logo

Genes within 1Mb (chr12:102005601:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 3.40e-01 0.044 0.046 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 2.90e-01 0.0849 0.0801 0.201 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00418 0.0488 0.201 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 6.78e-01 0.0294 0.0706 0.201 B L1
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 8.05e-01 0.0199 0.0803 0.201 B L1
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 3.42e-01 0.0656 0.0688 0.201 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 8.32e-04 -0.182 0.0538 0.201 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 1.40e-02 0.153 0.0618 0.201 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 3.93e-01 0.0851 0.0994 0.201 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 3.35e-01 0.0919 0.0951 0.201 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 2.53e-01 0.102 0.0886 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 9.26e-01 -0.007 0.075 0.201 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0532 0.101 0.201 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 7.82e-01 0.0194 0.0702 0.201 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0311 0.0776 0.201 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0174 0.0759 0.201 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 4.59e-09 -0.3 0.049 0.201 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0685 0.0914 0.201 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0924 0.0989 0.201 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0795 0.0648 0.201 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 7.70e-01 -0.024 0.0821 0.201 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 2.70e-01 0.1 0.0904 0.201 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.12e-04 -0.235 0.0623 0.201 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 2.71e-01 0.101 0.092 0.201 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0149 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 7.27e-01 0.0332 0.0949 0.2 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0638 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 1.46e-01 -0.163 0.111 0.2 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 4.26e-01 0.0921 0.116 0.2 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0211 0.0997 0.2 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 4.91e-01 0.0567 0.0822 0.2 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 3.35e-01 0.104 0.108 0.2 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 4.68e-01 -0.063 0.0866 0.201 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0572 0.0733 0.201 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0326 0.0921 0.201 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00623 0.103 0.201 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 2.11e-01 -0.118 0.0942 0.201 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 5.11e-05 -0.331 0.08 0.201 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0198 0.0678 0.201 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 8.41e-01 0.0187 0.0931 0.2 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.89e-01 0.0467 0.0864 0.2 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0608 0.0625 0.2 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0127 0.101 0.2 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 2.27e-01 -0.112 0.0923 0.2 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 7.67e-05 -0.271 0.0673 0.2 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 2.84e-01 0.106 0.0991 0.2 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 5.33e-01 0.0728 0.116 0.2 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 5.24e-01 0.0225 0.0353 0.201 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 1.19e-01 0.105 0.0669 0.201 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0899 0.0981 0.201 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0721 0.0707 0.201 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 5.91e-01 0.0596 0.111 0.201 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 8.59e-01 0.0143 0.0807 0.201 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.73e-02 -0.17 0.0708 0.201 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0205 0.0861 0.201 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 2.17e-01 0.0885 0.0715 0.201 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 1.63e-01 -0.116 0.083 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 9.55e-02 -0.0371 0.0221 0.204 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 7.54e-01 0.0364 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 3.87e-01 0.0741 0.0854 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 4.35e-01 0.0949 0.121 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 8.59e-01 0.0209 0.118 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 5.92e-02 0.228 0.12 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.45e-02 -0.259 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 2.50e-01 0.134 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00867 0.0955 0.204 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0308 0.0961 0.204 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0316 0.0902 0.204 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 9.85e-01 -0.000891 0.0465 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0736 0.116 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0982 0.0618 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0748 0.0918 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 1.13e-01 0.162 0.102 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 9.67e-01 0.00482 0.115 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 3.02e-02 -0.205 0.0939 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 2.10e-01 0.128 0.101 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 6.41e-01 0.0499 0.107 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0998 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 2.38e-01 0.127 0.107 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 4.73e-01 0.0309 0.043 0.203 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 6.09e-01 0.0582 0.114 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0437 0.0742 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0233 0.102 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0369 0.112 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0014 0.111 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.05e-01 -0.161 0.0987 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0095 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 8.19e-02 -0.186 0.106 0.203 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0483 0.11 0.203 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0684 0.0997 0.203 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 1.15e-01 -0.092 0.0581 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 4.92e-01 0.0727 0.106 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.08e-01 0.0364 0.0549 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0389 0.0777 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0733 0.0921 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 1.66e-02 0.245 0.102 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 3.97e-03 -0.223 0.0764 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 3.32e-01 0.082 0.0843 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 4.21e-02 0.232 0.114 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 9.85e-01 0.00216 0.112 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0761 0.104 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 2.40e-02 -0.115 0.0507 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 7.51e-01 0.0334 0.105 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0461 0.0562 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 4.93e-01 0.0599 0.0872 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000268 0.101 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0506 0.111 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 9.20e-01 0.00978 0.0967 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 9.09e-03 0.248 0.0943 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0752 0.101 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 7.18e-01 -0.042 0.116 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 2.46e-01 0.116 0.0999 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 3.04e-01 0.121 0.117 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0418 0.118 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 7.34e-01 0.035 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 9.61e-01 0.00548 0.113 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 4.01e-01 -0.101 0.12 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 9.27e-01 0.0105 0.115 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0644 0.0869 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0594 0.1 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 9.75e-01 0.00242 0.0774 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 9.24e-01 0.00806 0.0843 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0136 0.0913 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.52e-06 -0.299 0.0604 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 1.69e-01 0.122 0.0886 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 4.71e-01 -0.074 0.103 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 1.49e-01 0.114 0.0791 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0236 0.0994 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0354 0.093 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 8.06e-06 -0.267 0.0582 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0735 0.106 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 2.21e-01 -0.125 0.102 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 8.42e-01 0.0197 0.0985 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0672 0.106 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 6.71e-01 0.0428 0.101 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.44e-01 -0.105 0.0899 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 5.84e-01 0.0532 0.0971 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0168 0.0996 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 9.23e-01 0.00768 0.0797 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 4.58e-01 -0.08 0.108 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 4.23e-01 0.0854 0.106 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.38e-01 -0.135 0.0904 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 3.50e-01 0.106 0.113 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 9.30e-01 0.00918 0.104 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 1.78e-01 -0.139 0.103 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0144 0.0929 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 7.06e-01 0.0373 0.0987 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 8.52e-01 0.02 0.107 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.39e-03 -0.223 0.0689 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 9.56e-01 0.00597 0.109 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 9.49e-01 0.00715 0.111 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0438 0.0994 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0669 0.103 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0596 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 3.73e-01 0.0983 0.11 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 8.29e-01 0.0214 0.0987 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 6.27e-01 0.0524 0.108 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 2.38e-01 -0.129 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0684 0.103 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 1.92e-03 -0.34 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00463 0.119 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 9.20e-01 0.0114 0.114 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 6.18e-01 0.0496 0.0993 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 4.76e-01 0.0782 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 8.38e-01 -0.00798 0.0391 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 9.72e-01 0.00381 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 3.54e-02 -0.224 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 8.36e-01 0.0197 0.0947 0.203 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0331 0.113 0.203 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0818 0.116 0.203 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.29e-01 -0.146 0.0957 0.203 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 7.48e-01 0.0351 0.109 0.203 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.107 0.203 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 