logo

Genes within 1Mb (chr12:101947706:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 5.42e-02 -0.0821 0.0424 0.229 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.58e-01 0.0436 0.0744 0.229 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.57e-01 -0.064 0.045 0.229 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 7.75e-03 -0.173 0.0644 0.229 B L1
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.87e-01 -0.03 0.0744 0.229 B L1
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 5.55e-01 0.0378 0.0639 0.229 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 1.74e-01 0.0696 0.051 0.229 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 1.83e-02 -0.136 0.0573 0.229 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 3.59e-02 -0.193 0.0913 0.229 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 9.00e-01 0.0111 0.0884 0.229 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0479 0.0824 0.229 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0386 0.0664 0.229 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.02e-01 -0.146 0.0891 0.229 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0213 0.0622 0.229 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.04e-01 -0.112 0.0683 0.229 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0808 0.067 0.229 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 7.06e-02 0.0849 0.0467 0.229 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0141 0.083 0.229 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.16e-01 -0.141 0.0894 0.229 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 9.65e-01 0.00257 0.059 0.229 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 8.73e-01 0.0119 0.0745 0.229 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 6.19e-01 0.041 0.0822 0.229 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.35e-01 0.0694 0.0582 0.229 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 9.01e-01 0.0104 0.0837 0.229 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.92e-01 0.0498 0.0928 0.232 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0739 0.0847 0.232 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 6.84e-01 -0.038 0.0934 0.232 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 3.59e-01 0.0917 0.0999 0.232 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0293 0.104 0.232 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 5.08e-01 -0.059 0.0891 0.232 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0315 0.0736 0.232 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 4.94e-02 -0.19 0.0961 0.232 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 4.00e-01 0.0652 0.0774 0.229 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 5.42e-01 -0.04 0.0655 0.229 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 4.34e-01 0.0644 0.0821 0.229 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.06e-01 0.0474 0.0917 0.229 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 1.52e-01 0.121 0.084 0.229 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 1.77e-01 0.1 0.074 0.229 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 5.59e-01 0.0354 0.0605 0.229 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 3.07e-02 0.182 0.0837 0.23 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0855 0.0784 0.23 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 7.34e-01 0.0194 0.057 0.23 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.44e-01 0.0424 0.0916 0.23 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 9.23e-02 0.142 0.0837 0.23 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 1.00e-01 0.104 0.0631 0.23 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 3.01e-01 0.0934 0.0901 0.23 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 4.89e-01 0.0735 0.106 0.23 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0285 0.0324 0.229 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.97e-01 0.0327 0.0618 0.229 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0926 0.0901 0.229 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 4.22e-01 0.0524 0.065 0.229 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.88e-01 0.134 0.101 0.229 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0117 0.0742 0.229 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0721 0.0657 0.229 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 1.86e-01 0.104 0.0787 0.229 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0973 0.0655 0.229 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 1.91e-01 0.1 0.0763 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 6.92e-01 -0.00812 0.0204 0.232 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 8.89e-01 0.0148 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0679 0.0782 0.232 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00307 0.111 0.232 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.83e-01 -0.143 0.107 0.232 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 1.06e-01 -0.18 0.11 0.232 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.05e-01 0.134 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 8.86e-04 -0.349 0.103 0.232 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 2.37e-01 -0.103 0.0871 0.232 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 6.53e-01 0.0397 0.088 0.232 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00758 0.0827 0.232 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0247 0.0427 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0718 0.106 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 7.65e-01 0.0171 0.0572 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 5.42e-02 -0.162 0.0838 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.47e-01 -0.043 0.0939 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 4.82e-01 0.0743 0.106 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0302 0.0873 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00967 0.0937 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0501 0.0985 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 9.86e-01 0.00177 0.103 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 1.61e-01 -0.139 0.0987 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0492 0.0381 0.228 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 3.84e-01 0.0879 0.101 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 2.75e-01 -0.072 0.0657 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0923 0.09 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 8.32e-01 0.0211 0.0991 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0593 