logo

Genes within 1Mb (chr12:101997722:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0523 0.0739 0.064 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 2.67e-01 -0.143 0.128 0.064 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.19e-01 0.039 0.0782 0.064 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 6.12e-01 0.0575 0.113 0.064 B L1
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 9.20e-01 0.013 0.129 0.064 B L1
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 5.86e-01 0.0604 0.111 0.064 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 9.47e-01 0.00585 0.0886 0.064 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 8.87e-01 0.0143 0.1 0.064 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 1.34e-01 0.239 0.159 0.064 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0699 0.153 0.064 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 1.62e-02 -0.341 0.141 0.064 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 8.33e-01 0.0247 0.117 0.064 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 8.74e-01 0.0251 0.158 0.064 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 2.53e-01 -0.126 0.109 0.064 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 1.32e-01 0.183 0.121 0.064 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 2.73e-01 0.13 0.118 0.064 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0885 0.0829 0.064 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 9.87e-01 0.00231 0.146 0.064 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0955 0.159 0.064 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 7.41e-01 0.0345 0.104 0.064 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0125 0.131 0.064 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 3.13e-01 -0.146 0.145 0.064 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 5.64e-01 0.0594 0.103 0.064 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 8.32e-01 0.0314 0.148 0.064 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 3.02e-02 -0.35 0.16 0.065 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 3.71e-01 0.133 0.148 0.065 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 6.86e-01 0.066 0.163 0.065 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 4.26e-01 0.139 0.175 0.065 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 8.48e-01 0.0347 0.181 0.065 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 2.54e-01 0.178 0.155 0.065 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 4.30e-01 -0.102 0.128 0.065 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 1.03e-01 -0.276 0.168 0.065 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 2.86e-01 -0.147 0.137 0.064 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 8.91e-01 0.0159 0.116 0.064 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00174 0.146 0.064 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 7.04e-01 -0.062 0.163 0.064 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 1.58e-01 0.212 0.149 0.064 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 2.74e-01 0.144 0.131 0.064 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 2.09e-02 -0.247 0.106 0.064 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0323 0.148 0.064 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 3.11e-01 0.139 0.137 0.064 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 1.10e-01 -0.159 0.099 0.064 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0986 0.16 0.064 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 8.22e-01 0.0332 0.147 0.064 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 1.35e-01 -0.166 0.11 0.064 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0468 0.158 0.064 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 1.49e-02 -0.449 0.183 0.064 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 6.32e-01 0.0274 0.0571 0.064 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 2.09e-01 -0.137 0.108 0.064 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 9.65e-01 0.007 0.159 0.064 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0843 0.115 0.064 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 6.37e-01 0.0845 0.179 0.064 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 2.71e-01 0.144 0.13 0.064 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 7.77e-01 0.0329 0.116 0.064 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 3.48e-01 0.131 0.139 0.064 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 9.65e-01 0.00508 0.116 0.064 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0362 0.135 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0433 0.036 0.061 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 5.13e-01 0.123 0.187 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.60e-01 -0.061 0.139 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0956 0.197 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 4.51e-01 -0.144 0.19 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 3.47e-01 0.185 0.196 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 7.60e-01 0.0575 0.187 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 4.49e-01 -0.143 0.188 0.061 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 8.49e-01 0.0294 0.155 0.061 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 1.80e-01 0.208 0.155 0.061 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 4.15e-01 -0.119 0.146 0.061 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00313 0.0739 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0211 0.184 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 5.54e-01 0.0586 0.0988 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 9.37e-01 0.0116 0.146 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 2.74e-01 0.178 0.162 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 5.14e-01 -0.119 0.183 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 7.15e-02 0.271 0.15 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 3.92e-02 -0.333 0.16 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 5.26e-01 0.108 0.17 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0263 0.179 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 3.83e-01 0.149 0.171 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 2.19e-01 0.0839 0.0681 0.065 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0315 0.18 0.065 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 8.91e-01 0.0162 0.118 0.065 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 8.98e-01 0.0206 0.161 0.065 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 9.84e-01 0.00347 0.177 0.065 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 6.92e-02 0.319 0.175 0.065 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 2.96e-01 0.165 0.157 0.065 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 1.06e-01 -0.266 0.164 0.065 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 1.98e-01 0.219 0.169 0.065 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00704 0.174 0.065 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 3.52e-01 -0.147 0.158 0.065 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 4.82e-02 0.182 0.0918 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 4.05e-01 -0.14 0.167 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00834 0.0872 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 4.06e-01 0.102 0.123 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0306 0.146 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 5.26e-01 -0.104 0.163 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 2.55e-01 -0.141 0.123 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 1.46e-01 0.195 0.133 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 1.94e-01 0.236 0.181 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0808 0.177 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 6.51e-03 -0.448 0.163 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 5.50e-01 0.0491 0.082 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0833 0.168 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 1.09e-01 0.144 0.0895 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 9.85e-01 0.00257 0.14 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 3.31e-01 -0.157 0.161 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 1.89e-01 -0.233 0.177 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 6.77e-01 0.0646 0.155 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 2.98e-01 -0.159 0.153 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0687 0.161 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 1.00e-01 0.305 0.185 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 9.24e-01 0.0153 0.16 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 7.00e-01 0.0724 0.188 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 4.37e-01 -0.146 0.188 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 1.70e-02 0.39 0.162 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0553 0.181 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 7.95e-02 -0.335 0.19 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 5.24e-01 0.117 0.184 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 4.33e-01 0.107 0.136 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 7.92e-01 0.0414 0.157 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 7.00e-02 -0.219 0.12 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 1.02e-01 0.215 0.131 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 1.82e-01 0.191 0.142 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 6.78e-02 -0.182 0.099 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 2.72e-01 -0.156 0.142 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.32e-01 0.0785 0.164 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 3.87e-01 -0.11 0.127 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 7.26e-01 0.0557 0.159 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 6.11e-01 0.0756 0.148 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0231 0.0975 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0187 0.171 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.69e-01 0.0705 0.165 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0193 0.159 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 2.26e-01 -0.208 0.171 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 4.27e-01 0.129 0.162 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 3.16e-01 -0.146 0.145 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0654 0.16 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 5.26e-01 -0.104 0.164 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 4.98e-01 0.0891 0.131 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 3.60e-01 0.163 0.177 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 8.80e-01 0.0265 0.176 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 4.94e-01 0.103 0.15 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 1.33e-01 0.279 0.185 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 7.79e-01 0.0459 0.163 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0781 0.162 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 4.22e-01 -0.117 0.145 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 5.13e-01 -0.101 0.155 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 4.44e-01 -0.129 0.168 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 8.29e-01 -0.024 0.111 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 4.01e-01 -0.144 0.171 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 5.91e-01 -0.101 0.188 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 9.34e-01 0.014 0.168 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 8.15e-01 0.0409 0.174 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 2.28e-01 -0.229 0.189 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 6.21e-01 0.0925 0.187 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0168 0.167 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 7.84e-01 0.0499 0.182 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 8.54e-01 -0.033 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 3.24e-01 -0.167 0.169 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 9.17e-01 0.0189 0.182 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 3.55e-01 0.18 0.195 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0547 0.186 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 4.85e-01 0.114 0.163 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0287 0.18 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0281 0.062 0.063 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 3.39e-01 -0.167 0.174 0.063 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.01e-01 0.0888 0.17 0.063 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0774 0.15 0.063 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 4.89e-01 0.125 0.18 0.063 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 6.33e-01 0.0879 0.184 0.063 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0481 0.153 0.063 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 3.41e-01 -0.165 0.173 0.063 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 3.14e-01 -0.171 0.17 0.063 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 3.75e-01 -0.133 0.15 0.063 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 6.63e-01 -0.083 0.19 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.57e-01 0.0612 0.138 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 3.26e-01 -0.156 0.159 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0535 0.186 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 1.24e-01 -0.279 0.181 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 3.31e-01 -0.16 0.164 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 5.43e-01 -0.105 0.173 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 1.43e-01 -0.267 0.181 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 9.83e-01 0.00361 0.167 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 8.02e-01 0.0409 0.163 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 6.56e-02 -0.226 0.122 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0121 0.171 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 7.85e-02 0.291 0.164 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 1.34e-01 -0.212 0.141 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 6.81e-01 -0.071 0.172 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 1.08e-01 -0.311 0.193 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 9.14e-01 0.02 0.184 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 7.85e-01 0.0517 0.189 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 3.90e-01 -0.131 0.152 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 4.07e-02 0.405 0.197 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 6.44e-01 0.094 0.203 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000616 0.189 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 7.30e-01 -0.067 0.194 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 1.03e-01 -0.31 0.189 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 4.84e-01 0.116 0.165 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 2.39e-01 0.182 0.154 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 1.12e-01 -0.187 0.117 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 3.02e-01 -0.169 0.163 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0875 0.165 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 5.66e-01 0.0746 0.13 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0153 0.169 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0227 0.183 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 2.31e-01 0.155 0.129 0.07 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0476 0.174 0.07 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 7.12e-01 0.05 0.135 0.07 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 5.36e-01 -0.12 0.194 0.07 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 7.09e-01 0.0833 0.223 0.07 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 1.53e-01 0.195 0.136 0.07 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0618 0.158 0.07 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0796 0.16 0.07 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0946 0.186 0.07 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 2.74e-01 -0.187 0.17 0.07 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 2.56e-01 -0.179 0.157 0.07 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0956 0.0637 0.059 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 2.58e-01 -0.146 0.129 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00196 0.171 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 1.20e-01 -0.196 0.126 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 2.31e-01 0.216 0.18 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 5.76e-01 0.0765 0.137 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 4.64e-01 0.109 0.148 0.059 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0219 0.127 0.059 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 4.61e-01 0.0871 0.118 0.059 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 7.78e-01 0.0364 0.129 0.059 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0666 0.172 0.064 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.26e-01 0.0874 0.179 0.064 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 8.31e-01 0.0335 0.157 0.064 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 2.55e-01 0.194 0.17 0.064 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 9.75e-01 0.0055 0.176 0.064 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 6.34e-01 0.0682 0.143 0.064 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 1.39e-01 -0.233 0.157 0.068 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 4.67e-01 0.112 0.154 0.068 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 6.94e-01 0.0784 0.199 0.068 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 9.08e-01 0.0209 0.18 0.068 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 2.41e-01 0.219 0.186 0.068 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 8.40e-02 0.303 0.174 0.068 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0723 0.137 0.068 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 1.91e-02 -0.364 0.154 0.068 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0735 0.156 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 3.14e-01 0.119 0.117 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 9.71e-01 0.00558 0.156 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 4.73e-01 -0.126 0.175 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 6.90e-02 0.285 0.156 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 3.54e-01 0.126 0.135 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 4.97e-02 -0.226 0.115 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 2.01e-01 -0.217 0.169 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0608 0.13 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 5.06e-01 -0.105 0.158 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 8.17e-01 0.0429 0.185 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 8.21e-01 0.0394 0.174 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 2.98e-01 0.167 0.161 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 2.84e-01 -0.134 0.125 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 4.69e-01 -0.178 0.246 0.058 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 2.54e-01 0.263 0.23 0.058 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 9.34e-01 0.0145 0.174 0.058 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 2.92e-01 0.242 0.229 0.058 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0139 0.241 0.058 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 8.08e-01 0.0548 0.225 0.058 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 4.86e-01 0.159 0.228 0.058 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0716 0.224 0.058 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 1.22e-01 -0.317 0.204 0.058 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 7.62e-01 -0.051 0.168 0.067 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00433 0.154 0.067 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 7.78e-01 0.0511 0.181 0.067 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 4.21e-01 0.136 0.169 0.067 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 2.83e-01 0.188 0.175 0.067 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 4.72e-01 0.122 0.169 0.067 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 2.06e-01 -0.187 0.148 0.067 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0307 0.171 0.066 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 9.20e-01 0.0159 0.158 0.066 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 3.15e-01 0.19 0.189 0.066 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 5.95e-01 -0.088 0.165 0.066 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 1.10e-01 -0.253 0.158 0.066 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 6.89e-01 0.0613 0.153 0.066 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 4.42e-01 -0.109 0.142 0.066 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 7.89e-02 -0.421 0.238 0.056 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 1.34e-01 0.313 0.208 0.056 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 6.51e-01 -0.1 0.221 0.056 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 8.74e-01 -0.035 0.221 0.056 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 7.49e-01 0.0742 0.232 0.056 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 2.11e-02 -0.464 0.199 0.056 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 2.15e-01 0.194 0.156 0.056 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 2.80e-01 -0.224 0.207 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 6.41e-01 0.0402 0.086 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 8.69e-01 0.0285 0.173 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 7.60e-01 0.0278 0.0909 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 9.91e-01 0.00161 0.143 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 5.70e-01 0.0836 0.147 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 6.58e-02 0.305 0.165 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 1.13e-01 0.197 0.124 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 1.10e-01 -0.238 0.148 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 1.68e-01 0.236 0.171 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 7.64e-01 0.054 0.18 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0932 0.178 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -484022 sc-eQTL 1.95e-02 0.228 0.0969 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 1.79e-01 -0.215 0.16 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.86e-01 0.032 0.0792 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 3.99e-01 0.0957 0.113 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0878 0.139 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 2.36e-01 -0.188 0.158 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0894 0.119 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 3.92e-01 0.107 0.124 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 258250 sc-eQTL 3.55e-01 0.166 0.179 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 7.54e-01 0.0574 0.183 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -199863 sc-eQTL 1.07e-01 -0.268 0.165 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 3.68e-01 -0.129 0.144 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 5.77e-01 0.065 0.116 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0672 0.15 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0583 0.177 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 1.47e-01 0.219 0.151 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 2.27e-01 0.159 0.131 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 2.72e-02 -0.238 0.107 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0444 0.166 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0637 0.145 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 2.02e-01 0.224 0.175 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 7.06e-01 0.0638 0.169 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0796 0.168 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 4.64e-01 0.107 0.145 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 3.82e-01 -0.11 0.125 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -122398 sc-eQTL 9.19e-01 0.016 0.156 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 300775 sc-eQTL 4.02e-01 0.128 0.152 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 166763 sc-eQTL 1.41e-01 -0.154 0.104 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 717617 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0458 0.16 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 589950 sc-eQTL 3.20e-01 0.148 0.149 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -64427 sc-eQTL 3.43e-01 -0.114 0.12 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 120142 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0472 0.162 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -122463 sc-eQTL 5.10e-02 -0.37 0.189 0.065 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000258230 AC063950.1 223967 eQTL 0.0488 0.112 0.057 0.0 0.0 0.0613

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139351 \N 258253 1.33e-06 9.53e-07 3.58e-07 9.74e-07 2.95e-07 4.76e-07 1.38e-06 3.68e-07 1.35e-06 4.19e-07 1.39e-06 6.36e-07 1.97e-06 2.76e-07 5.08e-07 7.95e-07 8.19e-07 6.21e-07 7.52e-07 6.86e-07 5.8e-07 1.28e-06 8.96e-07 6.54e-07 2.05e-06 4.23e-07 7.6e-07 7.68e-07 1.25e-06 1.34e-06 6.16e-07 1.87e-07 1.99e-07 6.95e-07 5.63e-07 4.42e-07 5.04e-07 2.21e-07 3.74e-07 2.48e-07 2.91e-07 1.52e-06 1.09e-07 3.4e-08 1.52e-07 1.28e-07 2.27e-07 7e-08 1.23e-07