Genes within 1Mb (chr12:101918745:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 9.99e-01 6.83e-05 0.0686 0.081 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0955 0.119 0.081 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0514 0.0725 0.081 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 7.76e-01 0.0299 0.105 0.081 B L1
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 1.71e-01 0.163 0.119 0.081 B L1
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 1.46e-01 0.149 0.102 0.081 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0789 0.0819 0.081 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 3.11e-02 0.2 0.0921 0.081 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 4.88e-01 -0.103 0.148 0.081 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 1.03e-02 0.361 0.139 0.081 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 2.15e-01 0.164 0.132 0.081 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 3.28e-01 -0.105 0.107 0.081 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 3.50e-02 -0.304 0.143 0.081 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 2.35e-01 0.119 0.1 0.081 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 3.66e-01 -0.1 0.111 0.081 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 2.60e-01 -0.122 0.108 0.081 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 9.47e-01 0.00506 0.076 0.081 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0025 0.137 0.081 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 1.43e-02 -0.362 0.146 0.081 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 8.59e-01 0.0173 0.0974 0.081 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0522 0.123 0.081 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 2.36e-01 0.161 0.135 0.081 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 1.27e-01 0.147 0.0959 0.081 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 4.43e-01 0.106 0.138 0.081 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0292 0.154 0.079 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 2.90e-01 -0.149 0.14 0.079 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 7.56e-01 0.0482 0.155 0.079 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 5.07e-01 -0.11 0.166 0.079 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0113 0.172 0.079 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0708 0.148 0.079 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 3.64e-02 0.254 0.121 0.079 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 2.70e-01 -0.177 0.16 0.079 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0928 0.126 0.081 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0352 0.107 0.081 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 3.49e-01 0.126 0.134 0.081 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 1.49e-01 -0.216 0.149 0.081 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0168 0.138 0.081 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 5.42e-01 0.0739 0.121 0.081 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 6.11e-05 0.389 0.095 0.081 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 9.25e-02 -0.228 0.135 0.082 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 3.99e-03 -0.359 0.123 0.082 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 1.51e-01 0.131 0.0908 0.082 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0319 0.147 0.082 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 3.77e-02 0.279 0.134 0.082 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0842 0.102 0.082 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 4.33e-01 0.114 0.145 0.082 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 8.06e-01 0.0418 0.17 0.082 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0556 0.0514 0.081 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0535 0.0982 0.081 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 1.64e-02 -0.343 0.142 0.081 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 2.23e-01 0.126 0.103 0.081 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0326 0.162 0.081 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 6.34e-01 0.0562 0.118 0.081 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 3.36e-01 0.101 0.105 0.081 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 7.05e-01 0.0477 0.126 0.081 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 3.14e-01 -0.105 0.104 0.081 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0891 0.122 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 7.31e-02 0.0597 0.0331 0.082 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 1.15e-01 0.273 0.172 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 8.18e-01 0.0295 0.128 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 1.14e-01 0.287 0.181 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 4.72e-01 0.127 0.176 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 2.40e-02 -0.408 0.179 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 3.45e-01 0.164 0.173 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 4.92e-01 0.12 0.174 0.082 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00701 0.143 0.082 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0228 0.144 0.082 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 9.13e-01 0.0147 0.135 0.082 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0939 0.0696 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 5.47e-02 -0.333 0.172 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0308 0.0934 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 3.28e-01 0.135 0.138 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 8.21e-01 0.0348 0.153 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 1.27e-01 0.263 0.172 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0477 0.143 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 8.13e-02 0.266 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 2.81e-01 -0.173 0.16 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 1.85e-01 0.224 0.168 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0482 0.162 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0429 0.0634 0.08 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 5.67e-02 -0.318 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0788 0.109 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 2.93e-01 0.157 0.149 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 4.60e-01 0.122 0.164 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.02e-01 0.0202 0.164 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 3.59e-01 0.134 0.146 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.70e-01 0.21 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 4.36e-01 0.123 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 9.79e-02 0.267 0.161 0.08 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 2.24e-01 -0.179 0.147 0.08 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 1.62e-01 -0.122 0.0873 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 3.59e-01 -0.146 0.159 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0852 0.0823 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0239 0.117 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 5.90e-02 0.261 0.137 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 8.50e-01 0.0292 0.155 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00571 0.117 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.96e-02 0.295 0.125 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0803 0.172 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 6.49e-02 0.309 0.166 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 1.82e-02 0.369 0.155 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 4.20e-01 -0.063 0.0781 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 8.27e-01 0.0351 0.16 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0875 0.0856 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 5.99e-01 0.07 0.133 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 3.18e-01 -0.154 0.154 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 2.05e-01 0.214 0.169 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0691 0.147 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.26e-01 0.223 0.145 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 2.53e-01 0.176 0.153 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 2.55e-01 0.202 0.177 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 5.51e-01 0.0912 0.153 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 1.93e-01 -0.214 0.164 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 5.42e-02 -0.317 0.164 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 2.23e-01 0.176 0.144 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 6.22e-01 0.0785 0.159 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 2.52e-01 0.193 0.168 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 7.66e-01 0.0481 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0985 0.124 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 5.34e-02 -0.275 0.142 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 3.13e-01 0.111 0.11 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 9.02e-01 0.0148 0.12 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 1.24e-01 -0.2 0.129 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0272 0.0909 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 8.18e-01 0.0302 0.131 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 9.10e-03 -0.392 0.149 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 7.22e-01 0.0418 0.117 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 1.88e-02 -0.343 0.145 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0902 0.137 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 6.34e-01 0.043 0.09 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 1.14e-01 -0.248 0.156 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 3.19e-01 -0.151 0.151 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 7.42e-01 0.0481 0.146 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 5.20e-01 0.102 0.158 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0992 0.149 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 6.36e-01 0.0633 0.133 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0163 0.143 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 8.63e-02 -0.252 0.146 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 8.57e-01 0.0213 0.118 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 3.04e-01 -0.164 0.159 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 7.98e-01 0.0404 0.157 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 8.22e-01 0.0303 0.134 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.76e-01 -0.226 0.166 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 1.59e-01 -0.214 0.151 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 1.10e-02 -0.382 0.149 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00308 0.136 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00124 0.144 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 3.29e-01 0.153 0.156 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 4.25e-02 0.208 0.102 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 2.03e-01 0.203 0.159 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 2.53e-01 0.184 0.16 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 8.63e-02 -0.247 0.143 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 8.68e-01 0.0248 0.149 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 2.35e-01 -0.193 0.162 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 3.94e-01 0.136 0.16 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 3.75e-03 -0.411 0.14 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 7.60e-01 0.0478 0.156 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 5.60e-01 0.0962 0.165 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 4.04e-02 -0.319 0.154 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 2.91e-01 0.177 0.167 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 3.43e-01 0.17 0.179 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 4.48e-01 0.13 0.171 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0934 0.15 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 4.20e-01 -0.133 0.165 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0602 0.0575 0.08 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 2.24e-01 -0.196 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 8.78e-02 -0.268 0.157 0.08 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 7.89e-01 0.0374 0.14 0.08 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 9.30e-01 0.0147 0.168 0.08 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 8.80e-01 0.0258 0.171 0.08 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 9.79e-01 0.00383 0.142 0.08 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 3.52e-01 0.15 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0725 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0743 0.14 0.08 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 3.63e-01 -0.156 0.172 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 2.07e-01 -0.157 0.124 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 2.86e-01 -0.153 0.143 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 8.70e-01 0.0275 0.168 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 1.83e-01 0.218 0.163 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 5.42e-01 0.0904 0.148 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0553 0.156 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0234 0.165 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 6.76e-01 -0.063 0.151 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 1.80e-02 -0.347 0.145 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 1.69e-02 0.265 0.11 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0318 0.155 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 2.30e-01 0.179 0.149 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0484 0.128 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 7.00e-01 0.0599 0.155 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 2.54e-02 0.389 0.173 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 1.44e-01 -0.226 0.155 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 1.39e-01 -0.235 0.159 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0754 0.128 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 2.84e-01 0.179 0.167 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0877 0.171 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 9.73e-01 0.00531 0.159 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 9.87e-02 0.269 0.162 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0037 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 4.98e-01 -0.103 0.152 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 3.38e-03 -0.414 0.14 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 3.96e-01 0.092 0.108 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 1.55e-01 -0.215 0.15 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 3.14e-01 0.153 0.152 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 2.75e-01 -0.131 0.119 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 3.28e-01 0.153 0.156 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 8.63e-02 -0.288 0.167 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 6.25e-01 0.0636 0.13 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 9.50e-01 0.0111 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 3.60e-01 0.124 0.135 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00708 0.195 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 8.91e-01 0.0308 0.224 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00322 0.138 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0235 0.159 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 3.49e-01 0.151 0.161 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 4.61e-02 -0.371 0.184 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 4.99e-01 -0.116 0.171 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0981 0.159 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0343 0.0556 0.083 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0155 0.112 0.083 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 8.50e-02 -0.256 0.148 0.083 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 2.02e-01 0.14 0.11 0.083 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0688 0.157 0.083 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 1.84e-01 0.158 0.118 0.083 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 2.70e-01 0.142 0.129 0.083 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.11 0.083 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 1.48e-01 -0.148 0.102 0.083 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 2.85e-01 -0.12 0.112 0.083 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 7.20e-01 0.0576 0.16 0.081 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 8.85e-02 -0.283 0.166 0.081 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 7.76e-01 0.0415 0.146 0.081 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0413 0.159 0.081 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000994 0.164 0.081 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 6.37e-02 0.246 0.132 0.081 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 1.84e-01 0.201 0.151 0.076 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 3.21e-01 -0.147 0.147 0.076 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 7.37e-01 0.064 0.191 0.076 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 4.20e-01 -0.139 0.172 0.076 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.63e-01 0.00827 0.179 0.076 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 8.12e-01 0.04 0.168 0.076 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 3.76e-02 0.271 0.13 0.076 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0186 0.149 0.076 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0179 0.144 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 2.13e-01 -0.135 0.108 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 8.49e-01 0.0274 0.144 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0215 0.162 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0216 0.145 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 4.74e-01 0.0893 0.125 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.47e-03 0.335 0.104 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 4.80e-01 -0.11 0.155 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 5.22e-01 0.0763 0.119 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 5.90e-01 0.0781 0.145 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 3.21e-01 -0.168 0.169 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 2.55e-01 0.182 0.159 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 3.50e-01 0.138 0.147 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 5.46e-04 0.392 0.112 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 6.14e-01 0.101 0.2 0.082 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 7.02e-02 -0.339 0.186 0.082 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 6.67e-01 -0.061 0.142 0.082 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 2.48e-01 0.216 0.186 0.082 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0529 0.196 0.082 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 2.50e-01 0.21 0.182 0.082 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 3.70e-01 0.167 0.185 0.082 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0254 0.183 0.082 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 9.92e-01 0.00159 0.167 0.082 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00476 0.158 0.082 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0972 0.144 0.082 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 3.62e-01 0.154 0.169 0.082 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 3.87e-02 -0.326 0.157 0.082 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.76e-01 0.0049 0.164 0.082 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 9.61e-01 0.00778 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.44e-02 0.337 0.137 0.082 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 3.40e-01 -0.15 0.157 0.084 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 9.50e-01 0.0091 0.145 0.084 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 3.42e-01 0.165 0.174 0.084 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 6.70e-01 -0.065 0.152 0.084 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0321 0.146 0.084 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00309 0.141 0.084 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 8.60e-02 0.224 0.13 0.084 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 4.54e-02 -0.364 0.181 0.085 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 4.10e-02 -0.324 0.157 0.085 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 5.19e-01 0.109 0.168 0.085 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 4.34e-01 -0.131 0.167 0.085 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 6.52e-01 0.0797 0.176 0.085 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 7.70e-01 -0.045 0.154 0.085 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 8.95e-01 0.0157 0.119 0.085 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 4.59e-01 -0.117 0.158 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0723 0.0792 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 1.57e-01 -0.226 0.159 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0401 0.0838 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 1.56e-01 0.187 0.131 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 3.67e-01 0.123 0.135 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.40e-01 0.0117 0.154 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 8.85e-01 0.0166 0.115 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.58e-02 0.329 0.135 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0569 0.158 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 1.28e-01 0.252 0.165 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0594 0.164 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -562999 sc-eQTL 9.95e-02 -0.153 0.0926 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 6.14e-01 -0.077 0.152 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0849 0.0751 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00827 0.108 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 3.08e-01 0.135 0.132 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 5.18e-01 0.0974 0.15 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0587 0.113 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 2.61e-02 0.262 0.117 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 179273 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0202 0.171 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 2.87e-02 0.378 0.172 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -278840 sc-eQTL 1.61e-02 0.379 0.156 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0663 0.132 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 6.41e-01 -0.05 0.107 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 4.25e-01 0.11 0.138 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 4.57e-01 -0.121 0.163 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 7.09e-01 0.052 0.139 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 2.52e-01 0.139 0.121 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 2.81e-05 0.408 0.0954 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 4.42e-01 -0.118 0.153 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 9.95e-01 0.000787 0.134 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 2.37e-01 0.192 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 2.56e-01 -0.177 0.156 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00918 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 8.57e-01 0.0242 0.135 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.14e-02 0.292 0.114 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -201375 sc-eQTL 1.94e-01 -0.187 0.144 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 221798 sc-eQTL 7.79e-03 -0.373 0.139 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 87786 sc-eQTL 1.86e-01 0.128 0.0962 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 638640 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0912 0.148 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 510973 sc-eQTL 4.39e-01 0.106 0.137 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -143404 sc-eQTL 3.02e-01 -0.115 0.111 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 41165 sc-eQTL 1.61e-01 0.209 0.149 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -201440 sc-eQTL 4.60e-01 0.13 0.176 0.082 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 41165 eQTL 8.36e-32 0.284 0.0233 0.0 0.0 0.0824


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 41165 1.83e-05 1.62e-05 2.57e-06 9e-06 2.36e-06 8.57e-06 2.25e-05 2.18e-06 1.55e-05 7.35e-06 2.06e-05 7.15e-06 2.88e-05 5.77e-06 4.91e-06 9.51e-06 8.06e-06 1.12e-05 4.28e-06 3.16e-06 7.18e-06 1.58e-05 1.42e-05 4.68e-06 2.73e-05 4.75e-06 8e-06 7.09e-06 1.62e-05 1.38e-05 1.01e-05 1.03e-06 1.34e-06 3.64e-06 5.85e-06 3.63e-06 1.77e-06 2.14e-06 2.08e-06 1.3e-06 8.78e-07 1.89e-05 2.69e-06 2.81e-07 9.2e-07 2.28e-06 2.57e-06 7.39e-07 9.89e-07