Genes within 1Mb (chr12:101973010:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0188 0.0718 0.075 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 1.37e-01 -0.185 0.124 0.075 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 4.00e-01 0.0639 0.0758 0.075 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 4.58e-01 0.0815 0.11 0.075 B L1
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 4.18e-01 0.101 0.125 0.075 B L1
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 6.39e-01 0.0504 0.107 0.075 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000681 0.0859 0.075 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0475 0.0974 0.075 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 1.42e-01 0.227 0.154 0.075 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0249 0.148 0.075 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 1.80e-01 -0.185 0.138 0.075 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00799 0.114 0.075 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.79e-01 0.0233 0.153 0.075 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 2.95e-01 -0.111 0.106 0.075 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 6.22e-01 0.0579 0.117 0.075 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 2.22e-01 0.14 0.115 0.075 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 3.39e-01 -0.077 0.0803 0.075 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00654 0.145 0.075 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0151 0.157 0.075 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 4.65e-01 0.0754 0.103 0.075 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 9.71e-01 0.00472 0.13 0.075 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0684 0.144 0.075 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 8.69e-01 0.0169 0.102 0.075 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 1.04e-01 -0.238 0.145 0.075 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 6.07e-02 -0.309 0.164 0.07 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 3.36e-01 0.145 0.151 0.07 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.08e-01 -0.169 0.166 0.07 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 3.30e-01 0.173 0.177 0.07 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0225 0.184 0.07 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 3.85e-01 0.138 0.158 0.07 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 2.47e-01 -0.151 0.13 0.07 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 9.26e-01 0.0159 0.172 0.07 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0921 0.135 0.075 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 2.74e-01 0.125 0.114 0.075 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 5.69e-01 0.0819 0.143 0.075 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 7.45e-01 -0.052 0.16 0.075 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0308 0.147 0.075 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 4.91e-01 0.0893 0.129 0.075 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0122 0.106 0.075 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0604 0.146 0.075 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 6.56e-01 0.0603 0.135 0.075 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0903 0.0979 0.075 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 2.62e-01 -0.177 0.157 0.075 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 4.83e-01 0.102 0.145 0.075 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 9.43e-01 0.00777 0.109 0.075 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0743 0.156 0.075 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 2.43e-01 -0.213 0.182 0.075 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 8.77e-01 0.00869 0.0559 0.075 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0964 0.106 0.075 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 2.94e-01 -0.163 0.155 0.075 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.05e-01 0.115 0.112 0.075 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 5.88e-01 0.0951 0.175 0.075 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 4.27e-01 -0.102 0.128 0.075 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0279 0.114 0.075 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 4.01e-01 0.114 0.136 0.075 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 7.09e-01 0.0424 0.114 0.075 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0163 0.132 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 5.17e-01 0.0233 0.0358 0.074 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 9.42e-01 0.0135 0.186 0.074 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0245 0.137 0.074 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0736 0.195 0.074 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 6.19e-01 -0.094 0.189 0.074 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 5.48e-01 0.117 0.195 0.074 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 9.19e-01 0.0189 0.186 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 8.21e-01 0.0422 0.187 0.074 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0826 0.153 0.074 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 3.72e-02 0.32 0.152 0.074 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 3.41e-01 0.138 0.145 0.074 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 6.26e-02 0.137 0.0731 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 7.27e-01 0.0641 0.184 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 5.16e-01 -0.064 0.0984 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 4.17e-01 -0.118 0.145 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 9.64e-01 0.00738 0.162 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 5.64e-01 -0.105 0.182 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 1.98e-01 0.194 0.15 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 1.36e-01 -0.24 0.161 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 1.14e-01 0.268 0.169 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 2.03e-01 -0.226 0.178 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 6.31e-01 0.082 0.171 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 1.47e-02 0.167 0.0677 0.073 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 3.58e-01 -0.167 0.181 0.073 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 2.86e-01 -0.126 0.118 0.073 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 4.31e-01 -0.128 0.162 0.073 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 6.82e-01 -0.073 0.178 0.073 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 4.44e-02 0.355 0.175 0.073 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 2.28e-01 0.191 0.158 0.073 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 3.03e-01 -0.171 0.166 0.073 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 7.28e-01 0.0595 0.171 0.073 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 8.64e-01 0.0299 0.175 0.073 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0907 0.159 0.073 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 3.28e-01 0.0889 0.0905 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 5.65e-02 -0.312 0.163 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0362 0.0853 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.71e-01 0.108 0.121 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 1.20e-01 0.223 0.143 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0529 0.16 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 2.34e-01 -0.144 0.121 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 9.90e-01 0.00167 0.131 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 2.28e-01 0.215 0.178 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00266 0.174 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 3.79e-01 -0.143 0.162 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 2.02e-01 0.102 0.08 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 8.66e-01 0.0278 0.165 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 1.01e-01 0.144 0.0875 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 6.17e-01 0.0684 0.136 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 9.98e-01 0.000386 0.158 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 2.09e-01 -0.218 0.173 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 2.45e-01 0.176 0.151 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 4.16e-01 -0.122 0.15 