logo

Genes within 1Mb (chr12:102030605:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 3.27e-01 0.0452 0.046 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 2.96e-01 0.084 0.0801 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 9.65e-01 0.00217 0.0488 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 7.12e-01 0.0261 0.0706 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 7.19e-01 0.0289 0.0803 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.37e-01 0.0537 0.0689 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 9.77e-04 -0.18 0.0538 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 2.36e-02 0.141 0.0619 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 3.93e-01 0.0851 0.0994 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 3.35e-01 0.0918 0.0951 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 2.82e-01 0.0957 0.0887 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 8.31e-01 -0.016 0.075 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 5.74e-01 -0.057 0.101 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.86e-01 0.0284 0.0702 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0372 0.0776 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00991 0.0759 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.50e-09 -0.304 0.0489 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0664 0.0912 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 3.11e-01 -0.1 0.0988 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0803 0.0647 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0433 0.082 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 2.74e-01 0.099 0.0902 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 1.66e-04 -0.238 0.0621 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 3.59e-01 0.0846 0.0919 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0157 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 7.16e-01 0.0346 0.095 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0712 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 1.42e-01 -0.164 0.111 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.93e-01 0.0794 0.116 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 8.33e-01 -0.021 0.0997 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 5.50e-01 0.0492 0.0823 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 3.00e-01 0.112 0.108 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0765 0.0866 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0633 0.0733 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0455 0.092 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 8.78e-01 0.0158 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 2.20e-01 -0.116 0.0942 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.36e-05 -0.345 0.0797 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 8.83e-01 -0.01 0.0678 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 6.29e-01 0.0449 0.0929 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 6.11e-01 0.0439 0.0863 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0515 0.0625 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0256 0.101 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0978 0.0923 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.81e-04 -0.25 0.0676 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 2.75e-01 0.108 0.099 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 6.64e-01 0.0507 0.116 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 5.35e-01 0.0219 0.0353 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 1.12e-01 0.107 0.0668 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0863 0.098 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0689 0.0707 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 6.54e-01 0.0496 0.111 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 8.68e-01 0.0135 0.0807 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 1.60e-02 -0.172 0.0707 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0141 0.086 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 2.80e-01 0.0774 0.0715 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 2.20e-01 -0.102 0.083 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0365 0.0222 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 7.67e-01 0.0344 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 3.06e-01 0.0877 0.0855 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 4.35e-01 0.0951 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 7.83e-01 0.0325 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 9.21e-02 0.204 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 3.02e-02 -0.25 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 2.27e-01 0.14 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0208 0.0956 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0231 0.0962 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 7.82e-01 -0.025 0.0904 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00256 0.0465 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0638 0.116 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0969 0.0618 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 5.14e-01 -0.06 0.0917 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 9.35e-02 0.171 0.101 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 9.42e-01 0.00836 0.115 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.12e-02 -0.218 0.0937 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 2.05e-01 0.129 0.101 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 7.22e-01 0.0381 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 3.09e-01 -0.114 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 1.88e-01 0.142 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 4.79e-01 0.0306 0.0431 0.2 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 5.94e-01 0.0608 0.114 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0383 0.0744 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0425 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0518 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0299 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 8.80e-02 -0.169 0.0988 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0342 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 1.15e-01 -0.169 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0615 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0917 0.0998 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0935 0.058 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 5.46e-01 0.0638 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 3.31e-01 0.0534 0.0548 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0506 0.0776 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0628 0.0922 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 2.30e-02 0.233 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 6.23e-03 -0.212 0.0765 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 4.70e-01 0.0611 0.0844 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 3.74e-02 0.238 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 8.21e-01 0.0253 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 3.32e-01 -0.101 0.104 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 2.14e-02 -0.118 0.0508 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 6.41e-01 0.0491 0.105 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0511 0.0563 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.07e-01 0.0451 0.0874 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 9.02e-01 0.0125 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0648 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 9.69e-01 0.00375 0.0969 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 5.34e-03 0.265 0.0942 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0813 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0544 0.116 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 2.13e-01 0.125 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 