Genes within 1Mb (chr12:101950870:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00157 0.0482 0.145 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 3.82e-01 0.0733 0.0836 0.145 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00696 0.0509 0.145 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 1.53e-02 0.178 0.0727 0.145 B L1
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 7.25e-01 0.0295 0.0838 0.145 B L1
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0773 0.0718 0.145 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00448 0.0577 0.145 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 1.21e-01 0.101 0.065 0.145 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 5.64e-01 -0.06 0.104 0.145 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 3.94e-01 0.0848 0.0993 0.145 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 3.45e-01 0.0877 0.0926 0.145 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 7.11e-01 0.0281 0.0757 0.145 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.62e-02 -0.244 0.101 0.145 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 5.66e-01 0.0407 0.0708 0.145 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 2.36e-01 0.0927 0.0781 0.145 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 6.61e-01 0.0336 0.0766 0.145 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 8.70e-01 0.0088 0.0536 0.145 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 2.67e-01 0.106 0.0948 0.145 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.93e-02 -0.24 0.102 0.145 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 7.94e-01 0.0176 0.0676 0.145 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 2.18e-01 0.105 0.0851 0.145 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 6.83e-02 -0.171 0.0934 0.145 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0534 0.0668 0.145 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 3.25e-01 0.0944 0.0956 0.145 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.29e-01 0.0095 0.107 0.14 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 8.97e-01 0.0126 0.0974 0.14 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 9.72e-02 0.177 0.106 0.14 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 6.24e-01 0.0564 0.115 0.14 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00898 0.119 0.14 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 3.19e-01 0.102 0.102 0.14 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 8.87e-01 0.012 0.0844 0.14 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0229 0.111 0.14 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 3.26e-01 0.087 0.0883 0.145 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0303 0.0749 0.145 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0421 0.0939 0.145 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 3.75e-01 0.093 0.105 0.145 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0193 0.0964 0.145 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 5.41e-01 0.0519 0.0848 0.145 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 5.58e-02 0.132 0.0686 0.145 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0151 0.0965 0.144 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.09e-03 -0.289 0.0874 0.144 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 2.72e-01 0.0713 0.0648 0.144 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 1.79e-01 -0.14 0.104 0.144 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 6.18e-01 0.048 0.096 0.144 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 7.38e-01 0.0243 0.0724 0.144 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 9.00e-01 -0.013 0.103 0.144 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0917 0.121 0.144 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00336 0.0368 0.145 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.63e-01 0.00326 0.0701 0.145 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 2.10e-01 -0.128 0.102 0.145 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00933 0.0739 0.145 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 1.17e-04 -0.437 0.111 0.145 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 6.77e-01 0.035 0.0841 0.145 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 1.17e-02 0.187 0.0736 0.145 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0788 0.0895 0.145 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 5.71e-01 0.0423 0.0746 0.145 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0898 0.0866 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 7.43e-01 -0.00766 0.0234 0.145 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.12e-01 0.0134 0.121 0.145 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 2.79e-01 0.0969 0.0892 0.145 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 8.90e-01 0.0176 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 3.23e-01 0.122 0.123 0.145 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 9.60e-02 -0.211 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 6.90e-01 0.0483 0.121 0.145 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0424 0.122 0.145 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0906 0.0996 0.145 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 2.65e-02 -0.222 0.0991 0.145 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 2.82e-01 -0.102 0.0941 0.145 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 8.83e-01 0.00711 0.0484 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.92e-02 0.198 0.12 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 2.41e-02 0.145 0.0639 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 4.50e-02 0.191 0.0947 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0189 0.106 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 7.60e-01 0.0365 0.12 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 2.67e-01 0.11 0.0985 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 5.51e-01 0.0632 0.106 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 2.58e-01 -0.126 0.111 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 6.79e-01 0.0484 0.117 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0219 0.112 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 4.80e-01 0.0313 0.0442 0.142 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 7.15e-01 0.0427 0.117 0.142 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 5.50e-01 0.0456 0.0763 0.142 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 9.69e-01 0.00404 0.105 