0.0984 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 8.06e-02 0.154 0.0875 0.228 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0494 0.0923 0.228 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 8.29e-01 0.0206 0.0951 0.228 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 7.34e-01 0.0331 0.0973 0.228 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 2.26e-01 -0.107 0.0883 0.228 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 4.13e-01 0.0443 0.0541 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 4.84e-01 0.0686 0.0979 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0371 0.0509 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0725 0.0719 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0438 0.0855 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 5.56e-01 0.0563 0.0954 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 4.43e-02 0.145 0.0716 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0606 0.0782 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 9.88e-03 -0.273 0.105 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 7.45e-01 0.0337 0.104 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 7.21e-01 0.0346 0.097 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 2.17e-01 0.0581 0.047 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 9.84e-01 0.00195 0.0967 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0267 0.0517 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 1.19e-01 -0.125 0.0798 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.79e-01 -0.125 0.0926 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 9.66e-01 0.00438 0.102 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 8.15e-01 0.0208 0.0889 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0858 0.0879 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0304 0.0927 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 2.49e-01 0.123 0.107 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0334 0.0921 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0611 0.101 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 7.18e-02 -0.182 0.1 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 1.19e-01 -0.138 0.0879 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 8.38e-01 0.0199 0.0972 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00887 0.103 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 5.63e-01 0.0572 0.0988 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0236 0.0762 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 9.00e-02 -0.149 0.0873 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 6.22e-01 0.0335 0.0677 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.46e-01 -0.107 0.0734 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0901 0.0797 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 3.97e-02 0.114 0.0553 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 1.91e-01 -0.105 0.0804 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 8.18e-02 -0.162 0.0925 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 9.22e-01 0.00708 0.0721 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 4.65e-02 -0.179 0.0894 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0801 0.0842 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 1.36e-01 0.0824 0.0551 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.58e-01 0.0567 0.0967 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0536 0.0931 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 4.89e-01 0.0621 0.0896 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 7.13e-01 0.0358 0.097 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 3.83e-01 -0.08 0.0915 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 6.25e-01 0.0402 0.0821 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.30e-01 0.0555 0.0882 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.92e-02 -0.211 0.0894 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0749 0.0722 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.33e-01 -0.147 0.0974 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 8.84e-01 0.0142 0.0968 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0504 0.0826 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 3.17e-01 -0.103 0.103 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0426 0.0931 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 8.06e-02 -0.161 0.0919 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.04e-01 0.0854 0.0829 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 7.52e-01 0.028 0.0884 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 1.39e-01 0.142 0.0955 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 1.58e-01 0.0891 0.0629 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 6.30e-01 0.047 0.0975 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 2.49e-01 0.116 0.1 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 9.55e-01 0.00513 0.09 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 6.56e-02 0.171 0.0923 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 2.79e-01 0.11 0.101 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 1.12e-01 -0.158 0.0991 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 8.13e-01 0.0211 0.0893 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 7.22e-01 0.0347 0.0974 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00361 0.0988 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0895 0.0932 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.75e-01 0.0888 0.0998 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 9.56e-01 0.00588 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00773 0.103 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.73e-02 -0.197 0.0886 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 1.64e-01 0.137 0.0984 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0191 0.0349 0.232 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 2.28e-01 0.118 0.0975 0.232 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.23e-01 -0.147 0.0948 0.232 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.83e-01 0.0738 0.0844 0.232 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.53e-01 0.145 0.101 0.232 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 3.44e-01 0.0978 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0188 0.0859 0.232 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0115 0.0975 0.232 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0275 0.0955 0.232 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 9.43e-01 