3.07e-01 0.12 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0303 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 7.99e-01 0.0262 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0112 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0937 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 9.65e-01 0.00506 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0795 0.0869 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0653 0.1 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 8.59e-01 0.0138 0.0775 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000573 0.0844 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 8.87e-01 -0.013 0.0914 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 8.94e-07 -0.305 0.0603 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 1.38e-01 0.132 0.0886 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0833 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 8.88e-02 0.135 0.079 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0128 0.0995 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 7.64e-01 -0.028 0.0931 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 7.26e-06 -0.268 0.0583 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0644 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 1.58e-01 -0.144 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 8.44e-01 0.0194 0.0987 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0685 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 8.10e-01 0.0243 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.48e-01 -0.104 0.0901 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 5.93e-01 0.052 0.097 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0205 0.0996 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 9.32e-01 0.00684 0.0796 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0762 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.14e-01 0.0871 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 1.42e-01 -0.133 0.0904 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 4.23e-01 0.0905 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 9.67e-01 0.00426 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 1.41e-01 -0.152 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00752 0.093 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 8.45e-01 0.0194 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 8.36e-01 0.0222 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 1.06e-03 -0.229 0.0689 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0107 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 8.49e-01 0.0212 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0444 0.0995 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0731 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0557 0.112 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.20e-01 0.089 0.11 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 8.84e-01 0.0144 0.0988 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 7.12e-01 0.0399 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 3.44e-01 -0.103 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0478 0.103 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 1.28e-03 -0.352 0.108 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00797 0.119 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 8.93e-01 0.0153 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 5.93e-01 0.0531 0.0992 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 4.71e-01 0.0789 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 8.36e-01 -0.00809 0.039 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 9.84e-01 0.00225 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 4.07e-02 -0.218 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 8.93e-01 0.0127 0.0946 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0393 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0771 0.116 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 1.12e-01 -0.152 0.0956 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 7.03e-01 0.0417 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 2.95e-01 0.112 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 2.77e-01 -0.103 0.0944 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 9.01e-02 -0.198 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0552 0.0845 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 8.66e-01 0.0165 0.0977 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0811 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 1.21e-02 -0.278 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 7.79e-02 -0.177 0.1 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 6.69e-01 0.0454 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 4.91e-01 0.0772 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 3.73e-02 0.214 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 2.18e-01 0.124 0.1 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 8.37e-02 -0.131 0.0756 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 8.54e-01 0.0195 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 8.87e-01 0.0146 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 3.98e-03 -0.25 0.0859 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 1.43e-01 0.156 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 8.88e-01 0.0169 0.12 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 2.40e-01 0.125 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0679 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0456 0.0874 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 2.52e-01 -0.131 0.114 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 1.04e-01 0.189 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00718 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 3.44e-01 -0.105 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00747 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 6.97e-01 0.0404 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0505 0.0971 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.93e-01 0.0291 0.0737 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0575 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 1.49e-01 -0.149 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.93e-03 -0.24 0.0798 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 6.72e-01 0.0449 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0618 0.115 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 9.27e-01 0.00781 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 3.75e-01 0.079 0.0886 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 4.64e-01 0.0936 0.127 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 7.19e-01 -0.053 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0862 0.0898 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 5.33e-02 -0.2 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 5.43e-01 0.0643 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 2.02e-01 0.156 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 1.93e-01 0.146 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 6.47e-01 0.0477 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0147 0.0382 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 4.46e-01 0.0587 0.0769 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 7.36e-01 0.0344 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 7.07e-01 0.0284 0.0755 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 5.87e-01 0.0586 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00364 0.0816 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 3.26e-02 -0.189 0.0877 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 6.20e-01 0.0377 0.076 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 1.35e-02 0.173 0.0694 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 7.90e-01 0.0205 0.077 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 8.54e-01 0.0201 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 