Genes within 1Mb (chr12:101980636:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0467 0.0445 0.194 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 5.99e-01 0.0408 0.0776 0.194 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0338 0.0471 0.194 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 6.12e-02 0.127 0.0677 0.194 B L1
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 4.25e-01 0.062 0.0775 0.194 B L1
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 8.19e-01 0.0153 0.0667 0.194 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 8.58e-01 0.00959 0.0534 0.194 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 4.11e-01 0.0499 0.0605 0.194 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0445 0.0962 0.194 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 6.29e-01 0.0445 0.0921 0.194 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0236 0.086 0.194 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 2.91e-01 0.0753 0.0711 0.194 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 6.52e-03 -0.26 0.0945 0.194 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 9.14e-02 0.112 0.0663 0.194 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.91e-01 0.0634 0.0737 0.194 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 9.01e-01 0.00902 0.0721 0.194 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 5.70e-01 0.0287 0.0505 0.194 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 8.77e-01 0.0141 0.0908 0.194 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 9.35e-03 -0.254 0.0968 0.194 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 1.13e-01 0.102 0.0642 0.194 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 9.53e-02 0.136 0.081 0.194 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 5.87e-01 -0.049 0.0899 0.194 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 7.69e-01 0.0188 0.0639 0.194 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 1.27e-01 0.139 0.0911 0.194 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0116 0.0988 0.189 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 6.11e-01 -0.046 0.0903 0.189 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 2.51e-01 0.114 0.0991 0.189 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 1.17e-01 0.166 0.106 0.189 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0541 0.11 0.189 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 2.42e-01 0.111 0.0945 0.189 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 2.26e-01 0.0947 0.078 0.189 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 9.61e-01 0.00506 0.103 0.189 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 4.20e-01 0.067 0.0829 0.194 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0233 0.0703 0.194 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 6.02e-02 -0.165 0.0874 0.194 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.78e-01 0.0867 0.0981 0.194 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 5.97e-01 0.0479 0.0904 0.194 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 9.10e-01 0.00896 0.0796 0.194 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 3.45e-01 0.0613 0.0647 0.194 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 2.61e-01 0.101 0.09 0.193 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 8.35e-04 -0.277 0.0816 0.193 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 4.17e-01 0.0493 0.0607 0.193 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0503 0.0977 0.193 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 3.43e-01 0.0852 0.0896 0.193 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 3.83e-01 0.0591 0.0676 0.193 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 2.65e-01 0.107 0.0961 0.193 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0659 0.113 0.193 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0125 0.0347 0.194 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 1.48e-01 0.0957 0.0659 0.194 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 2.87e-01 -0.103 0.0964 0.194 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00112 0.0698 0.194 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 5.87e-02 -0.205 0.108 0.194 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 5.27e-02 0.153 0.0787 0.194 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 4.06e-01 0.0586 0.0705 0.194 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 8.16e-01 0.0198 0.0847 0.194 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0516 0.0705 0.194 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0736 0.0819 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 9.62e-01 -0.001 0.021 0.207 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0957 0.108 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0829 0.0801 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 7.26e-01 0.0401 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0317 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 6.88e-02 -0.207 0.113 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 2.97e-01 0.113 0.108 0.207 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 5.34e-01 -0.068 0.109 0.207 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 1.53e-01 -0.128 0.0891 0.207 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0416 0.0901 0.207 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 8.46e-02 -0.146 0.084 0.207 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0296 0.0444 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 3.58e-01 0.102 0.11 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 8.47e-02 0.102 0.059 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 7.92e-02 0.154 0.0872 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0293 0.0975 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 2.61e-01 0.123 0.109 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 5.39e-01 0.0557 0.0906 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 4.38e-01 0.0756 0.0972 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 2.23e-01 -0.125 0.102 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 1.83e-01 0.143 0.107 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0495 0.103 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 9.63e-01 0.00193 0.0411 0.194 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000494 0.109 0.194 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 7.44e-01 0.0232 0.0709 0.194 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 5.97e-01 0.0514 0.0971 0.194 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 1.84e-01 0.141 0.106 0.194 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0991 0.106 0.194 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 9.43e-01 0.00685 0.0948 0.194 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0312 0.0994 0.194 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0454 0.102 0.194 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 4.69e-01 0.0759 0.105 0.194 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 9.73e-02 -0.158 0.0947 0.194 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 5.09e-01 0.0373 0.0563 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 3.57e-01 0.094 0.102 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 4.47e-01 0.0403 0.0529 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 8.98e-01 0.00961 0.075 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0229 0.089 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 8.01e-01 0.0251 0.0994 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 5.16e-01 0.0489 0.0751 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 1.38e-01 0.121 0.0811 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 7.55e-01 0.0345 0.111 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0106 0.108 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 3.67e-01 -0.091 0.101 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 8.82e-01 0.00735 0.0494 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 9.55e-01 0.00577 0.101 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0818 0.0539 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 3.69e-01 0.0754 0.0838 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0951 0.0971 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 6.03e-01 0.0557 0.107 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 2.51e-01 -0.107 0.0928 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0877 