logo

Genes within 1Mb (chr12:101972754:ACT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0404 0.0467 0.16 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 9.45e-01 0.0056 0.0814 0.16 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.42e-01 0.00988 0.0495 0.16 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 5.08e-02 -0.139 0.0709 0.16 B L1
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0363 0.0813 0.16 B L1
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0875 0.0697 0.16 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 5.48e-01 0.0336 0.0559 0.16 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.81e-02 -0.139 0.0628 0.16 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 1.94e-02 -0.235 0.0996 0.16 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 6.98e-01 0.0375 0.0966 0.16 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 9.33e-01 0.00756 0.0901 0.16 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 1.12e-01 -0.116 0.0728 0.16 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0244 0.0989 0.16 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0675 0.0684 0.16 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 1.04e-01 -0.123 0.0754 0.16 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0686 0.074 0.16 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 3.22e-01 0.0515 0.0518 0.16 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 8.91e-01 0.0127 0.0923 0.16 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0428 0.1 0.16 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 8.77e-02 -0.112 0.0652 0.16 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 1.98e-01 -0.107 0.0825 0.16 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0381 0.0914 0.16 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 1.99e-01 0.0834 0.0647 0.16 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 1.04e-01 -0.151 0.0925 0.16 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 9.99e-01 7.67e-05 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.03e-01 0.0239 0.0958 0.164 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 3.42e-01 -0.1 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0775 0.113 0.164 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0286 0.117 0.164 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0346 0.101 0.164 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 1.36e-01 -0.124 0.0826 0.164 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 1.51e-01 -0.157 0.109 0.164 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 3.16e-01 0.0868 0.0863 0.16 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0442 0.0732 0.16 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 6.66e-01 0.0396 0.0918 0.16 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 4.29e-01 0.0811 0.102 0.16 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 1.73e-01 0.128 0.0939 0.16 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 8.49e-02 0.143 0.0824 0.16 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 9.51e-01 0.00413 0.0676 0.16 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0147 0.0931 0.161 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.10e-01 0.0208 0.0864 0.161 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0355 0.0626 0.161 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 5.53e-01 0.0599 0.101 0.161 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.88e-01 0.0643 0.0925 0.161 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 9.44e-01 0.00491 0.0698 0.161 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 6.30e-01 0.048 0.0993 0.161 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 6.51e-01 0.0528 0.116 0.161 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00229 0.0353 0.16 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 9.13e-01 0.00735 0.0672 0.16 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0591 0.0981 0.16 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 7.23e-01 0.0251 0.0708 0.16 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 4.59e-01 0.082 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0518 0.0806 0.16 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0748 0.0715 0.16 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 8.94e-01 0.0114 0.086 0.16 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0682 0.0715 0.16 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 5.78e-01 0.0464 0.0833 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 7.79e-01 -0.00636 0.0227 0.158 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 5.76e-01 0.0657 0.117 0.158 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 3.11e-01 0.0879 0.0866 0.158 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0212 0.123 0.158 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 7.83e-01 -0.033 0.119 0.158 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 3.20e-02 -0.263 0.122 0.158 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0432 0.117 0.158 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.91e-02 -0.256 0.116 0.158 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0663 0.0968 0.158 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 9.40e-01 0.00731 0.0975 0.158 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0374 0.0916 0.158 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 8.06e-01 0.0116 0.0472 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0412 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 1.90e-01 0.0826 0.0629 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 6.31e-02 -0.173 0.0925 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00124 0.104 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0119 0.117 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0232 0.0964 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00315 0.103 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 8.15e-01 0.0255 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0377 0.114 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0202 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0286 0.0428 0.159 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 6.34e-01 0.054 0.113 0.159 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0626 0.0738 0.159 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 1.90e-01 -0.133 0.101 0.159 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0239 0.111 0.159 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0733 