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 5.68e-02 -0.0943 0.0492 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 4.38e-01 0.0789 0.102 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0304 0.0544 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 4.11e-01 0.0694 0.0843 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0216 0.107 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00573 0.0936 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 5.32e-03 0.256 0.091 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0774 0.0974 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0626 0.112 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 1.05e-01 0.157 0.0964 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 6.00e-01 0.059 0.112 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0622 0.113 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 4.51e-01 0.0742 0.0983 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0537 0.115 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 7.44e-01 0.036 0.11 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 7.59e-01 -0.026 0.0845 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.05e-01 -0.065 0.0973 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 7.84e-01 0.0206 0.0751 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0163 0.0887 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 7.38e-06 -0.272 0.0591 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 6.16e-02 0.16 0.0853 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 2.99e-01 -0.103 0.099 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 1.98e-01 0.0987 0.0765 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 8.42e-01 -0.018 0.0899 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 4.13e-04 -0.206 0.0573 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0673 0.103 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 8.65e-02 -0.169 0.0981 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00298 0.0951 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0371 0.0972 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 4.02e-02 -0.178 0.0862 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 6.69e-01 0.04 0.0934 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0164 0.0959 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 9.00e-01 0.00965 0.0767 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 6.03e-01 0.0534 0.102 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 2.30e-01 -0.105 0.0872 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 7.08e-01 0.0408 0.109 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00201 0.101 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 1.29e-01 -0.152 0.0997 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 8.50e-01 0.017 0.09 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 9.38e-01 0.00805 0.104 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 5.96e-04 -0.232 0.0665 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 4.16e-01 -0.086 0.105 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0226 0.107 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0443 0.0958 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 6.65e-01 -0.043 0.0991 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 2.90e-01 0.112 0.106 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 8.12e-01 0.0226 0.0951 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 8.43e-01 0.0205 0.104 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 2.88e-01 -0.111 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0613 0.0985 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 4.56e-03 -0.297 0.103 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 5.75e-01 0.0608 0.108 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 5.92e-01 0.0508 0.0946 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 2.57e-01 0.118 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 6.23e-01 0.0185 0.0375 0.216 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 7.64e-01 0.0316 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.13e-02 -0.199 0.102 0.216 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 6.67e-01 0.0392 0.0909 0.216 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0504 0.111 0.216 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 2.96e-02 -0.2 0.0914 0.216 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 2.30e-01 0.126 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 6.28e-01 0.0498 0.103 0.216 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0135 0.091 0.216 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0996 0.081 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 7.45e-01 0.0306 0.0939 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 8.61e-02 -0.183 0.106 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 1.07e-01 -0.156 0.0962 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 2.43e-01 0.119 0.102 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 5.32e-01 0.0673 0.108 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 5.42e-02 0.191 0.0985 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 4.98e-01 0.0658 0.097 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 5.09e-02 -0.143 0.0728 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00241 0.0986 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 3.80e-03 -0.242 0.0828 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 2.94e-01 0.108 0.102 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 9.80e-01 0.00296 0.116 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 4.73e-01 0.0731 0.102 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0683 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 