logo

Genes within 1Mb (chr12:101942442:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 7.19e-01 -0.018 0.05 0.184 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 4.62e-01 0.0641 0.0869 0.184 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 8.12e-03 -0.139 0.052 0.184 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 8.66e-01 0.0129 0.0765 0.184 B L1
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 7.41e-01 0.0288 0.087 0.184 B L1
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00257 0.0748 0.184 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0875 0.0595 0.184 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 2.87e-01 0.0723 0.0677 0.184 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 6.71e-01 0.0458 0.108 0.184 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 5.43e-01 0.0628 0.103 0.184 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0489 0.0963 0.184 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 5.99e-01 0.0426 0.0808 0.184 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 7.02e-06 -0.48 0.104 0.184 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 1.03e-01 0.123 0.0752 0.184 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.99e-01 0.107 0.0834 0.184 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 9.17e-01 0.0085 0.0819 0.184 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 1.38e-02 -0.14 0.0565 0.184 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0621 0.1 0.184 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.70e-05 -0.458 0.104 0.184 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 5.98e-03 0.195 0.0701 0.184 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.21e-01 0.139 0.0895 0.184 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0218 0.0993 0.184 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.62e-01 -0.052 0.0705 0.184 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 5.43e-01 0.0616 0.101 0.184 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 8.54e-01 0.0206 0.112 0.189 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 2.00e-02 -0.237 0.101 0.189 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 8.63e-02 0.192 0.112 0.189 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.01e-01 -0.125 0.12 0.189 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 4.23e-02 0.252 0.123 0.189 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 3.15e-02 -0.23 0.106 0.189 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0883 0.189 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 7.10e-01 0.0435 0.117 0.189 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 1.76e-01 0.127 0.0939 0.184 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 6.87e-05 -0.312 0.0769 0.184 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0112 0.1 0.184 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.85e-01 0.0971 0.111 0.184 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 1.93e-02 0.239 0.101 0.184 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 2.27e-04 -0.328 0.0875 0.184 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 6.43e-01 0.0342 0.0736 0.184 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 1.52e-02 0.243 0.0993 0.182 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 4.37e-04 -0.324 0.0907 0.182 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0429 0.0677 0.182 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0249 0.109 0.182 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 9.79e-01 0.00261 0.1 0.182 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0522 0.0754 0.182 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0135 0.107 0.182 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 9.37e-01 0.00997 0.126 0.182 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0204 0.0386 0.184 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 2.92e-01 0.0775 0.0734 0.184 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 2.16e-04 -0.392 0.104 0.184 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 3.30e-01 0.0755 0.0774 0.184 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.41e-01 0.178 0.12 0.184 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0955 0.088 0.184 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0208 0.0784 0.184 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0308 0.0941 0.184 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0943 0.0781 0.184 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 7.23e-02 -0.163 0.0905 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 6.80e-01 0.00999 0.0241 0.191 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 3.20e-01 -0.125 0.125 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 6.83e-02 -0.168 0.0917 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00338 0.132 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0113 0.127 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 7.25e-01 0.0463 0.131 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.83e-01 0.088 0.125 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0126 0.126 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 1.80e-01 -0.138 0.103 0.191 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 1.68e-01 -0.143 0.103 0.191 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 8.21e-03 -0.256 0.0957 0.191 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 7.22e-01 -0.018 0.0504 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 1.53e-01 -0.179 0.125 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0552 0.0673 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0489 0.0996 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 6.75e-01 0.0464 0.111 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 3.89e-01 -0.107 0.124 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 1.53e-02 -0.248 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 4.20e-01 0.0892 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 2.58e-01 -0.131 0.116 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 3.52e-01 0.113 0.122 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 5.44e-02 -0.224 0.116 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 6.40e-01 0.0219 0.0466 0.185 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0267 0.123 0.185 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 2.14e-01 -0.1 0.0802 0.185 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 8.46e-01 0.0214 0.11 0.185 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.31e-01 0.182 0.12 0.185 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 3.22e-01 -0.119 0.12 0.185 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000424 0.108 0.185 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00446 