2.38e-01 -0.112 0.0944 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 5.79e-02 -0.221 0.116 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0372 0.0844 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 9.15e-01 0.0105 0.0976 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0733 0.114 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 8.87e-03 -0.289 0.109 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 4.77e-02 -0.199 0.0997 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 6.05e-01 0.0549 0.106 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 3.42e-01 0.106 0.112 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 6.48e-02 0.19 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 2.54e-01 0.115 0.101 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 5.03e-02 -0.149 0.0755 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 7.67e-01 0.0313 0.106 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 6.96e-01 0.04 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.31e-03 -0.265 0.0858 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 1.60e-01 0.15 0.106 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 8.13e-01 0.0284 0.12 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 2.53e-01 0.121 0.106 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0596 0.109 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0486 0.0874 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 2.61e-01 -0.128 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 1.60e-01 0.164 0.116 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0269 0.108 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0931 0.111 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 9.84e-01 0.0022 0.11 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 7.01e-01 0.0399 0.104 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0517 0.0971 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 7.61e-01 0.0225 0.0738 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0434 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 8.52e-02 -0.178 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.17e-03 -0.247 0.0797 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 8.31e-01 0.0226 0.106 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0692 0.115 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 9.27e-01 0.00781 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 3.75e-01 0.079 0.0886 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 4.64e-01 0.0936 0.127 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 7.19e-01 -0.053 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0862 0.0898 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 5.33e-02 -0.2 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 5.43e-01 0.0643 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 2.02e-01 0.156 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 1.93e-01 0.146 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 6.47e-01 0.0477 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0155 0.0382 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 4.31e-01 0.0607 0.0769 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 8.81e-01 0.0153 0.102 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 8.11e-01 0.0181 0.0755 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 5.20e-01 0.0695 0.108 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00417 0.0815 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 3.30e-02 -0.188 0.0877 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 6.86e-01 0.0308 0.076 0.2 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 5.04e-03 0.196 0.0691 0.2 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 9.13e-01 0.00843 0.077 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 8.53e-01 0.0203 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0688 0.113 0.201 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 2.28e-01 -0.12 0.0988 0.201 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00181 0.108 0.201 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0419 0.112 0.201 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.61e-01 -0.102 0.0904 0.201 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 7.85e-01 0.0286 0.105 0.205 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 7.30e-01 0.0353 0.102 0.205 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 5.25e-01 0.0837 0.131 0.205 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0967 0.119 0.205 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0838 0.123 0.205 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.70e-01 -0.159 0.115 0.205 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 2.22e-01 0.11 0.0901 0.205 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 7.41e-02 0.184 0.102 0.205 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00547 0.0986 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0334 0.0743 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0735 0.0986 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0698 0.111 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 2.83e-01 -0.107 0.0992 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 4.08e-02 -0.175 0.0849 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0502 0.073 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0692 0.106 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0423 0.0813 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 5.29e-01 0.0623 0.0988 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 2.20e-01 0.142 0.115 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 6.93e-01 -0.043 0.109 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 5.25e-03 -0.279 0.0989 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0382 0.0785 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 6.64e-01 0.0586 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 4.19e-01 0.102 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 1.46e-02 -0.23 0.0932 0.212 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0185 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 4.51e-01 0.0995 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.11e-01 -0.154 0.122 0.212 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 8.47e-01 0.0241 0.125 0.212 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 9.75e-02 -0.203 0.121 0.212 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 8.30e-02 -0.194 0.111 0.212 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 9.86e-01 0.00194 0.107 0.204 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 7.21e-01 0.035 0.0977 0.204 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0533 0.115 0.204 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0308 0.107 0.204 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0059 0.111 0.204 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 8.74e-05 -0.414 0.103 0.204 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 4.55e-01 0.0702 0.0938 0.204 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 8.53e-01 0.0199 0.107 0.197 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 2.06e-01 -0.125 0.0987 0.197 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000977 0.119 0.197 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 8.99e-02 -0.176 0.103 0.197 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0724 0.0996 0.197 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.12e-03 -0.309 0.0934 0.197 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 6.39e-01 -0.042 0.0893 0.197 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0263 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 1.70e-01 -0.153 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 6.01e-02 -0.221 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0627 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 2.56e-01 0.14 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0283 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0967 0.0829 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 3.40e-01 0.106 0.11 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 4.72e-01 0.0388 0.0538 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0244 0.108 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0722 0.0567 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0291 0.0895 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 2.43e-01 0.107 0.0919 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 3.85e-01 0.0905 0.104 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.70e-03 -0.231 0.0762 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 4.40e-01 0.072 0.0931 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0522 0.107 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0501 0.112 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 4.01e-01 0.0937 0.111 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -476143 sc-eQTL 2.97e-02 -0.134 0.0613 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 3.41e-01 0.0965 0.101 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0065 0.0501 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 7.56e-01 0.0223 0.0717 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0619 0.0876 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 3.48e-02 0.21 0.099 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 3.06e-02 -0.161 0.0741 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 1.34e-02 0.193 0.0775 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 266129 sc-eQTL 2.62e-01 0.127 0.113 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 8.13e-01 0.0273 0.116 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -191984 sc-eQTL 4.36e-01 0.082 0.105 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0618 0.0905 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0583 0.0732 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0325 0.0943 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 5.69e-01 0.0635 0.111 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0804 0.0952 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 6.03e-03 -0.226 0.0815 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 3.11e-01 -0.069 0.0679 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 9.37e-01 0.00828 0.105 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0966 0.091 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 3.42e-01 -0.105 0.11 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 3.10e-01 -0.108 0.106 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0296 0.106 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 1.43e-05 -0.389 0.0876 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 9.60e-01 0.00399 0.0791 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -114519 sc-eQTL 8.23e-02 0.172 0.0986 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 308654 sc-eQTL 5.39e-01 0.0596 0.0968 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0584 0.0663 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 725496 sc-eQTL 8.75e-01 0.016 0.102 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 597829 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0144 0.0945 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 sc-eQTL 2.72e-03 -0.227 0.0749 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 128021 sc-eQTL 5.88e-01 0.0558 0.103 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -114584 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00733 0.121 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 308654 eQTL 2.36e-05 -0.134 0.0315 0.0 0.0 0.197
ENSG00000111670 GNPTAB 174642 eQTL 4.12e-02 -0.0358 0.0175 0.0 0.0 0.197
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 pQTL 4.04e-06 -0.0539 0.0117 0.0 0.0 0.188
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 eQTL 2.3100000000000002e-27 -0.166 0.0148 0.00502 0.00413 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 308654 2.62e-06 3.13e-06 5.97e-07 2.02e-06 4.92e-07 8.16e-07 1.52e-06 3.95e-07 1.86e-06 9.48e-07 2.48e-06 1.3e-06 3.54e-06 1.25e-06 9.35e-07 1.7e-06 1.58e-06 2.2e-06 1.57e-06 1.13e-06 9.57e-07 2.43e-06 2.32e-06 1.02e-06 3.75e-06 1.37e-06 1.31e-06 1.74e-06 1.71e-06 2.23e-06 1.84e-06 2.35e-07 4.31e-07 6.23e-07 1.27e-06 9.35e-07 8.12e-07 3.66e-07 7.23e-07 4.34e-07 2.6e-07 3.38e-06 5.44e-07 1.33e-07 3.55e-07 3.12e-07 3.34e-07 2.23e-07 2.91e-07
ENSG00000120860 WASHC3 -56548 1.48e-05 1.73e-05 2.16e-06 1.14e-05 2.34e-06 5.96e-06 1.78e-05 2.13e-06 1.27e-05 6.37e-06 1.74e-05 6.49e-06 2.46e-05 6.39e-06 4.35e-06 7.94e-06 7.02e-06 1.04e-05 4.2e-06 3.13e-06 6.47e-06 1.2e-05 1.24e-05 3.78e-06 2.34e-05 4.3e-06 7.69e-06 5.54e-06 1.42e-05 1.22e-05 9.19e-06 9.99e-07 1.19e-06 3.52e-06 6.37e-06 3.17e-06 1.83e-06 1.93e-06 2.17e-06 1.4e-06 8.22e-07 1.92e-05 2.14e-06 1.55e-07 7.91e-07 1.76e-06 1.73e-06 6.55e-07 4.72e-07