logo

Genes within 1Mb (chr12:102294676:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 3.63e-01 0.0398 0.0436 0.226 B L1
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.06e-01 0.0287 0.076 0.226 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 4.49e-01 0.035 0.0462 0.226 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 5.68e-01 0.0382 0.0668 0.226 B L1
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.11e-01 0.0243 0.0653 0.226 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 3.21e-03 -0.153 0.0512 0.226 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 2.50e-02 0.132 0.0586 0.226 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 3.00e-01 0.0978 0.094 0.226 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 2.97e-01 0.0942 0.09 0.226 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 1.45e-01 0.122 0.0838 0.226 B L1
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.04e-01 0.0271 0.0714 0.226 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 7.09e-01 -0.036 0.0964 0.226 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 5.62e-01 0.0388 0.0668 0.226 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00248 0.0723 0.226 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 4.20e-07 -0.249 0.0477 0.226 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00791 0.0863 0.226 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0612 0.0934 0.226 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0777 0.0612 0.226 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 4.26e-01 0.0682 0.0854 0.226 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 4.13e-04 -0.212 0.059 0.226 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 4.16e-01 0.0708 0.0869 0.226 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 9.50e-01 0.00613 0.0985 0.223 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 4.39e-01 0.0697 0.09 0.223 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 2.25e-01 -0.12 0.0987 0.223 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.23e-01 0.0389 0.11 0.223 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0946 0.223 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 4.79e-01 0.0553 0.078 0.223 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 4.55e-01 0.0769 0.103 0.223 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 1.02e-01 -0.134 0.0814 0.226 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 7.84e-01 -0.019 0.0693 0.226 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 2.35e-01 -0.103 0.0866 0.226 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0684 0.0891 0.226 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.13e-03 -0.253 0.0765 0.226 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 7.79e-01 0.018 0.064 0.226 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0272 0.0883 0.225 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 7.37e-01 0.0276 0.082 0.225 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0542 0.0593 0.225 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0302 0.0879 0.225 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.28e-03 -0.211 0.0646 0.225 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 4.58e-01 0.0701 0.0941 0.225 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 9.15e-01 0.0118 0.111 0.225 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 5.01e-01 0.0224 0.0333 0.226 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 1.62e-01 0.0887 0.0632 0.226 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 2.76e-01 -0.101 0.0924 0.226 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0802 0.0667 0.226 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.42e-01 0.0251 0.0761 0.226 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 9.64e-03 -0.174 0.0666 0.226 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0286 0.0811 0.226 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 2.64e-01 0.0755 0.0674 0.226 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0191 0.0786 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0299 0.0209 0.23 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 5.55e-01 0.0644 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 6.08e-01 0.0414 0.0805 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 5.42e-01 0.0699 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 1.24e-01 0.176 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 4.91e-02 -0.214 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 8.79e-01 0.0137 0.0899 0.23 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0248 0.0905 0.23 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 3.51e-01 0.0794 0.0848 0.23 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 2.60e-01 0.0494 0.0437 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0841 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0328 0.0586 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0802 0.0865 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0173 0.108 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 4.65e-02 -0.178 0.0887 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 3.35e-01 0.0925 0.0958 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 5.39e-01 0.0621 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0603 0.106 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 6.16e-02 0.189 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 6.88e-01 0.0163 0.0405 0.228 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0377 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 9.38e-01 0.00541 0.0699 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0652 0.0956 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0775 0.104 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 7.11e-02 -0.168 0.0927 0.228 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0217 0.0979 0.228 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 2.97e-01 -0.105 0.101 0.228 