0.11 0.159 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 3.20e-01 0.0983 0.0986 0.159 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00427 0.104 0.159 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00136 0.107 0.159 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0994 0.109 0.159 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00345 0.0994 0.159 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 7.50e-01 -0.019 0.0594 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 8.40e-01 0.0217 0.108 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.20e-01 0.0128 0.0559 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0623 0.079 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 7.08e-01 0.0352 0.0939 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0289 0.105 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 9.88e-01 0.00122 0.0794 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 1.62e-01 -0.12 0.0856 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 3.32e-03 -0.34 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 4.51e-01 0.0857 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 8.95e-01 0.0141 0.106 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 2.61e-01 0.0586 0.052 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 7.48e-01 0.0344 0.107 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 3.10e-01 0.0581 0.057 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00969 0.0886 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0193 0.103 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0727 0.113 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 2.83e-02 0.214 0.0971 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00527 0.0973 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 9.93e-01 0.000842 0.102 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 8.89e-01 0.0164 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00913 0.102 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0235 0.112 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0514 0.112 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0403 0.0978 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 8.65e-01 0.0184 0.108 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 1.30e-01 0.172 0.113 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 1.43e-01 0.16 0.109 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 1.71e-01 -0.116 0.0844 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0405 0.0978 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000742 0.0754 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 6.68e-02 -0.15 0.0815 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0912 0.0888 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 4.48e-01 0.0472 0.0621 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 2.45e-01 -0.103 0.0887 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0547 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0684 0.0793 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0804 0.0993 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0556 0.093 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 1.59e-01 0.0859 0.0608 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0668 0.106 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0157 0.102 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0317 0.0982 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 1.12e-01 0.169 0.106 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 1.68e-01 -0.138 0.0999 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0446 0.0899 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 9.02e-01 0.0119 0.0968 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.80e-01 -0.015 0.0992 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 1.51e-01 -0.114 0.079 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 4.91e-01 -0.074 0.107 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0778 0.106 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 5.81e-01 0.0501 0.0905 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 5.70e-03 -0.309 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 5.88e-01 0.0561 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0962 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0423 0.0924 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 1.96e-01 -0.127 0.0979 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 5.64e-01 0.0616 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 1.23e-01 0.108 0.0699 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.67e-01 -0.12 0.108 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0427 0.113 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0041 0.101 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 1.78e-01 0.141 0.104 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0103 0.114 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 9.27e-02 -0.188 0.111 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0844 0.1 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 4.97e-01 0.0743 0.109 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 8.99e-01 0.0137 0.108 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0276 0.102 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0736 0.11 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0387 0.118 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.79e-01 0.0798 0.112 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 3.61e-02 -0.206 0.0974 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.15e-01 0.135 0.108 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 9.08e-01 0.00441 0.0381 0.162 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 8.13e-01 0.0253 0.107 0.162 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0447 0.104 0.162 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 4.37e-01 0.0716 0.0921 0.162 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 1.19e-01 0.172 0.11 0.162 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00753 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 9.99e-01 -6.34e-05 0.0938 0.162 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0635 0.106 0.162 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 3.09e-01 -0.106 0.104 0.162 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 8.71e-01 0.015 0.0922 0.162 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 1.59e-01 0.165 