logo

Genes within 1Mb (chr12:101985371:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0467 0.0445 0.194 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 5.99e-01 0.0408 0.0776 0.194 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0338 0.0471 0.194 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 6.12e-02 0.127 0.0677 0.194 B L1
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 4.25e-01 0.062 0.0775 0.194 B L1
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 8.19e-01 0.0153 0.0667 0.194 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 8.58e-01 0.00959 0.0534 0.194 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 4.11e-01 0.0499 0.0605 0.194 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0445 0.0962 0.194 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 6.29e-01 0.0445 0.0921 0.194 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0236 0.086 0.194 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 2.91e-01 0.0753 0.0711 0.194 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 6.52e-03 -0.26 0.0945 0.194 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 9.14e-02 0.112 0.0663 0.194 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.91e-01 0.0634 0.0737 0.194 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 9.01e-01 0.00902 0.0721 0.194 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 5.70e-01 0.0287 0.0505 0.194 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 8.77e-01 0.0141 0.0908 0.194 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 9.35e-03 -0.254 0.0968 0.194 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 1.13e-01 0.102 0.0642 0.194 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 9.53e-02 0.136 0.081 0.194 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 5.87e-01 -0.049 0.0899 0.194 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 7.69e-01 0.0188 0.0639 0.194 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 1.27e-01 0.139 0.0911 0.194 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0116 0.0988 0.189 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 6.11e-01 -0.046 0.0903 0.189 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 2.51e-01 0.114 0.0991 0.189 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 1.17e-01 0.166 0.106 0.189 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0541 0.11 0.189 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 2.42e-01 0.111 0.0945 0.189 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 2.26e-01 0.0947 0.078 0.189 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 9.61e-01 0.00506 0.103 0.189 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 4.20e-01 0.067 0.0829 0.194 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0233 0.0703 0.194 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 6.02e-02 -0.165 0.0874 0.194 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.78e-01 0.0867 0.0981 0.194 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 5.97e-01 0.0479 0.0904 0.194 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 9.10e-01 0.00896 0.0796 0.194 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 3.45e-01 0.0613 0.0647 0.194 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 2.61e-01 0.101 0.09 0.193 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 8.35e-04 -0.277 0.0816 0.193 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 4.17e-01 0.0493 0.0607 0.193 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0503 0.0977 0.193 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 3.43e-01 0.0852 0.0896 0.193 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 3.83e-01 0.0591 0.0676 0.193 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 2.65e-01 0.107 0.0961 0.193 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0659 0.113 0.193 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0125 0.0347 0.194 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 1.48e-01 0.0957 0.0659 0.194 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 2.87e-01 -0.103 0.0964 0.194 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00112 0.0698 0.194 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 5.87e-02 -0.205 0.108 0.194 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 5.27e-02 0.153 0.0787 0.194 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 4.06e-01 0.0586 0.0705 0.194 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 8.16e-01 0.0198 0.0847 0.194 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0516 0.0705 0.194 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0736 0.0819 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 9.62e-01 -0.001 0.021 0.207 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0957 0.108 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0829 0.0801 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 7.26e-01 0.0401 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0317 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 6.88e-02 -0.207 0.113 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 2.97e-01 0.113 0.108 0.207 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 5.34e-01 -0.068 0.109 0.207 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 1.53e-01 -0.128 0.0891 0.207 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0416 0.0901 0.207 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 8.46e-02 -0.146 0.084 0.207 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0296 0.0444 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 3.58e-01 0.102 0.11 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 8.47e-02 0.102 0.059 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 7.92e-02 0.154 0.0872 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0293 0.0975 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 2.61e-01 0.123 0.109 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 5.39e-01 0.0557 0.0906 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 4.38e-01 0.0756 0.0972 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 2.23e-01 -0.125 0.102 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 1.83e-01 0.143 0.107 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0495 0.103 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 9.63e-01 0.00193 0.0411 0.194 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000494 0.109 0.194 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 7.44e-01 0.0232 0.0709 0.194 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 5.97e-01 0.0514 0.0971 0.194 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 1.84e-01 0.141 0.106 0.194 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0991 0.106 0.194 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 9.43e-01 0.00685 0.0948 0.194 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0312 0.0994 0.194 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0454 0.102 0.194 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 4.69e-01 0.0759 0.105 0.194 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 9.73e-02 -0.158 0.0947 0.194 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 5.09e-01 0.0373 0.0563 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 3.57e-01 0.094 0.102 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 4.47e-01 0.0403 0.0529 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 8.98e-01 0.00961 0.075 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0229 0.089 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 8.01e-01 0.0251 0.0994 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 5.16e-01 0.0489 0.0751 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 1.38e-01 0.121 0.0811 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 7.55e-01 0.0345 0.111 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0106 0.108 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 3.67e-01 -0.091 0.101 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 8.82e-01 0.00735 0.0494 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 9.55e-01 0.00577 0.101 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0818 0.0539 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 3.69e-01 0.0754 0.0838 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0951 0.0971 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 6.03e-01 0.0557 0.107 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 2.51e-01 -0.107 0.0928 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0877 