2.57e-01 -0.095 0.0836 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 9.09e-02 0.189 0.111 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 5.38e-01 0.0642 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0925 0.107 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0358 0.105 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0583 0.1 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0585 0.0936 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 5.05e-01 0.0475 0.0711 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0897 0.0997 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 4.51e-03 -0.221 0.0771 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 8.47e-01 0.0197 0.102 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0531 0.111 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 8.76e-01 0.0123 0.0788 0.2 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 2.78e-01 0.115 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 3.22e-01 0.0815 0.0819 0.2 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 2.61e-01 0.133 0.118 0.2 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 7.33e-02 -0.149 0.0823 0.2 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0983 0.0959 0.2 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 9.80e-02 0.161 0.0966 0.2 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 3.11e-01 0.115 0.113 0.2 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 1.22e-01 0.16 0.103 0.2 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 4.68e-01 0.07 0.0961 0.2 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0213 0.0368 0.213 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 5.99e-01 0.0391 0.0742 0.213 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 9.67e-01 0.00408 0.0984 0.213 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 8.38e-01 0.0149 0.0728 0.213 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0265 0.0786 0.213 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 4.13e-02 -0.174 0.0846 0.213 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 4.16e-01 0.0597 0.0732 0.213 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 1.66e-02 0.162 0.067 0.213 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 4.82e-01 0.0523 0.0742 0.213 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 9.17e-01 0.011 0.105 0.214 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 4.09e-01 -0.09 0.109 0.214 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 2.32e-01 -0.114 0.0949 0.214 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0357 0.107 0.214 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 1.60e-01 -0.122 0.0867 0.214 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 6.05e-01 0.0523 0.101 0.22 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.25e-01 0.0627 0.0985 0.22 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 8.42e-01 0.0253 0.127 0.22 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0418 0.119 0.22 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 1.65e-01 -0.156 0.112 0.22 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 2.66e-01 0.0972 0.0871 0.22 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 1.14e-01 0.157 0.099 0.22 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0283 0.0953 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0407 0.0718 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0873 0.0952 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0281 0.0961 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 8.07e-02 -0.144 0.0823 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0377 0.0706 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 2.95e-01 -0.108 0.103 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0459 0.0789 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 8.41e-01 0.0193 0.096 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 8.06e-01 0.026 0.106 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 1.59e-03 -0.305 0.0954 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0159 0.0762 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 7.59e-01 0.0399 0.13 0.227 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 6.55e-01 0.0544 0.122 0.227 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 7.32e-02 -0.164 0.0907 0.227 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 3.81e-01 0.111 0.127 0.227 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 1.63e-01 -0.165 0.118 0.227 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 7.35e-01 0.0408 0.12 0.227 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 1.39e-01 -0.174 0.117 0.227 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 2.61e-01 -0.122 0.108 0.227 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0205 0.104 0.218 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 9.73e-01 0.00327 0.0952 0.218 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 3.96e-01 -0.095 0.112 0.218 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0631 0.108 0.218 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 2.56e-05 -0.432 0.1 0.218 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 6.72e-01 0.0387 0.0915 0.218 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0096 0.104 0.21 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 2.34e-01 -0.114 0.0956 0.21 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00671 0.115 0.21 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0636 0.0965 0.21 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 5.21e-04 -0.318 0.0901 0.21 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0122 0.0865 0.21 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 9.54e-01 0.007 0.122 0.215 