logo

Genes within 1Mb (chr12:102097563:AAAAC:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0491 0.0538 0.152 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 9.54e-02 -0.156 0.0931 0.152 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0444 0.0569 0.152 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 9.71e-01 0.00299 0.0824 0.152 B L1
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0773 0.0936 0.152 B L1
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0233 0.0805 0.152 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 1.97e-02 0.15 0.0636 0.152 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 4.48e-01 0.0555 0.073 0.152 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 5.59e-01 -0.068 0.116 0.152 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 3.57e-01 -0.102 0.111 0.152 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 8.22e-02 -0.18 0.103 0.152 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 8.51e-02 -0.146 0.0842 0.152 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 9.17e-01 -0.012 0.115 0.152 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.00e+00 8.3e-06 0.0794 0.152 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0238 0.0878 0.152 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0511 0.0858 0.152 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.94e-06 0.271 0.0572 0.152 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0518 0.106 0.152 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0706 0.115 0.152 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 7.32e-01 0.0259 0.0755 0.152 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0306 0.0953 0.152 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 1.35e-01 -0.157 0.105 0.152 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 1.11e-02 0.188 0.0735 0.152 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0419 0.107 0.152 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 9.68e-01 0.00462 0.116 0.153 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 8.98e-01 0.0136 0.106 0.153 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.55e-01 0.165 0.116 0.153 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 6.18e-01 0.0623 0.125 0.153 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 8.59e-01 -0.023 0.129 0.153 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 1.59e-02 0.266 0.109 0.153 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0863 0.0915 0.153 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 1.56e-01 -0.171 0.12 0.153 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 8.85e-01 0.0145 0.1 0.152 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0153 0.0851 0.152 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 2.21e-01 0.131 0.106 0.152 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 8.11e-01 0.0285 0.119 0.152 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 8.00e-01 0.0278 0.109 0.152 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.52e-03 0.279 0.0944 0.152 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 1.33e-01 -0.118 0.0781 0.152 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 2.05e-01 0.135 0.106 0.152 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0426 0.0987 0.152 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 7.74e-02 0.126 0.0711 0.152 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0653 0.115 0.152 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 5.72e-01 0.0599 0.106 0.152 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.86e-01 0.0692 0.0797 0.152 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0223 0.114 0.152 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 9.54e-01 0.00762 0.133 0.152 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 1.97e-01 0.0524 0.0406 0.152 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 9.85e-01 0.00148 0.0776 0.152 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0589 0.113 0.152 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.60e-01 -0.115 0.0814 0.152 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0598 0.128 0.152 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0266 0.0931 0.152 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 9.32e-02 0.139 0.0822 0.152 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 8.96e-01 0.013 0.0992 0.152 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 3.35e-01 0.0797 0.0825 0.152 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 6.29e-01 0.0464 0.0961 0.152 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0115 0.0268 0.138 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 9.13e-01 0.0152 0.139 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 1.36e-01 0.153 0.102 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.15e-01 0.23 0.145 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 5.47e-02 -0.271 0.14 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 3.06e-01 0.15 0.146 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 2.42e-01 -0.163 0.139 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 8.94e-02 -0.237 0.139 0.138 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 7.37e-01 0.0386 0.115 0.138 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 1.40e-01 -0.17 0.115 0.138 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0147 0.109 0.138 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0611 0.0527 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 4.29e-01 0.104 0.131 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 7.48e-01 0.0227 0.0706 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0168 0.104 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 7.87e-01 0.0313 0.116 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0902 0.13 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 2.03e-01 0.137 0.107 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0365 0.116 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0469 0.122 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 1.33e-01 -0.192 0.127 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 3.59e-01 -0.112 0.122 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 7.13e-01 0.0181 0.0492 0.151 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 8.62e-01 0.0226 0.13 0.151 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 6.83e-01 0.0346 0.0848 0.151 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0517 0.116 0.151 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0384 0.127 0.151 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 5.31e-01 0.0795 0.127 0.151 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 2.94e-01 0.119 0.113 0.151 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 4.75e-01 -0.085 0.119 0.151 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 7.05e-01 0.0463 0.122 0.151 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.151 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0424 0.114 0.151 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 1.83e-03 0.209 0.0661 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 2.05e-01 -0.155 0.122 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 4.00e-02 -0.13 0.063 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 9.78e-02 0.149 0.0894 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0272 0.107 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 3.68e-01 -0.107 0.119 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 4.52e-02 0.18 0.0894 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 3.43e-02 0.206 0.0968 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 2.45e-01 -0.155 0.132 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 9.14e-01 -0.014 0.129 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 5.40e-01 0.0742 0.121 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 1.12e-01 0.0969 0.0608 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 1.03e-02 -0.32 0.123 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0699 0.0669 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0674 0.104 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 1.14e-01 -0.19 0.12 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0269 0.132 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 1.89e-01 0.151 0.115 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0409 0.114 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0235 0.12 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 5.94e-01 0.074 0.139 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.12 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 6.75e-01 0.055 0.131 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0863 0.131 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0693 0.114 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0546 0.126 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 9.87e-01 0.00213 0.134 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00681 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 2.30e-01 -0.117 0.0972 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0526 0.112 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 8.28e-01 0.0189 0.0867 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0584 0.0944 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0687 0.102 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 4.05e-04 0.25 0.0694 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 5.33e-02 -0.199 0.103 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0342 0.119 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.65e-01 -0.128 0.092 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0176 0.116 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 6.62e-01 0.0473 0.108 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 1.39e-01 0.105 0.0706 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0126 0.121 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0137 0.116 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 8.56e-01 0.0203 0.112 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 3.22e-01 -0.12 0.121 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0215 0.115 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 4.83e-03 0.287 0.101 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 8.95e-01 0.0148 0.112 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 2.87e-01 0.122 0.114 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00721 0.0916 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 5.78e-01 0.069 0.124 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0172 0.122 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.82e-01 0.0913 0.104 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0287 0.13 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 7.48e-01 0.0383 0.119 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 3.63e-01 -0.108 0.118 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 8.51e-01 -0.02 0.106 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 9.98e-01 0.000247 0.113 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0589 0.123 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.89e-02 0.166 0.08 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 9.02e-01 0.0153 0.125 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 6.86e-01 0.0516 0.128 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 9.21e-01 0.0113 0.114 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 5.16e-01 0.0769 0.118 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 2.56e-01 -0.147 0.129 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 4.90e-01 0.0877 0.127 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0449 0.114 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 6.38e-01 0.0583 0.124 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0727 0.125 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 1.88e-01 -0.155 0.117 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 2.04e-01 0.16 0.126 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 4.39e-01 0.105 0.135 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0206 0.13 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 7.74e-01 0.0326 0.113 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 1.72e-01 -0.17 0.124 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00685 0.0442 0.147 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 4.57e-01 0.0923 0.124 0.147 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0206 0.121 0.147 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0968 0.107 0.147 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 9.12e-01 0.0143 0.128 0.147 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 6.52e-01 0.0592 0.131 0.147 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 6.66e-01 0.0471 0.109 0.147 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0445 0.124 0.147 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 7.41e-02 -0.216 0.12 0.147 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 3.25e-01 -0.106 0.107 0.147 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 1.88e-01 -0.176 0.133 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 3.32e-01 0.094 0.0968 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 8.31e-01 0.024 0.112 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 4.29e-01 -0.103 0.131 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 5.24e-01 0.0815 0.128 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0647 0.115 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 8.83e-01 0.018 0.122 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 4.02e-01 -0.108 0.128 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 4.26e-01 0.0938 0.118 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 2.67e-01 -0.128 0.115 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 6.87e-02 0.158 0.0863 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 7.11e-01 0.0448 0.121 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 4.58e-01 0.0867 0.117 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 7.97e-01 0.0258 0.1 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 6.52e-01 0.0549 0.121 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0778 0.137 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0137 0.123 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 2.80e-01 0.136 0.125 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.23e-01 0.155 0.1 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 3.68e-01 -0.119 0.132 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 2.53e-01 -0.154 0.135 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 6.79e-01 0.0519 0.125 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 4.04e-01 0.108 0.129 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 9.88e-01 0.00189 0.127 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 5.38e-02 0.227 0.117 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 3.31e-01 -0.108 0.11 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 5.20e-01 0.054 0.0839 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00121 0.117 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 5.62e-01 0.0684 0.118 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 1.00e-02 0.237 0.0914 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 3.29e-01 -0.118 0.121 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 3.24e-01 0.129 0.13 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0952 0.106 0.152 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 9.01e-01 0.0178 0.143 0.152 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0295 0.111 0.152 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0593 0.16 0.152 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 4.43e-01 0.141 0.183 0.152 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 8.54e-01 0.0208 0.113 0.152 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.35e-01 0.126 0.13 0.152 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0884 0.132 0.152 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 8.10e-01 0.037 0.153 0.152 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 8.70e-02 -0.24 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 3.22e-01 -0.129 0.13 0.152 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0385 0.0447 0.152 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 3.59e-01 -0.083 0.0902 0.152 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0433 0.12 0.152 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.33e-01 -0.133 0.0882 0.152 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0591 0.127 0.152 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0311 0.0957 0.152 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 2.22e-01 0.127 0.104 0.152 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0666 0.0891 0.152 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 9.08e-01 0.00953 0.0827 0.152 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 7.56e-01 0.0282 0.0904 0.152 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 9.03e-01 0.0155 0.127 0.152 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00511 0.132 0.152 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 