0.092 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0877 0.0969 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 3.79e-01 0.0985 0.112 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0542 0.0964 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 9.06e-01 0.0127 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 1.50e-02 -0.261 0.107 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 4.61e-01 0.0698 0.0944 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0548 0.104 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0382 0.11 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0906 0.105 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 5.29e-01 0.0522 0.0827 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 1.36e-02 -0.234 0.0941 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 2.03e-01 0.0937 0.0734 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 7.45e-01 0.0262 0.0802 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 5.88e-01 0.0472 0.0869 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 3.83e-01 0.053 0.0606 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 1.15e-01 0.136 0.0861 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 2.65e-02 -0.221 0.0988 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 6.32e-01 0.0371 0.0773 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 4.08e-01 0.0801 0.0966 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0253 0.0906 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 6.29e-01 0.0287 0.0594 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 3.05e-01 0.105 0.102 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.62e-02 -0.206 0.0979 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 9.02e-01 0.0117 0.0952 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0953 0.103 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 7.38e-01 0.0325 0.0973 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 2.18e-01 0.107 0.0869 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0775 0.0946 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 2.50e-03 -0.291 0.0951 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 2.18e-01 0.0956 0.0775 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 4.86e-01 0.0732 0.105 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 8.18e-01 -0.024 0.104 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0762 0.0886 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 9.29e-02 0.185 0.11 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0692 0.1 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 4.25e-02 -0.201 0.0987 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 4.00e-01 0.0753 0.0893 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.45e-01 0.0898 0.0949 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 2.34e-01 -0.123 0.103 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 6.58e-01 0.0301 0.068 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 2.68e-02 0.231 0.104 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 8.30e-01 0.0235 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0894 0.0975 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 2.08e-01 0.127 0.101 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 7.27e-01 0.0385 0.11 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 9.34e-01 0.00899 0.108 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.0967 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 8.77e-01 0.0165 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 4.68e-01 0.077 0.106 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 2.50e-02 -0.224 0.0991 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 4.27e-01 0.0854 0.107 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0517 0.115 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00685 0.11 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 1.44e-01 -0.141 0.0959 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 9.55e-01 0.00595 0.106 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 8.54e-01 0.00688 0.0373 0.195 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 9.98e-02 0.172 0.104 0.195 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0981 0.102 0.195 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 7.07e-01 0.034 0.0905 0.195 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.13e-02 -0.233 0.107 0.195 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 6.21e-02 0.206 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 7.30e-01 0.0317 0.092 0.195 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0285 0.104 0.195 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 1.65e-01 0.142 0.102 0.195 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0936 0.0903 0.195 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.36e-02 -0.176 0.0821 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 7.06e-01 0.0363 0.0959 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 9.21e-01 0.0111 0.112 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 8.27e-01 0.024 0.109 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 4.64e-02 0.196 0.098 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00374 0.104 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0546 0.11 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 8.51e-01 0.0188 0.0998 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.26e-05 -0.398 0.0936 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 5.35e-01 0.0458 0.0737 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.61e-02 -0.214 0.101 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 1.80e-01 0.133 0.0986 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 8.20e-01 0.0193 0.0849 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 1.14e-01 0.162 0.102 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0334 0.116 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0115 0.101 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0789 0.104 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 8.32e-01 0.0177 0.0836 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 6.09e-01 0.0559 0.109 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 1.16e-01 -0.175 0.111 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 8.50e-01 0.0196 0.104 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 1.66e-01 0.147 0.106 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0337 0.105 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 7.10e-01 0.0373 0.1 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.95e-02 -0.193 0.093 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 8.40e-01 0.0145 0.0714 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 4.66e-01 0.0725 0.0994 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 4.54e-01 0.075 0.1 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0172 0.0788 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0124 0.103 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0773 0.111 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 5.43e-01 0.0483 0.0792 0.219 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 5.21e-01 0.0686 0.107 0.219 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 1.52e-01 0.118 0.0821 0.219 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0142 0.119 0.219 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 5.46e-01 0.0827 0.137 0.219 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 4.16e-01 0.0684 0.0838 0.219 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 3.33e-01 0.0939 0.0966 0.219 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0978 0.219 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 7.15e-01 0.0419 0.114 0.219 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0826 0.104 0.219 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 4.93e-01 0.0665 0.0967 0.219 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 1.42e-01 0.055 0.0373 0.196 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 9.12e-01 0.00837 0.0757 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 2.08e-01 -0.126 0.0999 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 9.13e-01 0.00811 0.0742 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 2.62e-01 -0.119 0.106 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 6.14e-03 0.218 0.0787 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0487 