logo

Genes within 1Mb (chr12:102004454:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0377 0.0474 0.182 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 4.04e-01 0.069 0.0825 0.182 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.73e-02 -0.11 0.0497 0.182 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 7.84e-01 0.02 0.0727 0.182 B L1
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0388 0.0826 0.182 B L1
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 1.48e-01 0.103 0.0707 0.182 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 3.82e-02 0.117 0.0563 0.182 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0613 0.0644 0.182 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 2.31e-01 -0.123 0.102 0.182 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 9.62e-01 0.00464 0.0981 0.182 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 2.99e-02 0.198 0.0905 0.182 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 1.18e-01 -0.118 0.0754 0.182 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.63e-01 -0.115 0.102 0.182 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 3.07e-02 0.153 0.0702 0.182 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 5.59e-01 0.0458 0.0784 0.182 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 6.47e-01 0.0351 0.0767 0.182 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 7.98e-05 0.208 0.0518 0.182 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 8.08e-01 0.0235 0.0967 0.182 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 8.46e-01 0.0204 0.105 0.182 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0413 0.0687 0.182 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 1.22e-01 -0.134 0.0863 0.182 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 3.21e-01 -0.095 0.0955 0.182 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 2.97e-01 0.0709 0.0679 0.182 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 4.02e-01 0.0817 0.0973 0.182 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 6.44e-02 0.196 0.105 0.185 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 3.48e-01 0.0911 0.0969 0.185 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 9.28e-01 0.00971 0.107 0.185 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 7.21e-01 0.0409 0.114 0.185 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 3.67e-01 -0.107 0.118 0.185 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0114 0.102 0.185 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 9.50e-02 0.14 0.0836 0.185 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 9.24e-01 0.0106 0.111 0.185 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 1.31e-01 -0.135 0.0893 0.182 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0543 0.0759 0.182 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0838 0.0951 0.182 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 2.89e-01 0.113 0.106 0.182 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 9.00e-01 0.0123 0.0978 0.182 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 6.23e-03 0.234 0.0845 0.182 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 8.14e-02 0.122 0.0696 0.182 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 1.47e-03 -0.307 0.0953 0.18 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.12e-01 -0.113 0.0902 0.18 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 3.26e-01 0.0645 0.0655 0.18 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 4.62e-02 0.21 0.105 0.18 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0398 0.0971 0.18 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 8.97e-03 0.19 0.072 0.18 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 5.22e-01 0.0668 0.104 0.18 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0103 0.122 0.18 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 9.07e-01 0.00429 0.0367 0.182 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.01e-02 -0.162 0.0691 0.182 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.102 0.182 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 7.53e-01 0.0232 0.0737 0.182 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 8.30e-03 -0.302 0.113 0.182 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00645 0.084 0.182 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 5.78e-04 0.254 0.0725 0.182 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 4.74e-02 0.177 0.0887 0.182 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0453 0.0745 0.182 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 3.50e-03 0.251 0.085 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 6.71e-01 -0.00998 0.0235 0.184 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0455 0.122 0.184 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0884 0.0898 0.184 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 7.68e-01 0.0378 0.128 0.184 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 5.47e-01 0.0746 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 3.44e-01 -0.121 0.127 0.184 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 9.28e-03 0.314 0.119 0.184 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0292 0.122 0.184 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 4.90e-01 0.0693 0.1 0.184 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 7.90e-01 -0.027 0.101 0.184 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 1.49e-01 0.137 0.0944 0.184 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 8.49e-01 0.00902 0.0473 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.44e-01 0.137 0.117 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0399 0.0632 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 5.60e-01 0.0545 0.0934 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 5.94e-02 -0.195 0.103 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 8.84e-01 0.0171 0.117 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 9.53e-01 0.00565 0.0966 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 3.28e-01 0.101 0.103 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 7.28e-01 -0.038 0.109 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 5.67e-02 0.217 0.113 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 4.43e-02 0.22 0.109 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0248 0.043 0.179 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.28e-01 0.137 0.113 0.179 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 1.06e-01 -0.12 0.0737 0.179 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 6.19e-01 0.0504 0.101 0.179 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 8.33e-01 0.0235 0.111 0.179 