0.00604 0.0846 0.232 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 8.34e-03 0.281 0.105 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.03e-01 0.126 0.0771 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 1.50e-02 0.217 0.0883 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.48e-01 0.0479 0.105 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 4.05e-01 0.0852 0.102 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 6.71e-02 0.169 0.0917 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 8.81e-01 0.0145 0.0973 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 4.48e-01 -0.078 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0512 0.093 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 4.17e-02 -0.184 0.09 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 1.66e-01 0.095 0.0684 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00833 0.0955 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 4.99e-01 0.0624 0.0922 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 1.90e-01 0.104 0.0788 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0178 0.096 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0441 0.108 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 4.08e-01 0.0801 0.0967 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0929 0.0992 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0633 0.0798 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0445 0.104 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 9.75e-01 0.00334 0.107 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 4.48e-01 0.0753 0.099 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 7.55e-01 0.0319 0.102 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 6.74e-01 0.0422 0.1 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 8.94e-02 0.16 0.0937 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0855 0.0881 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0315 0.067 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 9.48e-02 0.156 0.0929 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 5.50e-01 0.0563 0.094 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 3.91e-01 0.0636 0.074 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 1.02e-02 0.246 0.095 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 4.09e-01 0.0861 0.104 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 5.13e-01 -0.05 0.0761 0.226 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 7.29e-01 0.0356 0.103 0.226 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0943 0.0791 0.226 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0854 0.114 0.226 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.38e-01 0.194 0.13 0.226 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 9.73e-01 0.00273 0.0808 0.226 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 1.07e-01 0.15 0.0922 0.226 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0361 0.0946 0.226 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 6.89e-01 -0.044 0.11 0.226 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 2.12e-01 -0.126 0.1 0.226 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0494 0.0931 0.226 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 3.58e-01 -0.032 0.0347 0.23 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 4.10e-01 0.0578 0.0701 0.23 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.51e-01 -0.133 0.0926 0.23 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 8.95e-01 0.00906 0.0688 0.23 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.32e-01 -0.148 0.0977 0.23 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 5.93e-01 0.0397 0.0743 0.23 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0537 0.0807 0.23 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00589 0.0693 0.23 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0578 0.0641 0.23 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 3.52e-01 0.0653 0.0701 0.23 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00223 0.0992 0.229 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 4.87e-02 -0.203 0.102 0.229 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0572 0.09 0.229 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0835 0.098 0.229 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 8.66e-01 0.0172 0.102 0.229 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 5.16e-01 0.0536 0.0824 0.229 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 9.00e-01 0.0116 0.0919 0.232 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0681 0.0895 0.232 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0735 0.116 0.232 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.13e-01 0.166 0.104 0.232 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 3.29e-01 -0.106 0.108 0.232 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0916 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0342 0.0795 0.232 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 9.16e-02 -0.153 0.09 0.232 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 7.28e-01 0.0307 0.0881 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 9.58e-01 0.00353 0.0665 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 4.78e-01 0.0626 0.0881 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 3.04e-01 0.102 0.099 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 6.99e-01 0.0344 0.0888 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 6.31e-01 0.0368 0.0766 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 4.80e-01 0.0462 0.0652 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 6.68e-02 0.175 0.095 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0142 0.0734 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.31e-01 0.0868 0.0891 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0184 0.105 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 7.88e-02 0.172 0.0976 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.59e-01 0.103 0.0906 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 7.72e-01 0.0206 0.0708 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 9.12e-01 0.0138 0.124 0.227 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 2.65e-01 -0.13 0.116 0.227 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 5.06e-02 0.171 0.0866 0.227 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.03e-01 0.0605 0.116 0.227 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 1.77e-01 -0.164 0.121 0.227 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 5.43e-02 -0.217 0.112 0.227 