logo

Genes within 1Mb (chr12:101870178:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 3.42e-01 0.0427 0.0448 0.244 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 7.28e-01 0.0272 0.0782 0.244 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.14e-01 0.0749 0.0472 0.244 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0911 0.0685 0.244 B L1
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0931 0.0779 0.244 B L1
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 4.40e-01 0.0518 0.0671 0.244 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 6.88e-02 0.0976 0.0534 0.244 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 7.75e-02 -0.107 0.0606 0.244 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 4.28e-01 0.0769 0.0968 0.244 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 1.36e-01 -0.138 0.0923 0.244 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 4.03e-01 0.0723 0.0864 0.244 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 5.83e-02 0.134 0.0701 0.244 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.77e-03 0.283 0.0935 0.244 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0513 0.0661 0.244 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0649 0.0731 0.244 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0575 0.0715 0.244 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 5.46e-01 0.0303 0.0501 0.244 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0119 0.0879 0.244 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.35e-03 0.302 0.0929 0.244 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0769 0.0623 0.244 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0323 0.0788 0.244 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0453 0.087 0.244 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 8.49e-01 0.0118 0.0618 0.244 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0445 0.0885 0.244 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0588 0.0974 0.241 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 4.42e-01 0.0686 0.089 0.241 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.60e-03 -0.269 0.0962 0.241 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 9.09e-01 -0.012 0.105 0.241 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 9.58e-01 0.00579 0.109 0.241 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 5.42e-01 0.0571 0.0935 0.241 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 3.99e-03 -0.22 0.0757 0.241 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 2.62e-01 -0.114 0.102 0.241 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 6.60e-01 0.036 0.0819 0.244 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.19e-01 0.108 0.0689 0.244 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 1.89e-01 -0.114 0.0866 0.244 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0405 0.0969 0.244 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 1.27e-01 -0.136 0.0887 0.244 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 1.10e-01 0.125 0.078 0.244 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 5.80e-01 0.0355 0.064 0.244 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0955 0.0882 0.245 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.40e-06 0.386 0.0777 0.245 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 9.64e-03 -0.153 0.0586 0.245 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0208 0.0958 0.245 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 6.59e-01 0.0388 0.088 0.245 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 2.97e-03 0.195 0.065 0.245 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 9.94e-01 0.00066 0.0944 0.245 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 4.94e-02 -0.217 0.11 0.245 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 3.72e-01 0.03 0.0336 0.244 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0716 0.0639 0.244 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.24e-02 0.232 0.0922 0.244 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 9.71e-01 0.00246 0.0675 0.244 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0634 0.105 0.244 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00467 0.0769 0.244 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00158 0.0683 0.244 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 1.96e-01 0.106 0.0816 0.244 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0182 0.0683 0.244 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 9.15e-02 0.134 0.0789 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 7.26e-01 0.0075 0.0213 0.25 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 4.31e-01 0.0873 0.111 0.25 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 5.10e-02 0.159 0.0809 0.25 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 1.97e-01 -0.15 0.116 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 6.67e-02 0.205 0.111 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 3.64e-01 0.106 0.116 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 3.01e-01 0.114 0.11 0.25 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 4.60e-02 -0.221 0.11 0.25 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0209 0.0913 0.25 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 2.29e-02 0.208 0.0905 0.25 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 8.71e-01 -0.014 0.0863 0.25 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 1.95e-01 0.0567 0.0436 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 3.24e-01 0.108 0.109 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.48e-01 0.0677 0.0584 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0508 0.0865 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 1.33e-01 -0.144 0.0957 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0189 0.108 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0303 0.0894 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 3.91e-03 -0.275 0.0941 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 6.49e-02 0.186 0.1 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 5.86e-02 -0.2 0.105 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 3.93e-01 0.0867 0.101 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 7.47e-01 0.0133 0.0413 0.241 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 7.29e-02 0.195 0.108 0.241 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.43e-01 0.104 0.0708 0.241 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 2.02e-02 -0.225 0.0962 0.241 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 1.03e-01 -0.174 0.106 0.241 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 3.55e-01 0.0984 0.106 0.241 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 8.91e-01 0.0131 0.0952 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0345 0.0998 0.241 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 2.15e-01 0.127 0.102 0.241 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 8.96e-01 0.0137 0.105 0.241 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 3.43e-01 0.0907 0.0955 0.241 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 7.23e-01 0.02 0.0564 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0736 0.102 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.64e-01 0.0592 0.0529 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 9.70e-01 0.00279 0.075 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0387 0.0891 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0528 0.0994 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.80e-01 0.021 0.0752 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 8.52e-02 -0.14 0.081 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 8.84e-01 0.0161 0.111 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0582 0.108 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 6.15e-01 0.0509 0.101 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 4.82e-01 0.0341 0.0484 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 2.55e-01 0.113 0.099 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 4.42e-01 0.0409 0.0531 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0539 0.0823 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0559 0.0954 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0228 0.105 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 3.93e-01 0.078 0.0911 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 1.71e-01 -0.124 0.09 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 9.41e-01 0.00709 0.0952 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0742 0.11 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 4.64e-01 0.0694 0.0945 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0078 0.11 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.38e-02 0.269 0.108 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 4.70e-01 0.0694 0.0958 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 4.76e-02 -0.208 0.104 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 1.22e-01 0.173 0.111 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0773 0.107 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 2.13e-02 0.185 0.0797 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 5.21e-03 0.258 0.0914 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 1.29e-01 -0.109 0.0714 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0268 0.0782 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 1.67e-01 -0.117 0.0843 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 2.30e-01 0.071 0.059 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 7.31e-01 0.0298 0.0865 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.48e-03 0.299 0.0976 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 8.77e-01 -0.012 0.0773 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0593 0.0966 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 6.23e-01 0.0446 0.0904 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.36e-01 0.0201 0.0593 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0978 0.102 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.41e-02 0.239 0.0965 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 2.68e-01 -0.104 0.094 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0393 0.102 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00558 0.0964 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.26e-01 0.0303 0.0863 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 6.69e-01 0.0396 0.0925 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.75e-01 0.104 0.0946 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0838 0.0757 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 2.11e-01 -0.128 0.102 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 1.72e-01 -0.138 0.101 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.90e-01 0.0231 0.0866 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0897 0.108 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 5.42e-01 0.0601 0.0982 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.12e-03 0.315 0.0953 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0492 0.0877 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 2.19e-01 -0.115 0.093 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 3.15e-01 0.102 0.101 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0408 0.0667 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0672 0.103 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 8.80e-01 -0.016 0.105 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.14e-02 0.237 0.0929 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 4.81e-01 -0.069 0.0976 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00863 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 2.42e-01 -0.122 0.104 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 3.48e-01 0.0879 0.0935 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0723 0.102 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 1.77e-01 0.145 0.107 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 7.93e-02 0.178 0.101 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0613 0.109 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 1.98e-01 0.151 0.117 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0683 0.112 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 3.11e-01 0.0991 0.0976 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 8.35e-01 0.0225 0.108 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000323 0.0371 0.242 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0516 0.104 0.242 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.62e-03 0.302 0.0992 0.242 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0217 0.0899 0.242 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0307 0.108 0.242 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0123 0.11 0.242 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.51e-01 -0.029 0.0914 0.242 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 6.54e-01 0.0465 0.104 0.242 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 7.00e-02 -0.184 0.101 0.242 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 2.37e-01 0.106 0.0896 0.242 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 6.42e-01 0.0517 0.111 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.71e-02 0.19 0.0792 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0402 0.0928 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 1.66e-01 -0.15 0.108 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0508 0.106 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0257 0.0957 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0024 0.101 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 2.59e-02 -0.236 0.105 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 1.09e-01 -0.155 0.0966 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.62e-05 0.391 0.091 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.03e-02 -0.14 0.0711 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000247 0.0997 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0671 0.0963 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 3.67e-03 0.238 0.0809 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 5.82e-01 0.0552 0.1 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0833 0.113 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 7.28e-01 0.0361 0.104 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.05e-01 0.135 0.106 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 6.96e-03 -0.229 0.084 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 1.63e-01 0.156 0.111 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 9.84e-01 0.00231 0.114 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 1.00e-01 0.174 0.105 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 3.25e-01 -0.107 0.109 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0359 0.107 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 8.21e-01 0.0225 0.0989 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 7.51e-06 0.405 0.0882 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 1.29e-02 -0.174 0.0693 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 4.44e-01 0.0751 0.0979 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 1.80e-01 0.132 0.0982 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 1.12e-01 0.123 0.0772 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 6.55e-01 0.0452 0.101 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 7.17e-01 0.0396 0.109 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 9.81e-01 0.0019 0.08 0.267 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 2.92e-01 -0.113 0.107 0.267 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0291 0.0835 0.267 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 1.67e-02 -0.284 0.117 0.267 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 8.86e-01 0.0198 0.138 0.267 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 9.13e-01 0.00928 0.0847 0.267 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0162 0.0977 0.267 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0984 0.267 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 1.73e-01 -0.157 0.114 0.267 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 3.98e-02 -0.216 0.104 0.267 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 5.20e-03 -0.269 0.0943 0.267 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 4.81e-01 0.0262 0.0371 0.243 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 7.44e-01 0.0245 0.075 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 4.92e-02 0.195 0.0985 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0285 0.0735 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0967 0.105 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0426 0.0793 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 4.36e-01 0.0673 0.0862 0.243 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 6.42e-01 0.0344 0.074 0.243 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 7.99e-01 0.0175 0.0686 0.243 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 1.43e-01 0.11 0.0746 0.243 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 3.78e-01 0.0917 0.104 0.244 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 6.26e-04 0.366 0.105 0.244 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 6.07e-01 0.0487 0.0945 0.244 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 4.87e-01 0.0716 0.103 0.244 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 1.96e-01 -0.138 0.106 0.244 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 6.95e-02 -0.157 0.0859 0.244 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 6.20e-02 -0.18 0.0957 0.234 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 6.87e-01 -0.038 0.0942 0.234 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 2.51e-02 -0.271 0.12 0.234 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00454 0.11 0.234 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 2.93e-01 -0.12 0.114 0.234 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0149 0.107 0.234 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 9.26e-02 -0.14 0.0829 0.234 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0223 0.0953 0.234 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 2.46e-01 0.108 0.0925 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 4.51e-02 0.14 0.0694 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0495 0.0928 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0289 0.104 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0908 0.0934 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 5.14e-01 0.0527 0.0806 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00837 0.0688 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0702 0.1 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 2.97e-01 0.0802 0.0768 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 3.56e-02 -0.196 0.0927 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 2.05e-01 -0.139 0.109 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 1.90e-01 -0.135 0.103 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 1.98e-01 0.123 0.095 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 3.42e-01 0.0706 0.0742 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 1.49e-02 -0.309 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 5.34e-01 0.0748 0.12 0.23 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00995 0.0905 0.23 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 5.42e-01 0.0731 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0391 0.125 0.23 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0019 0.117 0.23 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 6.04e-02 0.222 0.117 0.23 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 2.70e-01 -0.129 0.116 0.23 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 2.88e-01 0.113 0.106 0.23 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 1.82e-01 0.134 0.1 0.247 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 5.61e-01 0.0535 0.092 0.247 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 3.03e-01 0.111 0.108 0.247 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 8.88e-01 0.0142 0.101 0.247 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 4.73e-02 -0.207 0.104 0.247 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 6.60e-01 0.0446 0.101 0.247 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0864 0.0882 0.247 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 7.33e-01 0.0345 0.101 0.242 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 3.65e-01 0.0848 0.0934 0.242 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 4.30e-01 0.0884 0.112 0.242 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0949 0.0977 0.242 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 2.60e-01 -0.106 0.0939 0.242 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 3.00e-02 0.196 0.0895 0.242 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 2.57e-01 0.0955 0.084 0.242 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 8.12e-01 0.0294 0.124 0.22 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 7.64e-01 0.0323 0.108 0.22 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.91e-02 -0.214 0.113 0.22 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 8.49e-01 0.0216 0.113 0.22 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 4.09e-01 0.0985 0.119 0.22 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0326 0.104 0.22 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 1.68e-01 -0.111 0.0799 0.22 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0827 0.107 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 1.69e-01 0.0717 0.0519 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 1.12e-01 0.166 0.104 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 8.38e-02 0.095 0.0547 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 1.94e-01 -0.112 0.0862 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0993 0.0889 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 2.84e-01 0.108 0.101 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 9.15e-01 0.00805 0.0753 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 1.89e-02 -0.211 0.089 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 5.65e-02 0.198 0.103 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0433 0.109 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 3.81e-01 0.0946 0.108 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -611566 sc-eQTL 1.47e-01 0.0857 0.059 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 8.21e-01 -0.022 0.0969 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 3.52e-01 0.0445 0.0478 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0201 0.0685 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0365 0.0839 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0392 0.0957 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 3.13e-01 0.0723 0.0715 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 6.28e-02 -0.139 0.0745 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 130706 sc-eQTL 6.38e-01 0.051 0.108 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 3.51e-01 -0.103 0.11 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -327407 sc-eQTL 4.73e-01 0.0722 0.1 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 5.51e-01 0.0509 0.0853 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 5.05e-02 0.134 0.0684 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.71e-02 -0.168 0.088 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0564 0.105 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 2.08e-01 -0.113 0.0895 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 5.47e-01 0.0471 0.0781 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 7.15e-01 0.0234 0.0641 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 4.55e-01 0.074 0.0988 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 3.64e-01 0.0784 0.0862 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 4.06e-01 0.0869 0.104 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0777 0.1 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 2.18e-01 -0.123 0.0996 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 7.27e-02 0.155 0.0861 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 7.06e-01 0.0283 0.0748 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -249942 sc-eQTL 2.15e-01 -0.115 0.0927 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 173231 sc-eQTL 1.91e-06 0.421 0.086 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 39219 sc-eQTL 5.55e-03 -0.171 0.061 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 590073 sc-eQTL 6.51e-01 0.0432 0.0953 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 462406 sc-eQTL 5.82e-01 0.0487 0.0884 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -191971 sc-eQTL 3.37e-04 0.253 0.0695 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -7402 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0135 0.0963 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -250007 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0841 0.113 0.246 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 \N 173231 1.97e-06 2.43e-06 2.4e-07 1.54e-06 4.72e-07 7.87e-07 1.33e-06 4.33e-07 1.78e-06 7.31e-07 1.92e-06 1.47e-06 3.42e-06 1.1e-06 4.05e-07 1.01e-06 1.03e-06 1.35e-06 5.7e-07 4.71e-07 7.74e-07 1.94e-06 1.78e-06 6.86e-07 3.4e-06 8.11e-07 1.01e-06 1.08e-06 1.69e-06 1.66e-06 9.44e-07 3e-07 3.55e-07 9.24e-07 9.25e-07 5.24e-07 7.08e-07 3.65e-07 4.98e-07 2.28e-07 2.87e-07 2.94e-06 3.5e-07 1.99e-07 2.22e-07 3.44e-07 3.01e-07 6.02e-08 1.56e-07
ENSG00000136048 \N -7402 2.81e-05 2.87e-05 5.66e-06 1.45e-05 4.53e-06 1.29e-05 3.78e-05 3.73e-06 2.55e-05 1.25e-05 3.19e-05 1.38e-05 4.34e-05 1.22e-05 6.11e-06 1.5e-05 1.44e-05 2.11e-05 7.46e-06 5.81e-06 1.24e-05 2.7e-05 2.66e-05 8.06e-06 3.83e-05 6.43e-06 1.12e-05 1.05e-05 2.85e-05 2.53e-05 1.68e-05 1.54e-06 2.41e-06 6.68e-06 1.04e-05 5.22e-06 2.82e-06 2.99e-06 4.24e-06 3.17e-06 1.66e-06 3.32e-05 2.88e-06 3.57e-07 2.07e-06 3.29e-06 3.8e-06 1.42e-06 1.52e-06
ENSG00000258230 \N 96423 4.51e-06 4.83e-06 7.57e-07 2.68e-06 1.12e-06 1.53e-06 4.07e-06 9.76e-07 4.94e-06 2.01e-06 4.99e-06 3.5e-06 7.12e-06 2.29e-06 1.22e-06 2.38e-06 2e-06 2.88e-06 1.41e-06 9.73e-07 1.99e-06 4.53e-06 3.78e-06 1.87e-06 7.14e-06 1.21e-06 2.41e-06 1.51e-06 4.23e-06 4.39e-06 2.53e-06 4.33e-07 7.95e-07 1.86e-06 2.04e-06 9.05e-07 9.55e-07 4.77e-07 1.25e-06 3.8e-07 3.48e-07 5.71e-06 4.63e-07 1.82e-07 3.01e-07 3.94e-07 6.79e-07 2.32e-07 1.41e-07