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 4.00e-01 0.0932 0.111 0.179 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 2.89e-01 -0.105 0.0988 0.179 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0305 0.104 0.179 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 6.34e-01 0.051 0.107 0.179 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 9.00e-01 0.0138 0.109 0.179 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 1.08e-01 0.16 0.099 0.179 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0171 0.0617 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 9.53e-01 0.00656 0.112 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0631 0.0579 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00925 0.0821 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0589 0.0974 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 6.70e-01 0.0464 0.109 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 2.40e-01 0.0967 0.0821 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0155 0.0892 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 2.15e-02 -0.277 0.12 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0358 0.118 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 8.26e-03 0.29 0.109 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0323 0.0544 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.111 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0837 0.0594 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0343 0.0925 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 4.51e-01 0.0809 0.107 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 1.92e-01 0.153 0.117 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 4.00e-01 0.0863 0.102 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 1.75e-01 -0.138 0.101 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 5.47e-01 0.0644 0.107 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00465 0.123 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 6.83e-01 0.0435 0.106 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 9.41e-03 -0.3 0.114 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 8.83e-01 0.0172 0.117 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0154 0.102 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0319 0.112 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 6.59e-01 0.0525 0.119 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 8.77e-01 0.0177 0.114 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0931 0.0876 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0854 0.101 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 7.10e-02 0.141 0.0775 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 9.24e-01 0.0081 0.0851 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 7.61e-01 0.028 0.0922 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 1.85e-03 0.198 0.0629 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0508 0.0913 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0739 0.105 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 2.69e-01 0.0902 0.0813 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 1.95e-01 0.132 0.102 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 9.45e-01 0.00665 0.0955 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 3.47e-05 0.255 0.0602 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 4.05e-01 0.0917 0.11 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 7.70e-01 -0.031 0.106 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0584 0.102 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0313 0.11 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0399 0.104 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 1.64e-01 0.13 0.093 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 3.64e-01 0.0953 0.105 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 3.70e-01 0.0965 0.108 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 8.41e-01 0.0173 0.0862 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 6.71e-01 0.0496 0.116 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0157 0.115 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 2.19e-01 -0.121 0.098 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 3.24e-01 0.121 0.122 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 7.77e-01 0.0299 0.105 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0453 0.105 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 8.98e-01 0.0121 0.094 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 1.44e-01 -0.146 0.0994 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 1.23e-01 -0.167 0.108 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 2.40e-01 0.0839 0.0712 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 9.47e-01 0.00739 0.11 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 1.51e-01 -0.167 0.116 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 8.63e-01 0.018 0.104 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 1.70e-01 0.148 0.107 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 4.10e-01 0.0972 0.118 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0503 0.116 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 2.45e-01 -0.12 0.103 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 6.45e-01 0.052 0.113 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 6.16e-01 0.0572 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.24e-01 0.131 0.107 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 6.18e-02 0.215 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 3.88e-01 -0.107 0.124 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0561 0.118 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0954 0.103 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 2.40e-01 0.134 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 7.55e-01 0.0125 0.0401 0.184 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.74e-01 -0.123 0.112 0.184 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 9.40e-01 0.00832 0.11 0.184 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 3.20e-01 0.0967 0.0969 0.184 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 2.48e-03 -0.349 0.114 0.184 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0393 0.119 0.184 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 1.14e-01 0.156 0.0982 0.184 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 1.33e-01 0.168 0.111 0.184 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 2.68e-01 -0.122 0.109 0.184 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 3.98e-03 0.277 0.0953 0.184 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.07e-01 0.158 0.124 