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 8.67e-02 0.197 0.114 0.227 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 2.31e-01 -0.135 0.113 0.227 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 6.63e-03 0.278 0.101 0.227 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 7.00e-01 0.0372 0.0964 0.227 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.36e-01 -0.131 0.0877 0.227 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0322 0.104 0.227 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00729 0.0969 0.227 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 1.51e-01 -0.144 0.0998 0.227 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 9.94e-01 0.000738 0.097 0.227 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0519 0.0847 0.227 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 1.80e-01 -0.134 0.0993 0.224 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 2.24e-01 -0.112 0.0918 0.224 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0866 0.11 0.224 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 6.89e-01 0.0387 0.0964 0.224 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 5.49e-01 0.0556 0.0927 0.224 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.63e-02 0.197 0.0881 0.224 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 8.41e-01 0.0167 0.083 0.224 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 1.50e-01 0.165 0.114 0.232 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0324 0.1 0.232 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.80e-01 0.0931 0.106 0.232 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 1.10e-01 0.168 0.105 0.232 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 7.97e-01 0.0286 0.111 0.232 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 5.21e-01 0.0621 0.0967 0.232 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 4.15e-01 0.0611 0.0747 0.232 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 1.40e-01 -0.146 0.0987 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 2.06e-01 -0.062 0.0489 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0128 0.0987 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0247 0.0519 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 1.06e-01 -0.132 0.0811 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 9.71e-01 0.00302 0.084 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00451 0.095 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 4.26e-01 0.0565 0.0709 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 1.88e-01 -0.112 0.0846 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 2.58e-01 -0.111 0.0976 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 6.89e-01 0.0411 0.102 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 7.10e-02 -0.183 0.101 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -534038 sc-eQTL 2.88e-01 0.061 0.0572 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 2.79e-01 0.102 0.0936 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0284 0.0463 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 5.61e-02 -0.126 0.0658 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0915 0.081 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 7.64e-01 0.0279 0.0926 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 6.31e-02 0.129 0.0688 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 1.06e-01 -0.117 0.0723 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 208234 sc-eQTL 4.54e-02 -0.209 0.104 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 6.16e-01 0.0537 0.107 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -249879 sc-eQTL 7.43e-01 -0.032 0.0973 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 1.41e-01 0.12 0.0812 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00557 0.066 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 3.89e-01 0.0732 0.0848 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 7.68e-01 0.0297 0.1 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 2.75e-01 0.0938 0.0856 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.01e-01 0.0955 0.0744 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 3.43e-01 0.0581 0.0612 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 3.83e-01 -0.083 0.095 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 1.03e-01 -0.135 0.0826 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0178 0.101 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0186 0.0968 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0266 0.0961 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.19e-01 0.103 0.0832 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 5.99e-01 0.0379 0.072 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -172414 sc-eQTL 1.83e-01 0.119 0.0888 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 250759 sc-eQTL 7.41e-02 -0.155 0.0863 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 116747 sc-eQTL 9.42e-01 0.00433 0.0596 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 667601 sc-eQTL 3.70e-01 0.082 0.0912 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 539934 sc-eQTL 1.50e-01 0.122 0.0844 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 sc-eQTL 2.11e-01 0.0858 0.0684 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 70126 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.0919 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -172479 sc-eQTL 4.39e-01 0.0839 0.108 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120805 ARL1 539934 eQTL 0.0273 0.0387 0.0175 0.00102 0.0 0.222
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 eQTL 0.00013 0.0549 0.0143 0.0 0.0 0.222

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 \N 250759 1.87e-06 2.05e-06 2.72e-07 1.33e-06 4.43e-07 7.17e-07 1.31e-06 4.44e-07 1.8e-06 7.58e-07 1.87e-06 1.46e-06 2.88e-06 6.9e-07 4.4e-07 1.15e-06 9.46e-07 1.34e-06 5.76e-07 8.94e-07 6.36e-07 1.94e-06 1.68e-06 9.74e-07 2.51e-06 1.06e-06 1.14e-06 1.04e-06 1.75e-06 1.66e-06 7.64e-07 2.37e-07 4.55e-07 8.95e-07 8.57e-07 7.45e-07 7.3e-07 3.86e-07 7.04e-07 2.32e-07 2.74e-07 2.51e-06 3.78e-07 1.33e-07 3.5e-07 3.24e-07 4.3e-07 2.2e-07 2.3e-07
ENSG00000120860 WASHC3 -114443 4.89e-06 5.52e-06 6.54e-07 3.48e-06 1.49e-06 1.55e-06 6.83e-06 1.2e-06 4.83e-06 2.76e-06 6.72e-06 2.9e-06 8.92e-06 1.65e-06 1.04e-06 4e-06 2.72e-06 3.95e-06 1.5e-06 1.72e-06 2.84e-06 5.39e-06 4.85e-06 1.88e-06 8.25e-06 2.08e-06 2.33e-06 1.71e-06 5.21e-06 6.2e-06 2.64e-06 4.59e-07 7.88e-07 2.26e-06 2.07e-06 1.35e-06 1.03e-06 5.61e-07 1.09e-06 5.49e-07 7.51e-07 7.2e-06 6.62e-07 1.46e-07 7.54e-07 1.17e-06 1.12e-06 7.43e-07 5.99e-07