logo

Genes within 1Mb (chr12:101939931:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0077 0.0487 0.169 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 1.01e-01 -0.139 0.0842 0.169 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 6.18e-02 -0.0959 0.0511 0.169 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0579 0.0744 0.169 B L1
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0172 0.0847 0.169 B L1
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 1.19e-01 0.113 0.0724 0.169 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0428 0.0582 0.169 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0888 0.0658 0.169 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0819 0.105 0.169 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 4.10e-01 0.083 0.1 0.169 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 7.62e-01 0.0285 0.0938 0.169 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 4.94e-01 0.0526 0.0768 0.169 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.19e-01 0.0373 0.104 0.169 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0214 0.0719 0.169 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 2.02e-01 0.102 0.0793 0.169 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0943 0.0775 0.169 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0226 0.0545 0.169 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 9.79e-01 0.00251 0.0963 0.169 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.88e-01 0.0281 0.104 0.169 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0124 0.0685 0.169 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 2.19e-01 0.106 0.0861 0.169 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 2.79e-01 -0.103 0.0951 0.169 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000252 0.0677 0.169 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 4.71e-01 0.07 0.0969 0.169 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 2.06e-01 0.136 0.107 0.176 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0159 0.0983 0.176 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 1.31e-01 -0.163 0.107 0.176 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0107 0.116 0.176 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 9.32e-01 0.0102 0.12 0.176 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 8.18e-01 0.0238 0.103 0.176 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 7.03e-02 0.154 0.0845 0.176 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0609 0.112 0.176 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 2.01e-01 -0.114 0.0889 0.169 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0247 0.0755 0.169 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 3.69e-01 0.0851 0.0946 0.169 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 2.18e-01 -0.13 0.105 0.169 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 3.08e-01 0.0992 0.097 0.169 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 5.29e-01 0.0539 0.0855 0.169 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0544 0.0696 0.169 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 3.97e-01 0.0811 0.0956 0.17 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0657 0.0888 0.17 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 3.14e-01 0.0649 0.0643 0.17 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 7.77e-01 0.0294 0.104 0.17 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 2.21e-01 -0.117 0.095 0.17 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 1.10e-01 -0.115 0.0714 0.17 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 7.99e-01 0.0261 0.102 0.17 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 3.75e-01 -0.106 0.12 0.17 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00496 0.0369 0.169 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0181 0.0704 0.169 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 6.84e-01 0.0419 0.103 0.169 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 9.67e-01 0.0031 0.0742 0.169 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 2.02e-01 0.148 0.115 0.169 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 5.07e-01 -0.056 0.0844 0.169 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 9.47e-01 0.00498 0.0751 0.169 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0829 0.0898 0.169 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 3.14e-01 0.0755 0.0748 0.169 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0862 0.087 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0243 0.0238 0.161 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 9.07e-01 0.0145 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 1.68e-01 -0.126 0.0909 0.161 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 9.20e-01 0.0131 0.13 0.161 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0213 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 5.10e-03 0.36 0.127 0.161 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 1.91e-01 -0.161 0.123 0.161 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0157 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0456 0.102 0.161 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0304 0.103 0.161 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 2.24e-04 0.349 0.0927 0.161 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 9.05e-01 0.00579 0.0487 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0255 0.121 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0977 0.0647 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 5.68e-01 -0.055 0.0961 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 3.08e-01 0.109 0.107 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 3.97e-01 0.102 0.12 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 3.90e-01 0.0854 0.0992 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0671 0.107 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 1.27e-01 0.171 0.111 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 2.24e-01 0.143 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 1.21e-01 -0.174 0.112 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 9.06e-01 0.00522 0.0443 0.166 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 6.99e-02 -0.211 0.116 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.25e-01 -0.061 0.0763 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0338 0.105 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0715 0.115 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 4.81e-01 0.0804 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 8.60e-01 0.018 0.102 0.166 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0362 0.107 0.166 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0376 0.11 0.166 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 2.17e-01 0.139 0.112 0.166 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0464 0.103 0.166 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 3.32e-01 0.0602 0.0619 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 3.38e-01 -0.108 0.112 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 8.16e-02 -0.101 0.058 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 6.78e-01 0.0343 0.0826 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 2.34e-01 0.117 0.0977 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 4.67e-02 0.217 0.108 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 6.12e-02 -0.155 0.0821 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0387 0.0897 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 1.98e-01 -0.157 0.121 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 9.13e-01 0.013 0.119 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 1.04e-01 0.181 0.11 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00335 0.054 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 2.12e-01 -0.138 0.11 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0862 0.059 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0763 0.0917 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 5.86e-01 -0.058 0.106 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00365 0.117 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 3.91e-01 0.0873 0.102 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0164 0.101 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 6.76e-02 -0.194 0.105 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0638 0.122 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 2.44e-01 -0.123 0.105 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 7.45e-02 -0.212 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.04e-01 0.0995 0.119 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0584 0.104 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 4.21e-02 0.232 0.114 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0879 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 3.11e-01 -0.118 0.116 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 5.25e-01 0.0561 0.0881 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 5.60e-01 0.0594 0.102 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0231 0.0784 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 5.71e-01 0.0484 0.0854 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0149 0.0926 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0451 0.0646 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 6.74e-01 0.0391 0.0929 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0236 0.107 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 2.99e-01 0.0861 0.0828 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 1.77e-01 0.14 0.103 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0847 0.097 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 9.27e-01 0.00586 0.0638 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 3.07e-01 0.113 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.48e-01 0.0344 0.107 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 9.69e-01 0.00401 0.103 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 3.59e-01 0.102 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 1.97e-01 -0.136 0.105 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 7.24e-01 0.0333 0.0941 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0689 0.101 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.21e-01 0.037 0.103 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 2.11e-01 0.103 0.0823 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 7.06e-01 0.0422 0.112 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 1.76e-01 -0.149 0.11 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 2.33e-01 0.113 0.094 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 8.99e-01 0.0149 0.117 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0025 0.108 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0613 0.107 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000931 0.0963 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 5.46e-02 0.196 0.102 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 3.56e-01 -0.103 0.111 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0274 0.0732 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 9.88e-01 0.0017 0.113 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 1.14e-01 -0.18 0.113 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 1.88e-01 0.134 0.102 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0746 0.105 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 7.04e-01 0.0438 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00482 0.113 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 9.08e-01 0.0117 0.101 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0835 0.11 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0221 0.114 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0347 0.108 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0379 0.115 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 2.57e-01 0.14 0.123 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0775 0.118 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 3.31e-01 0.101 0.103 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 3.91e-01 0.0978 0.114 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 1.58e-01 0.0577 0.0408 0.169 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 8.15e-01 0.0269 0.115 0.169 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 9.63e-01 0.0052 0.112 0.169 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0292 0.0993 0.169 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 2.84e-01 0.127 0.119 0.169 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 2.64e-01 -0.136 0.121 0.169 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 3.53e-01 0.0937 0.101 0.169 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 1.21e-01 -0.177 0.114 0.169 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0154 0.112 0.169 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0435 0.0993 0.169 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 8.68e-01 0.0203 0.122 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0286 0.0883 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0264 0.102 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 9.94e-02 -0.196 0.118 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 6.52e-01 0.0526 0.116 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 1.39e-02 -0.257 0.104 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 8.81e-01 0.0165 0.111 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 5.79e-01 0.0649 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 3.79e-01 0.0932 0.106 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0845 0.103 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 5.10e-01 0.0516 0.0782 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 1.56e-01 0.154 0.108 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 7.61e-01 0.032 0.105 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 1.09e-01 -0.144 0.0896 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 3.14e-01 0.11 0.109 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 1.46e-01 -0.179 0.123 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 2.74e-01 0.124 0.113 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.07e-01 0.0439 0.116 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 1.27e-01 0.142 0.093 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 8.69e-01 0.0203 0.122 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 3.72e-01 -0.112 0.125 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0488 0.116 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 7.02e-01 0.0458 0.119 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 5.94e-01 0.0626 0.117 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 6.90e-01 -0.043 0.108 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0974 0.1 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 3.20e-01 0.076 0.0763 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0699 0.107 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.107 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 5.52e-01 0.0503 0.0844 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0627 0.11 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 3.13e-01 -0.12 0.119 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0513 0.0917 0.156 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 3.43e-01 -0.117 0.123 0.156 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 9.01e-01 0.012 0.0959 0.156 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 8.82e-01 0.0204 0.138 0.156 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0437 0.158 0.156 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 2.67e-01 -0.108 0.0968 0.156 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 4.77e-01 -0.08 0.112 0.156 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 6.30e-01 0.055 0.114 0.156 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 3.96e-02 0.27 0.13 0.156 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 1.33e-01 0.182 0.12 0.156 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 6.63e-01 0.049 0.112 0.156 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0623 0.0401 0.17 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 8.54e-01 0.0149 0.0813 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 3.49e-01 0.101 0.108 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0844 0.0795 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 8.94e-01 0.0152 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 8.32e-01 0.0183 0.0861 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 5.69e-01 0.0534 0.0935 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 1.49e-01 -0.116 0.0798 0.17 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00345 0.0743 0.17 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0432 0.0813 0.17 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 4.99e-01 0.0769 0.113 0.169 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0371 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00686 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 6.87e-01 0.0454 0.112 0.169 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0671 0.116 0.169 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 5.91e-01 0.0508 0.0943 0.169 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 2.83e-01 0.111 0.103 0.178 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0743 0.101 0.178 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 1.85e-01 -0.172 0.129 0.178 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 3.60e-01 0.108 0.118 0.178 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00568 0.122 0.178 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0209 0.115 0.178 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 4.07e-01 0.0741 0.0892 0.178 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0173 0.102 0.178 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 3.21e-01 -0.101 0.101 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0571 0.0766 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0111 0.102 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 3.92e-01 -0.098 0.114 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 4.84e-01 0.0718 0.102 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 7.41e-02 0.157 0.0877 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00696 0.0754 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 7.99e-01 -0.028 0.11 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 7.20e-01 0.0302 0.0843 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 2.16e-01 0.127 0.102 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0109 0.12 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 3.39e-01 0.108 0.113 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 8.03e-01 -0.026 0.104 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 1.34e-01 -0.122 0.0809 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0359 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 2.28e-01 0.151 0.124 0.176 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 1.76e-01 0.127 0.0936 0.176 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0225 0.125 0.176 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0727 0.13 0.176 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 7.66e-01 0.0364 0.122 0.176 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 2.52e-01 0.142 0.123 0.176 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0156 0.122 0.176 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0121 0.111 0.176 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0215 0.11 0.176 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 9.62e-02 -0.167 0.1 0.176 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 9.24e-02 0.198 0.117 0.176 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0234 0.111 0.176 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 1.34e-01 0.171 0.114 0.176 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0328 0.111 0.176 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0337 0.0967 0.176 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 2.79e-01 -0.119 0.11 0.176 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0215 0.102 0.176 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 8.63e-01 0.0211 0.122 0.176 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0747 0.106 0.176 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00265 0.102 0.176 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 2.11e-01 -0.123 0.0981 0.176 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0939 0.0914 0.176 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 4.93e-01 0.0936 0.136 0.164 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.87e-01 0.0826 0.118 0.164 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 7.90e-01 0.0335 0.126 0.164 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 7.01e-01 0.0481 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 8.08e-02 0.229 0.13 0.164 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 1.66e-01 0.159 0.114 0.164 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 2.94e-01 0.0931 0.0884 0.164 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 7.83e-01 0.0326 0.118 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0249 0.0561 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 1.54e-01 -0.161 0.112 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0863 0.059 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0195 0.0932 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0267 0.096 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 1.59e-01 0.153 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 7.19e-01 0.0292 0.081 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 2.68e-01 -0.108 0.0968 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 4.31e-01 0.0881 0.112 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 1.19e-01 0.182 0.116 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0889 0.116 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -541813 sc-eQTL 6.47e-01 0.03 0.0654 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 1.22e-01 -0.165 0.107 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 2.74e-02 -0.116 0.0523 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0077 0.0757 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 7.68e-01 0.0274 0.0927 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 1.28e-01 0.161 0.105 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 1.52e-01 -0.113 0.0788 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0314 0.083 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 200459 sc-eQTL 7.04e-02 -0.216 0.119 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 9.58e-01 0.00637 0.122 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -257654 sc-eQTL 5.20e-01 0.0716 0.111 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0822 0.0934 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0148 0.0757 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 5.83e-01 0.0535 0.0973 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 3.69e-01 -0.104 0.115 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 2.16e-01 0.122 0.0981 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 2.97e-01 0.0893 0.0855 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0668 0.0702 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 1.89e-01 -0.141 0.107 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0708 0.0936 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 3.32e-01 0.11 0.113 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0864 0.109 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 6.41e-01 0.0505 0.108 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0856 0.0939 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0697 0.081 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180189 sc-eQTL 3.83e-01 0.0883 0.101 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242984 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0742 0.0986 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108972 sc-eQTL 3.80e-01 0.0593 0.0675 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659826 sc-eQTL 5.95e-01 0.0552 0.104 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 532159 sc-eQTL 2.23e-01 -0.117 0.0959 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122218 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0532 0.0779 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 62351 sc-eQTL 6.16e-01 0.0526 0.105 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -180254 sc-eQTL 1.43e-01 -0.18 0.123 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 242984 eQTL 2.97e-03 0.0945 0.0317 0.0 0.0 0.181
ENSG00000136048 DRAM1 62351 eQTL 0.00916 0.0466 0.0178 0.0 0.0 0.181
ENSG00000258230 AC063950.1 166176 eQTL 0.0332 0.074 0.0347 0.0 0.0 0.181

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 242984 2.63e-06 2.45e-06 4.68e-07 1.63e-06 3.67e-07 6.56e-07 1.3e-06 4.18e-07 1.71e-06 7.31e-07 2.02e-06 8.93e-07 2.9e-06 9.7e-07 6.98e-07 1.07e-06 1.04e-06 1.35e-06 8.06e-07 1.16e-06 7.69e-07 2.06e-06 1.61e-06 6.81e-07 2.42e-06 7.94e-07 1.15e-06 1.12e-06 1.74e-06 1.31e-06 7.46e-07 3.41e-07 4e-07 5.66e-07 8.23e-07 6.3e-07 6.85e-07 3.43e-07 5.16e-07 3.02e-07 2.73e-07 2.35e-06 5.92e-07 6.53e-08 3.91e-07 3.34e-07 2.66e-07 1.97e-07 2.57e-07