0.092 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0877 0.0969 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 3.79e-01 0.0985 0.112 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0542 0.0964 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 9.06e-01 0.0127 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 1.50e-02 -0.261 0.107 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 4.61e-01 0.0698 0.0944 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0548 0.104 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0382 0.11 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0906 0.105 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 5.29e-01 0.0522 0.0827 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 1.36e-02 -0.234 0.0941 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 2.03e-01 0.0937 0.0734 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 7.45e-01 0.0262 0.0802 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 5.88e-01 0.0472 0.0869 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 3.83e-01 0.053 0.0606 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 1.15e-01 0.136 0.0861 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 2.65e-02 -0.221 0.0988 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 6.32e-01 0.0371 0.0773 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 4.08e-01 0.0801 0.0966 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0253 0.0906 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 6.29e-01 0.0287 0.0594 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 3.05e-01 0.105 0.102 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.62e-02 -0.206 0.0979 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 9.02e-01 0.0117 0.0952 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0953 0.103 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 7.38e-01 0.0325 0.0973 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 2.18e-01 0.107 0.0869 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0775 0.0946 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 2.50e-03 -0.291 0.0951 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 2.18e-01 0.0956 0.0775 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 4.86e-01 0.0732 0.105 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 8.18e-01 -0.024 0.104 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0762 0.0886 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 9.29e-02 0.185 0.11 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0692 0.1 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 4.25e-02 -0.201 0.0987 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 4.00e-01 0.0753 0.0893 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.45e-01 0.0898 0.0949 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 2.34e-01 -0.123 0.103 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 6.58e-01 0.0301 0.068 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 2.68e-02 0.231 0.104 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 8.30e-01 0.0235 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0894 0.0975 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 2.08e-01 0.127 0.101 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 7.27e-01 0.0385 0.11 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 9.34e-01 0.00899 0.108 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.0967 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 8.77e-01 0.0165 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 4.68e-01 0.077 0.106 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 2.50e-02 -0.224 0.0991 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 4.27e-01 0.0854 0.107 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0517 0.115 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00685 0.11 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 1.44e-01 -0.141 0.0959 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 9.55e-01 0.00595 0.106 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 8.54e-01 0.00688 0.0373 0.195 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 9.98e-02 0.172 0.104 0.195 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0981 0.102 0.195 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 7.07e-01 0.034 0.0905 0.195 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.13e-02 -0.233 0.107 0.195 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 6.21e-02 0.206 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 7.30e-01 0.0317 0.092 0.195 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0285 0.104 0.195 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 1.65e-01 0.142 0.102 0.195 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0936 0.0903 0.195 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.36e-02 -0.176 0.0821 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 7.06e-01 0.0363 0.0959 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 9.21e-01 0.0111 0.112 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 8.27e-01 0.024 0.109 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 4.64e-02 0.196 0.098 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00374 0.104 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0546 0.11 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 8.51e-01 0.0188 0.0998 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.26e-05 -0.398 0.0936 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 5.35e-01 0.0458 0.0737 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.61e-02 -0.214 0.101 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 1.80e-01 0.133 0.0986 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 8.20e-01 0.0193 0.0849 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 1.14e-01 0.162 0.102 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0334 0.116 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0115 0.101 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0789 0.104 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 8.32e-01 0.0177 0.0836 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 6.09e-01 0.0559 0.109 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 1.16e-01 -0.175 0.111 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 8.50e-01 0.0196 0.104 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 1.66e-01 0.147 0.106 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0337 0.105 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 7.10e-01 0.0373 0.1 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.95e-02 -0.193 0.093 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 8.40e-01 0.0145 0.0714 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 4.66e-01 0.0725 0.0994 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 4.54e-01 0.075 0.1 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0172 0.0788 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0124 0.103 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0773 0.111 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 5.43e-01 0.0483 0.0792 0.219 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 5.21e-01 0.0686 0.107 0.219 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 1.52e-01 0.118 0.0821 0.219 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0142 0.119 0.219 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 5.46e-01 0.0827 0.137 0.219 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 4.16e-01 0.0684 0.0838 0.219 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 3.33e-01 0.0939 0.0966 0.219 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0978 0.219 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 7.15e-01 0.0419 0.114 0.219 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0826 0.104 0.219 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 4.93e-01 0.0665 0.0967 0.219 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 1.42e-01 0.055 0.0373 0.196 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 9.12e-01 0.00837 0.0757 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 2.08e-01 -0.126 0.0999 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 9.13e-01 0.00811 0.0742 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 2.62e-01 -0.119 0.106 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 6.14e-03 0.218 0.0787 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0487 0.0871 0.196 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 2.11e-02 0.171 0.0737 0.196 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0344 0.0692 0.196 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0404 0.0757 0.196 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 1.24e-01 -0.16 0.104 0.194 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 1.49e-02 -0.263 0.107 0.194 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 6.97e-01 0.0369 0.0947 0.194 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.13e-01 0.104 0.103 0.194 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 9.00e-02 0.181 0.106 0.194 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 7.21e-01 -0.031 0.0867 0.194 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 1.96e-01 0.126 0.0969 0.193 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0631 0.0948 0.193 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 4.70e-01 0.0885 0.122 0.193 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 1.11e-01 0.177 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 6.37e-01 0.0544 0.115 0.193 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 2.99e-01 0.112 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 8.64e-01 0.0145 0.0842 0.193 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 4.25e-01 0.0767 0.0959 0.193 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0713 0.0957 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0686 0.0721 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 1.54e-02 -0.231 0.0945 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 1.60e-01 0.151 0.107 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 8.60e-01 0.0171 0.0966 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 1.68e-01 0.115 0.0829 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 2.44e-01 0.0827 0.0708 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 2.41e-02 0.231 0.102 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 9.43e-01 0.00562 0.0789 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 2.64e-01 -0.107 0.0957 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 8.77e-01 0.0175 0.112 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 9.86e-01 0.0018 0.106 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 1.38e-01 -0.145 0.0972 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 3.52e-01 0.0709 0.076 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 1.43e-01 0.194 0.132 0.185 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 4.38e-01 0.0966 0.124 0.185 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 3.05e-01 0.0963 0.0935 0.185 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.06e-01 -0.127 0.124 0.185 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 5.40e-02 -0.249 0.128 0.185 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0248 0.121 0.185 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0433 0.123 0.185 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 8.65e-01 0.0206 0.121 0.185 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 1.59e-01 0.156 0.11 0.185 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 2.34e-01 -0.123 0.103 0.184 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 2.71e-01 -0.104 0.0945 0.184 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 3.79e-01 0.098 0.111 0.184 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 2.63e-01 -0.117 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 8.24e-01 -0.024 0.108 0.184 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 4.95e-01 0.0712 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0382 0.0911 0.184 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 4.51e-01 0.078 0.103 0.192 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0367 0.0955 0.192 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 1.09e-01 -0.183 0.114 0.192 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.77e-01 0.0883 0.0998 0.192 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 3.54e-02 0.201 0.0951 0.192 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 9.27e-01 0.00846 0.0924 0.192 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 4.27e-01 0.0684 0.0859 0.192 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0536 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00239 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 1.68e-01 0.16 0.115 0.184 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 6.84e-01 0.0471 0.116 0.184 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 9.10e-01 0.0138 0.122 0.184 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.106 0.184 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 1.90e-01 0.107 0.0815 0.184 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 2.61e-01 -0.122 0.108 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0114 0.0513 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 5.36e-01 0.0639 0.103 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 2.25e-01 0.0658 0.0541 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 9.07e-02 0.144 0.0847 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 1.84e-01 0.116 0.0874 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 8.42e-01 0.0198 0.0993 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 6.39e-01 0.0348 0.0741 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 6.15e-01 0.0447 0.0888 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 3.90e-01 -0.088 0.102 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 6.96e-02 0.194 0.106 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0981 0.106 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -496373 sc-eQTL 6.78e-01 0.0248 0.0596 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 3.05e-01 0.0999 0.0973 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0029 0.0481 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 2.26e-01 0.0834 0.0687 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0414 0.0843 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 6.29e-01 0.0465 0.0962 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 6.83e-01 0.0294 0.0721 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 9.80e-01 0.00193 0.0756 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 245899 sc-eQTL 9.73e-01 0.00364 0.109 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 8.66e-01 0.0188 0.111 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -212214 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0948 0.101 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 3.85e-01 0.0769 0.0882 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0323 0.0714 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 2.98e-02 -0.199 0.091 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 3.29e-01 0.106 0.108 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0125 0.093 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 8.59e-01 0.0143 0.0809 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 8.37e-02 0.115 0.0659 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 9.60e-01 0.00501 0.0999 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0648 0.0872 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0253 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0425 0.102 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 1.95e-01 0.131 0.101 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00462 0.0876 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 6.74e-01 0.0318 0.0756 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -134749 sc-eQTL 5.51e-01 0.0568 0.0951 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 288424 sc-eQTL 3.71e-04 -0.326 0.0901 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 154412 sc-eQTL 3.96e-01 0.054 0.0635 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 705266 sc-eQTL 4.30e-01 -0.077 0.0974 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 577599 sc-eQTL 3.14e-01 0.0911 0.0903 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -76778 sc-eQTL 9.12e-01 0.00814 0.0733 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 107791 sc-eQTL 1.68e-01 0.135 0.098 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -134814 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0596 0.116 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 107791 eQTL 0.00505 0.0492 0.0175 0.0 0.0 0.202

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina