Genes within 1Mb (chr12:101939505:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0141 0.0449 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 6.73e-01 -0.033 0.0782 0.201 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.38e-01 0.0703 0.0473 0.201 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 1.34e-01 0.103 0.0684 0.201 B L1
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 1.85e-01 0.104 0.0779 0.201 B L1
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 6.35e-03 -0.182 0.066 0.201 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00379 0.0538 0.201 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 4.70e-02 0.121 0.0605 0.201 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 4.61e-01 0.0716 0.0968 0.201 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0208 0.0928 0.201 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0816 0.0864 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0179 0.0714 0.201 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 2.89e-01 -0.102 0.0961 0.201 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0253 0.0668 0.201 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0193 0.0739 0.201 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 1.67e-01 0.0998 0.0719 0.201 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.10e-01 0.0807 0.0503 0.201 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 7.14e-02 0.16 0.0881 0.201 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.53e-01 -0.137 0.0958 0.201 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 3.75e-01 -0.056 0.063 0.201 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00613 0.0797 0.201 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0579 0.0879 0.201 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 6.63e-01 0.0272 0.0624 0.201 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 9.12e-01 0.00987 0.0895 0.201 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 2.13e-01 0.125 0.0996 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 5.32e-01 0.0572 0.0913 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 9.68e-03 0.258 0.0988 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 4.26e-01 0.0857 0.108 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0974 0.111 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 3.91e-01 0.0823 0.0958 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0999 0.0789 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 3.15e-01 0.105 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0218 0.084 0.201 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 2.92e-01 0.0749 0.0709 0.201 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 7.34e-01 0.0303 0.0891 0.201 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 6.72e-01 0.0421 0.0994 0.201 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0462 0.0915 0.201 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 2.51e-01 0.0923 0.0803 0.201 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 4.56e-01 0.0489 0.0655 0.201 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0591 0.0905 0.2 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.48e-01 -0.122 0.0836 0.2 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 4.79e-01 0.0432 0.0609 0.2 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 9.81e-01 0.00234 0.098 0.2 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0122 0.0901 0.2 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00622 0.0679 0.2 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0248 0.0966 0.2 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 2.47e-01 -0.131 0.113 0.2 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 9.88e-01 -0.000527 0.0343 0.201 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0321 0.0653 0.201 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 8.46e-01 0.0186 0.0954 0.201 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 8.31e-01 0.0147 0.0689 0.201 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 1.10e-01 -0.171 0.107 0.201 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 6.94e-01 0.0309 0.0784 0.201 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.64e-01 0.0969 0.0694 0.201 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 2.81e-01 0.09 0.0833 0.201 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 1.45e-01 0.101 0.0693 0.201 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 2.43e-01 0.0945 0.0807 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0102 0.0217 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 5.25e-01 0.0717 0.113 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 4.36e-01 0.065 0.0832 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 3.19e-01 -0.118 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 1.51e-01 -0.164 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 1.64e-02 -0.282 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 9.35e-02 -0.189 0.112 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 6.27e-02 0.21 0.112 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00159 0.0929 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0405 0.0935 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0229 0.0879 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 5.31e-01 0.0283 0.0451 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 4.17e-01 0.0912 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 2.12e-02 0.138 0.0596 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 7.45e-01 0.0291 0.0892 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 5.71e-01 0.0562 0.099 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 1.42e-01 -0.164 0.111 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 2.25e-01 0.112 0.0918 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 1.69e-01 0.136 0.0984 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0585 0.104 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 3.52e-01 -0.102 0.109 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00332 0.105 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0263 0.0417 0.203 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 3.72e-01 0.0984 0.11 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.43e-01 0.105 0.0716 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 2.93e-01 0.104 0.0983 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 3.45e-01 0.102 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 2.57e-01 -0.122 0.107 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 3.67e-02 -0.2 0.0952 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 8.79e-01 0.0154 0.101 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0657 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 7.79e-02 -0.187 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 8.77e-01 0.015 0.0967 0.203 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0264 0.0569 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0264 0.103 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 2.52e-01 0.0613 0.0534 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 4.48e-01 0.0575 0.0756 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 1.13e-01 0.142 0.0894 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 8.50e-01 0.0189 0.1 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 9.18e-01 0.00782 0.0759 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 3.92e-01 0.0704 0.0822 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 2.28e-01 0.135 0.111 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 3.56e-01 0.101 0.109 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 1.67e-01 -0.141 0.101 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 6.05e-01 0.0259 0.05 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 1.63e-01 -0.143 0.102 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 4.71e-01 0.0396 0.0549 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 2.06e-01 0.108 0.0848 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0292 0.0987 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 1.46e-03 -0.341 0.106 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0352 0.0943 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 5.46e-01 0.0565 0.0934 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 5.99e-01 0.0518 0.0983 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 7.75e-01 0.0325 0.113 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 8.39e-01 -0.02 0.0978 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 2.80e-01 0.119 0.11 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 3.51e-01 -0.103 0.11 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 4.45e-01 0.0736 0.0961 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 2.65e-01 -0.118 0.106 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 3.61e-01 -0.103 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.53e-01 0.154 0.107 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00652 0.0827 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 2.05e-01 -0.121 0.0951 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0787 0.0734 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00685 0.0801 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 1.22e-01 0.134 0.0863 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.92e-01 0.0792 0.0604 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 4.13e-01 -0.071 0.0866 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0613 0.1 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0522 0.0774 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 8.20e-01 0.022 0.0969 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 9.51e-01 0.00556 0.0907 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 5.17e-01 0.0386 0.0595 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0376 0.104 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.00e-01 -0.164 0.0991 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 7.63e-01 -0.029 0.096 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 2.71e-01 -0.114 0.104 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 9.19e-01 0.00996 0.0981 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 4.65e-01 0.0643 0.0878 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 1.71e-01 0.13 0.0945 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00474 0.0974 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0143 0.0779 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 1.13e-01 0.166 0.105 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 8.25e-01 -0.023 0.104 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0281 0.0888 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0151 0.111 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 9.81e-02 0.165 0.099 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0945 0.0989 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00279 0.089 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 2.67e-01 -0.105 0.0943 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 2.47e-01 0.119 0.102 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 8.22e-01 0.0152 0.0676 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 3.38e-01 0.1 0.104 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 1.78e-01 -0.144 0.106 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0594 0.0956 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0646 0.0989 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 8.39e-01 -0.022 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0936 0.106 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 2.52e-01 0.109 0.0947 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00528 0.104 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 7.60e-01 0.0332 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 4.72e-01 -0.074 0.103 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00308 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0994 0.118 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0318 0.113 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.03e-01 -0.161 0.0981 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0703 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00208 0.0378 0.199 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0491 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 6.54e-01 0.0463 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 5.56e-01 0.054 0.0916 0.199 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 3.37e-01 -0.105 0.11 0.199 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 5.24e-01 0.0714 0.112 0.199 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.67e-01 0.129 0.0928 0.199 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 8.09e-02 0.184 0.105 0.199 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 5.04e-01 0.0693 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 5.00e-01 0.0619 0.0916 0.199 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 4.53e-01 -0.087 0.116 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 2.38e-01 -0.099 0.0836 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0195 0.097 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 1.68e-01 0.156 0.113 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 1.94e-01 0.144 0.11 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.72e-01 0.137 0.0995 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 7.27e-01 0.0368 0.105 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 1.46e-01 -0.161 0.111 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 6.82e-01 0.0412 0.1 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.78e-01 -0.132 0.0976 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 8.26e-01 0.0163 0.0741 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0753 0.0994 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0453 0.0853 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 2.89e-01 -0.11 0.103 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 3.26e-02 -0.248 0.115 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 4.50e-01 -0.079 0.104 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0416 0.107 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 1.69e-01 0.118 0.0858 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0848 0.113 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 1.78e-01 0.155 0.115 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 9.19e-01 0.011 0.107 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 4.49e-01 0.0833 0.11 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 9.76e-01 0.00329 0.108 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 2.68e-01 -0.113 0.101 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.00e-01 -0.156 0.0946 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 6.78e-01 0.0301 0.0723 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0325 0.101 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 5.34e-01 0.0631 0.101 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.26e-01 -0.122 0.0794 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 9.99e-01 -6.81e-05 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 4.95e-01 0.0766 0.112 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0246 0.0877 0.189 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0465 0.118 0.189 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 3.03e-01 0.0944 0.0912 0.189 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 1.12e-01 0.208 0.13 0.189 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0671 0.151 0.189 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 6.95e-01 0.0366 0.0929 0.189 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 4.71e-02 0.212 0.105 0.189 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 6.30e-01 0.0526 0.109 0.189 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0883 0.126 0.189 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0779 0.116 0.189 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 3.82e-01 0.0938 0.107 0.189 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 5.65e-01 0.0218 0.0378 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0122 0.0763 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0262 0.101 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 8.14e-01 0.0176 0.0748 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0892 0.107 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 6.91e-01 0.0322 0.0808 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 7.88e-01 0.0237 0.0878 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0231 0.0753 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 7.24e-01 0.0246 0.0698 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 3.91e-01 0.0654 0.0762 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 3.09e-01 0.108 0.106 0.201 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0309 0.11 0.201 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0577 0.0963 0.201 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0763 0.105 0.201 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 3.41e-02 0.229 0.107 0.201 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 8.50e-01 0.0167 0.0882 0.201 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 7.82e-01 0.0273 0.0986 0.205 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 7.86e-01 0.0262 0.0961 0.205 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 3.65e-03 0.357 0.121 0.205 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0115 0.112 0.205 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 2.76e-01 -0.127 0.116 0.205 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 3.17e-01 0.109 0.109 0.205 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 6.80e-01 0.0353 0.0853 0.205 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 3.61e-01 0.0889 0.0971 0.205 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0286 0.0961 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 3.64e-01 0.0658 0.0723 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0511 0.0961 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 7.20e-01 0.0389 0.108 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0071 0.0969 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 8.20e-01 0.0191 0.0835 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 5.68e-01 0.0406 0.0712 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 2.80e-01 -0.113 0.105 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 6.46e-01 0.037 0.0804 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 4.36e-02 0.197 0.0969 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 5.46e-01 0.0692 0.115 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0573 0.108 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 2.20e-01 0.122 0.0993 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 3.98e-01 0.0656 0.0775 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0675 0.128 0.224 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 2.54e-01 -0.137 0.12 0.224 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 6.96e-01 0.0356 0.0908 0.224 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 1.23e-01 -0.185 0.119 0.224 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 6.28e-01 0.061 0.126 0.224 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 3.71e-01 -0.105 0.117 0.224 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 7.77e-01 0.0338 0.119 0.224 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 1.71e-01 0.16 0.116 0.224 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 3.36e-01 0.103 0.107 0.224 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 9.70e-01 0.00403 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 6.36e-01 0.046 0.097 0.2 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0405 0.114 0.2 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0435 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 6.03e-01 0.0575 0.11 0.2 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 6.63e-01 0.0465 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 7.30e-01 0.0322 0.0933 0.2 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 4.11e-01 0.0881 0.107 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 4.01e-01 0.083 0.0987 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 2.48e-02 -0.264 0.117 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 4.21e-01 0.0832 0.103 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0861 0.0993 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 8.88e-02 0.162 0.095 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 9.46e-01 0.0061 0.0891 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 6.08e-01 0.067 0.13 0.201 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.00e+00 3.64e-07 0.114 0.201 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 1.05e-01 -0.194 0.119 0.201 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 7.08e-01 -0.045 0.12 0.201 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 8.43e-01 -0.025 0.126 0.201 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 6.48e-01 0.0502 0.11 0.201 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 2.17e-01 -0.105 0.0845 0.201 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 9.35e-01 0.00917 0.113 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 7.12e-01 0.0194 0.0525 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 1.90e-01 0.138 0.105 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.97e-02 0.129 0.0547 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 8.49e-01 0.0166 0.0871 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 6.31e-01 0.0432 0.0897 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 5.94e-02 -0.191 0.101 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0405 0.0758 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 5.68e-02 0.172 0.09 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0835 0.104 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 1.27e-01 -0.167 0.109 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0378 0.109 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -542239 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0138 0.0603 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 3.15e-01 -0.099 0.0984 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 1.01e-01 0.0798 0.0484 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 1.95e-01 0.0903 0.0695 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 1.97e-01 0.11 0.085 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 1.44e-01 -0.142 0.0969 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0152 0.0729 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 3.01e-01 0.0791 0.0763 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 200033 sc-eQTL 2.15e-01 0.137 0.11 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 5.77e-01 0.0627 0.112 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -258080 sc-eQTL 2.70e-01 -0.113 0.102 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0627 0.0882 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 5.05e-01 0.0477 0.0713 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 5.94e-01 0.049 0.0918 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 6.87e-01 0.0438 0.109 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0222 0.0929 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 5.49e-01 0.0485 0.0808 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 2.16e-01 0.0819 0.0661 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 2.88e-01 0.109 0.102 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 3.08e-01 0.0913 0.0893 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0741 0.108 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 4.94e-01 0.0714 0.104 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0974 0.103 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 1.79e-01 0.121 0.0895 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 6.81e-01 0.032 0.0775 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -180615 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0564 0.0958 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 242558 sc-eQTL 8.60e-02 -0.16 0.0929 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 108546 sc-eQTL 3.10e-01 0.065 0.0639 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 659400 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0695 0.0982 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 531733 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0012 0.0912 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -122644 sc-eQTL 2.61e-01 -0.083 0.0737 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 61925 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0602 0.0992 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -180680 sc-eQTL 3.69e-01 -0.105 0.117 0.198 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 61925 eQTL 1.03e-06 0.0857 0.0174 0.0 0.0 0.176


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 61925 1.34e-05 2.36e-05 2.64e-06 1.06e-05 2.44e-06 6.22e-06 2.07e-05 3.39e-06 1.78e-05 8.97e-06 2.82e-05 1.09e-05 3.19e-05 1.03e-05 4.78e-06 9.29e-06 8.63e-06 1.32e-05 3.59e-06 3.16e-06 7.89e-06 1.67e-05 1.36e-05 3.69e-06 2.67e-05 4.53e-06 7.7e-06 7.73e-06 1.53e-05 1.28e-05 1.65e-05 9.89e-07 1.24e-06 3.91e-06 7.74e-06 3.22e-06 1.77e-06 2.35e-06 2.04e-06 1.3e-06 1.08e-06 2.12e-05 2.67e-06 1.62e-07 9.12e-07 2.45e-06 2.4e-06 7.75e-07 4.6e-07
ENSG00000257202 \N 14786 3.92e-05 3.58e-05 6.57e-06 1.62e-05 6.8e-06 1.6e-05 4.85e-05 5.19e-06 3.63e-05 1.76e-05 4.45e-05 2.05e-05 5.32e-05 1.56e-05 7.89e-06 2.25e-05 1.98e-05 2.86e-05 8.6e-06 7.38e-06 1.82e-05 3.82e-05 3.46e-05 1e-05 4.95e-05 9.17e-06 1.63e-05 1.52e-05 3.51e-05 2.81e-05 2.38e-05 1.65e-06 2.95e-06 7.83e-06 1.27e-05 6.4e-06 3.52e-06 3.34e-06 5.3e-06 3.57e-06 1.81e-06 4.09e-05 4.22e-06 4.21e-07 2.75e-06 4.63e-06 4.54e-06 1.71e-06 1.54e-06