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 8.33e-01 0.0333 0.158 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 5.83e-01 0.0999 0.182 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 1.90e-01 0.205 0.156 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 6.61e-01 0.0827 0.189 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 4.82e-01 0.133 0.189 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 2.16e-02 0.378 0.163 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 9.27e-01 0.0167 0.182 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0908 0.192 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 1.36e-01 0.275 0.184 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 6.31e-01 0.0633 0.132 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 9.89e-01 0.00216 0.152 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 7.85e-02 -0.205 0.116 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 8.15e-01 0.0298 0.127 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 6.85e-01 0.0561 0.138 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 3.00e-01 -0.1 0.0963 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 4.56e-01 -0.103 0.138 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00778 0.16 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.75e-01 -0.11 0.124 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 2.39e-01 0.182 0.154 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 9.80e-02 0.239 0.144 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 2.85e-01 -0.102 0.0949 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 5.07e-01 -0.111 0.167 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.71e-01 0.0262 0.161 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0916 0.155 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 7.34e-01 0.0571 0.168 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 6.80e-01 0.0656 0.159 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 2.73e-01 -0.156 0.142 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0531 0.154 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.13e-01 0.0374 0.158 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 9.28e-01 0.0114 0.126 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 8.31e-01 0.0366 0.171 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 9.75e-01 0.00524 0.169 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 9.01e-01 0.0179 0.144 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0236 0.179 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 9.07e-01 0.0186 0.159 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.41e-01 0.0319 0.158 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 4.57e-01 -0.106 0.142 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0505 0.151 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0274 0.164 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 7.41e-01 0.0357 0.108 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 9.95e-02 -0.274 0.166 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 8.88e-01 -0.026 0.184 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 9.35e-01 0.0135 0.165 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0306 0.171 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 2.75e-01 -0.203 0.186 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 3.46e-01 0.173 0.183 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 2.21e-01 0.201 0.163 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 3.82e-01 -0.156 0.178 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0694 0.174 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0326 0.165 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 1.95e-01 -0.228 0.176 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 9.82e-01 0.00435 0.189 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 2.10e-01 -0.226 0.18 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 4.59e-01 -0.117 0.158 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 3.27e-01 -0.171 0.174 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0376 0.0629 0.071 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 5.50e-01 -0.106 0.177 0.071 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.01e-01 0.0434 0.172 0.071 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 8.73e-01 0.0244 0.153 0.071 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 8.46e-01 0.0355 0.183 0.071 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 5.74e-01 -0.105 0.187 0.071 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0543 0.155 0.071 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 4.27e-01 -0.14 0.176 0.071 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0543 0.172 0.071 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0892 0.153 0.071 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0722 0.192 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 3.56e-01 0.129 0.139 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.89e-02 -0.331 0.159 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0593 0.188 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 3.99e-01 -0.155 0.183 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0777 0.166 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 4.89e-01 -0.121 0.174 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 2.38e-01 -0.218 0.184 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0719 0.162 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 7.83e-01 0.0436 0.158 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.20e-01 -0.119 0.12 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 2.00e-01 -0.213 0.166 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 1.68e-01 0.222 0.16 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00215 0.138 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 5.43e-01 -0.102 0.167 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0932 0.188 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 4.95e-01 0.117 0.172 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 4.92e-01 -0.121 0.176 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0445 0.142 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0333 0.185 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 2.56e-01 0.215 0.189 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0891 0.176 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 6.52e-01 0.0815 0.181 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 1.16e-01 -0.279 0.176 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 9.79e-01 0.00437 0.162 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 7.32e-01 0.052 0.152 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0551 0.115 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0687 0.16 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 2.60e-01 -0.182 0.161 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 3.98e-01 0.108 0.127 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0784 0.166 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 2.78e-01 0.194 0.178 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 1.07e-01 0.2 0.123 0.089 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0788 0.167 0.089 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 1.72e-01 0.177 0.129 0.089 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0424 0.187 0.089 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0949 0.214 0.089 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00609 0.132 0.089 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 4.46e-01 -0.116 0.152 0.089 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 4.07e-01 -0.128 0.154 0.089 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 1.50e-01 -0.258 0.178 0.089 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0324 0.164 0.089 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 1.58e-01 -0.214 0.151 0.089 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 8.73e-01 0.00977 0.0611 0.072 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 2.54e-01 -0.141 0.123 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0575 0.163 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0924 0.121 0.072 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 6.51e-01 0.0781 0.172 0.072 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 3.29e-01 0.127 0.13 0.072 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 8.88e-01 0.02 0.142 0.072 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 