0.113 0.185 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 1.37e-01 0.172 0.116 0.185 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 1.51e-01 0.171 0.118 0.185 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 4.13e-01 0.0885 0.108 0.185 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00163 0.0636 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 2.26e-01 0.139 0.115 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 2.12e-02 -0.137 0.0591 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 3.87e-01 0.0733 0.0845 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0887 0.1 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0482 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 9.75e-01 0.0027 0.0849 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 2.37e-01 0.109 0.0917 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 4.39e-01 0.0968 0.125 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0527 0.122 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 2.60e-01 -0.128 0.114 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 9.18e-01 0.00576 0.0558 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 8.46e-01 0.0222 0.114 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 8.03e-02 -0.107 0.0607 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 3.14e-01 0.0955 0.0946 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 7.26e-01 0.0386 0.11 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 1.07e-03 0.39 0.118 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 5.43e-01 -0.064 0.105 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0265 0.104 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 2.04e-01 -0.139 0.109 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 8.02e-02 0.221 0.125 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0541 0.109 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 8.97e-02 0.21 0.123 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.97e-02 -0.288 0.123 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0231 0.109 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 4.70e-01 0.0865 0.119 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 3.45e-01 -0.12 0.126 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 9.27e-01 0.0111 0.121 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 9.92e-01 0.000923 0.0934 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.46e-05 -0.457 0.103 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 6.37e-03 0.225 0.0816 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.61e-01 0.0826 0.0903 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00928 0.098 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.95e-02 -0.134 0.0678 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 6.93e-01 0.0383 0.0971 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 2.75e-05 -0.461 0.107 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 7.73e-01 -0.025 0.0867 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0458 0.108 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 6.43e-01 0.0471 0.101 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0734 0.0664 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 7.38e-01 0.0382 0.114 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 3.24e-05 -0.448 0.106 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 2.80e-01 0.114 0.106 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 5.62e-01 0.0664 0.114 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 6.47e-02 0.199 0.107 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 2.11e-01 -0.121 0.0966 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0936 0.105 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 7.74e-06 -0.474 0.103 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0269 0.0866 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0114 0.117 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 4.17e-01 0.0941 0.116 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 3.06e-01 -0.101 0.0987 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 3.15e-02 0.263 0.122 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 2.72e-01 -0.125 0.113 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.25e-03 -0.361 0.11 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 3.67e-02 0.211 0.1 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.71e-01 0.148 0.107 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 2.44e-01 -0.136 0.117 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 2.84e-01 0.0826 0.077 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0388 0.119 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 4.34e-02 0.249 0.123 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 5.11e-06 -0.494 0.105 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 1.12e-01 0.182 0.114 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.22e-01 0.124 0.125 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 6.48e-02 0.227 0.122 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 3.59e-01 -0.101 0.11 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 3.19e-01 0.12 0.12 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 6.35e-01 -0.058 0.122 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 9.60e-03 -0.296 0.113 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 5.29e-01 0.0778 0.123 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0275 0.132 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 7.22e-01 0.0452 0.127 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 5.17e-01 0.0718 0.111 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 3.57e-01 -0.113 0.122 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 9.01e-01 0.00516 0.0415 0.186 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 2.70e-01 0.128 0.116 0.186 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 2.71e-06 -0.519 0.108 0.186 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 9.27e-02 0.169 0.0998 0.186 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.64e-01 0.109 0.12 0.186 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 9.26e-01 0.0114 0.123 0.186 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 9.60e-01 0.00515 0.102 0.186 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0888 0.116 0.186 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 3.68e-01 0.102 0.113 0.186 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 7.93e-02 -0.176 0.0998 0.186 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 3.37e-01 0.124 0.129 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.02e-01 -0.152 0.0929 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 3.90e-01 0.0929 0.108 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.97e-01 0.163 0.126 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 3.03e-01 -0.127 0.123 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 1.47e-01 0.162 0.111 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0568 0.117 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 2.55e-01 0.141 0.123 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 1.21e-01 0.173 0.111 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 2.48e-04 -0.393 0.105 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0485 0.0823 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 7.14e-01 0.042 0.114 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 1.36e-01 0.165 0.11 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0822 0.0946 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 6.05e-01 0.0595 0.115 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0135 0.129 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0898 0.118 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.15e-02 -0.304 0.119 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00177 0.0972 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.90e-01 -0.166 0.127 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0963 0.13 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.93e-01 0.0828 0.121 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0374 0.124 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0746 0.122 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 1.70e-01 0.154 0.112 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 3.82e-03 -0.301 0.103 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0628 0.0797 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.54e-01 -0.103 0.111 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0921 0.112 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 7.42e-01 -0.029 0.0881 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0501 0.115 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 1.97e-01 -0.16 0.124 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 5.46e-01 0.0528 0.0872 0.181 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 6.47e-02 0.216 0.116 0.181 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0692 0.091 0.181 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 7.59e-01 0.0403 0.131 0.181 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.31e-01 0.227 0.149 0.181 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0677 0.0923 0.181 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 6.88e-01 -0.043 0.107 0.181 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 3.11e-01 0.11 0.108 0.181 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 4.63e-01 0.0925 0.126 0.181 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 9.42e-01 0.00846 0.115 0.181 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 1.29e-01 0.161 0.106 0.181 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0446 0.0428 0.183 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0513 0.0865 0.183 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.47e-02 -0.278 0.113 0.183 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 3.57e-01 0.0783 0.0847 0.183 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.02e-01 0.125 0.121 0.183 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 6.54e-01 0.0412 0.0917 0.183 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.34e-01 -0.078 0.0996 0.183 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0017 0.0855 0.183 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0599 0.0791 0.183 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 4.40e-01 -0.067 0.0865 0.183 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 3.57e-01 -0.109 0.118 0.184 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 4.10e-05 -0.495 0.118 0.184 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 9.11e-01 0.012 0.107 0.184 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 2.84e-01 0.125 0.117 0.184 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 5.04e-01 0.0808 0.121 0.184 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 1.90e-01 -0.129 0.0979 0.184 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 8.68e-01 0.018 0.109 0.195 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0356 0.106 0.195 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 2.27e-01 0.165 0.136 0.195 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 2.87e-01 -0.132 0.124 0.195 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 9.09e-02 0.217 0.128 0.195 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 1.11e-01 -0.192 0.12 0.195 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 4.93e-01 0.0645 0.094 0.195 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0673 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 9.16e-01 0.0113 0.107 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 5.88e-04 -0.274 0.0784 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0768 0.107 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 8.16e-01 -0.028 0.12 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 9.89e-02 0.178 0.107 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 1.96e-02 -0.216 0.0918 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 7.17e-01 0.0287 0.0793 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 2.37e-04 0.422 0.113 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 3.16e-02 -0.191 0.0884 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 4.36e-01 0.0847 0.109 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 1.79e-01 0.171 0.127 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 1.21e-01 0.185 0.119 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.82e-03 -0.309 0.109 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 7.89e-01 0.0231 0.0862 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 2.37e-02 0.346 0.151 0.191 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0587 0.144 0.191 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 2.42e-01 -0.127 0.108 0.191 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.74e-01 0.128 0.143 0.191 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 3.56e-01 0.139 0.15 0.191 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.51e-01 -0.106 0.14 0.191 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 3.22e-01 -0.141 0.142 0.191 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 8.04e-01 0.0348 0.14 0.191 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0838 0.128 0.191 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 6.34e-01 0.0554 0.116 0.184 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 2.92e-02 -0.231 0.105 0.184 