8.59e-01 0.0206 0.116 0.152 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 5.43e-01 0.0766 0.126 0.152 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 2.76e-01 -0.142 0.13 0.152 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 6.37e-03 0.286 0.104 0.152 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0323 0.113 0.154 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 6.31e-01 0.0529 0.11 0.154 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 4.08e-01 0.117 0.142 0.154 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 4.81e-01 0.0908 0.128 0.154 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 7.12e-01 0.0493 0.133 0.154 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 2.03e-02 0.289 0.123 0.154 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 2.59e-01 -0.11 0.0972 0.154 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 1.09e-01 -0.178 0.11 0.154 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 8.73e-01 0.0181 0.113 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 5.73e-01 0.0481 0.0851 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.64e-01 0.157 0.113 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 8.38e-01 0.026 0.127 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 6.12e-01 0.0579 0.114 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 1.40e-02 0.24 0.0968 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0469 0.0837 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0542 0.123 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0247 0.0945 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 5.29e-02 0.222 0.114 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 9.37e-01 0.0107 0.135 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0412 0.126 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 1.15e-02 0.294 0.115 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 1.94e-01 -0.118 0.0908 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 8.42e-02 0.266 0.153 0.142 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 6.47e-01 0.0664 0.145 0.142 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0714 0.109 0.142 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0803 0.144 0.142 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0888 0.151 0.142 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.65e-01 0.128 0.141 0.142 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 4.88e-01 0.0994 0.143 0.142 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 8.10e-01 0.0338 0.141 0.142 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 3.76e-01 -0.114 0.128 0.142 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 6.45e-01 0.0557 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 4.98e-01 0.0749 0.11 0.158 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 2.69e-01 0.143 0.129 0.158 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 3.82e-01 0.106 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 3.56e-01 -0.116 0.125 0.158 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.64e-01 0.11 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0648 0.106 0.158 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 7.28e-01 0.0423 0.121 0.158 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 1.99e-01 -0.144 0.112 0.158 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0603 0.134 0.158 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000453 0.117 0.158 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 8.86e-01 0.0162 0.113 0.158 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.61e-01 0.0991 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 6.19e-03 -0.274 0.0992 0.158 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0184 0.145 0.155 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0174 0.126 0.155 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 6.40e-01 0.0623 0.133 0.155 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0893 0.133 0.155 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 6.58e-01 0.0619 0.14 0.155 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 4.05e-01 0.101 0.121 0.155 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0806 0.0939 0.155 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0503 0.125 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0456 0.0611 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 4.84e-01 0.0862 0.123 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 5.84e-01 0.0355 0.0647 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0371 0.102 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 8.36e-01 0.0217 0.105 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 7.18e-01 0.0428 0.118 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.50e-01 0.0826 0.0883 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0406 0.106 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 4.84e-01 0.0854 0.122 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 4.32e-02 -0.257 0.127 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 1.06e-01 -0.204 0.126 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -384181 sc-eQTL 1.48e-02 0.175 0.0712 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 5.97e-02 -0.222 0.117 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0741 0.0581 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 9.37e-01 0.00656 0.0835 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 6.46e-01 -0.047 0.102 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 2.12e-01 -0.146 0.116 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 9.62e-02 0.145 0.0867 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 5.25e-02 0.177 0.0907 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 358091 sc-eQTL 3.48e-01 -0.124 0.132 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 8.36e-01 0.0278 0.135 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -100022 sc-eQTL 9.95e-01 0.000738 0.122 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 8.49e-01 0.0201 0.105 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 9.07e-01 0.00999 0.0853 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 1.03e-01 0.178 0.109 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 9.93e-01 0.00107 0.13 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 7.39e-01 0.037 0.111 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 2.17e-03 0.293 0.0945 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0873 0.079 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 6.87e-01 0.0479 0.119 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0318 0.104 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 3.28e-01 0.123 0.125 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 6.89e-01 0.0484 0.121 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 3.65e-01 -0.109 0.12 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 2.26e-01 0.126 0.104 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 4.56e-01 -0.067 0.0897 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -22557 sc-eQTL 1.36e-01 0.167 0.112 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 400616 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0969 0.109 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 266604 sc-eQTL 3.17e-02 0.16 0.0742 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 817458 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00806 0.115 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 689791 sc-eQTL 5.51e-01 0.0637 0.107 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 35414 sc-eQTL 3.38e-01 0.0829 0.0863 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 219983 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00185 0.116 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -22622 sc-eQTL 9.15e-01 0.0146 0.137 0.153 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120800 UTP20 817458 eQTL 0.0351 -0.0324 0.0153 0.0012 0.0 0.158
ENSG00000120860 WASHC3 35414 pQTL 0.00178 0.0389 0.0124 0.0 0.0 0.158
ENSG00000120860 WASHC3 35414 eQTL 1.11e-09 0.102 0.0165 0.0 0.0 0.158

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 WASHC3 35414 0.00021 0.00022 2.75e-05 5.67e-05 1.99e-05 7.11e-05 0.000168 2.32e-05 0.000162 6.58e-05 0.000196 8.48e-05 0.000264 5.6e-05 2.28e-05 0.000102 6.7e-05 0.000108 3.01e-05 2.93e-05 5.83e-05 0.000193 0.00017 4.42e-05 0.000199 4.62e-05 8.01e-05 4.77e-05 0.000159 6.51e-05 9.4e-05 5.33e-06 5.87e-06 2.53e-05 3e-05 1.72e-05 6.62e-06 6.85e-06 1.32e-05 6.44e-06 3.66e-06 0.00024 1.85e-05 5.83e-07 1.35e-05 1.75e-05 1.78e-05 6.72e-06 6.82e-06