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 6.46e-02 0.157 0.0842 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 3.52e-01 0.0914 0.0979 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 8.85e-02 0.195 0.114 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 2.63e-01 0.125 0.112 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 3.69e-01 0.091 0.101 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 8.93e-01 0.0143 0.107 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0434 0.112 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0832 0.102 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0235 0.1 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 7.71e-01 0.022 0.0756 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 4.11e-01 0.0863 0.105 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0954 0.101 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 8.58e-01 0.0156 0.087 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.10e-01 -0.132 0.105 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 9.23e-01 0.0115 0.119 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0665 0.106 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0742 0.109 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0909 0.0876 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 4.92e-01 -0.079 0.115 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.98e-01 0.0795 0.117 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 3.06e-01 0.111 0.109 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 6.17e-01 0.0561 0.112 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 6.19e-01 0.0548 0.11 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 6.19e-01 0.0515 0.104 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0177 0.097 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0383 0.0736 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 9.65e-01 0.00447 0.103 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 1.47e-01 0.15 0.103 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0803 0.0812 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.59e-02 0.235 0.105 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 6.63e-01 0.05 0.114 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0459 0.0908 0.133 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000473 0.122 0.133 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 1.51e-01 -0.136 0.0941 0.133 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 2.62e-01 -0.153 0.136 0.133 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 1.80e-01 0.21 0.155 0.133 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0704 0.0961 0.133 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 2.22e-01 0.136 0.11 0.133 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.83e-01 -0.121 0.112 0.133 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 3.58e-01 -0.12 0.131 0.133 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 3.55e-01 -0.111 0.12 0.133 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 7.88e-01 0.0299 0.111 0.133 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0225 0.0383 0.161 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 1.23e-01 0.119 0.077 0.161 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0762 0.102 0.161 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0295 0.0759 0.161 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0952 0.108 0.161 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0634 0.0818 0.161 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 6.06e-01 -0.046 0.089 0.161 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0495 0.0763 0.161 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 6.71e-01 0.0301 0.0707 0.161 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 7.35e-01 0.0262 0.0774 0.161 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 9.85e-01 0.00207 0.109 0.16 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0606 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 5.66e-02 -0.189 0.0986 0.16 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 4.44e-01 -0.083 0.108 0.16 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0104 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 4.82e-01 0.0639 0.0909 0.16 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0567 0.107 0.159 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 5.29e-01 0.0659 0.105 0.159 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0181 0.135 0.159 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0662 0.122 0.159 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 3.74e-01 -0.113 0.127 0.159 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0634 0.119 0.159 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0744 0.0927 0.159 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 3.33e-02 -0.224 0.105 0.159 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 5.63e-01 0.0573 0.099 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 7.07e-01 0.0281 0.0747 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 4.61e-01 0.0731 0.099 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 6.47e-01 0.0512 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.17e-01 0.0811 0.0997 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00536 0.0861 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0495 0.0733 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 4.44e-01 0.0829 0.108 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0681 0.0829 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 2.77e-01 0.11 0.101 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 6.24e-01 0.0581 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 1.22e-01 0.172 0.111 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 1.26e-02 0.255 0.101 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 6.90e-01 -0.032 0.0801 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 4.29e-01 -0.11 0.138 0.167 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 5.83e-04 -0.439 0.125 0.167 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 4.27e-01 0.0779 0.0977 0.167 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0823 0.129 0.167 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.60e-01 0.1 0.135 0.167 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 3.92e-02 -0.259 0.125 0.167 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.06e-01 0.162 0.128 0.167 