0.142 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 8.85e-02 0.195 0.114 0.142 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0985 0.114 0.142 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0597 0.102 0.142 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 3.95e-01 0.0911 0.107 0.142 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0123 0.11 0.142 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 7.51e-01 0.0358 0.113 0.142 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 4.06e-01 0.0853 0.102 0.142 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0566 0.0615 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.62e-01 0.0053 0.111 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 8.58e-01 0.0104 0.0579 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 3.62e-01 0.0747 0.0818 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 8.46e-01 0.0189 0.0973 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 9.27e-01 0.00996 0.109 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 4.08e-01 -0.068 0.0821 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 4.33e-01 0.0699 0.0889 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 7.17e-01 0.0438 0.121 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00988 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0297 0.11 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 5.72e-01 0.0307 0.0542 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0753 0.111 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 8.29e-02 -0.103 0.0591 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 8.21e-02 0.16 0.0916 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 8.08e-01 -0.026 0.107 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0919 0.117 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 3.13e-01 -0.103 0.102 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 7.89e-01 0.0271 0.101 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0467 0.107 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 6.40e-01 0.0575 0.123 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 7.14e-01 0.0388 0.106 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 6.36e-01 0.0547 0.115 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 9.30e-02 -0.194 0.115 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 3.46e-02 0.213 0.0999 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 2.55e-01 -0.126 0.111 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 5.24e-01 -0.075 0.118 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 3.95e-01 0.096 0.113 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 5.63e-01 0.0509 0.0878 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 2.00e-02 -0.234 0.1 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 8.00e-01 0.0198 0.0781 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 2.47e-01 0.0984 0.0848 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 3.04e-01 0.0947 0.092 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0174 0.0644 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 1.00e-01 0.15 0.0909 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 4.19e-02 -0.214 0.104 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0307 0.0817 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 1.88e-01 0.134 0.102 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0165 0.0956 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 6.46e-01 0.0289 0.0627 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0631 0.108 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 5.44e-02 -0.2 0.103 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0044 0.1 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 3.92e-01 -0.093 0.108 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 4.58e-01 0.0762 0.102 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 6.44e-01 0.0425 0.0918 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 5.60e-01 0.059 0.101 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 4.22e-02 -0.21 0.103 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 8.52e-02 0.143 0.0824 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 7.09e-02 0.202 0.111 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 1.45e-01 -0.162 0.11 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 2.76e-01 -0.103 0.0945 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 3.97e-01 0.0997 0.118 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 3.34e-01 -0.101 0.105 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.37e-01 -0.155 0.104 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0642 0.0935 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 4.33e-01 0.078 0.0993 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 1.66e-01 -0.15 0.108 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 3.05e-01 0.073 0.071 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 6.88e-01 0.0441 0.11 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 8.87e-01 0.0163 0.114 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.10e-01 -0.163 0.102 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 5.97e-01 -0.056 0.106 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00475 0.115 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 9.01e-01 0.0141 0.113 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0799 0.101 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 1.98e-01 0.143 0.11 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 4.43e-01 0.0847 0.11 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.00e-01 -0.171 0.104 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0489 0.112 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 1.87e-01 -0.158 0.119 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00833 0.115 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 1.48e-01 -0.145 0.0996 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 4.35e-01 0.0862 0.11 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00379 0.0395 0.145 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 8.95e-01 0.0146 0.111 0.145 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0459 0.108 0.145 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 6.48e-01 0.0437 0.0957 0.145 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 7.55e-04 -0.382 0.112 0.145 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 8.53e-01 0.0217 0.117 0.145 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 5.41e-02 0.187 0.0965 0.145 