logo

Genes within 1Mb (chr12:102018450:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 8.34e-01 0.0177 0.084 0.06 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 8.36e-01 0.0303 0.146 0.06 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00879 0.0888 0.06 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0437 0.128 0.06 B L1
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 1.77e-01 0.197 0.145 0.06 B L1
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0397 0.126 0.06 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 3.16e-01 0.101 0.1 0.06 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 2.89e-01 -0.121 0.114 0.06 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 1.18e-01 -0.283 0.18 0.06 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 5.75e-01 0.0973 0.173 0.06 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 2.39e-01 -0.191 0.161 0.06 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.26e-01 -0.105 0.132 0.06 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 9.44e-01 0.0125 0.178 0.06 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0291 0.124 0.06 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 4.39e-01 -0.106 0.137 0.06 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 4.78e-01 -0.095 0.134 0.06 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.65e-01 0.104 0.0933 0.06 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 6.73e-02 -0.294 0.16 0.06 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 5.48e-01 -0.105 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0842 0.115 0.06 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 3.10e-01 -0.147 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 5.02e-01 0.107 0.16 0.06 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 9.78e-02 0.188 0.113 0.06 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 1.84e-01 -0.216 0.162 0.06 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 3.34e-01 -0.167 0.173 0.063 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0805 0.158 0.063 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 1.71e-01 -0.238 0.173 0.063 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 9.77e-01 0.00532 0.187 0.063 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 4.31e-01 -0.152 0.193 0.063 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 1.04e-02 0.423 0.163 0.063 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0375 0.137 0.063 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 6.83e-02 -0.329 0.179 0.063 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 5.14e-01 -0.102 0.155 0.06 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 7.95e-01 0.0343 0.132 0.06 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 3.76e-01 0.146 0.165 0.06 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 5.04e-01 -0.123 0.184 0.06 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.97e-01 0.0437 0.169 0.06 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 3.74e-04 0.523 0.145 0.06 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0319 0.121 0.06 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 5.37e-01 -0.101 0.163 0.06 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 6.79e-01 0.0629 0.152 0.06 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 3.19e-01 0.11 0.11 0.06 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 8.79e-01 0.0269 0.177 0.06 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 2.75e-01 0.177 0.162 0.06 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0553 0.123 0.06 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0236 0.174 0.06 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 7.91e-01 0.0543 0.205 0.06 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 3.96e-01 0.0539 0.0633 0.06 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.73e-01 0.0868 0.121 0.06 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 2.75e-01 -0.193 0.176 0.06 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 3.15e-01 0.128 0.127 0.06 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 7.23e-01 0.0707 0.199 0.06 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 2.30e-01 -0.174 0.145 0.06 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 1.65e-01 -0.179 0.128 0.06 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 3.67e-01 0.14 0.154 0.06 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 2.03e-01 -0.164 0.128 0.06 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0482 0.15 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0244 0.0384 0.064 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 7.60e-01 -0.061 0.199 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 7.90e-01 0.0393 0.147 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 6.06e-01 0.108 0.209 0.064 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 4.36e-03 -0.571 0.198 0.064 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 9.46e-01 0.0142 0.209 0.064 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 8.13e-02 -0.346 0.197 0.064 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 5.45e-01 -0.121 0.2 0.064 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 5.24e-01 -0.105 0.164 0.064 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 2.41e-01 0.194 0.165 0.064 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 3.49e-01 0.146 0.155 0.064 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 6.55e-02 -0.154 0.0833 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 7.10e-01 0.078 0.209 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 1.86e-01 -0.149 0.112 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 1.97e-01 -0.214 0.165 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 2.08e-02 0.424 0.182 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.60e-01 0.0634 0.208 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 3.98e-02 0.351 0.17 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 7.90e-01 -0.049 0.184 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 4.32e-01 0.152 0.193 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 3.03e-01 0.209 0.203 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0351 0.195 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0688 0.0768 0.058 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 1.33e-01 -0.305 0.202 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 3.87e-01 0.115 0.133 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 