logo

Genes within 1Mb (chr12:101942206:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 5.94e-01 0.0336 0.063 0.09 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 1.61e-01 -0.153 0.109 0.09 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0624 0.0665 0.09 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 9.79e-01 0.00258 0.0964 0.09 B L1
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 5.85e-01 -0.06 0.11 0.09 B L1
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0339 0.0942 0.09 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 2.95e-01 -0.079 0.0752 0.09 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 1.64e-01 -0.119 0.0852 0.09 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 5.94e-03 -0.371 0.134 0.09 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 7.48e-01 0.0419 0.13 0.09 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 8.57e-01 0.022 0.121 0.09 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 9.56e-01 0.00555 0.101 0.09 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 8.48e-01 0.0262 0.136 0.09 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 5.92e-01 0.0506 0.0942 0.09 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0243 0.104 0.09 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 6.85e-03 -0.274 0.1 0.09 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0671 0.0712 0.09 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 7.29e-01 0.0441 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 9.62e-01 0.00655 0.138 0.09 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0199 0.0906 0.09 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 9.24e-01 -0.011 0.114 0.09 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 2.23e-01 -0.154 0.126 0.09 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 1.20e-01 -0.139 0.0891 0.09 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 7.42e-01 0.0424 0.128 0.09 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 6.69e-02 0.252 0.137 0.095 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0839 0.126 0.095 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 1.94e-01 -0.18 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 2.78e-01 0.161 0.148 0.095 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 4.08e-01 0.127 0.154 0.095 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 8.57e-01 0.024 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 7.63e-01 0.033 0.109 0.095 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0767 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 3.55e-01 -0.107 0.115 0.09 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0535 0.0978 0.09 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0512 0.123 0.09 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 3.78e-01 -0.121 0.137 0.09 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 6.41e-01 0.0588 0.126 0.09 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0169 0.111 0.09 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0252 0.0903 0.09 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 9.09e-01 0.0142 0.125 0.09 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 1.28e-01 -0.176 0.115 0.09 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00895 0.0838 0.09 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 7.81e-01 0.0375 0.135 0.09 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0942 0.124 0.09 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 1.70e-01 -0.128 0.093 0.09 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 4.72e-01 0.0956 0.133 0.09 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 1.29e-01 -0.237 0.155 0.09 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0655 0.0477 0.09 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 5.32e-01 0.057 0.0911 0.09 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 8.21e-01 0.0301 0.133 0.09 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.97e-01 0.0375 0.0961 0.09 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 4.90e-01 0.104 0.15 0.09 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0144 0.109 0.09 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0922 0.0971 0.09 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 9.19e-01 0.0119 0.117 0.09 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 7.54e-01 0.0304 0.0972 0.09 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 8.60e-01 -0.02 0.113 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0369 0.0307 0.089 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 4.88e-01 0.111 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 2.18e-01 -0.145 0.118 0.089 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.68e-01 0.072 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 2.11e-01 0.203 0.162 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 1.84e-02 0.393 0.165 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 7.50e-01 -0.051 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 9.58e-01 0.00854 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 9.07e-02 -0.222 0.131 0.089 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 4.37e-01 -0.103 0.132 0.089 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 6.63e-02 0.228 0.123 0.089 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00993 0.0637 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 9.40e-02 -0.265 0.158 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0386 0.0851 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.15e-01 0.0634 0.126 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 3.65e-01 0.127 0.14 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0215 0.157 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0662 0.13 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0551 0.139 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00124 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0136 0.154 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 1.58e-02 -0.354 0.146 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 6.17e-01 -0.029 0.0578 0.088 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 5.00e-02 -0.298 0.151 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0484 0.0997 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0599 0.136 0.088 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 4.60e-01 -0.111 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 3.60e-01 -0.136 0.149 0.088 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 7.98e-01 0.0342 0.133 0.088 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0336 0.14 0.088 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 7.65e-01 -0.043 0.144 0.088 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 4.87e-01 0.103 0.147 0.088 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0484 0.134 0.088 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 2.05e-01 0.102 0.0806 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 2.87e-01 -0.156 0.146 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0917 0.0758 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0155 0.108 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0216 0.128 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 4.50e-01 0.108 0.142 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0474 0.108 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 2.32e-01 -0.14 0.117 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 6.96e-02 -0.287 0.158 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 5.21e-01 0.0993 0.155 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 1.60e-01 0.203 0.144 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 8.06e-01 0.0173 0.0701 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 6.65e-01 0.0622 0.144 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0817 0.0767 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 5.17e-01 0.0773 0.119 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0549 0.138 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 9.41e-01 0.0112 0.152 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 3.71e-01 -0.118 0.132 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 7.68e-01 0.0387 0.131 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 1.94e-01 -0.179 0.137 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0305 0.159 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 8.43e-01 0.0271 0.137 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0974 0.158 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 2.54e-01 -0.181 0.158 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 7.59e-01 0.0426 0.139 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 2.00e-01 0.195 0.152 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 1.42e-01 -0.237 0.161 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 2.09e-01 -0.195 0.154 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0584 0.116 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 7.83e-01 0.0368 0.133 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 1.72e-01 0.14 0.102 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 2.97e-01 -0.117 0.112 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 1.26e-01 -0.185 0.121 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 4.23e-01 -0.068 0.0848 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 3.11e-01 0.123 0.121 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 3.55e-01 -0.13 0.14 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 2.72e-01 0.119 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 2.72e-01 0.149 0.135 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 7.72e-02 -0.224 0.126 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0824 0.0833 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 3.52e-01 0.134 0.144 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 6.90e-01 0.0554 0.139 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 3.20e-01 -0.133 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 7.02e-01 0.0553 0.144 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 7.38e-02 -0.243 0.135 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 6.71e-01 0.052 0.122 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 4.53e-01 -0.098 0.13 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 9.13e-01 0.0147 0.134 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 2.30e-01 0.128 0.107 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0917 0.145 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 5.30e-01 -0.09 0.143 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 7.57e-01 0.0378 0.122 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0901 0.152 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0797 0.143 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0598 0.142 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 4.27e-01 0.101 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 2.18e-01 0.167 0.135 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 3.50e-01 -0.138 0.147 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 1.56e-01 -0.137 0.0964 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0652 0.149 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0103 0.148 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 8.34e-01 0.0277 0.132 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0623 0.137 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 8.45e-01 0.0293 0.149 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 3.83e-01 -0.128 0.146 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0635 0.131 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 4.25e-01 -0.114 0.143 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 9.94e-02 0.249 0.15 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 4.17e-01 -0.116 0.143 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 1.95e-01 0.198 0.153 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 3.26e-01 0.162 0.164 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 5.76e-01 0.088 0.157 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 9.29e-01 0.0123 0.137 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0194 0.151 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 7.10e-01 0.0197 0.0528 0.089 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0501 0.148 0.089 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00533 0.145 0.089 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0079 0.128 0.089 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 8.20e-01 0.035 0.154 0.089 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 3.98e-01 -0.133 0.156 0.089 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0152 0.13 0.089 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0382 0.148 0.089 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 3.51e-01 0.135 0.144 0.089 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0332 0.128 0.089 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 9.26e-01 0.0146 0.157 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0169 0.114 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 3.47e-01 -0.124 0.131 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 2.06e-02 -0.354 0.152 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 7.19e-01 0.0541 0.15 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 1.23e-02 -0.337 0.134 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 5.31e-01 0.0896 0.143 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 2.30e-01 -0.181 0.15 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 8.48e-01 0.0264 0.137 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 1.12e-01 -0.213 0.133 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0232 0.101 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 4.79e-01 0.0999 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0245 0.136 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 2.42e-01 -0.137 0.116 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 1.24e-01 0.218 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 3.96e-01 -0.136 0.159 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 1.14e-01 0.231 0.145 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00267 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0704 0.121 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00735 0.158 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0652 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 5.78e-01 0.0834 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 2.09e-01 0.193 0.153 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 8.72e-01 0.0245 0.151 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0459 0.141 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 5.35e-02 -0.254 0.131 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 4.42e-01 0.0771 0.1 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0533 0.14 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0333 0.141 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 9.22e-01 0.0109 0.111 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0668 0.144 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 4.99e-01 -0.105 0.156 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0475 0.111 0.089 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0386 0.15 0.089 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 8.23e-01 0.026 0.116 0.089 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0923 0.167 0.089 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 7.91e-01 0.0509 0.192 0.089 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0837 0.117 0.089 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00131 0.136 0.089 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 6.72e-01 0.0586 0.138 0.089 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 1.30e-02 0.393 0.156 0.089 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 5.05e-01 0.098 0.146 0.089 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 5.46e-01 0.0821 0.136 0.089 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 8.54e-02 -0.0895 0.0518 0.091 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000632 0.105 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 5.14e-01 0.0911 0.139 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0541 0.103 0.091 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 7.06e-01 0.0556 0.147 0.091 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00248 0.111 0.091 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 7.96e-01 0.0313 0.121 0.091 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 8.17e-01 -0.024 0.104 0.091 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0728 0.0961 0.091 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 5.29e-01 0.0664 0.105 0.091 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0473 0.148 0.09 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0375 0.154 0.09 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.28e-01 0.0654 0.135 0.09 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 6.70e-01 0.0625 0.147 0.09 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 2.55e-01 -0.173 0.151 0.09 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0849 0.123 0.09 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 2.09e-01 0.169 0.134 0.098 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 1.76e-01 -0.178 0.131 0.098 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 1.25e-01 -0.26 0.169 0.098 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 1.53e-02 0.37 0.151 0.098 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 7.26e-01 0.056 0.159 0.098 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0244 0.15 0.098 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0151 0.117 0.098 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 4.09e-01 -0.11 0.133 0.098 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 2.77e-01 -0.144 0.132 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0363 0.0997 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 1.34e-01 -0.198 0.132 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 2.76e-01 -0.162 0.148 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 8.17e-01 0.031 0.133 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 4.70e-01 0.0831 0.115 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00532 0.098 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 8.11e-01 0.0342 0.143 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0178 0.11 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 6.49e-01 0.0607 0.133 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0233 0.156 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 9.26e-02 0.246 0.146 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 1.75e-01 -0.184 0.135 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0529 0.106 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 4.05e-01 0.146 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 1.39e-01 0.243 0.164 0.091 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 2.58e-01 0.14 0.124 0.091 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 9.14e-01 0.0178 0.164 0.091 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 1.26e-01 -0.263 0.17 0.091 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 2.67e-01 -0.178 0.16 0.091 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 2.34e-01 0.194 0.162 0.091 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 1.79e-01 -0.215 0.159 0.091 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 3.50e-01 0.137 0.146 0.091 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 2.22e-01 -0.175 0.143 0.093 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 2.16e-01 -0.163 0.131 0.093 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 2.02e-01 0.197 0.154 0.093 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0802 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 9.57e-01 0.00803 0.15 0.093 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0341 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 8.00e-01 -0.032 0.126 0.093 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 8.14e-01 -0.034 0.144 0.093 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0786 0.133 0.093 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 8.95e-01 -0.021 0.16 0.093 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 4.57e-01 0.104 0.139 0.093 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0313 0.134 0.093 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0811 0.129 0.093 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0581 0.12 0.093 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 2.62e-01 0.197 0.175 0.088 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 7.25e-01 -0.054 0.153 0.088 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 7.34e-01 0.0551 0.162 0.088 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 8.23e-01 0.0362 0.161 0.088 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 3.99e-02 0.347 0.167 0.088 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 5.03e-01 0.0991 0.148 0.088 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 5.31e-01 0.0717 0.114 0.088 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 3.90e-01 0.131 0.152 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0738 0.0726 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 1.20e-02 -0.365 0.144 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0559 0.0768 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 5.95e-01 0.0644 0.121 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 8.74e-01 0.0198 0.125 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 7.71e-01 -0.041 0.141 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0376 0.105 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 3.45e-01 -0.119 0.126 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 7.84e-02 -0.255 0.144 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 7.56e-01 0.0473 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 8.90e-02 -0.256 0.15 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -539538 sc-eQTL 5.00e-01 0.0572 0.0846 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 5.74e-01 -0.078 0.138 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 1.34e-01 -0.102 0.0681 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 7.95e-01 0.0255 0.098 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 6.53e-01 -0.054 0.12 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 6.86e-01 0.0553 0.137 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 2.92e-01 -0.108 0.102 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 2.31e-01 -0.129 0.107 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 202734 sc-eQTL 5.28e-02 -0.299 0.154 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 5.43e-01 0.0961 0.158 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -255379 sc-eQTL 2.84e-01 0.154 0.143 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0661 0.122 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0183 0.0984 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0998 0.126 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 3.31e-01 -0.146 0.149 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 2.10e-01 0.16 0.128 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 7.95e-01 -0.029 0.111 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0454 0.0914 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 1.63e-01 -0.194 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0932 0.122 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 7.00e-01 0.0568 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0132 0.142 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 4.82e-01 -0.099 0.141 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0644 0.122 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0392 0.105 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -177914 sc-eQTL 8.16e-01 0.0306 0.131 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 245259 sc-eQTL 1.29e-01 -0.194 0.127 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 111247 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0153 0.0878 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 662101 sc-eQTL 5.61e-01 0.0783 0.135 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 534434 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0824 0.125 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -119943 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0537 0.101 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 64626 sc-eQTL 3.60e-01 0.124 0.136 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -177979 sc-eQTL 2.97e-01 -0.167 0.159 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 245259 eQTL 4.52e-02 0.0824 0.0411 0.0 0.0 0.101
ENSG00000136048 DRAM1 64626 eQTL 0.000722 0.0779 0.023 0.0 0.0 0.101
ENSG00000196091 MYBPC1 373853 pQTL 0.0249 -0.0652 0.029 0.00146 0.0 0.099
ENSG00000258230 AC063950.1 168451 eQTL 0.0135 0.111 0.0447 0.0 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 245259 1.32e-06 1.52e-06 2.43e-07 1.26e-06 3.82e-07 6.42e-07 1.43e-06 4.37e-07 1.74e-06 6.05e-07 2.05e-06 1.05e-06 2.61e-06 3.61e-07 4.92e-07 9.98e-07 1.11e-06 1.08e-06 7.08e-07 4.42e-07 7.79e-07 1.96e-06 1.14e-06 5.91e-07 2.41e-06 7.6e-07 1.06e-06 8.87e-07 1.63e-06 1.31e-06 8.46e-07 2.62e-07 3.16e-07 5.6e-07 5.93e-07 4.86e-07 6.69e-07 3.63e-07 4.63e-07 3.15e-07 3.35e-07 1.95e-06 2.9e-07 1.99e-07 3.26e-07 2.18e-07 2.28e-07 1.41e-07 1.98e-07