logo

Genes within 1Mb (chr12:102010690:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 3.40e-01 0.044 0.046 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 2.90e-01 0.0849 0.0801 0.201 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00418 0.0488 0.201 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 6.78e-01 0.0294 0.0706 0.201 B L1
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 8.05e-01 0.0199 0.0803 0.201 B L1
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 3.42e-01 0.0656 0.0688 0.201 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 8.32e-04 -0.182 0.0538 0.201 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 1.40e-02 0.153 0.0618 0.201 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 3.93e-01 0.0851 0.0994 0.201 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 3.35e-01 0.0919 0.0951 0.201 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 2.53e-01 0.102 0.0886 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 9.26e-01 -0.007 0.075 0.201 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0532 0.101 0.201 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 7.82e-01 0.0194 0.0702 0.201 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0311 0.0776 0.201 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0174 0.0759 0.201 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 4.59e-09 -0.3 0.049 0.201 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0685 0.0914 0.201 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0924 0.0989 0.201 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0795 0.0648 0.201 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 7.70e-01 -0.024 0.0821 0.201 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 2.70e-01 0.1 0.0904 0.201 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.12e-04 -0.235 0.0623 0.201 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 2.71e-01 0.101 0.092 0.201 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0149 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 7.27e-01 0.0332 0.0949 0.2 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0638 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 1.46e-01 -0.163 0.111 0.2 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 4.26e-01 0.0921 0.116 0.2 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0211 0.0997 0.2 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 4.91e-01 0.0567 0.0822 0.2 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 3.35e-01 0.104 0.108 0.2 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 4.68e-01 -0.063 0.0866 0.201 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0572 0.0733 0.201 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0326 0.0921 0.201 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00623 0.103 0.201 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 2.11e-01 -0.118 0.0942 0.201 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 5.11e-05 -0.331 0.08 0.201 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0198 0.0678 0.201 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 8.41e-01 0.0187 0.0931 0.2 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.89e-01 0.0467 0.0864 0.2 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0608 0.0625 0.2 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0127 0.101 0.2 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 2.27e-01 -0.112 0.0923 0.2 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 7.67e-05 -0.271 0.0673 0.2 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 2.84e-01 0.106 0.0991 0.2 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 5.33e-01 0.0728 0.116 0.2 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 5.24e-01 0.0225 0.0353 0.201 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 1.19e-01 0.105 0.0669 0.201 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0899 0.0981 0.201 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0721 0.0707 0.201 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 5.91e-01 0.0596 0.111 0.201 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 8.59e-01 0.0143 0.0807 0.201 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.73e-02 -0.17 0.0708 0.201 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0205 0.0861 0.201 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 2.17e-01 0.0885 0.0715 0.201 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 1.63e-01 -0.116 0.083 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 9.55e-02 -0.0371 0.0221 0.204 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 7.54e-01 0.0364 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 3.87e-01 0.0741 0.0854 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 4.35e-01 0.0949 0.121 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 8.59e-01 0.0209 0.118 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 5.92e-02 0.228 0.12 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.45e-02 -0.259 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 2.50e-01 0.134 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00867 0.0955 0.204 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0308 0.0961 0.204 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0316 0.0902 0.204 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 9.85e-01 -0.000891 0.0465 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0736 0.116 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0982 0.0618 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0748 0.0918 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 1.13e-01 0.162 0.102 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 9.67e-01 0.00482 0.115 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 3.02e-02 -0.205 0.0939 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 2.10e-01 0.128 0.101 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 6.41e-01 0.0499 0.107 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0998 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 2.38e-01 0.127 0.107 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 4.73e-01 0.0309 0.043 0.203 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 6.09e-01 0.0582 0.114 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0437 0.0742 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0233 0.102 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0369 0.112 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0014 