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0335 0.103 0.228 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0406 0.0939 0.228 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0776 0.0552 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 8.89e-01 0.014 0.1 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 2.98e-01 0.0543 0.052 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0251 0.0738 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 5.97e-02 0.184 0.097 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 2.75e-03 -0.22 0.0725 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 4.71e-01 0.0578 0.0801 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 7.45e-02 0.194 0.108 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 8.14e-01 0.0249 0.106 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 6.08e-01 -0.051 0.0993 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 1.34e-01 -0.073 0.0485 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 3.91e-01 0.0858 0.0997 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0224 0.0535 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 3.65e-01 0.0751 0.0827 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.48e-01 -0.034 0.105 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0294 0.0919 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 8.39e-03 0.238 0.0895 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0663 0.0957 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0223 0.11 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.0948 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 5.38e-01 0.0683 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0459 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 3.03e-01 0.0997 0.0966 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 9.19e-01 0.0115 0.113 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 4.09e-01 0.0895 0.108 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00823 0.0829 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0263 0.0956 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 9.03e-01 0.00904 0.0737 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0195 0.087 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 9.68e-06 -0.263 0.058 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 6.94e-02 0.154 0.0841 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 3.01e-01 -0.101 0.0975 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 1.41e-01 0.111 0.0753 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0135 0.0886 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 9.24e-04 -0.19 0.0567 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0867 0.1 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 7.28e-02 -0.173 0.0961 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0177 0.0932 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 9.35e-01 0.0078 0.0953 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 2.64e-02 -0.189 0.0844 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 4.51e-01 0.0694 0.0918 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00495 0.0943 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00166 0.0754 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.78e-01 0.0284 0.101 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 2.11e-01 -0.108 0.0857 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 4.88e-01 0.0742 0.107 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.37e-01 0.0332 0.0987 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 2.35e-01 -0.116 0.0978 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 8.56e-01 0.016 0.0881 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 8.71e-01 0.0166 0.102 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.55e-03 -0.21 0.0654 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0904 0.103 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0331 0.105 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0503 0.0942 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0495 0.0975 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 2.01e-01 0.133 0.104 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 7.90e-01 0.0249 0.0936 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 6.85e-01 0.0415 0.102 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 3.40e-01 -0.098 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0239 0.0971 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 6.77e-03 -0.279 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 5.30e-01 0.067 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 7.82e-01 0.0258 0.0932 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 2.21e-01 0.126 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 7.46e-01 0.012 0.0371 0.227 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.24e-01 0.0368 0.104 0.227 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 1.21e-01 -0.157 0.101 0.227 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 7.19e-01 0.0323 0.0898 0.227 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00785 0.11 0.227 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 3.09e-02 -0.196 0.0903 0.227 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 3.45e-01 0.0978 0.103 0.227 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 7.52e-01 0.0322 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 9.79e-01 0.00237 0.0899 0.227 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 6.68e-02 -0.203 0.11 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0551 0.0804 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0131 0.093 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 3.91e-02 -0.218 0.105 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 2.65e-01 -0.107 0.0956 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 3.16e-01 0.101 0.101 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 6.86e-01 0.0431 0.106 