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 1.36e-01 -0.186 0.124 0.184 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 6.63e-01 0.051 0.117 0.184 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0665 0.121 0.184 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0751 0.117 0.184 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 8.85e-01 0.0148 0.102 0.184 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 7.90e-02 -0.208 0.118 0.183 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.81e-04 -0.405 0.106 0.183 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 5.51e-01 0.0786 0.131 0.183 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 8.40e-02 0.198 0.114 0.183 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 3.27e-01 0.108 0.11 0.183 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.34e-02 -0.214 0.105 0.183 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 6.55e-01 0.0442 0.099 0.183 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 4.39e-01 0.11 0.142 0.212 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 6.34e-02 -0.229 0.122 0.212 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 1.13e-02 0.329 0.128 0.212 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 6.92e-01 0.0517 0.13 0.212 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0512 0.137 0.212 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 2.05e-01 -0.151 0.119 0.212 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0117 0.0925 0.212 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0152 0.123 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00112 0.0587 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 3.56e-01 -0.109 0.118 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 8.70e-02 -0.106 0.0616 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0581 0.0974 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.83e-02 0.207 0.0994 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 2.89e-01 -0.12 0.113 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 9.11e-02 -0.143 0.0842 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 6.72e-01 0.043 0.102 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0504 0.117 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 5.87e-01 0.0666 0.122 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 2.17e-01 -0.15 0.121 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -539302 sc-eQTL 8.38e-01 0.0138 0.0673 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 3.29e-01 0.107 0.11 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 6.22e-03 -0.148 0.0534 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 4.26e-01 0.062 0.0777 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0965 0.095 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 1.79e-01 0.146 0.108 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0291 0.0814 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 4.17e-01 0.0693 0.0852 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 202970 sc-eQTL 8.34e-01 0.0259 0.123 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 5.32e-01 0.0784 0.125 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -255143 sc-eQTL 2.42e-01 -0.133 0.114 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 4.56e-02 0.198 0.0984 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 9.21e-04 -0.263 0.0783 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00988 0.103 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 6.02e-01 0.0637 0.122 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 3.56e-02 0.219 0.103 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 2.18e-03 -0.276 0.089 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 6.69e-01 0.032 0.0746 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0979 0.113 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.44e-05 -0.42 0.0945 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0941 0.12 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 3.83e-01 0.1 0.115 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 4.75e-01 0.0817 0.114 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 2.13e-02 -0.227 0.098 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 6.16e-01 -0.043 0.0856 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177678 sc-eQTL 3.64e-02 0.221 0.105 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245495 sc-eQTL 1.79e-04 -0.382 0.1 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111483 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0491 0.0708 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662337 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0708 0.109 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534670 sc-eQTL 5.39e-01 0.062 0.101 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119707 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0655 0.0816 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64862 sc-eQTL 9.78e-01 0.00309 0.11 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -177743 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0872 0.129 0.183 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 245495 eQTL 4.09e-19 -0.26 0.0285 0.0 0.0 0.2
ENSG00000139351 SYCP3 202973 eQTL 0.0339 -0.0895 0.0421 0.0 0.0 0.2
ENSG00000185480 PARPBP -177743 eQTL 0.0256 0.0601 0.0269 0.0 0.0 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 245495 2.16e-06 1.36e-06 2.95e-07 1.28e-06 2.66e-07 6.45e-07 1.5e-06 3.5e-07 1.48e-06 5.06e-07 1.87e-06 6.6e-07 2.55e-06 3.41e-07 4.52e-07 8.25e-07 9e-07 8e-07 8.36e-07 6.96e-07 4.48e-07 1.75e-06 8.37e-07 6.37e-07 2.49e-06 3.63e-07 9.01e-07 6.89e-07 1.31e-06 1.3e-06 6.97e-07 5.02e-08 1.81e-07 6.99e-07 5.66e-07 4.34e-07 3.67e-07 1.32e-07 3.43e-07 2.29e-07 2.36e-07 2.05e-06 2.9e-07 1.24e-08 1.62e-07 1.12e-07 1.76e-07 8.34e-08 5.02e-08
ENSG00000120860 \N -119707 5.79e-06 5.07e-06 4.42e-07 2.95e-06 7.24e-07 1.56e-06 3.91e-06 9.96e-07 3.4e-06 1.83e-06 4.16e-06 2.28e-06 7.38e-06 2.39e-06 1.39e-06 2.34e-06 2.06e-06 2.96e-06 1.39e-06 1.21e-06 1.81e-06 4.25e-06 3.46e-06 1.66e-06 5.75e-06 1.22e-06 1.96e-06 1.69e-06 3.81e-06 4.12e-06 2.05e-06 2.87e-07 5.85e-07 1.44e-06 2.1e-06 9.68e-07 7.89e-07 3.92e-07 1.3e-06 3.28e-07 2.87e-07 5.67e-06 4.2e-07 1.66e-07 3.14e-07 3.67e-07 6.76e-07 2.53e-07 2.41e-07
ENSG00000257202 \N 17723 4.16e-05 2.2e-05 3.15e-06 1.24e-05 3.26e-06 1.29e-05 2.91e-05 3.37e-06 1.85e-05 9.71e-06 2.26e-05 8.63e-06 3.48e-05 8.55e-06 5.5e-06 1.15e-05 1.17e-05 2.1e-05 5.87e-06 4.81e-06 9.65e-06 2.15e-05 2.19e-05 6.86e-06 3.2e-05 5.39e-06 8.26e-06 8.03e-06 1.93e-05 2.23e-05 1.24e-05 1.33e-06 1.73e-06 5.15e-06 8.5e-06 4.07e-06 1.87e-06 2.49e-06 3.61e-06 2.66e-06 1.5e-06 2.9e-05 3.24e-06 2.01e-07 1.99e-06 2.59e-06 2.95e-06 8.57e-07 9.75e-07