4.56e-01 0.136 0.181 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 2.04e-01 -0.253 0.199 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0697 0.198 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 7.67e-02 0.313 0.176 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 1.79e-01 -0.25 0.185 0.058 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 3.70e-02 -0.398 0.19 0.058 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0753 0.196 0.058 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 1.13e-01 -0.283 0.177 0.058 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 5.61e-01 0.0617 0.106 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0475 0.192 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0973 0.0996 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 6.45e-01 0.065 0.141 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 1.17e-01 0.262 0.167 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 5.65e-01 -0.108 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 8.01e-01 0.0357 0.142 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 5.97e-01 0.0812 0.153 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 1.87e-01 -0.275 0.208 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 6.98e-01 0.0789 0.203 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 2.77e-01 -0.207 0.19 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 9.68e-01 0.0037 0.0912 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 8.79e-01 0.0284 0.187 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0996 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 2.17e-01 0.191 0.154 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 6.09e-01 0.092 0.18 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 1.11e-01 -0.314 0.196 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 1.70e-01 0.235 0.171 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 7.75e-01 0.0486 0.17 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 3.82e-01 -0.157 0.179 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 8.54e-01 0.0379 0.207 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 8.01e-01 -0.045 0.178 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 7.89e-01 0.0536 0.2 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0702 0.201 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 1.85e-01 0.232 0.175 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 3.37e-01 0.185 0.193 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 3.67e-01 0.184 0.204 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.03e-01 0.249 0.195 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 1.78e-01 -0.203 0.15 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0433 0.174 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 9.76e-01 0.004 0.134 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 4.85e-01 -0.102 0.146 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0831 0.158 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 3.95e-01 0.094 0.11 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.39e-01 -0.124 0.16 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 7.25e-01 0.0649 0.184 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 4.57e-01 -0.106 0.143 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 1.10e-01 -0.285 0.178 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0688 0.167 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 3.67e-01 0.099 0.11 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.06e-01 -0.159 0.191 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 4.09e-01 0.152 0.184 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 8.96e-01 0.0233 0.178 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 2.52e-01 0.22 0.192 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 1.15e-01 -0.286 0.18 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 6.46e-01 0.0748 0.163 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.39e-01 -0.129 0.166 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 9.62e-01 0.00817 0.171 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0283 0.137 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 1.50e-01 -0.266 0.184 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.97e-01 -0.047 0.183 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.06e-02 0.359 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 2.43e-03 -0.582 0.19 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 1.52e-01 -0.26 0.181 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 1.75e-01 -0.245 0.18 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0961 0.162 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 8.76e-01 -0.027 0.173 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 4.85e-01 0.131 0.187 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 4.53e-01 0.0927 0.123 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 5.08e-01 0.126 0.19 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0104 0.2 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 5.78e-01 0.0995 0.179 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 5.45e-01 0.112 0.185 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0625 0.202 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 5.81e-01 0.11 0.198 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0745 0.178 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 5.57e-01 0.114 0.193 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.41e-01 -0.151 0.195 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 3.88e-01 -0.16 0.185 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 5.87e-01 -0.108 0.198 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 3.28e-01 0.208 0.212 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 8.67e-01 0.034 0.203 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 4.30e-01 -0.14 0.177 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 6.70e-01 0.0835 0.196 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 2.78e-02 0.147 0.0662 0.061 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 7.85e-01 0.0514 0.188 0.061 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 9.59e-01 0.00939 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00569 0.162 0.061 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 6.26e-01 0.0949 0.194 0.061 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 2.61e-01 -0.223 0.198 0.061 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 1.87e-02 -0.386 0.163 0.061 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0105 0.187 0.061 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 8.93e-02 -0.311 0.182 0.061 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0208 0.162 0.061 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 5.95e-01 0.106 0.2 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00775 0.145 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 5.19e-01 -0.108 0.167 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 6.48e-01 0.089 0.195 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 3.77e-01 0.168 0.19 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.11e-01 0.215 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0637 0.181 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 4.46e-01 0.146 0.191 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.67e-01 -0.131 0.179 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 2.55e-01 0.199 0.175 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 9.54e-02 0.22 0.132 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 8.21e-01 0.0418 0.184 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 4.54e-01 0.133 0.178 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 4.50e-01 -0.115 0.152 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0584 0.185 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 5.39e-01 0.128 0.208 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 5.10e-01 -0.123 0.187 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0837 0.192 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 2.10e-01 0.193 0.154 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 3.07e-01 0.206 0.201 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 5.63e-01 0.119 0.206 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0547 0.191 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 4.34e-01 0.154 0.196 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 5.72e-01 -0.109 0.193 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0584 0.183 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0807 0.171 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 2.94e-01 0.136 0.13 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0875 0.181 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.68e-01 0.0539 0.183 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.60e-01 -0.162 0.143 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 5.83e-01 0.103 0.187 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 7.98e-01 0.0517 0.202 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 4.90e-01 -0.107 0.155 0.056 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 3.26e-01 0.205 0.208 0.056 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 5.27e-01 -0.102 0.162 0.056 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 5.70e-02 -0.44 0.229 0.056 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 3.54e-01 0.248 0.266 0.056 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.28e-01 0.0572 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 1.74e-01 0.258 0.188 0.056 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 2.16e-01 -0.238 0.191 0.056 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 4.22e-01 -0.18 0.223 0.056 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 6.24e-02 -0.38 0.202 0.056 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 3.29e-01 -0.185 0.189 0.056 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 9.76e-02 -0.114 0.0684 0.059 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.67e-02 0.275 0.138 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 2.11e-01 -0.23 0.183 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 6.87e-01 -0.055 0.136 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 1.46e-01 0.282 0.193 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 5.01e-01 0.099 0.147 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 8.53e-01 0.0298 0.16 0.059 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0406 0.137 0.059 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 4.37e-01 0.0987 0.127 0.059 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 3.54e-01 -0.129 0.139 0.059 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 2.62e-01 0.215 0.191 0.06 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0153 0.199 0.06 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 1.66e-01 -0.241 0.173 0.06 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 3.10e-01 -0.192 0.189 0.06 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 8.48e-01 0.0375 0.196 0.06 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 1.48e-01 0.23 0.158 0.06 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0171 0.18 0.061 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 4.80e-01 -0.124 0.176 0.061 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 4.44e-01 -0.174 0.227 0.061 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0324 0.206 0.061 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 2.86e-01 -0.228 0.213 0.061 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 1.59e-02 0.48 0.197 0.061 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0318 0.156 0.061 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 3.58e-01 -0.164 0.178 0.061 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 1.79e-01 -0.235 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 4.55e-01 0.0988 0.132 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 1.19e-01 0.273 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 5.88e-01 -0.107 0.197 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.25e-01 0.0622 0.176 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.28e-03 0.46 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 5.41e-01 0.0793 0.13 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 2.32e-01 -0.225 0.188 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00539 0.144 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 4.85e-01 0.123 0.175 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 7.42e-01 0.0679 0.206 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 4.74e-01 0.138 0.193 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 6.93e-03 0.479 0.176 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 8.80e-01 -0.021 0.139 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 