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00601 0.126 0.167 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 1.41e-01 0.17 0.115 0.167 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 4.32e-01 0.0852 0.108 0.16 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 1.33e-01 -0.149 0.0985 0.16 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 1.20e-01 -0.181 0.116 0.16 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 9.64e-02 0.181 0.108 0.16 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 3.62e-01 -0.103 0.112 0.16 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00516 0.109 0.16 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 8.04e-01 0.0236 0.0952 0.16 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 3.56e-01 -0.103 0.111 0.158 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 6.52e-01 0.0465 0.103 0.158 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 7.35e-02 -0.22 0.122 0.158 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 6.63e-01 0.0471 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 2.07e-01 -0.131 0.103 0.158 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 8.81e-03 0.259 0.0979 0.158 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 4.48e-01 0.0705 0.0926 0.158 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 9.96e-01 0.000613 0.13 0.161 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 7.51e-01 -0.036 0.113 0.161 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 2.21e-01 -0.146 0.119 0.161 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0172 0.119 0.161 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00608 0.125 0.161 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 2.15e-01 0.135 0.109 0.161 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0133 0.0844 0.161 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 9.63e-01 0.00524 0.112 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00534 0.0544 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 9.84e-01 0.00224 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 4.92e-01 0.0396 0.0575 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 2.39e-02 -0.203 0.0893 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0523 0.093 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0887 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 7.32e-01 0.027 0.0786 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0994 0.0939 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0562 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0328 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0295 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -508990 sc-eQTL 6.33e-01 0.0302 0.0632 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 7.20e-01 0.0371 0.103 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 4.75e-01 0.0365 0.051 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0683 0.073 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00215 0.0895 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0501 0.102 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 2.37e-01 0.0903 0.0762 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0894 0.0799 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 233282 sc-eQTL 1.09e-02 -0.293 0.114 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 8.41e-01 0.0237 0.118 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -224831 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0229 0.107 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 2.28e-01 0.11 0.091 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 7.87e-01 -0.02 0.0738 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 3.06e-01 0.0972 0.0948 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 8.88e-01 0.0158 0.112 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 8.80e-02 0.164 0.0955 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 1.51e-01 0.12 0.0832 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0154 0.0686 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0331 0.104 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0434 0.0908 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 1.75e-01 -0.149 0.109 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 1.29e-01 -0.159 0.104 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 6.67e-02 0.167 0.0905 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 2.11e-01 0.0984 0.0784 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -147366 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0391 0.0979 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 275807 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0258 0.0956 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 141795 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0458 0.0654 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 692649 sc-eQTL 5.98e-01 0.053 0.1 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 564982 sc-eQTL 7.35e-01 0.0316 0.0932 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0067 0.0755 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 95174 sc-eQTL 8.05e-01 0.025 0.101 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -147431 sc-eQTL 5.76e-01 0.0667 0.119 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 -508990 eQTL 0.0423 0.0609 0.0299 0.0 0.0 0.129
ENSG00000111666 CHPT1 275807 eQTL 1.70e-02 0.0847 0.0354 0.0 0.0 0.129
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 eQTL 0.0114 0.0444 0.0175 0.0 0.0 0.129

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 275807 4.81e-06 7.72e-06 6.33e-07 3.85e-06 1.82e-06 1.62e-06 6.99e-06 1.01e-06 8.59e-06 3.34e-06 1.3e-05 2.83e-06 1.31e-05 3.86e-06 1.23e-06 3.73e-06 1.92e-06 3.57e-06 1.47e-06 1.63e-06 3.4e-06 6.85e-06 4.69e-06 1.55e-06 7.3e-06 1.76e-06 2.62e-06 2.87e-06 4.45e-06 5.18e-06 4.33e-06 4.15e-07 6.12e-07 2.77e-06 1.99e-06 1.16e-06 1.31e-06 3.91e-07 8.52e-07 3.63e-07 1.52e-07 7.12e-06 1.22e-06 1.8e-07 5.77e-07 1.62e-06 8.72e-07 7.05e-07 4.98e-07
ENSG00000120860 WASHC3 -89395 3.08e-05 3.01e-05 4.31e-06 1.3e-05 4.07e-06 1.13e-05 3.58e-05 3.67e-06 3.01e-05 1.2e-05 3.66e-05 1.48e-05 4.6e-05 1.42e-05 5.31e-06 1.33e-05 1.1e-05 1.71e-05 5.89e-06 5.37e-06 1.07e-05 2.53e-05 2.47e-05 5.48e-06 3.21e-05 5.6e-06 1.02e-05 9.99e-06 2.43e-05 1.91e-05 1.53e-05 1.1e-06 1.81e-06 5.41e-06 9.92e-06 4.22e-06 2.04e-06 2.51e-06 3.21e-06 2.18e-06 1.14e-06 3.49e-05 3.47e-06 1.59e-07 2.04e-06 2.97e-06 2.74e-06 1.47e-06 1.12e-06