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 3.77e-02 0.203 0.0968 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 4.00e-01 0.0804 0.0954 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 3.95e-02 -0.148 0.0715 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.07e-01 0.0366 0.097 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 7.52e-03 -0.221 0.0818 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 3.73e-01 0.09 0.101 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 9.77e-01 0.00325 0.114 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 3.86e-01 0.0866 0.0997 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0282 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0853 0.0821 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 8.15e-02 0.191 0.109 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 6.67e-01 0.044 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0774 0.105 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0118 0.103 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0644 0.0987 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 7.37e-01 -0.031 0.0924 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 5.94e-01 0.0375 0.0701 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0975 0.0982 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.35e-02 -0.19 0.0764 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 9.76e-01 0.00308 0.101 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0701 0.109 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0206 0.078 0.211 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 3.31e-01 0.102 0.105 0.211 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 1.95e-01 0.106 0.0809 0.211 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.211 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 1.25e-01 -0.127 0.0818 0.211 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0878 0.0951 0.211 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 1.13e-01 0.153 0.0958 0.211 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 1.17e-01 0.161 0.102 0.211 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 3.67e-01 0.086 0.0951 0.211 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0131 0.0362 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 5.32e-01 0.0456 0.0729 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 8.82e-01 0.0144 0.0968 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0119 0.0716 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0425 0.0772 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.11e-01 -0.134 0.0835 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 6.43e-01 0.0334 0.072 0.226 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 1.14e-02 0.168 0.0657 0.226 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 4.55e-01 0.0546 0.0729 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.44e-01 0.0339 0.104 0.226 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0955 0.108 0.226 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 2.06e-01 -0.119 0.0939 0.226 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0261 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.0858 0.226 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 4.83e-01 0.0697 0.0992 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 4.90e-01 0.0669 0.0967 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 8.29e-01 0.027 0.125 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0935 0.117 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0782 0.11 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 3.24e-01 0.0848 0.0857 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 1.78e-01 0.132 0.0975 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0387 0.0931 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000506 0.0703 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 1.03e-01 -0.152 0.0926 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0376 0.0939 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0795 0.0808 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0116 0.069 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 2.02e-01 -0.129 0.101 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 8.63e-01 0.0134 0.0774 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0941 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.03e-01 0.0396 0.104 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 8.83e-03 -0.249 0.0943 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 8.20e-01 -0.017 0.0747 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 7.10e-01 0.0475 0.127 0.239 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 6.11e-01 0.0609 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 6.85e-02 -0.163 0.089 0.239 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 4.19e-01 0.101 0.124 0.239 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.62e-01 -0.162 0.116 0.239 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 6.99e-01 0.0459 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 7.15e-02 -0.208 0.115 0.239 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 1.96e-01 -0.137 0.106 0.239 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0442 0.102 0.231 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 6.19e-01 0.0466 0.0935 0.231 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0921 0.11 0.231 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 6.60e-01 -0.047 0.106 0.231 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.76e-04 -0.38 0.0994 0.231 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 3.91e-01 0.0772 0.0898 0.231 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0501 0.102 0.224 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0586 0.094 0.224 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.113 0.224 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0893 0.0945 0.224 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.52e-03 -0.286 0.0888 0.224 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0253 0.0848 0.224 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 9.36e-01 0.00959 0.12 0.223 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0779 0.104 0.223 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 1.27e-02 -0.273 0.108 0.223 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 3.27e-01 0.114 0.115 0.223 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0459 0.101 0.223 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0495 0.0779 0.223 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 4.01e-01 0.087 0.103 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 2.02e-01 0.0649 0.0508 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0789 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00632 0.0539 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0636 0.0845 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 7.92e-01 0.026 0.0985 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 2.19e-03 -0.223 0.072 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 5.07e-01 0.0585 0.0881 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 8.80e-01 0.0154 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 9.26e-01 0.0099 0.106 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 7.31e-02 0.188 0.105 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -187068 sc-eQTL 4.18e-02 -0.119 0.0581 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 5.56e-01 0.0567 0.096 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 6.22e-01 0.0234 0.0474 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 7.26e-01 0.0238 0.0679 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 6.97e-02 0.171 0.0941 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.75e-02 -0.168 0.0701 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 5.16e-02 0.144 0.0738 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 555204 sc-eQTL 2.91e-01 0.113 0.107 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 6.95e-01 0.0429 0.109 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 97091 sc-eQTL 4.26e-01 0.0794 0.0995 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 1.84e-01 -0.114 0.0854 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0159 0.0693 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 2.50e-01 -0.103 0.0889 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 9.39e-01 0.00686 0.0902 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 4.10e-02 -0.16 0.0777 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 6.75e-01 -0.027 0.0644 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0766 0.0992 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0429 0.0867 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 2.59e-01 -0.119 0.105 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0626 0.1 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 3.20e-05 -0.355 0.0836 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 5.92e-01 0.0403 0.0751 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 174556 sc-eQTL 2.77e-01 0.102 0.0936 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 597729 sc-eQTL 5.95e-01 0.0487 0.0915 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0527 0.0626 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 886904 sc-eQTL 6.82e-01 0.0366 0.0892 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 232527 sc-eQTL 1.70e-02 -0.172 0.0713 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 417096 sc-eQTL 9.18e-01 0.00996 0.0971 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 174491 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0399 0.114 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 597729 eQTL 1.68e-04 -0.109 0.0289 0.0 0.0 0.229
ENSG00000111670 GNPTAB 463717 eQTL 1.79e-02 -0.038 0.016 0.0 0.0 0.229
ENSG00000120860 WASHC3 232527 pQTL 0.00057 -0.0369 0.0107 0.0 0.0 0.22
ENSG00000120860 WASHC3 232527 eQTL 1.57e-22 -0.137 0.0137 0.0 0.0 0.229
ENSG00000136048 DRAM1 417096 eQTL 0.00319 0.0481 0.0163 0.0 0.0 0.229

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -187068 2.13e-06 2.51e-06 3.3e-07 1.69e-06 4.72e-07 8e-07 1.59e-06 6.48e-07 1.81e-06 8.51e-07 2.11e-06 1.26e-06 3.47e-06 1.12e-06 6.98e-07 1.52e-06 1.05e-06 2.17e-06 7.88e-07 1.19e-06 9.48e-07 2.75e-06 2.11e-06 1.01e-06 3.3e-06 1.33e-06 1.21e-06 1.42e-06 1.91e-06 1.9e-06 1.55e-06 2.87e-07 5.36e-07 1.24e-06 9.03e-07 9.66e-07 7.76e-07 4.62e-07 1.11e-06 3.54e-07 2.1e-07 3e-06 3.75e-07 2.15e-07 3.27e-07 3.08e-07 6.75e-07 2.22e-07 2.01e-07
ENSG00000111666 CHPT1 597729 3.92e-07 1.92e-07 6.41e-08 2.41e-07 1.03e-07 1.03e-07 3.11e-07 7.52e-08 2.26e-07 1.21e-07 2.62e-07 1.86e-07 3.6e-07 8.54e-08 7.79e-08 1.14e-07 6.81e-08 2.66e-07 7.53e-08 7.83e-08 1.39e-07 2.07e-07 2e-07 4.34e-08 3.14e-07 1.86e-07 1.37e-07 1.48e-07 1.54e-07 1.81e-07 1.59e-07 4.93e-08 4.74e-08 9.81e-08 7.44e-08 4.68e-08 6.14e-08 7.68e-08 5.8e-08 7.04e-08 4.79e-08 2.19e-07 3.25e-08 1.43e-08 4e-08 9.44e-09 8.21e-08 2.16e-09 4.83e-08
ENSG00000120860 WASHC3 232527 1.35e-06 1.34e-06 2.16e-07 1.27e-06 4.51e-07 6.28e-07 1.37e-06 3.83e-07 1.7e-06 6.9e-07 2.02e-06 1.18e-06 2.63e-06 3.58e-07 4.05e-07 9.61e-07 1e-06 1.17e-06 5.9e-07 5.44e-07 7e-07 1.92e-06 1.38e-06 8.07e-07 2.34e-06 8.38e-07 1.01e-06 9.33e-07 1.67e-06 1.29e-06 8.07e-07 2.78e-07 3.47e-07 6.11e-07 5.66e-07 6.26e-07 7.21e-07 2.97e-07 4.98e-07 2.03e-07 3.02e-07 2.01e-06 2.46e-07 1.32e-07 3.75e-07 2.03e-07 2.9e-07 1.39e-07 2.61e-07
ENSG00000136048 DRAM1 417096 1.01e-06 6.42e-07 1.23e-07 4.31e-07 1.09e-07 2.46e-07 6.18e-07 2.06e-07 6.52e-07 2.87e-07 9.46e-07 4.94e-07 9.97e-07 1.6e-07 3e-07 3.35e-07 4.54e-07 4.39e-07 2.65e-07 1.86e-07 2.52e-07 5.17e-07 4.01e-07 2.6e-07 1.06e-06 2.57e-07 3.68e-07 3.24e-07 5.03e-07 6.98e-07 3.77e-07 6.7e-08 5.86e-08 1.77e-07 3.38e-07 1.61e-07 1.1e-07 1.09e-07 7.63e-08 2.17e-08 1.02e-07 6.81e-07 4.12e-08 1.54e-08 1.61e-07 1.39e-08 1.27e-07 1.24e-08 6.06e-08