0.111 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.05e-01 -0.161 0.0987 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0095 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 8.19e-02 -0.186 0.106 0.203 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0483 0.11 0.203 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0684 0.0997 0.203 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 1.15e-01 -0.092 0.0581 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 4.92e-01 0.0727 0.106 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.08e-01 0.0364 0.0549 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0389 0.0777 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0733 0.0921 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 1.66e-02 0.245 0.102 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 3.97e-03 -0.223 0.0764 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 3.32e-01 0.082 0.0843 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 4.21e-02 0.232 0.114 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 9.85e-01 0.00216 0.112 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0761 0.104 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 2.40e-02 -0.115 0.0507 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 7.51e-01 0.0334 0.105 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0461 0.0562 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 4.93e-01 0.0599 0.0872 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000268 0.101 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0506 0.111 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 9.20e-01 0.00978 0.0967 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 9.09e-03 0.248 0.0943 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0752 0.101 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 7.18e-01 -0.042 0.116 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 2.46e-01 0.116 0.0999 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 3.04e-01 0.121 0.117 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0418 0.118 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 7.34e-01 0.035 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 9.61e-01 0.00548 0.113 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 4.01e-01 -0.101 0.12 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 9.27e-01 0.0105 0.115 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0644 0.0869 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0594 0.1 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 9.75e-01 0.00242 0.0774 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 9.24e-01 0.00806 0.0843 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0136 0.0913 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.52e-06 -0.299 0.0604 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 1.69e-01 0.122 0.0886 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 4.71e-01 -0.074 0.103 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 1.49e-01 0.114 0.0791 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0236 0.0994 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0354 0.093 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 8.06e-06 -0.267 0.0582 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0735 0.106 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 2.21e-01 -0.125 0.102 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 8.42e-01 0.0197 0.0985 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0672 0.106 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 6.71e-01 0.0428 0.101 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.44e-01 -0.105 0.0899 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 5.84e-01 0.0532 0.0971 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0168 0.0996 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 9.23e-01 0.00768 0.0797 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 4.58e-01 -0.08 0.108 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 4.23e-01 0.0854 0.106 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.38e-01 -0.135 0.0904 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 3.50e-01 0.106 0.113 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 9.30e-01 0.00918 0.104 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 1.78e-01 -0.139 0.103 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0144 0.0929 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 7.06e-01 0.0373 0.0987 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 8.52e-01 0.02 0.107 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.39e-03 -0.223 0.0689 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 9.56e-01 0.00597 0.109 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 9.49e-01 0.00715 0.111 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0438 0.0994 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0669 0.103 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0596 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 3.73e-01 0.0983 0.11 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 8.29e-01 0.0214 0.0987 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 6.27e-01 0.0524 0.108 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 2.38e-01 -0.129 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0684 0.103 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 1.92e-03 -0.34 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00463 0.119 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 9.20e-01 0.0114 0.114 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 6.18e-01 0.0496 0.0993 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 4.76e-01 0.0782 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 8.38e-01 -0.00798 0.0391 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 9.72e-01 0.00381 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 3.54e-02 -0.224 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 8.36e-01 0.0197 0.0947 0.203 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0331 0.113 0.203 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0818 0.116 0.203 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.29e-01 -0.146 0.0957 0.203 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 7.48e-01 0.0351 0.109 0.203 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.107 0.203 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 2.38e-01 -0.112 0.0944 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 5.79e-02 -0.221 0.116 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0372 0.0844 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 9.15e-01 0.0105 0.0976 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0733 0.114 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 8.87e-03 -0.289 0.109 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 4.77e-02 -0.199 0.0997 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 6.05e-01 0.0549 0.106 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 3.42e-01 0.106 0.112 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 6.48e-02 0.19 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 2.54e-01 0.115 0.101 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 5.03e-02 -0.149 0.0755 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 7.67e-01 0.0313 0.106 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 6.96e-01 0.04 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.31e-03 -0.265 0.0858 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 1.60e-01 0.15 0.106 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 8.13e-01 0.0284 0.12 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 2.53e-01 0.121 0.106 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0596 0.109 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0486 0.0874 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 2.61e-01 -0.128 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 1.60e-01 0.164 0.116 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0269 0.108 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0931 0.111 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 9.84e-01 0.0022 0.11 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 7.01e-01 0.0399 0.104 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0517 0.0971 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 7.61e-01 0.0225 0.0738 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0434 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 8.52e-02 -0.178 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.17e-03 -0.247 0.0797 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 8.31e-01 0.0226 0.106 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0692 0.115 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 9.27e-01 0.00781 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 3.75e-01 0.079 0.0886 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 4.64e-01 0.0936 0.127 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 7.19e-01 -0.053 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0862 0.0898 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 5.33e-02 -0.2 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 5.43e-01 0.0643 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 2.02e-01 0.156 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 1.93e-01 0.146 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 6.47e-01 0.0477 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0155 0.0382 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 4.31e-01 0.0607 0.0769 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 8.81e-01 0.0153 0.102 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 8.11e-01 0.0181 0.0755 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 5.20e-01 0.0695 0.108 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00417 0.0815 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 3.30e-02 -0.188 0.0877 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 6.86e-01 0.0308 0.076 0.2 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 5.04e-03 0.196 0.0691 0.2 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 9.13e-01 0.00843 0.077 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 8.53e-01 0.0203 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0688 0.113 0.201 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 2.28e-01 -0.12 0.0988 0.201 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00181 0.108 0.201 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0419 0.112 0.201 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.61e-01 -0.102 0.0904 0.201 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 7.85e-01 0.0286 0.105 0.205 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 7.30e-01 0.0353 0.102 0.205 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 5.25e-01 0.0837 0.131 0.205 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0967 0.119 0.205 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0838 0.123 0.205 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.70e-01 -0.159 0.115 0.205 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 2.22e-01 0.11 0.0901 0.205 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 7.41e-02 0.184 0.102 0.205 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00547 0.0986 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0334 0.0743 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0735 0.0986 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0698 0.111 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 2.83e-01 -0.107 0.0992 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 4.08e-02 -0.175 0.0849 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0502 0.073 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0692 0.106 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0423 0.0813 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 5.29e-01 0.0623 0.0988 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 2.20e-01 0.142 0.115 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 6.93e-01 -0.043 0.109 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 5.25e-03 -0.279 0.0989 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0382 0.0785 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 6.64e-01 0.0586 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 4.19e-01 0.102 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 1.46e-02 -0.23 0.0932 0.212 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0185 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 4.51e-01 0.0995 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.11e-01 -0.154 0.122 0.212 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 8.47e-01 0.0241 0.125 0.212 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 9.75e-02 -0.203 0.121 0.212 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 8.30e-02 -0.194 0.111 0.212 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 9.86e-01 0.00194 0.107 0.204 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 7.21e-01 0.035 0.0977 0.204 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0533 0.115 0.204 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0308 0.107 0.204 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0059 0.111 0.204 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 8.74e-05 -0.414 0.103 0.204 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 4.55e-01 0.0702 0.0938 0.204 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 8.53e-01 0.0199 0.107 0.197 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 2.06e-01 -0.125 0.0987 0.197 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000977 0.119 0.197 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 8.99e-02 -0.176 0.103 0.197 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0724 0.0996 0.197 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.12e-03 -0.309 0.0934 0.197 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 6.39e-01 -0.042 0.0893 0.197 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0263 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 1.70e-01 -0.153 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 6.01e-02 -0.221 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0627 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 2.56e-01 0.14 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0283 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0967 0.0829 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 3.40e-01 0.106 0.11 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 4.72e-01 0.0388 0.0538 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0244 0.108 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0722 0.0567 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0291 0.0895 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 2.43e-01 0.107 0.0919 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 3.85e-01 0.0905 0.104 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.70e-03 -0.231 0.0762 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 4.40e-01 0.072 0.0931 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0522 0.107 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0501 0.112 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 4.01e-01 0.0937 0.111 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -471054 sc-eQTL 2.97e-02 -0.134 0.0613 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 3.41e-01 0.0965 0.101 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0065 0.0501 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 7.56e-01 0.0223 0.0717 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0619 0.0876 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 3.48e-02 0.21 0.099 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 3.06e-02 -0.161 0.0741 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 1.34e-02 0.193 0.0775 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 271218 sc-eQTL 2.62e-01 0.127 0.113 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 8.13e-01 0.0273 0.116 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -186895 sc-eQTL 4.36e-01 0.082 0.105 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0618 0.0905 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0583 0.0732 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0325 0.0943 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 5.69e-01 0.0635 0.111 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0804 0.0952 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 6.03e-03 -0.226 0.0815 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 3.11e-01 -0.069 0.0679 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 9.37e-01 0.00828 0.105 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0966 0.091 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 3.42e-01 -0.105 0.11 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 3.10e-01 -0.108 0.106 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0296 0.106 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 1.43e-05 -0.389 0.0876 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 9.60e-01 0.00399 0.0791 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -109430 sc-eQTL 8.23e-02 0.172 0.0986 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 313743 sc-eQTL 5.39e-01 0.0596 0.0968 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0584 0.0663 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 730585 sc-eQTL 8.75e-01 0.016 0.102 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 602918 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0144 0.0945 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 sc-eQTL 2.72e-03 -0.227 0.0749 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 133110 sc-eQTL 5.88e-01 0.0558 0.103 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -109495 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00733 0.121 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 313743 eQTL 4.21e-05 -0.129 0.0313 0.0 0.0 0.196
ENSG00000111670 GNPTAB 179731 eQTL 3.44e-02 -0.0368 0.0174 0.0 0.0 0.196
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 pQTL 5.94e-06 -0.0525 0.0115 0.0 0.0 0.187
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 eQTL 1.4500000000000002e-27 -0.165 0.0147 0.00657 0.00587 0.196

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 313743 1.36e-06 1.39e-06 2.7e-07 1.18e-06 2.93e-07 6.73e-07 1.63e-06 3.41e-07 1.4e-06 4.24e-07 1.76e-06 6.6e-07 2.43e-06 3.26e-07 5.03e-07 9.19e-07 7.74e-07 6.5e-07 7.02e-07 6.86e-07 5.47e-07 1.75e-06 8.68e-07 5.53e-07 2.39e-06 2.99e-07 1.04e-06 7.27e-07 1.07e-06 1.23e-06 6.82e-07 1.18e-07 2.34e-07 5.46e-07 5.34e-07 3.96e-07 5.19e-07 1.36e-07 1.38e-07 9.18e-08 8.42e-08 1.62e-06 3.37e-07 1.06e-07 1.34e-07 1.26e-07 1.9e-07 8.31e-08 5.39e-08
ENSG00000120860 WASHC3 -51459 1.48e-05 1.67e-05 2.23e-06 1.06e-05 2.42e-06 5.96e-06 1.46e-05 2.51e-06 1.29e-05 5.93e-06 1.74e-05 6.94e-06 2.24e-05 6.73e-06 4.15e-06 8.32e-06 6.79e-06 1.13e-05 3.56e-06 3.29e-06 6.79e-06 1.22e-05 1.24e-05 3.41e-06 2.61e-05 4.39e-06 7.6e-06 5.22e-06 1.33e-05 1.14e-05 8.68e-06 1.04e-06 1.29e-06 3.54e-06 7.35e-06 2.69e-06 1.71e-06 1.93e-06 2.11e-06 1.19e-06 8.59e-07 1.97e-05 2.34e-06 1.32e-07 8.03e-07 1.7e-06 2.04e-06 8.43e-07 4.14e-07