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0989 0.106 0.215 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 1.86e-02 -0.263 0.11 0.215 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 1.96e-01 0.152 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 7.71e-01 -0.03 0.103 0.215 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0547 0.0794 0.215 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 4.21e-01 0.0849 0.105 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 2.27e-01 0.0628 0.0518 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0727 0.104 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0387 0.0548 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0514 0.0862 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 8.75e-01 0.0158 0.1 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 8.59e-04 -0.247 0.0731 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 3.66e-01 0.0813 0.0897 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0257 0.104 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0148 0.108 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 1.21e-01 0.166 0.107 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -168985 sc-eQTL 3.61e-02 -0.125 0.0591 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 3.68e-01 0.0879 0.0975 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 8.55e-01 0.00881 0.0482 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 8.29e-01 0.0149 0.0691 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 2.63e-02 0.213 0.0953 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 3.08e-02 -0.155 0.0714 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 4.84e-02 0.149 0.075 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 573287 sc-eQTL 4.17e-01 0.0887 0.109 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 7.38e-01 0.0372 0.111 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 115174 sc-eQTL 2.44e-01 0.118 0.101 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 2.12e-01 -0.109 0.0873 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0615 0.0707 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0484 0.0911 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 9.41e-01 0.00679 0.0922 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 6.79e-03 -0.216 0.0788 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0491 0.0657 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0256 0.101 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 2.39e-01 -0.104 0.0878 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 1.93e-01 -0.139 0.106 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0418 0.102 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 3.32e-06 -0.401 0.084 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 9.08e-01 0.00885 0.0763 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 192639 sc-eQTL 3.01e-01 0.0987 0.0953 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 615812 sc-eQTL 7.40e-01 0.031 0.0932 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0534 0.0637 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 904987 sc-eQTL 8.75e-01 0.0143 0.0909 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 250610 sc-eQTL 1.03e-02 -0.187 0.0724 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 435179 sc-eQTL 8.88e-01 0.014 0.0988 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 192574 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0245 0.116 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 615812 eQTL 1.18e-04 -0.114 0.0294 0.0 0.0 0.219
ENSG00000111670 GNPTAB 481800 eQTL 2.05e-02 -0.0379 0.0163 0.0 0.0 0.219
ENSG00000120860 WASHC3 250610 pQTL 0.00024 -0.0399 0.0108 0.0 0.0 0.212
ENSG00000120860 WASHC3 250610 eQTL 5.46e-25 -0.147 0.0139 0.00548 0.00385 0.219
ENSG00000136048 DRAM1 435179 eQTL 0.0157 0.0402 0.0166 0.0 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -168985 3.55e-06 2.47e-06 3.44e-07 2.02e-06 5.79e-07 7.53e-07 2.13e-06 8.31e-07 2.07e-06 1.04e-06 2.45e-06 1.4e-06 3.71e-06 1.36e-06 9.73e-07 1.68e-06 1.22e-06 2.19e-06 1.08e-06 1.35e-06 1.14e-06 3.09e-06 2.54e-06 1.22e-06 4.08e-06 1.09e-06 1.42e-06 1.67e-06 2.39e-06 2.29e-06 1.94e-06 3.79e-07 5.19e-07 1.33e-06 1.27e-06 9.91e-07 9.23e-07 3.86e-07 1.13e-06 4.35e-07 1.96e-07 3.71e-06 6.27e-07 1.6e-07 3.45e-07 3.36e-07 8.54e-07 2.33e-07 1.66e-07
ENSG00000111666 CHPT1 615812 3.92e-07 1.92e-07 7e-08 2.49e-07 1.07e-07 1.03e-07 2.86e-07 7.12e-08 2.01e-07 1.15e-07 2.38e-07 1.59e-07 3.48e-07 8.44e-08 6.6e-08 1.1e-07 6.63e-08 2.43e-07 7.42e-08 6.29e-08 1.27e-07 2.06e-07 1.86e-07 3.67e-08 2.99e-07 1.82e-07 1.33e-07 1.42e-07 1.4e-07 1.69e-07 1.52e-07 4.93e-08 4.37e-08 9.81e-08 6.25e-08 3.43e-08 5.45e-08 7.63e-08 5.8e-08 7.17e-08 4.47e-08 2.19e-07 3.19e-08 1.14e-08 4e-08 6.68e-09 7.13e-08 2.1e-09 4.72e-08
ENSG00000120860 WASHC3 250610 1.4e-06 1.25e-06 2.45e-07 1.26e-06 3.89e-07 6.17e-07 1.48e-06 4.16e-07 1.67e-06 5.9e-07 2.08e-06 8.59e-07 2.6e-06 2.92e-07 5.04e-07 9.92e-07 9.31e-07 1.12e-06 8.15e-07 5.21e-07 8.02e-07 1.92e-06 1.14e-06 5.94e-07 2.44e-06 7.46e-07 1.02e-06 9.36e-07 1.62e-06 1.29e-06 7.84e-07 3.05e-07 2.54e-07 5.5e-07 5.31e-07 4.57e-07 7.26e-07 2.34e-07 4.58e-07 2.8e-07 2.96e-07 1.95e-06 1.53e-07 1.33e-07 2.86e-07 1.59e-07 2.29e-07 4.91e-08 1.91e-07
ENSG00000136048 DRAM1 435179 9.83e-07 6.04e-07 1.27e-07 4.32e-07 9.86e-08 2.42e-07 5.8e-07 1.62e-07 5.49e-07 2.72e-07 8.58e-07 3.91e-07 9.57e-07 1.34e-07 2.26e-07 2.89e-07 3.69e-07 4.22e-07 2.13e-07 1.73e-07 2.01e-07 4.31e-07 3.87e-07 1.91e-07 9.82e-07 2.71e-07 3.1e-07 2.71e-07 4.13e-07 6.47e-07 3.66e-07 6.56e-08 4.74e-08 1.73e-07 3.4e-07 1.18e-07 1.05e-07 7.64e-08 6.66e-08 2.8e-08 8.75e-08 6.8e-07 2.99e-08 5.61e-09 1.47e-07 1.25e-08 1.07e-07 1.17e-08 4.71e-08