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0178 0.11 0.145 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 2.47e-01 0.125 0.108 0.145 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0562 0.0957 0.145 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0459 0.122 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 4.37e-02 -0.178 0.0875 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 1.60e-01 -0.143 0.102 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0564 0.119 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 5.96e-01 0.0619 0.117 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 5.56e-01 0.0621 0.105 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0992 0.111 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 7.36e-01 0.0395 0.117 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 6.87e-01 0.0432 0.107 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 7.87e-04 -0.347 0.102 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 4.97e-01 0.0537 0.0789 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 1.33e-01 -0.164 0.109 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 9.60e-01 0.00539 0.106 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 8.91e-01 0.0124 0.0909 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 6.61e-01 0.0485 0.11 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 3.62e-01 -0.113 0.124 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 5.36e-01 0.0684 0.11 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.113 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 1.93e-01 0.118 0.0906 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0383 0.119 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 4.05e-01 -0.101 0.121 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 6.04e-01 0.0585 0.113 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 1.09e-01 0.185 0.115 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 5.38e-01 0.0703 0.114 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 1.52e-01 -0.153 0.107 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.50e-02 -0.242 0.0989 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 5.99e-01 0.0401 0.0761 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0449 0.106 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 1.51e-01 0.153 0.106 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0897 0.0839 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 1.14e-01 -0.173 0.109 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 8.99e-02 -0.2 0.118 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 6.56e-01 0.0407 0.0909 0.156 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0357 0.123 0.156 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 2.50e-01 0.109 0.0945 0.156 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 6.17e-01 0.0684 0.136 0.156 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 8.02e-01 0.0395 0.157 0.156 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 7.39e-01 0.0322 0.0964 0.156 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 5.91e-01 0.0599 0.111 0.156 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 4.65e-01 0.0826 0.113 0.156 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 9.74e-01 0.00421 0.131 0.156 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 9.54e-01 0.00693 0.12 0.156 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 5.23e-02 0.215 0.109 0.156 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 8.25e-02 0.0679 0.0389 0.143 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00702 0.0791 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0838 0.105 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00969 0.0775 0.143 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0327 0.111 0.143 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 3.67e-01 0.0755 0.0836 0.143 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 9.35e-01 0.00742 0.091 0.143 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 3.67e-01 0.0705 0.0779 0.143 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 9.17e-01 0.00755 0.0723 0.143 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0447 0.079 0.143 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 7.23e-02 -0.2 0.111 0.145 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.87e-01 -0.153 0.115 0.145 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 8.43e-01 0.02 0.101 0.145 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 9.51e-02 0.184 0.11 0.145 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 4.82e-01 0.0802 0.114 0.145 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0286 0.0926 0.145 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 6.26e-01 0.0513 0.105 0.137 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 8.61e-01 0.018 0.102 0.137 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 1.05e-01 0.214 0.131 0.137 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00135 0.12 0.137 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0346 0.124 0.137 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 6.06e-01 0.0603 0.117 0.137 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 9.83e-01 0.00196 0.0909 0.137 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 3.86e-01 0.0899 0.103 0.137 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.34e-01 0.0084 0.101 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0689 0.0759 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0936 0.101 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 2.04e-01 0.144 0.113 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 6.05e-01 0.0526 0.102 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 3.70e-01 0.0786 0.0875 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 2.27e-01 0.0903 0.0744 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 7.76e-02 0.194 0.109 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0207 0.0845 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 7.71e-01 0.03 0.103 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00249 0.12 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0392 0.113 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 8.48e-01 0.0201 0.105 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 4.85e-02 0.16 0.0808 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 6.88e-01 0.0559 0.139 0.142 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0014 0.13 0.142 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0106 0.0982 0.142 