0.0871 0.196 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 2.11e-02 0.171 0.0737 0.196 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0344 0.0692 0.196 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0404 0.0757 0.196 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 1.24e-01 -0.16 0.104 0.194 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 1.49e-02 -0.263 0.107 0.194 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 6.97e-01 0.0369 0.0947 0.194 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.13e-01 0.104 0.103 0.194 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 9.00e-02 0.181 0.106 0.194 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 7.21e-01 -0.031 0.0867 0.194 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 1.96e-01 0.126 0.0969 0.193 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0631 0.0948 0.193 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 4.70e-01 0.0885 0.122 0.193 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 1.11e-01 0.177 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 6.37e-01 0.0544 0.115 0.193 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 2.99e-01 0.112 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 8.64e-01 0.0145 0.0842 0.193 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 4.25e-01 0.0767 0.0959 0.193 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0713 0.0957 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0686 0.0721 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 1.54e-02 -0.231 0.0945 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 1.60e-01 0.151 0.107 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 8.60e-01 0.0171 0.0966 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 1.68e-01 0.115 0.0829 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 2.44e-01 0.0827 0.0708 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 2.41e-02 0.231 0.102 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 9.43e-01 0.00562 0.0789 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 2.64e-01 -0.107 0.0957 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 8.77e-01 0.0175 0.112 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 9.86e-01 0.0018 0.106 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 1.38e-01 -0.145 0.0972 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 3.52e-01 0.0709 0.076 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 1.43e-01 0.194 0.132 0.185 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 4.38e-01 0.0966 0.124 0.185 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 3.05e-01 0.0963 0.0935 0.185 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.06e-01 -0.127 0.124 0.185 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 5.40e-02 -0.249 0.128 0.185 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0248 0.121 0.185 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0433 0.123 0.185 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 8.65e-01 0.0206 0.121 0.185 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 1.59e-01 0.156 0.11 0.185 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 2.34e-01 -0.123 0.103 0.184 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 2.71e-01 -0.104 0.0945 0.184 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 3.79e-01 0.098 0.111 0.184 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 2.63e-01 -0.117 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 8.24e-01 -0.024 0.108 0.184 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 4.95e-01 0.0712 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0382 0.0911 0.184 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 4.51e-01 0.078 0.103 0.192 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0367 0.0955 0.192 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 1.09e-01 -0.183 0.114 0.192 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.77e-01 0.0883 0.0998 0.192 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 3.54e-02 0.201 0.0951 0.192 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 9.27e-01 0.00846 0.0924 0.192 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 4.27e-01 0.0684 0.0859 0.192 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0536 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00239 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 1.68e-01 0.16 0.115 0.184 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 6.84e-01 0.0471 0.116 0.184 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 9.10e-01 0.0138 0.122 0.184 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.106 0.184 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 1.90e-01 0.107 0.0815 0.184 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 2.61e-01 -0.122 0.108 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0114 0.0513 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 5.36e-01 0.0639 0.103 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 2.25e-01 0.0658 0.0541 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 9.07e-02 0.144 0.0847 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 1.84e-01 0.116 0.0874 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 8.42e-01 0.0198 0.0993 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 6.39e-01 0.0348 0.0741 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 6.15e-01 0.0447 0.0888 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 3.90e-01 -0.088 0.102 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 6.96e-02 0.194 0.106 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0981 0.106 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -501108 sc-eQTL 6.78e-01 0.0248 0.0596 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 3.05e-01 0.0999 0.0973 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0029 0.0481 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 2.26e-01 0.0834 0.0687 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0414 0.0843 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 6.29e-01 0.0465 0.0962 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 6.83e-01 0.0294 0.0721 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 9.80e-01 0.00193 0.0756 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 241164 sc-eQTL 9.73e-01 0.00364 0.109 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 8.66e-01 0.0188 0.111 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -216949 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0948 0.101 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 3.85e-01 0.0769 0.0882 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0323 0.0714 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 2.98e-02 -0.199 0.091 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 3.29e-01 0.106 0.108 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0125 0.093 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 8.59e-01 0.0143 0.0809 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 8.37e-02 0.115 0.0659 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 9.60e-01 0.00501 0.0999 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0648 0.0872 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0253 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0425 0.102 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 1.95e-01 0.131 0.101 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00462 0.0876 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 6.74e-01 0.0318 0.0756 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -139484 sc-eQTL 5.51e-01 0.0568 0.0951 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 283689 sc-eQTL 3.71e-04 -0.326 0.0901 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 149677 sc-eQTL 3.96e-01 0.054 0.0635 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 700531 sc-eQTL 4.30e-01 -0.077 0.0974 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 572864 sc-eQTL 3.14e-01 0.0911 0.0903 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -81513 sc-eQTL 9.12e-01 0.00814 0.0733 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 103056 sc-eQTL 1.68e-01 0.135 0.098 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -139549 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0596 0.116 0.192 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 103056 eQTL 0.00457 0.0495 0.0174 0.0 0.0 0.203


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina