logo

Genes within 1Mb (chr12:101995142:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0457 0.0397 0.28 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0463 0.0693 0.28 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 8.64e-01 0.0072 0.0422 0.28 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 7.15e-02 0.11 0.0605 0.28 B L1
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 1.34e-01 0.104 0.069 0.28 B L1
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 6.49e-01 0.0272 0.0596 0.28 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 9.99e-01 -7.67e-05 0.0477 0.28 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 8.85e-01 0.00781 0.0541 0.28 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 5.38e-01 0.053 0.0859 0.28 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 8.47e-01 0.0159 0.0823 0.28 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 1.16e-01 -0.12 0.0764 0.28 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 7.55e-01 0.0199 0.0637 0.28 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 3.55e-02 -0.18 0.0851 0.28 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 3.95e-01 0.0507 0.0595 0.28 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 5.95e-01 0.0351 0.0659 0.28 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 4.79e-01 0.0456 0.0644 0.28 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 8.70e-01 0.0074 0.0451 0.28 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 8.71e-01 0.0129 0.0792 0.28 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 3.31e-02 -0.182 0.0849 0.28 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 4.38e-02 0.113 0.0558 0.28 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 1.85e-01 0.0941 0.0708 0.28 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0446 0.0784 0.28 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 4.78e-01 0.0396 0.0556 0.28 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 7.21e-01 0.0286 0.0798 0.28 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 2.41e-01 -0.105 0.0897 0.268 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000805 0.0823 0.268 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 4.47e-01 0.0689 0.0904 0.268 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 2.81e-02 0.212 0.0959 0.268 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0465 0.1 0.268 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 3.02e-01 0.0892 0.0862 0.268 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 6.80e-01 0.0294 0.0713 0.268 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0477 0.094 0.268 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0289 0.074 0.28 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 5.07e-01 0.0416 0.0626 0.28 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0983 0.0783 0.28 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 3.99e-01 0.074 0.0875 0.28 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 9.24e-01 0.00772 0.0806 0.28 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 6.94e-01 0.0279 0.0709 0.28 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 1.23e-01 0.0891 0.0575 0.28 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 3.48e-01 0.0747 0.0794 0.279 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 1.41e-02 -0.18 0.0728 0.279 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 5.84e-01 0.0293 0.0535 0.279 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0864 0.086 0.279 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 3.23e-01 0.0783 0.079 0.279 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 4.10e-01 0.0492 0.0596 0.279 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 4.17e-01 0.069 0.0848 0.279 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 9.97e-02 -0.164 0.099 0.279 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 9.88e-01 0.000471 0.0307 0.28 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 6.01e-01 0.0306 0.0584 0.28 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 1.68e-01 -0.118 0.0849 0.28 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 6.93e-01 0.0243 0.0615 0.28 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 2.05e-01 -0.122 0.0958 0.28 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 1.83e-01 0.0932 0.0698 0.28 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 5.13e-01 0.0407 0.0622 0.28 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 2.00e-01 0.0956 0.0744 0.28 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0401 0.0622 0.28 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0553 0.0723 0.28 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 7.60e-01 0.00584 0.0191 0.286 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0514 0.0988 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0723 0.0728 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 6.96e-01 0.0407 0.104 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0644 0.1 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 1.90e-01 -0.136 0.103 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 3.29e-01 0.0966 0.0985 0.286 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0368 0.0992 0.286 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 5.72e-02 -0.154 0.0806 0.286 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 6.93e-01 0.0324 0.082 0.286 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0429 0.077 0.286 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 3.22e-01 0.0396 0.0399 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 8.60e-01 0.0176 0.0996 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 2.25e-01 0.0648 0.0533 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 3.98e-01 0.0669 0.0789 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 9.81e-01 0.00213 0.0878 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 7.36e-01 0.0333 0.0988 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 4.66e-01 0.0595 0.0816 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00653 0.0876 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0101 0.0921 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 4.15e-01 0.0789 0.0965 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0194 0.0927 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 6.40e-02 0.0679 0.0364 0.278 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0674 0.0969 0.278 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 8.36e-01 0.0132 0.0633 0.278 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 4.38e-01 0.0673 0.0866 0.278 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 