4.92e-01 0.132 0.191 0.058 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0307 0.175 0.058 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 6.38e-01 0.097 0.206 0.058 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 5.11e-01 -0.127 0.193 0.058 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 4.12e-01 0.164 0.199 0.058 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 6.36e-02 0.356 0.191 0.058 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0131 0.168 0.058 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 9.81e-01 0.00441 0.184 0.061 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 5.93e-01 0.091 0.17 0.061 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 5.13e-01 -0.133 0.203 0.061 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 1.03e-01 -0.289 0.177 0.061 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 2.99e-02 -0.37 0.169 0.061 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 3.95e-01 0.14 0.164 0.061 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 3.17e-01 0.153 0.153 0.061 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 1.19e-01 -0.338 0.216 0.062 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 6.70e-01 0.0807 0.189 0.062 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 4.97e-01 -0.136 0.2 0.062 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 5.36e-01 0.123 0.199 0.062 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 3.33e-01 -0.203 0.209 0.062 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.77e-02 0.4 0.18 0.062 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 5.17e-01 0.0917 0.141 0.062 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0106 0.188 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 3.80e-01 -0.085 0.0966 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0697 0.194 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 6.88e-01 0.041 0.102 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 9.34e-01 0.0134 0.161 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 7.99e-01 0.0423 0.165 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 5.89e-01 0.101 0.187 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.32e-02 0.316 0.138 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 1.26e-01 -0.255 0.166 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 3.98e-01 -0.163 0.193 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 2.23e-01 0.246 0.201 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 5.48e-01 -0.12 0.2 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -463294 sc-eQTL 3.67e-01 0.102 0.113 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0433 0.185 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0639 0.0911 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 5.84e-01 0.0715 0.131 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 9.93e-02 0.263 0.159 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 2.53e-01 -0.208 0.182 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 3.93e-01 0.117 0.136 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 2.98e-01 0.149 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 278978 sc-eQTL 1.09e-01 -0.33 0.205 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 6.46e-01 0.0969 0.21 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -179135 sc-eQTL 3.56e-01 -0.177 0.191 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 1.20e-01 -0.25 0.16 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 3.70e-01 0.117 0.13 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 1.45e-01 0.244 0.167 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0829 0.198 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 6.38e-01 0.0797 0.169 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 1.10e-04 0.561 0.142 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 8.12e-01 0.0288 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 3.73e-01 0.161 0.181 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 7.38e-01 0.053 0.158 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0798 0.192 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 8.61e-02 -0.316 0.183 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 4.36e-01 -0.143 0.183 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 2.64e-01 0.178 0.158 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 6.23e-01 0.0675 0.137 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -101670 sc-eQTL 5.50e-01 -0.104 0.173 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 321503 sc-eQTL 6.31e-01 0.0811 0.169 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 187491 sc-eQTL 2.78e-01 0.125 0.115 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 738345 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0162 0.177 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 610678 sc-eQTL 7.55e-01 0.0514 0.165 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 sc-eQTL 3.84e-01 -0.116 0.133 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 140870 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00254 0.179 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -101735 sc-eQTL 5.86e-01 0.115 0.21 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 321503 eQTL 9.42e-03 0.142 0.0544 0.0 0.0 0.0594
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 pQTL 0.0213 0.0469 0.0204 0.0 0.0 0.0571
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 eQTL 4.89e-05 0.109 0.0268 0.0 0.0 0.0594

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 321503 1.27e-06 9.47e-07 2.95e-07 9.69e-07 2.19e-07 4.7e-07 1.09e-06 2.73e-07 1.11e-06 3.76e-07 1.32e-06 5.76e-07 2e-06 2.88e-07 4.31e-07 8.25e-07 7.73e-07 5.75e-07 4.24e-07 6.25e-07 2.93e-07 1.08e-06 7.39e-07 4.22e-07 2.05e-06 2.4e-07 7.55e-07 5.78e-07 7.61e-07 9.45e-07 5.45e-07 9.54e-08 1.21e-07 4.29e-07 4.36e-07 3.05e-07 3.37e-07 1.21e-07 7.56e-08 3.21e-07 1.14e-07 1.62e-06 5.58e-08 5.93e-09 1.82e-07 7.91e-08 1.83e-07 3.13e-08 5.95e-08
ENSG00000120860 WASHC3 -43699 1.45e-05 1.52e-05 2.05e-06 9.13e-06 2.32e-06 6.19e-06 1.68e-05 2.14e-06 1.28e-05 6.27e-06 1.69e-05 6.87e-06 2.3e-05 5.79e-06 4.13e-06 9e-06 6.42e-06 1.18e-05 3.32e-06 3.14e-06 6.54e-06 1.27e-05 1.21e-05 3.37e-06 2.32e-05 4.45e-06 7.57e-06 5.28e-06 1.31e-05 1.06e-05 8.7e-06 9.86e-07 1.23e-06 3.68e-06 5.87e-06 2.62e-06 1.85e-06 2.03e-06 2.18e-06 1.74e-06 1.04e-06 1.88e-05 2.39e-06 1.51e-07 8.04e-07 1.96e-06 2.13e-06 7.66e-07 4.32e-07