logo

Genes within 1Mb (chr12:101937540:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0207 0.0484 0.169 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 7.84e-02 -0.148 0.0836 0.169 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 9.19e-02 -0.0861 0.0508 0.169 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 3.31e-01 -0.072 0.0739 0.169 B L1
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 8.24e-01 0.0187 0.0842 0.169 B L1
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 1.63e-01 0.101 0.072 0.169 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0398 0.0579 0.169 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0949 0.0654 0.169 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 2.56e-01 -0.119 0.104 0.169 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 4.42e-01 0.0769 0.0998 0.169 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 6.66e-01 0.0403 0.0932 0.169 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 6.45e-01 0.0354 0.0767 0.169 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 7.34e-01 0.0352 0.104 0.169 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0262 0.0718 0.169 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 2.80e-01 0.0858 0.0792 0.169 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 2.36e-01 -0.092 0.0774 0.169 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00103 0.0544 0.169 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 8.60e-01 0.0169 0.0957 0.169 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 7.85e-01 0.0283 0.104 0.169 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00712 0.0681 0.169 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 4.61e-01 0.0635 0.0858 0.169 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 2.90e-01 -0.1 0.0946 0.169 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 8.95e-01 0.00891 0.0673 0.169 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 4.24e-01 0.0772 0.0964 0.169 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 1.85e-01 0.142 0.107 0.176 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0121 0.0979 0.176 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 1.28e-01 -0.164 0.107 0.176 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0255 0.115 0.176 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00456 0.119 0.176 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 6.38e-01 0.0485 0.103 0.176 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 3.46e-02 0.179 0.0839 0.176 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0848 0.112 0.176 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 2.39e-01 -0.105 0.0886 0.169 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00565 0.0752 0.169 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 5.35e-01 0.0586 0.0943 0.169 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 2.16e-01 -0.13 0.105 0.169 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 2.62e-01 0.109 0.0965 0.169 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 4.30e-01 0.0672 0.0851 0.169 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0548 0.0693 0.169 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 4.30e-01 0.0755 0.0955 0.17 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0618 0.0886 0.17 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 3.82e-01 0.0562 0.0642 0.17 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 9.31e-01 0.00893 0.103 0.17 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 2.36e-01 -0.113 0.0948 0.17 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 1.45e-01 -0.104 0.0713 0.17 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 7.32e-01 0.035 0.102 0.17 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 2.83e-01 -0.129 0.119 0.17 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0102 0.0369 0.169 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 5.32e-01 -0.044 0.0702 0.169 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 8.33e-01 0.0217 0.103 0.169 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0115 0.074 0.169 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 1.60e-01 0.162 0.115 0.169 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0663 0.0842 0.169 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 7.36e-01 0.0253 0.0749 0.169 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0533 0.0898 0.169 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 2.87e-01 0.0796 0.0747 0.169 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0881 0.0868 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0271 0.0236 0.161 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 9.05e-01 0.0147 0.123 0.161 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 8.28e-02 -0.157 0.0901 0.161 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 7.31e-01 0.0444 0.129 0.161 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 8.71e-01 0.0203 0.125 0.161 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 5.67e-03 0.354 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 1.36e-01 -0.183 0.122 0.161 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0339 0.123 0.161 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0463 0.101 0.161 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0314 0.102 0.161 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 1.70e-04 0.354 0.092 0.161 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 5.15e-01 0.0316 0.0485 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0299 0.121 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0921 0.0645 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0807 0.0957 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 1.76e-01 0.144 0.106 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 3.76e-01 0.106 0.12 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 2.14e-01 0.123 0.0987 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0796 0.106 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 2.02e-01 0.143 0.111 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 3.58e-01 0.108 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 2.19e-01 -0.138 0.112 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 8.93e-01 0.00599 0.0443 0.166 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 5.33e-02 -0.225 0.116 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0633 0.0762 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0115 0.104 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 2.73e-01 -0.126 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 4.99e-01 0.0772 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 8.32e-01 0.0217 0.102 0.166 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0541 0.107 0.166 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0508 0.11 0.166 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 1.71e-01 0.154 0.112 0.166 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0494 0.102 0.166 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 3.59e-01 0.0567 0.0617 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 1.92e-01 -0.146 0.111 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0936 0.0578 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 7.61e-01 0.025 0.0822 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 1.14e-01 0.154 0.097 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 6.10e-02 0.203 0.108 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 5.42e-02 -0.158 0.0817 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0653 0.0893 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 1.26e-01 -0.186 0.121 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 8.59e-01 0.0209 0.118 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 9.48e-02 0.184 0.11 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 9.90e-01 0.000658 0.0539 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 2.95e-01 -0.116 0.11 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0672 0.0589 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 2.08e-01 -0.115 0.0912 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0189 0.106 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00813 0.117 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 5.81e-01 0.0561 0.101 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00831 0.101 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 1.19e-01 -0.165 0.105 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0857 0.122 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0958 0.105 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 5.92e-02 -0.224 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.27e-01 0.0948 0.119 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0407 0.104 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 4.32e-02 0.231 0.114 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 3.56e-01 -0.112 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 3.91e-01 -0.1 0.116 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 6.44e-01 0.0407 0.0879 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 6.17e-01 0.0508 0.101 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0426 0.0781 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 7.93e-01 0.0224 0.0852 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0294 0.0923 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0253 0.0645 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 8.06e-01 0.0228 0.0924 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 8.89e-01 -0.015 0.107 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 3.43e-01 0.0783 0.0824 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 1.19e-01 0.161 0.103 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0701 0.0966 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 5.24e-01 0.0405 0.0634 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 6.49e-01 0.0506 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 8.46e-01 0.0208 0.107 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0152 0.103 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 2.27e-01 0.134 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 1.52e-01 -0.15 0.104 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 6.05e-01 0.0486 0.094 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0588 0.101 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 7.11e-01 0.0383 0.103 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 2.49e-01 0.0954 0.0825 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00987 0.112 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 9.85e-02 -0.183 0.11 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 3.49e-01 0.0884 0.0943 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 9.45e-01 0.00809 0.117 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00417 0.108 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0677 0.107 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 8.84e-01 0.0141 0.0961 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 8.69e-02 0.175 0.102 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0612 0.111 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 9.10e-01 0.00831 0.0731 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 8.37e-01 0.0232 0.113 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 6.64e-02 -0.208 0.112 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 1.84e-01 0.135 0.101 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0614 0.105 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 9.55e-01 0.00649 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0594 0.113 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0384 0.101 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0489 0.11 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0016 0.114 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0343 0.108 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0286 0.115 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 2.57e-01 0.14 0.123 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 3.17e-01 -0.118 0.118 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 5.38e-01 0.0638 0.103 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 4.22e-01 0.0916 0.114 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 1.42e-01 0.06 0.0407 0.169 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 7.01e-01 0.0441 0.115 0.169 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0198 0.112 0.169 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00547 0.0991 0.169 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 2.34e-01 0.141 0.118 0.169 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 3.88e-01 -0.105 0.121 0.169 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 3.29e-01 0.0983 0.101 0.169 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 1.06e-01 -0.185 0.114 0.169 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 8.37e-01 -0.023 0.112 0.169 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0125 0.0991 0.169 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 7.42e-01 0.0401 0.122 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0432 0.088 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0268 0.102 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 1.37e-01 -0.176 0.118 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 6.36e-01 0.055 0.116 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 1.58e-02 -0.252 0.103 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 8.23e-01 0.0247 0.11 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 5.14e-01 0.0762 0.116 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 4.38e-01 0.082 0.106 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0725 0.103 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 6.07e-01 0.0402 0.0781 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 1.96e-01 0.14 0.108 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 7.48e-01 0.0337 0.105 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 1.25e-01 -0.138 0.0894 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 3.45e-01 0.103 0.109 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 1.09e-01 -0.197 0.122 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 2.53e-01 0.129 0.113 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 8.90e-01 0.0161 0.116 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 1.44e-01 0.136 0.0926 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 5.82e-01 0.067 0.122 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 2.74e-01 -0.136 0.124 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0131 0.115 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 5.88e-01 0.0644 0.119 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 8.01e-01 0.0294 0.117 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0533 0.107 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0956 0.1 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 3.31e-01 0.0741 0.0761 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0906 0.106 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.107 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 4.40e-01 0.065 0.0841 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0303 0.11 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 2.81e-01 -0.128 0.118 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 6.09e-01 -0.047 0.0917 0.152 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 2.94e-01 -0.13 0.123 0.152 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 7.86e-01 0.0261 0.0959 0.152 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 7.58e-01 0.0425 0.138 0.152 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 5.11e-01 -0.104 0.158 0.152 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 1.47e-01 -0.141 0.0964 0.152 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 4.18e-01 -0.091 0.112 0.152 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 5.62e-01 0.0662 0.114 0.152 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 7.97e-02 0.231 0.131 0.152 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 8.40e-02 0.209 0.12 0.152 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 6.99e-01 0.0435 0.112 0.152 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0647 0.04 0.17 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 9.77e-01 0.00235 0.0811 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 3.63e-01 0.0978 0.107 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0807 0.0794 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 8.33e-01 0.024 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 8.50e-01 0.0163 0.0859 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 6.14e-01 0.0472 0.0934 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 1.57e-01 -0.113 0.0797 0.17 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 9.20e-01 0.00745 0.0742 0.17 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00864 0.0812 0.17 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 4.20e-01 0.0915 0.113 0.169 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0508 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0211 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 5.07e-01 0.0746 0.112 0.169 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 9.46e-01 0.00789 0.116 0.169 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 5.78e-01 0.0525 0.0942 0.169 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 1.82e-01 0.138 0.103 0.178 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0704 0.1 0.178 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 2.45e-01 -0.151 0.129 0.178 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 2.92e-01 0.124 0.117 0.178 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0109 0.122 0.178 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0412 0.114 0.178 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 2.60e-01 0.1 0.0889 0.178 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 9.90e-01 0.00127 0.102 0.178 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 3.18e-01 -0.101 0.101 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0366 0.0764 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0267 0.101 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0899 0.114 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 2.74e-01 0.112 0.102 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 6.62e-02 0.161 0.0874 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000411 0.0751 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 9.45e-01 0.00758 0.11 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.58e-01 0.0625 0.084 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 5.28e-01 0.0647 0.102 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0445 0.12 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 4.41e-01 0.0869 0.112 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0268 0.104 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 1.38e-01 -0.12 0.0808 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0725 0.133 0.179 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 3.09e-01 0.127 0.124 0.179 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 2.13e-01 0.117 0.0932 0.179 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00381 0.124 0.179 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0785 0.13 0.179 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 5.87e-01 0.0659 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 1.26e-01 0.188 0.122 0.179 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0131 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00624 0.111 0.179 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0291 0.11 0.176 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 1.07e-01 -0.161 0.0996 0.176 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 9.95e-02 0.194 0.117 0.176 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 9.12e-01 0.0122 0.11 0.176 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 9.08e-02 0.192 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 7.93e-01 -0.029 0.11 0.176 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0202 0.0963 0.176 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 3.40e-01 -0.105 0.11 0.176 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0136 0.101 0.176 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 7.73e-01 0.0351 0.121 0.176 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0798 0.106 0.176 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0244 0.102 0.176 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0858 0.098 0.176 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 1.46e-01 -0.133 0.0909 0.176 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 5.19e-01 0.0869 0.135 0.164 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.04e-01 0.0979 0.117 0.164 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 9.23e-01 -0.012 0.124 0.164 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0129 0.124 0.164 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 1.31e-01 0.196 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 7.31e-02 0.202 0.112 0.164 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 2.77e-01 0.0952 0.0873 0.164 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0196 0.116 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 9.87e-01 0.000902 0.0559 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 1.51e-01 -0.161 0.112 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0915 0.0588 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 6.83e-01 -0.038 0.0929 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0183 0.0957 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 1.56e-01 0.153 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 6.11e-01 0.0411 0.0808 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 1.64e-01 -0.134 0.0963 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 5.72e-01 0.063 0.111 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 1.50e-01 0.168 0.116 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0616 0.116 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -544204 sc-eQTL 6.49e-01 0.0297 0.0651 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 9.59e-02 -0.177 0.106 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 5.39e-02 -0.101 0.0522 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0362 0.0753 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 4.66e-01 0.0673 0.0921 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 1.86e-01 0.139 0.105 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 1.21e-01 -0.122 0.0784 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0401 0.0826 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 198068 sc-eQTL 5.05e-02 -0.232 0.118 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000669 0.121 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -260045 sc-eQTL 4.95e-01 0.0755 0.11 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0662 0.0931 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 9.20e-01 0.00757 0.0754 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 8.70e-01 0.0159 0.097 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 3.29e-01 -0.112 0.114 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 1.70e-01 0.134 0.0977 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 2.75e-01 0.0932 0.0852 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0612 0.0699 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 2.08e-01 -0.135 0.107 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0633 0.0933 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 2.73e-01 0.124 0.113 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0687 0.109 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 7.57e-01 0.0334 0.108 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0603 0.0937 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0851 0.0807 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -182580 sc-eQTL 4.53e-01 0.0759 0.101 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 240593 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0707 0.0984 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 106581 sc-eQTL 4.48e-01 0.0512 0.0674 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 657435 sc-eQTL 7.79e-01 0.0291 0.104 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 529768 sc-eQTL 2.05e-01 -0.122 0.0957 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -124609 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0416 0.0778 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 59960 sc-eQTL 5.35e-01 0.065 0.104 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -182645 sc-eQTL 9.31e-02 -0.206 0.122 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 240593 eQTL 2.58e-03 0.0955 0.0316 0.0 0.0 0.181
ENSG00000136048 DRAM1 59960 eQTL 0.00955 0.0462 0.0178 0.0 0.0 0.181
ENSG00000196091 MYBPC1 369187 pQTL 0.0438 -0.0456 0.0226 0.00106 0.0 0.179
ENSG00000258230 AC063950.1 163785 eQTL 0.0317 0.0743 0.0346 0.0 0.0 0.181

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 240593 1.59e-06 2.66e-06 2.59e-07 1.86e-06 4.73e-07 7.82e-07 1.25e-06 3.9e-07 1.78e-06 7.25e-07 2.02e-06 1.29e-06 2.72e-06 1.02e-06 4.61e-07 1.11e-06 1.07e-06 1.05e-06 5.76e-07 7.55e-07 6.48e-07 1.96e-06 1.6e-06 6.79e-07 2.58e-06 7.53e-07 1.22e-06 1.01e-06 1.63e-06 1.66e-06 8.65e-07 2.78e-07 3.84e-07 5.79e-07 8.57e-07 5.31e-07 7.06e-07 3.37e-07 4.78e-07 2.3e-07 1.98e-07 2.73e-06 5.87e-07 1.93e-07 2.24e-07 3.22e-07 2.46e-07 4.85e-08 2.79e-07