5.26e-01 -0.072 0.113 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 2.92e-01 -0.104 0.0988 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0129 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0157 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.41e-01 -0.106 0.0903 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 7.86e-01 0.0285 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 6.94e-01 0.0403 0.102 0.202 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 5.89e-01 0.0714 0.132 0.202 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 3.59e-01 -0.11 0.119 0.202 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.18e-01 -0.1 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 1.65e-01 -0.161 0.116 0.202 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0904 0.202 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 6.99e-02 0.187 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0109 0.0987 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0387 0.0744 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0752 0.0986 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 6.33e-01 -0.053 0.111 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0958 0.0993 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 3.94e-02 -0.176 0.085 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0454 0.0731 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 4.52e-01 -0.08 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0475 0.0813 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.82e-01 0.0407 0.0989 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 1.70e-01 0.159 0.115 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0505 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.19e-03 -0.306 0.0985 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0282 0.0785 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00389 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 8.42e-01 0.0195 0.0979 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0609 0.115 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0343 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00949 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 6.30e-05 -0.423 0.103 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 3.87e-01 0.0814 0.0939 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 9.97e-01 0.000372 0.107 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 2.59e-01 -0.112 0.0988 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0166 0.119 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 9.96e-02 -0.171 0.103 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.83e-01 -0.07 0.0997 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 7.58e-04 -0.319 0.0932 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0393 0.0893 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0263 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 1.70e-01 -0.153 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.01e-02 -0.221 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0627 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 2.56e-01 0.14 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0283 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0967 0.0829 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 3.40e-01 0.106 0.11 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 4.86e-01 0.0376 0.0538 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0167 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0686 0.0567 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0257 0.0895 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 2.18e-01 0.113 0.0918 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.74e-01 0.0747 0.104 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 1.85e-03 -0.24 0.0761 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 4.96e-01 0.0635 0.0931 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0631 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0651 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 4.07e-01 0.0924 0.111 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -451139 sc-eQTL 2.80e-02 -0.136 0.0613 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 3.76e-01 0.0897 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 9.92e-01 0.000509 0.05 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 8.52e-01 0.0134 0.0717 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0517 0.0877 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 5.03e-02 0.195 0.0991 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 3.74e-02 -0.155 0.0742 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 2.48e-02 0.176 0.0776 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 291133 sc-eQTL 2.39e-01 0.133 0.113 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 7.23e-01 0.0409 0.115 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -166980 sc-eQTL 5.35e-01 0.0652 0.105 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0719 0.0905 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0646 0.0732 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0426 0.0943 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 4.42e-01 0.0859 0.111 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0758 0.0953 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 3.74e-03 -0.239 0.0814 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0618 0.068 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0112 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0982 0.0911 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 2.81e-01 -0.119 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 3.26e-01 -0.104 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0292 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 7.99e-06 -0.4 0.0874 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 8.56e-01 0.0143 0.0791 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -89515 sc-eQTL 5.32e-02 0.191 0.0983 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 333658 sc-eQTL 4.99e-01 0.0654 0.0967 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0485 0.0662 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 750500 sc-eQTL 9.64e-01 0.00458 0.102 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 622833 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00433 0.0944 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 sc-eQTL 5.99e-03 -0.208 0.075 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 153025 sc-eQTL 5.39e-01 0.0631 0.103 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -89580 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0174 0.121 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 333658 eQTL 4.75e-05 -0.127 0.0312 0.0 0.0 0.195
ENSG00000111670 GNPTAB 199646 eQTL 2.95e-02 -0.0377 0.0173 0.0 0.0 0.195
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 pQTL 4.8e-06 -0.0528 0.0115 0.0 0.0 0.187
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 eQTL 2.04e-28 -0.167 0.0146 0.00891 0.00839 0.195

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 333658 1.21e-06 8.81e-07 2.81e-07 3.22e-07 2.28e-07 3.3e-07 7.96e-07 3.27e-07 1.11e-06 3.82e-07 1.1e-06 5.68e-07 1.35e-06 2.09e-07 4.39e-07 6e-07 7.72e-07 5.67e-07 4.49e-07 4.38e-07 3.6e-07 8.58e-07 6.26e-07 5.01e-07 1.53e-06 2.89e-07 6.23e-07 5e-07 8.4e-07 9.73e-07 4.61e-07 4.99e-08 1.72e-07 3.82e-07 3.27e-07 3.95e-07 3.4e-07 1.56e-07 1.33e-07 3.01e-08 1.99e-07 1.05e-06 5.29e-08 1.25e-08 1.64e-07 7.29e-08 1.9e-07 8.74e-08 9.51e-08
ENSG00000120860 WASHC3 -31544 1.08e-05 1.25e-05 2.43e-06 7.6e-06 2.54e-06 5.89e-06 1.59e-05 2.44e-06 1.24e-05 6.27e-06 1.6e-05 6.5e-06 2.23e-05 4.54e-06 4.13e-06 8.56e-06 7.26e-06 1.16e-05 4.21e-06 4.09e-06 6.98e-06 1.24e-05 1.25e-05 5.06e-06 2.14e-05 5.09e-06 7.21e-06 5.35e-06 1.48e-05 1.55e-05 7.73e-06 1.2e-06 1.67e-06 4.8e-06 5.86e-06 3.93e-06 2.05e-06 2.45e-06 3.25e-06 2.17e-06 1.64e-06 1.58e-05 1.79e-06 3.62e-07 1.9e-06 2.36e-06 2.46e-06 1.3e-06 1.03e-06