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.51e-01 -0.104 0.0901 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 2.79e-01 0.113 0.104 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 1.99e-02 0.282 0.12 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 9.22e-01 0.0117 0.119 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 1.88e-01 0.142 0.107 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 6.61e-01 0.0497 0.113 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 3.37e-01 -0.115 0.119 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.79e-03 -0.319 0.105 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 1.21e-01 -0.163 0.105 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 3.06e-01 0.0815 0.0794 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 2.32e-01 0.132 0.11 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0327 0.107 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 1.82e-01 0.122 0.0912 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 1.56e-01 0.158 0.111 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 7.28e-01 0.0436 0.125 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 3.64e-02 -0.24 0.114 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 6.41e-01 -0.055 0.118 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0573 0.0947 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 6.02e-01 0.0647 0.124 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 9.94e-02 -0.208 0.126 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 3.42e-01 0.112 0.117 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 4.65e-01 0.0884 0.121 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 1.53e-02 0.286 0.117 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 1.14e-02 -0.274 0.107 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0321 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 6.82e-02 0.141 0.0767 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 1.94e-01 0.14 0.107 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 5.31e-01 0.068 0.108 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 5.11e-02 0.166 0.0847 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0444 0.111 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 1.68e-01 -0.166 0.12 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 7.55e-01 0.0259 0.0828 0.193 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 2.91e-01 -0.118 0.111 0.193 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0331 0.0864 0.193 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 5.52e-01 0.074 0.124 0.193 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 3.16e-01 -0.143 0.142 0.193 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 9.54e-01 0.00505 0.0878 0.193 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 1.38e-01 0.15 0.1 0.193 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 7.56e-01 0.032 0.103 0.193 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 1.27e-01 -0.182 0.118 0.193 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 6.18e-01 0.0546 0.109 0.193 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0221 0.101 0.193 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 2.37e-02 0.0897 0.0394 0.185 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0238 0.0804 0.185 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0288 0.107 0.185 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 6.72e-01 0.0335 0.0788 0.185 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 2.51e-01 -0.129 0.112 0.185 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0431 0.0851 0.185 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 2.07e-01 0.117 0.0922 0.185 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 2.56e-01 0.0902 0.0791 0.185 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 8.70e-01 0.012 0.0735 0.185 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 7.58e-02 0.142 0.0798 0.185 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 4.72e-01 0.081 0.112 0.182 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 3.73e-01 -0.104 0.117 0.182 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 2.48e-01 0.118 0.102 0.182 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0392 0.111 0.182 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 4.08e-01 0.0954 0.115 0.182 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 4.69e-01 0.0678 0.0935 0.182 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 7.33e-01 0.0368 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 3.98e-01 0.0889 0.105 0.18 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 4.31e-02 -0.273 0.134 0.18 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 4.07e-01 0.102 0.123 0.18 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 2.03e-01 -0.162 0.127 0.18 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 2.41e-01 0.14 0.119 0.18 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0787 0.0932 0.18 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0128 0.106 0.18 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 1.81e-01 -0.135 0.101 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0612 0.0763 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 9.57e-01 0.00545 0.101 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 2.44e-02 0.255 0.113 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0518 0.102 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 5.94e-02 0.166 0.0873 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 1.59e-01 0.106 0.0747 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0259 0.111 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0941 0.0848 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0468 0.103 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0453 0.121 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 3.11e-01 0.115 0.114 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 3.11e-01 0.107 0.105 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 4.63e-02 0.163 0.0813 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 5.77e-02 -0.275 0.144 0.185 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 8.45e-01 0.0268 0.137 0.185 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 1.63e-01 0.143 0.102 0.185 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0844 0.136 0.185 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0983 0.142 0.185 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 5.88e-01 0.072 0.133 0.185 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0555 0.135 0.185 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0792 0.132 0.185 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 3.68e-04 0.424 0.116 0.185 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0744 0.112 0.18 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.92e-01 -0.108 0.102 0.18 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 2.59e-01 -0.136 0.12 0.18 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.112 0.18 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 4.53e-02 -0.233 0.116 0.18 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 5.43e-02 0.217 0.112 0.18 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0763 0.0986 0.18 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 4.48e-01 0.087 0.114 0.176 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 9.18e-02 0.178 0.105 0.176 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 6.04e-01 0.0658 0.127 0.176 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0803 0.111 0.176 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 1.27e-01 0.162 0.106 0.176 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 1.59e-01 0.144 0.102 0.176 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0741 0.0953 0.176 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 4.35e-01 0.104 0.133 0.181 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 2.49e-01 0.134 0.116 0.181 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 3.98e-01 0.104 0.123 0.181 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 7.20e-01 -0.044 0.123 0.181 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 4.26e-01 0.103 0.129 0.181 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0169 0.113 0.181 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 1.96e-02 0.202 0.0855 0.181 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 7.98e-01 0.0295 0.116 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0187 0.0546 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 7.31e-01 0.0377 0.11 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0525 0.0576 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 4.77e-01 0.0645 0.0905 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0793 0.0932 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00781 0.106 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0557 0.0787 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 4.60e-01 0.0698 0.0943 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 9.05e-01 0.0129 0.109 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 4.67e-01 0.0828 0.114 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 1.82e-02 0.265 0.111 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -477290 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0717 0.0656 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 4.53e-01 0.0808 0.107 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0683 0.0529 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0409 0.076 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 9.80e-01 0.00234 0.0931 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 5.13e-01 0.0696 0.106 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 8.83e-02 0.135 0.079 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0882 0.0832 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 264982 sc-eQTL 3.12e-01 -0.122 0.12 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0613 0.123 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -193131 sc-eQTL 2.14e-01 0.139 0.111 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 3.82e-01 -0.082 0.0935 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 1.40e-01 -0.112 0.0753 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0572 0.0974 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 7.83e-02 0.202 0.114 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 8.44e-01 0.0194 0.0985 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 8.54e-02 0.147 0.0851 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 3.89e-02 0.145 0.0696 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00409 0.109 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 6.98e-01 0.0372 0.0955 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 3.57e-01 -0.107 0.115 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 3.26e-01 -0.109 0.111 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0315 0.11 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 1.28e-02 0.237 0.0945 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0707 0.0826 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -115666 sc-eQTL 3.76e-06 -0.464 0.0977 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 307507 sc-eQTL 1.72e-01 -0.137 0.0999 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 173495 sc-eQTL 2.82e-01 0.0739 0.0685 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 724349 sc-eQTL 1.61e-01 0.148 0.105 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 596682 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0282 0.0978 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 sc-eQTL 3.11e-02 0.17 0.0783 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 126874 sc-eQTL 4.29e-01 0.0841 0.106 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -115731 sc-eQTL 8.96e-01 0.0163 0.125 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 -477290 eQTL 0.0261 0.0623 0.0279 0.0 0.0 0.169
ENSG00000075188 NUP37 -115666 eQTL 0.0105 -0.0585 0.0228 0.0 0.0 0.169
ENSG00000111666 CHPT1 307507 eQTL 4.64e-02 0.066 0.0331 0.0 0.0 0.169
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 pQTL 0.0288 0.0264 0.0121 0.0 0.0 0.173
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 eQTL 1.65e-12 0.114 0.016 0.0 0.0 0.169
ENSG00000185480 PARPBP -115731 eQTL 0.00566 -0.0829 0.0299 0.0 0.0 0.169

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 WASHC3 -57695 1.95e-05 2.26e-05 3.08e-06 1.14e-05 3.23e-06 8.16e-06 2.62e-05 3.51e-06 1.88e-05 8.88e-06 2.33e-05 9.35e-06 3.39e-05 8.62e-06 5.15e-06 1.03e-05 1.05e-05 1.58e-05 4.82e-06 4.62e-06 8.58e-06 1.88e-05 1.93e-05 5.62e-06 2.97e-05 5.36e-06 8.01e-06 7.92e-06 1.91e-05 1.63e-05 1.29e-05 1.4e-06 1.67e-06 4.3e-06 7.67e-06 3.83e-06 2.05e-06 2.61e-06 3.56e-06 2.11e-06 1.2e-06 2.6e-05 2.64e-06 2.27e-07 1.84e-06 2.61e-06 2.47e-06 1.17e-06 6.33e-07
ENSG00000185480 PARPBP -115731 9.86e-06 1.24e-05 1.9e-06 6.18e-06 2.3e-06 4.34e-06 1.14e-05 2.2e-06 1.03e-05 5.36e-06 1.31e-05 5.74e-06 1.7e-05 4.19e-06 3.14e-06 6.64e-06 6.1e-06 7.88e-06 2.93e-06 2.84e-06 6.01e-06 9.86e-06 8.9e-06 3.27e-06 1.49e-05 4.34e-06 4.88e-06 4.58e-06 1.02e-05 9.11e-06 6.69e-06 9.86e-07 1.1e-06 3.14e-06 4.3e-06 2.68e-06 1.82e-06 1.93e-06 2.08e-06 1.04e-06 8.81e-07 1.4e-05 2.39e-06 1.62e-07 9.54e-07 1.72e-06 1.31e-06 7.13e-07 4.37e-07