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 1.35e-02 -0.318 0.127 0.142 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 1.87e-01 -0.179 0.135 0.142 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0551 0.127 0.142 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 4.05e-02 -0.263 0.127 0.142 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 4.49e-02 0.253 0.125 0.142 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 7.84e-01 0.0318 0.116 0.142 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 2.21e-01 -0.134 0.109 0.142 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0989 0.1 0.142 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 9.06e-01 -0.014 0.118 0.142 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 2.76e-01 -0.12 0.11 0.142 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 7.02e-01 0.0438 0.114 0.142 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 1.96e-01 0.143 0.11 0.142 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 6.17e-01 0.0482 0.0964 0.142 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 7.95e-01 0.0287 0.11 0.145 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 6.50e-01 0.0462 0.102 0.145 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 4.10e-01 -0.101 0.122 0.145 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 1.11e-01 0.17 0.106 0.145 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 8.93e-01 0.0139 0.103 0.145 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 8.51e-01 0.0186 0.0986 0.145 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 5.07e-02 0.179 0.091 0.145 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 1.68e-01 -0.185 0.134 0.136 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0876 0.117 0.136 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 9.53e-01 0.00736 0.124 0.136 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0878 0.123 0.136 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 1.69e-01 0.178 0.129 0.136 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 4.77e-01 0.0807 0.113 0.136 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0309 0.0876 0.136 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0611 0.116 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 9.21e-01 0.00553 0.0557 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 7.19e-02 0.201 0.111 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.09e-01 0.0943 0.0585 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 2.49e-01 0.107 0.0923 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 3.13e-01 0.0961 0.0951 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0608 0.108 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 6.30e-01 0.0389 0.0805 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 3.14e-01 0.097 0.0962 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0435 0.111 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 5.55e-01 0.0687 0.116 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0077 0.115 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -530874 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0442 0.0651 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00922 0.107 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0188 0.0527 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 3.39e-02 0.159 0.0746 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 8.54e-01 0.0171 0.0923 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 9.47e-01 0.00706 0.105 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0721 0.0787 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 5.26e-01 0.0525 0.0826 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 211398 sc-eQTL 9.73e-01 0.00411 0.119 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0214 0.122 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -246715 sc-eQTL 8.06e-01 0.0272 0.111 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 1.46e-01 0.135 0.0925 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0438 0.0751 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0254 0.0968 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 3.06e-01 0.117 0.114 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 8.61e-01 0.0171 0.0979 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 9.13e-01 0.00934 0.0852 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 4.15e-02 0.142 0.0692 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0443 0.107 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000387 0.0937 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 3.69e-01 -0.102 0.113 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 7.64e-01 0.0328 0.109 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 8.62e-01 0.0189 0.108 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 5.26e-01 0.0598 0.094 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 1.50e-01 0.117 0.0808 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -169250 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00727 0.102 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 253923 sc-eQTL 1.01e-03 -0.323 0.0969 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 119911 sc-eQTL 2.04e-01 0.0865 0.0679 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 670765 sc-eQTL 1.01e-01 -0.171 0.104 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543098 sc-eQTL 5.11e-01 0.0638 0.0969 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -111279 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00966 0.0785 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73290 sc-eQTL 9.68e-01 0.00428 0.105 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -169315 sc-eQTL 3.12e-01 -0.125 0.124 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 -530874 eQTL 0.0396 0.0579 0.0281 0.0 0.0 0.161
ENSG00000111666 CHPT1 253923 eQTL 7.60e-03 -0.0888 0.0332 0.0 0.0 0.161
ENSG00000136048 DRAM1 73290 eQTL 0.0165 0.0448 0.0187 0.0 0.0 0.161
ENSG00000185480 PARPBP -169315 eQTL 0.025 0.0675 0.0301 0.0 0.0 0.161


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N 26151 1.41e-05 1.71e-05 1.92e-06 8.36e-06 2.38e-06 6.28e-06 2.04e-05 2.08e-06 1.41e-05 6.14e-06 1.74e-05 6.75e-06 2.71e-05 5.92e-06 3.66e-06 6.79e-06 8.25e-06 1.03e-05 3.58e-06 3.12e-06 6.52e-06 1.22e-05 1.27e-05 3.54e-06 2.42e-05 4.3e-06 6.34e-06 5.04e-06 1.53e-05 1.35e-05 9.4e-06 1.06e-06 1.18e-06 3.33e-06 5.76e-06 2.77e-06 1.83e-06 1.93e-06 2.08e-06 1.18e-06 1.01e-06 1.77e-05 1.61e-06 1.88e-07 8.47e-07 1.74e-06 1.47e-06 7.32e-07 4.57e-07