2.84e-01 0.13 0.121 0.072 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 9.08e-01 0.013 0.113 0.072 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 7.39e-01 -0.041 0.123 0.072 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 7.72e-01 0.05 0.172 0.075 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.24e-01 0.0398 0.179 0.075 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0763 0.156 0.075 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 3.27e-01 0.167 0.17 0.075 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 2.68e-01 -0.195 0.176 0.075 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 4.22e-01 -0.115 0.143 0.075 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 7.38e-02 -0.29 0.161 0.071 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 6.56e-01 0.0708 0.159 0.071 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 4.65e-01 -0.15 0.205 0.071 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 5.71e-01 0.105 0.185 0.071 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 8.54e-01 0.0354 0.192 0.071 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 7.36e-01 0.0609 0.181 0.071 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 2.02e-01 -0.179 0.14 0.071 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 9.74e-01 0.00522 0.161 0.071 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 7.06e-01 0.0579 0.154 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 1.84e-01 0.154 0.115 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 8.19e-01 0.0352 0.154 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 2.75e-01 -0.188 0.172 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 3.64e-01 0.14 0.155 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 2.80e-01 0.144 0.133 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0933 0.114 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 9.38e-02 -0.278 0.165 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 4.89e-01 0.0883 0.127 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00363 0.155 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0123 0.182 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00187 0.171 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 5.72e-01 0.0894 0.158 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 7.17e-01 0.0446 0.123 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 5.07e-01 -0.156 0.234 0.07 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 3.52e-01 -0.205 0.219 0.07 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.64e-01 0.15 0.165 0.07 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 8.14e-01 0.0515 0.219 0.07 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 4.42e-01 -0.176 0.229 0.07 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0154 0.214 0.07 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 1.34e-02 0.532 0.212 0.07 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0878 0.213 0.07 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 4.28e-01 -0.155 0.195 0.07 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 1.19e-01 0.256 0.164 0.078 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 5.73e-01 0.085 0.151 0.078 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 6.99e-01 0.0685 0.177 0.078 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 3.26e-01 0.163 0.165 0.078 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 8.45e-01 0.0336 0.171 0.078 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 8.60e-01 0.0293 0.166 0.078 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 4.19e-01 0.117 0.145 0.078 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 7.78e-01 0.0481 0.171 0.077 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 2.94e-01 0.165 0.157 0.077 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 2.67e-01 0.209 0.188 0.077 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 7.15e-01 0.0602 0.165 0.077 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 2.10e-02 -0.364 0.156 0.077 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0328 0.152 0.077 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0886 0.142 0.077 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 1.24e-01 -0.345 0.223 0.065 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.93e-01 0.0263 0.196 0.065 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 8.01e-02 -0.362 0.205 0.065 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 8.44e-01 0.0407 0.207 0.065 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 5.66e-01 -0.125 0.217 0.065 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0913 0.189 0.065 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0373 0.146 0.065 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 5.48e-01 -0.117 0.194 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 1.24e-02 0.212 0.084 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0119 0.171 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0583 0.09 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.49e-01 -0.133 0.141 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0885 0.146 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 2.42e-01 0.193 0.164 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 1.51e-01 0.176 0.123 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 4.06e-01 -0.123 0.147 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 6.50e-02 0.313 0.169 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 9.86e-01 0.0032 0.178 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 9.97e-01 0.000635 0.176 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -508734 sc-eQTL 1.98e-01 0.123 0.0956 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 9.16e-02 -0.264 0.156 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 7.53e-01 0.0244 0.0775 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.24e-01 0.11 0.111 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 3.64e-01 0.124 0.136 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 3.15e-01 -0.156 0.155 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0774 0.116 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0171 0.122 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 233538 sc-eQTL 2.71e-01 0.194 0.175 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 6.80e-01 0.074 0.179 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -224575 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00277 0.163 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 4.28e-01 -0.112 0.142 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 2.11e-01 0.143 0.114 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 8.48e-01 0.0284 0.148 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 2.98e-01 -0.181 0.174 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 4.27e-01 0.119 0.149 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 3.41e-01 0.124 0.13 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0393 0.106 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 4.13e-01 0.134 0.163 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 4.94e-01 0.0976 0.143 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 2.20e-01 0.212 0.172 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 2.87e-01 0.177 0.166 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 5.39e-02 -0.317 0.164 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0103 0.143 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 6.13e-01 0.0626 0.124 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147110 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0905 0.153 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 276063 sc-eQTL 8.34e-01 0.0314 0.15 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 142051 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0872 0.102 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692905 sc-eQTL 2.06e-01 -0.199 0.157 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 565238 sc-eQTL 4.70e-01 0.106 0.146 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89139 sc-eQTL 7.75e-01 0.0339 0.118 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95430 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0575 0.159 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -147175 sc-eQTL 5.22e-01 -0.12 0.187 0.075 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 95430 eQTL 0.00382 -0.0729 0.0252 0.0 0.0 0.0849


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina