logo

Genes within 1Mb (chr12:102306185:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0229 0.039 0.259 B L1
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 9.53e-01 0.00404 0.068 0.259 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0198 0.0413 0.259 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 9.16e-01 0.00632 0.0598 0.259 B L1
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0215 0.0584 0.259 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 6.78e-02 -0.0852 0.0464 0.259 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0339 0.053 0.259 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 6.51e-01 0.0382 0.0842 0.259 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 8.99e-02 0.137 0.0802 0.259 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0394 0.0752 0.259 B L1
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 2.78e-01 0.0673 0.062 0.259 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 8.71e-02 -0.143 0.0833 0.259 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0535 0.058 0.259 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 1.04e-01 0.102 0.0625 0.259 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 3.23e-02 -0.0938 0.0436 0.259 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 9.29e-03 0.195 0.0744 0.259 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 3.46e-02 -0.172 0.081 0.259 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 4.17e-01 0.0436 0.0537 0.259 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 3.94e-01 0.0638 0.0747 0.259 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0243 0.0531 0.259 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0974 0.0759 0.259 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 4.82e-01 0.0614 0.0873 0.255 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 1.97e-01 -0.103 0.0796 0.255 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.52e-01 0.126 0.0874 0.255 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 5.05e-01 0.065 0.0973 0.255 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 1.11e-03 -0.27 0.0817 0.255 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0745 0.069 0.255 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 2.31e-01 0.109 0.091 0.255 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 6.52e-04 0.247 0.0713 0.259 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 8.06e-01 0.0153 0.0621 0.259 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 8.34e-01 0.0163 0.0778 0.259 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 2.26e-01 0.0966 0.0796 0.259 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 3.41e-02 -0.148 0.0695 0.259 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 4.48e-01 0.0435 0.0572 0.259 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 1.54e-01 0.111 0.0774 0.26 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 3.50e-02 -0.152 0.0714 0.26 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0826 0.052 0.26 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0105 0.0774 0.26 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 9.09e-01 0.00666 0.0583 0.26 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 4.60e-02 -0.165 0.0822 0.26 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 1.39e-01 0.144 0.0968 0.26 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 3.39e-02 -0.0624 0.0292 0.259 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 9.23e-01 0.00547 0.0563 0.259 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0917 0.0819 0.259 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.71e-01 0.0811 0.059 0.259 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0287 0.0675 0.259 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0784 0.0598 0.259 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 1.17e-01 -0.113 0.0716 0.259 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 6.28e-01 0.0291 0.0599 0.259 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 3.63e-02 -0.145 0.069 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 2.03e-02 0.0422 0.018 0.258 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0946 0.0948 0.258 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 1.30e-01 -0.106 0.0698 0.258 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 9.70e-01 0.00371 0.0998 0.258 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 4.06e-02 -0.203 0.0985 0.258 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0093 0.095 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00155 0.0954 0.258 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 7.42e-02 -0.139 0.0776 0.258 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 8.43e-01 0.0156 0.0788 0.258 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0742 0.0739 0.258 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 5.06e-01 0.0257 0.0385 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 1.94e-01 -0.125 0.0956 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 7.68e-01 0.0152 0.0515 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.17e-01 0.119 0.0757 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 4.46e-01 0.0727 0.0951 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0268 0.0787 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 5.21e-01 0.0543 0.0844 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 1.78e-01 -0.12 0.0884 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 1.45e-01 0.136 0.0927 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 1.81e-01 -0.119 0.089 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 8.13e-01 0.00838 0.0353 0.259 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 2.72e-01 0.103 0.0931 0.259 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0224 0.0609 0.259 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0462 0.0834 0.259 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 7.04e-01 0.0347 0.0911 0.259 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 3.47e-01 0.0767 0.0813 0.259 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 5.04e-01 0.0571 0.0854 0.259 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 2.41e-01 0.103 0.0877 0.259 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 2.97e-01 0.0938 0.0898 0.259 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0468 0.0818 0.259 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0268 0.0487 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 4.94e-01 0.0604 0.0881 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0117 0.0458 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0608 0.0647 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0505 0.0858 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 6.71e-01 0.0276 0.065 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 1.41e-01 -0.104 0.0701 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 4.77e-01 0.0681 0.0956 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 3.77e-01 0.0824 0.093 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0944 0.087 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 7.05e-01 0.0162 0.0429 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 7.31e-01 0.0302 0.0879 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 5.81e-01 0.026 0.047 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 6.85e-01 0.0296 0.0729 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 4.10e-01 0.0765 0.0927 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 1.48e-01 -0.117 0.0805 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 7.94e-01 -0.021 0.0801 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 8.27e-01 0.0184 0.0843 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 3.51e-01 0.0908 0.097 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0131 0.0838 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 8.43e-01 0.0192 0.0965 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 4.03e-01 0.0808 0.0965 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0389 0.0844 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 8.29e-01 0.0213 0.0984 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0982 0.0942 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 1.40e-01 0.104 0.0704 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 1.46e-01 -0.119 0.0812 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0236 0.0629 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 1.50e-01 0.107 0.0739 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0804 0.0516 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 6.43e-01 0.0353 0.0761 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 7.70e-02 -0.155 0.0872 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0305 0.068 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 9.14e-01 0.00859 0.0796 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0831 0.0519 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0273 0.0885 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0944 0.0849 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 2.48e-01 0.0947 0.0818 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 7.34e-01 0.0285 0.0838 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 9.51e-01 0.0046 0.0751 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0741 0.0804 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 2.49e-02 -0.184 0.0816 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00486 0.0661 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 6.91e-01 0.0352 0.0883 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0573 0.0753 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0426 0.0937 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 3.93e-01 0.0732 0.0856 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0548 0.0852 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 8.14e-01 0.018 0.0765 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 5.97e-01 0.0468 0.0883 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 5.82e-01 0.0321 0.0582 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0126 0.0898 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 4.24e-01 0.0744 0.0928 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 1.91e-01 -0.109 0.083 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0547 0.0861 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0974 0.0921 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 5.70e-01 0.047 0.0827 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 9.04e-01 0.0109 0.0902 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 2.19e-01 0.112 0.0912 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 1.90e-01 -0.113 0.0862 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.07e-01 -0.149 0.0921 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 6.22e-01 0.047 0.0951 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 9.86e-01 0.00147 0.0832 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0675 0.0916 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0254 0.0322 0.26 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 9.14e-02 0.152 0.0899 0.26 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 1.71e-01 -0.121 0.0878 0.26 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 8.68e-01 0.013 0.0782 0.26 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 2.32e-01 0.114 0.0953 0.26 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00812 0.0795 0.26 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 9.56e-01 0.00501 0.0902 0.26 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 1.38e-03 0.28 0.0862 0.26 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0716 0.0781 0.26 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 3.19e-01 0.1 0.1 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0443 0.0727 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 6.16e-02 -0.157 0.0833 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 3.64e-02 0.2 0.0949 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 7.00e-02 0.157 0.086 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 1.45e-01 -0.133 0.0908 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 8.04e-01 0.0239 0.0963 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 5.79e-01 0.0476 0.0857 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 9.24e-02 -0.141 0.0832 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0798 0.0631 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 1.37e-01 -0.126 0.0846 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 8.52e-01 0.0136 0.0729 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 1.46e-02 -0.215 0.0873 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 2.49e-01 0.115 0.0993 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00387 0.0937 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 2.00e-01 -0.123 0.0957 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 8.52e-01 0.0144 0.0772 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0414 0.103 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 2.30e-01 -0.115 0.0955 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0678 0.0984 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 2.52e-01 -0.111 0.0966 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 1.24e-01 0.134 0.0869 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 1.84e-01 -0.109 0.0814 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0912 0.0618 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0354 0.0871 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0866 0.0683 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 8.84e-01 -0.013 0.0893 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 1.27e-01 0.147 0.096 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 8.90e-02 0.115 0.0668 0.256 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0592 0.0909 0.256 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 9.89e-02 -0.116 0.0698 0.256 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.14e-01 0.16 0.1 0.256 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 8.02e-01 0.018 0.0716 0.256 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00885 0.0827 0.256 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0389 0.0838 0.256 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0145 0.0975 0.256 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00478 0.0893 0.256 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 3.19e-01 0.0823 0.0823 0.256 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00433 0.0319 0.263 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0335 0.0643 0.263 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0672 0.0851 0.263 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.47e-01 0.0912 0.0627 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 4.45e-01 0.0521 0.068 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0864 0.0738 0.263 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0804 0.0632 0.263 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0416 0.0587 0.263 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 7.73e-02 -0.113 0.0638 0.263 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0953 0.0908 0.259 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0752 0.0946 0.259 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.97e-01 0.107 0.0824 0.259 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 1.66e-01 0.129 0.0928 0.259 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0864 0.0755 0.259 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 5.72e-01 0.0514 0.0909 0.251 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0801 0.0885 0.251 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 1.24e-01 0.176 0.114 0.251 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 9.23e-01 0.0105 0.108 0.251 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 7.69e-03 -0.267 0.099 0.251 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 4.55e-01 0.0588 0.0786 0.251 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 6.29e-01 0.0434 0.0897 0.251 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 3.20e-03 0.241 0.0809 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0562 0.0621 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0613 0.0825 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0037 0.0832 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 7.36e-02 -0.128 0.0712 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0417 0.0611 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 8.39e-02 0.156 0.0897 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 8.61e-01 0.0122 0.0693 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0897 0.084 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 3.71e-01 0.0829 0.0926 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0662 0.0856 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 5.47e-01 0.0403 0.0668 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 8.05e-02 -0.202 0.115 0.267 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 9.47e-03 -0.28 0.106 0.267 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 5.71e-02 0.155 0.0809 0.267 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0467 0.113 0.267 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0208 0.106 0.267 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 3.49e-01 -0.101 0.107 0.267 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 7.03e-03 0.282 0.103 0.267 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 1.51e-01 -0.139 0.0961 0.267 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 5.80e-01 0.0497 0.0895 0.253 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 1.26e-01 -0.125 0.0815 0.253 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 9.93e-01 0.000889 0.0963 0.253 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 2.06e-01 0.118 0.0929 0.253 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 3.40e-01 -0.086 0.0899 0.253 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 2.52e-01 0.0903 0.0785 0.253 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0813 0.0916 0.256 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 9.08e-01 0.00982 0.0847 0.256 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 7.56e-01 0.0316 0.101 0.256 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0183 0.0853 0.256 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0571 0.0819 0.256 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 2.94e-01 0.0802 0.0762 0.256 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 6.32e-01 0.0535 0.112 0.254 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0684 0.097 0.254 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 2.76e-01 0.112 0.102 0.254 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 8.91e-01 0.0148 0.108 0.254 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 2.19e-01 -0.115 0.0935 0.254 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0573 0.0725 0.254 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0859 0.0962 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 5.17e-01 0.0291 0.0447 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 6.84e-01 0.0367 0.0899 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0334 0.0473 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 4.21e-01 0.0599 0.0743 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0344 0.0866 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 5.61e-01 0.0377 0.0647 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 4.91e-01 0.0534 0.0774 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0897 0.0891 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 1.14e-01 0.147 0.0929 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0745 0.0925 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -175559 sc-eQTL 8.79e-01 0.00785 0.0517 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 5.56e-01 0.0499 0.0845 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0179 0.0418 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00454 0.0598 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 8.79e-01 0.0127 0.0835 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0439 0.0625 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0972 0.0653 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 566713 sc-eQTL 5.46e-01 0.0572 0.0946 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 2.35e-01 0.115 0.0961 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 108600 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0383 0.0877 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 1.78e-03 0.242 0.0764 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0158 0.0632 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0253 0.0814 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 6.45e-01 0.038 0.0823 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 9.51e-02 -0.119 0.0711 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 5.08e-01 0.0389 0.0587 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 8.66e-01 0.0145 0.0856 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0413 0.0747 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 5.09e-01 0.0598 0.0904 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 2.91e-01 0.0913 0.0862 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0934 0.0748 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 3.65e-01 0.0587 0.0646 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 186065 sc-eQTL 2.66e-01 0.0918 0.0823 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 609238 sc-eQTL 6.28e-02 -0.149 0.0799 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 475226 sc-eQTL 8.46e-02 -0.0949 0.0548 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 898413 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0941 0.0783 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 244036 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0526 0.0635 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 428605 sc-eQTL 9.06e-02 -0.144 0.0848 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 186000 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.261 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 186065 eQTL 4.02e-05 0.0784 0.019 0.0 0.0 0.251
ENSG00000111666 CHPT1 609238 eQTL 4.81e-02 -0.0549 0.0277 0.0 0.0 0.251
ENSG00000120860 WASHC3 244036 pQTL 0.00221 -0.0314 0.0103 0.0 0.0 0.252
ENSG00000120860 WASHC3 244036 eQTL 3.29e-10 -0.0855 0.0135 0.0 0.0 0.251
ENSG00000185480 PARPBP 186000 eQTL 5.69e-08 0.135 0.0248 0.00126 0.0 0.251

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 186065 3.7e-06 3.15e-06 3.66e-07 1.96e-06 4.43e-07 7.84e-07 2.08e-06 5.61e-07 1.8e-06 8.89e-07 2.48e-06 1.43e-06 3.49e-06 1.44e-06 9.62e-07 1.61e-06 1.24e-06 2.22e-06 9.61e-07 1.15e-06 8.12e-07 2.82e-06 2.28e-06 9.79e-07 4.06e-06 1.13e-06 1.39e-06 1.69e-06 2.07e-06 2.55e-06 1.49e-06 2.31e-07 4.72e-07 1.24e-06 1.26e-06 7.46e-07 8.47e-07 3.93e-07 1.11e-06 3.79e-07 3.53e-07 4.08e-06 4.65e-07 1.89e-07 3.75e-07 2.94e-07 6.24e-07 2.18e-07 2.14e-07
ENSG00000120860 WASHC3 244036 1.97e-06 2.15e-06 2.74e-07 1.51e-06 3.89e-07 8.22e-07 1.27e-06 3.97e-07 1.74e-06 6.69e-07 2.07e-06 1.25e-06 2.61e-06 6.67e-07 4.19e-07 9.69e-07 1.16e-06 1.27e-06 5.93e-07 4.42e-07 7.96e-07 1.98e-06 1.38e-06 5.73e-07 2.56e-06 9.36e-07 1.01e-06 9.36e-07 1.69e-06 1.67e-06 8.2e-07 1.86e-07 3e-07 5.51e-07 7.4e-07 4.86e-07 7.24e-07 2.97e-07 5e-07 2.08e-07 2.73e-07 2.5e-06 4.24e-07 2.07e-07 2.83e-07 3.19e-07 2.28e-07 1.16e-07 2.04e-07
ENSG00000185480 PARPBP 186000 3.7e-06 3.15e-06 3.66e-07 1.96e-06 4.43e-07 7.84e-07 2.08e-06 5.78e-07 1.8e-06 8.89e-07 2.48e-06 1.43e-06 3.49e-06 1.44e-06 9.62e-07 1.61e-06 1.24e-06 2.22e-06 9.61e-07 1.15e-06 8.12e-07 2.91e-06 2.28e-06 9.79e-07 4.06e-06 1.13e-06 1.39e-06 1.69e-06 2.07e-06 2.55e-06 1.53e-06 2.31e-07 4.72e-07 1.24e-06 1.26e-06 7.8e-07 8.47e-07 3.93e-07 1.11e-06 3.79e-07 3.53e-07 4.08e-06 4.65e-07 1.89e-07 3.75e-07 3.11e-07 6.24e-07 2.18e-07 2.27e-07