1.56e-01 0.135 0.0947 0.278 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0416 0.0946 0.278 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 7.61e-01 0.0258 0.0847 0.278 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0586 0.0887 0.278 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0148 0.0914 0.278 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 4.68e-01 0.0679 0.0934 0.278 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 5.66e-02 -0.162 0.0844 0.278 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 1.36e-01 0.0747 0.05 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0157 0.091 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 5.43e-01 0.0288 0.0472 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 8.32e-01 0.0142 0.0669 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 4.93e-01 0.0545 0.0793 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0158 0.0886 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 9.97e-01 0.000284 0.0671 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 1.97e-01 0.0938 0.0724 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 1.55e-01 0.14 0.0983 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0204 0.0961 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 1.46e-01 -0.131 0.0896 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 2.05e-01 0.0561 0.0441 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0157 0.0908 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00648 0.0486 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 4.59e-01 0.0558 0.0752 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0805 0.0872 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0363 0.0958 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0355 0.0835 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 1.60e-01 -0.116 0.0823 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0533 0.087 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 2.87e-01 0.107 0.1 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 8.00e-01 -0.022 0.0866 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00024 0.0976 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 4.41e-02 -0.196 0.0968 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 9.49e-02 0.143 0.0849 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0856 0.0939 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0085 0.0997 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 9.91e-01 0.00105 0.0956 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 5.64e-01 0.0429 0.0742 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 4.70e-02 -0.17 0.0848 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00252 0.066 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00248 0.0719 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 6.60e-01 0.0343 0.0779 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 7.99e-01 0.0139 0.0544 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 7.36e-01 0.0261 0.0773 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 4.18e-02 -0.181 0.0883 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00317 0.069 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 3.45e-01 0.0816 0.0862 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 5.68e-01 0.0462 0.0808 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 8.91e-01 0.00728 0.053 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0302 0.0913 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 1.86e-01 -0.116 0.0875 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 4.50e-01 -0.064 0.0845 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0544 0.0915 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 5.94e-01 0.0461 0.0864 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 9.06e-01 0.00918 0.0775 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0546 0.0834 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 3.42e-02 -0.181 0.0847 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 2.10e-01 0.0858 0.0682 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 6.74e-01 0.039 0.0926 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0681 0.0914 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0428 0.0781 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 1.90e-01 0.127 0.0968 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0359 0.0894 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 1.09e-01 -0.142 0.0884 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 5.76e-01 0.0447 0.0798 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 6.31e-01 0.0408 0.0849 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0683 0.0921 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 6.05e-01 0.0315 0.0607 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 3.73e-01 0.0835 0.0935 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00382 0.0998 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0475 0.0894 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 3.80e-01 0.0813 0.0924 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0627 0.101 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 4.73e-01 0.0712 0.0991 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 2.14e-01 0.11 0.0885 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0276 0.0968 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 4.98e-01 0.063 0.0928 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 2.72e-02 -0.193 0.0868 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 7.95e-01 0.0245 0.0941 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0332 0.101 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0574 0.0965 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 1.45e-01 -0.123 0.084 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0886 0.0929 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0129 0.0334 0.277 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 6.31e-01 0.0451 0.0937 0.277 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0747 0.0912 0.277 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 8.05e-01 0.02 0.081 0.277 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 1.91e-01 -0.127 0.0967 0.277 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 1.58e-01 0.14 0.0986 0.277 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 7.31e-01 0.0284 0.0823 0.277 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0222 0.0934 0.277 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 3.82e-01 0.0801 0.0914 0.277 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 1.61e-01 -0.114 0.0806 0.277 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 2.25e-01 0.123 0.101 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0792 0.0734 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0554 0.085 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 5.65e-01 0.0572 0.0993 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0315 0.0971 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 1.79e-01 0.118 0.0874 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0753 0.0922 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 1.86e-01 -0.129 0.0971 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 8.00e-01 0.0227 0.0891 0.278 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 8.40e-04 -0.287 0.0848 0.278 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 7.27e-01 0.0231 0.0658 0.278 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 1.23e-02 -0.228 0.0901 0.278 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 8.84e-02 0.15 0.0878 0.278 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 8.86e-01 0.0109 0.0758 0.278 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 2.24e-01 0.112 0.0917 0.278 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0948 0.103 0.278 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 9.95e-01 0.000563 0.0904 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0827 0.0926 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 8.09e-01 0.018 0.0745 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 7.46e-01 0.0316 0.0975 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 2.96e-01 -0.104 0.0993 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00346 0.0925 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 1.18e-01 0.148 0.0945 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0965 0.0932 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 7.86e-01 0.0241 0.0888 0.278 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 1.25e-01 -0.127 0.0826 0.278 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 9.31e-01 0.0055 0.0631 0.278 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 7.89e-01 0.0236 0.088 0.278 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00522 0.0885 0.278 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 6.41e-01 0.0325 0.0697 0.278 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0043 0.0908 0.278 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 7.83e-01 -0.027 0.098 0.278 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 1.50e-01 0.102 0.0701 0.311 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 5.97e-01 0.0505 0.0951 0.311 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 2.22e-02 0.167 0.0722 0.311 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 7.00e-01 -0.041 0.106 0.311 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 4.29e-01 0.0965 0.122 0.311 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 5.62e-01 0.0435 0.0748 0.311 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 8.95e-01 0.0114 0.0865 0.311 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 5.85e-01 0.048 0.0876 0.311 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0366 0.102 0.311 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 2.59e-01 -0.105 0.0929 0.311 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0443 0.0863 0.311 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 2.38e-01 0.0391 0.033 0.276 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0532 0.0667 0.276 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 1.65e-01 -0.123 0.0881 0.276 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0393 0.0654 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0686 0.0934 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 5.51e-03 0.195 0.0694 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0403 0.0768 0.276 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 1.72e-02 0.156 0.065 0.276 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0191 0.061 0.276 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0303 0.0668 0.276 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 1.89e-01 -0.123 0.0935 0.28 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 3.08e-02 -0.21 0.0966 0.28 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 8.78e-01 0.0131 0.0853 0.28 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 2.27e-01 0.112 0.0926 0.28 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 2.56e-01 0.109 0.0958 0.28 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0377 0.078 0.28 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 6.20e-01 0.0446 0.0898 0.273 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 7.41e-01 -0.029 0.0876 0.273 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 5.74e-01 0.0637 0.113 0.273 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 8.02e-02 0.179 0.102 0.273 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 4.81e-01 0.0749 0.106 0.273 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 5.05e-01 0.0666 0.0997 0.273 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0215 0.0778 0.273 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 4.63e-01 0.0651 0.0886 0.273 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 1.85e-01 -0.112 0.0841 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 7.89e-01 0.0171 0.0637 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 1.12e-01 -0.134 0.084 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 2.68e-01 0.105 0.0948 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 6.57e-01 0.0378 0.0851 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 7.44e-02 0.131 0.0729 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 2.54e-01 0.0713 0.0624 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 3.74e-01 0.0813 0.0912 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 2.66e-01 0.0779 0.0698 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 2.20e-01 -0.105 0.0849 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 8.65e-01 0.017 0.0998 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 9.07e-01 0.0109 0.0938 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 1.93e-01 -0.113 0.0864 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 1.57e-01 0.0956 0.0673 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 2.19e-01 0.149 0.121 0.27 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 7.55e-01 0.0355 0.114 0.27 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 2.58e-01 0.0971 0.0854 0.27 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0922 0.113 0.27 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 3.12e-02 -0.254 0.117 0.27 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0402 0.111 0.27 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 2.40e-01 0.132 0.112 0.27 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0392 0.111 0.27 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 5.66e-01 0.0582 0.101 0.27 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0538 0.0911 0.276 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0456 0.0834 0.276 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 1.78e-01 0.132 0.0975 0.276 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 6.63e-01 -0.04 0.0917 0.276 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000252 0.0949 0.276 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 2.64e-01 0.102 0.0915 0.276 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 4.36e-01 0.0624 0.0801 0.276 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 4.91e-01 0.0649 0.094 0.278 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 5.99e-01 0.0457 0.0869 0.278 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0801 0.104 0.278 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 4.79e-01 0.0645 0.0909 0.278 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 4.97e-01 0.0594 0.0874 0.278 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00878 0.0841 0.278 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 7.56e-01 0.0244 0.0783 0.278 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 8.24e-02 -0.203 0.116 0.263 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 7.95e-01 0.0267 0.102 0.263 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 3.83e-01 0.0945 0.108 0.263 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 6.06e-01 0.0557 0.108 0.263 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0311 0.113 0.263 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0219 0.0989 0.263 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 2.63e-01 0.0857 0.0762 0.263 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 1.33e-01 -0.152 0.101 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 1.04e-01 0.0747 0.0458 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00336 0.0925 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 3.82e-01 0.0426 0.0486 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 2.29e-01 0.0919 0.0762 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 2.66e-01 0.0876 0.0785 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 7.99e-01 0.0227 0.0891 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 5.71e-01 0.0377 0.0665 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00392 0.0797 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00241 0.0918 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 1.18e-01 0.15 0.0955 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0864 0.0951 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -486602 sc-eQTL 1.44e-01 0.0777 0.053 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00834 0.0871 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 6.95e-01 0.0169 0.043 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 3.00e-01 0.0639 0.0614 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 7.47e-01 0.0243 0.0753 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0288 0.0859 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00112 0.0644 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00921 0.0675 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 255670 sc-eQTL 2.59e-01 0.11 0.0971 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 7.37e-01 0.0333 0.0992 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -202443 sc-eQTL 2.03e-01 -0.115 0.09 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0156 0.0781 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 4.56e-01 0.0471 0.0631 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 8.90e-02 -0.138 0.0807 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 5.29e-01 0.0606 0.096 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 8.55e-01 0.0151 0.0822 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 6.41e-01 0.0334 0.0715 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 5.84e-02 0.111 0.0582 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 9.51e-01 0.00558 0.09 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 9.60e-01 0.00398 0.0786 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 5.20e-01 0.0612 0.0951 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 8.39e-01 0.0186 0.0915 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 7.36e-01 0.0307 0.0909 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 8.55e-01 0.0144 0.0789 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 1.78e-01 0.0916 0.0678 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -124978 sc-eQTL 7.48e-01 0.027 0.084 0.278 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 298195 sc-eQTL 5.23e-03 -0.227 0.0805 0.278 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 164183 sc-eQTL 5.37e-01 0.0347 0.0561 0.278 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 715037 sc-eQTL 1.33e-01 -0.129 0.0857 0.278 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 587370 sc-eQTL 3.08e-01 0.0816 0.0798 0.278 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -67007 sc-eQTL 6.58e-01 0.0287 0.0647 0.278 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 117562 sc-eQTL 2.06e-01 0.11 0.0866 0.278 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -125043 sc-eQTL 2.11e-01 -0.128 0.102 0.278 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111670 \N 164183 3e-06 2.61e-06 5.1e-07 2.03e-06 7.98e-07 8.09e-07 2.29e-06 9.03e-07 2.34e-06 1.19e-06 2.56e-06 1.49e-06 4.01e-06 1.39e-06 9.19e-07 2.11e-06 1.46e-06 2.09e-06 1.57e-06 1.17e-06 1.4e-06 3.15e-06 2.58e-06 1.6e-06 4.05e-06 1.21e-06 1.42e-06 1.81e-06 3.09e-06 2.29e-06 2.01e-06 4.52e-07 6.65e-07 1.59e-06 1.43e-06 9.67e-07 9.08e-07 4.18e-07 1.3e-06 3.28e-07 4.42e-07 3.4e-06 6.27e-07 1.85e-07 4.29e-07 4.02e-07 8.55e-07 2.15e-07 1.78e-07
ENSG00000258230 \N 221387 1.64e-06 1.5e-06 2.93e-07 1.22e-06 4.41e-07 6.63e-07 1.25e-06 4.77e-07 1.78e-06 7.23e-07 1.86e-06 1.29e-06 2.68e-06 4.76e-07 3.28e-07 1.1e-06 1.07e-06 1.35e-06 5.6e-07 7.22e-07 6.24e-07 1.96e-06 1.63e-06 9.6e-07 2.44e-06 1.1e-06 1.04e-06 1.07e-06 1.64e-06 1.39e-06 7.66e-07 2.82e-07 3.71e-07 9.6e-07 7.08e-07 6.32e-07 7.35e-07 3.38e-07 6.97e-07 2.04e-07 2.44e-07 2.32e-06 3.55e-07 1.65e-07 3.83e-07 3.08e-07 4.03e-07 1.96e-07 2.9e-07