logo

Genes within 1Mb (chr12:101841974:GAAAC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 4.83e-01 0.0607 0.0864 0.053 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 4.34e-01 0.118 0.15 0.053 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.63e-01 -0.128 0.0911 0.053 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 3.63e-01 0.12 0.132 0.053 B L1
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 4.60e-01 -0.111 0.15 0.053 B L1
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 5.33e-01 0.0808 0.129 0.053 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 2.32e-01 -0.124 0.103 0.053 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0784 0.117 0.053 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 8.76e-01 0.0291 0.187 0.053 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 2.76e-01 0.195 0.178 0.053 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 2.14e-01 -0.207 0.166 0.053 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 9.02e-01 0.0168 0.136 0.053 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.15e-01 -0.29 0.183 0.053 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 4.19e-01 0.103 0.128 0.053 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 9.55e-01 0.00801 0.141 0.053 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0361 0.138 0.053 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 2.72e-01 -0.106 0.0964 0.053 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 7.64e-02 0.3 0.169 0.053 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 2.95e-01 -0.193 0.184 0.053 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 9.93e-02 -0.199 0.12 0.053 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 3.07e-01 0.156 0.152 0.053 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0198 0.168 0.053 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 3.38e-01 -0.115 0.119 0.053 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 1.81e-01 -0.229 0.171 0.053 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 2.63e-01 0.215 0.192 0.052 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 2.88e-01 -0.187 0.175 0.052 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 2.28e-01 -0.233 0.193 0.052 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 8.05e-01 0.0512 0.207 0.052 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 8.66e-01 0.0362 0.214 0.052 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 8.40e-01 0.0372 0.184 0.052 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 9.51e-02 -0.254 0.151 0.052 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 2.00e-01 0.257 0.2 0.052 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 4.55e-01 0.116 0.156 0.053 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 2.92e-01 -0.139 0.132 0.053 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 2.40e-01 0.194 0.165 0.053 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 4.74e-01 -0.132 0.184 0.053 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 7.29e-02 -0.304 0.169 0.053 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 5.54e-02 -0.285 0.148 0.053 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 5.17e-01 0.079 0.122 0.053 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0403 0.173 0.054 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 9.64e-01 0.00731 0.16 0.054 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.21e-01 -0.18 0.115 0.054 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 4.25e-01 0.149 0.187 0.054 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 2.58e-01 0.194 0.171 0.054 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 3.54e-01 -0.12 0.129 0.054 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 9.42e-01 0.0135 0.184 0.054 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 6.82e-01 0.0886 0.216 0.054 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0436 0.0648 0.053 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 2.13e-01 -0.154 0.123 0.053 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 2.87e-01 -0.192 0.18 0.053 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 9.53e-01 0.00765 0.13 0.053 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 3.77e-01 0.18 0.203 0.053 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0577 0.148 0.053 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 3.42e-01 -0.125 0.132 0.053 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 5.40e-01 0.0969 0.158 0.053 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 3.76e-01 -0.117 0.131 0.053 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 8.62e-01 0.0266 0.153 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 3.77e-01 0.0346 0.0391 0.061 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0826 0.203 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.46e-01 0.218 0.149 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 9.62e-01 0.0101 0.213 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 5.16e-01 0.134 0.206 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 4.13e-01 0.175 0.213 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 5.20e-01 -0.131 0.203 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 4.86e-01 -0.142 0.204 0.061 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 6.36e-01 0.0794 0.167 0.061 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 3.62e-01 0.154 0.168 0.061 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 3.36e-01 -0.152 0.158 0.061 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0386 0.0881 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 5.71e-01 0.125 0.219 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 3.39e-02 -0.249 0.117 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.01e-01 0.285 0.173 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0046 0.194 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 6.89e-01 0.0873 0.218 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0939 0.18 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0195 0.193 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 2.90e-01 0.215 0.203 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 6.34e-01 0.102 0.213 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 4.44e-02 0.409 0.202 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0284 0.0826 0.052 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 5.31e-01 0.137 0.218 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 2.48e-01 -0.164 0.142 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0776 0.195 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 7.32e-01 0.0733 0.214 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 1.17e-01 0.333 0.212 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 9.36e-02 -0.319 0.189 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 3.57e-01 -0.184 0.199 0.052 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 5.55e-01 0.122 0.205 0.052 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 7.43e-01 0.0691 0.21 0.052 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 2.08e-01 -0.241 0.191 0.052 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 1.94e-01 0.143 0.11 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0394 0.2 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 9.25e-02 -0.174 0.103 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 5.65e-02 0.279 0.146 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 1.78e-01 -0.235 0.174 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 1.79e-01 -0.262 0.194 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 1.34e-01 -0.221 0.147 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0884 0.16 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 9.50e-01 0.0135 0.217 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 3.10e-01 0.215 0.211 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 2.69e-01 -0.219 0.197 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 3.10e-01 -0.098 0.0963 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 7.92e-01 0.0523 0.198 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.26e-01 -0.162 0.105 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 8.83e-01 0.0243 0.164 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 7.60e-01 0.0582 0.19 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 5.08e-01 -0.138 0.209 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 3.28e-01 0.178 0.182 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 3.59e-01 -0.165 0.18 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 8.53e-01 0.0353 0.19 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 8.38e-01 0.0447 0.219 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00564 0.189 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 5.89e-01 0.115 0.212 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 9.91e-01 0.00239 0.213 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 7.17e-02 0.334 0.184 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 4.09e-01 -0.169 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 5.32e-02 0.417 0.215 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 4.48e-01 -0.158 0.208 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 8.70e-01 0.0258 0.157 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.07e-01 -0.292 0.18 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.83e-01 0.186 0.139 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0349 0.152 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 2.44e-01 -0.193 0.165 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 3.02e-01 -0.119 0.115 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0347 0.165 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.68e-01 -0.263 0.19 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 7.96e-01 0.0383 0.148 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0913 0.185 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 2.89e-01 0.183 0.173 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0658 0.113 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 2.77e-01 -0.215 0.197 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 2.28e-01 -0.229 0.19 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 2.81e-01 -0.197 0.183 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 3.75e-01 0.176 0.198 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0828 0.187 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0091 0.168 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 1.06e-01 0.284 0.175 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0938 0.18 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.77e-01 -0.194 0.144 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 4.85e-01 -0.136 0.195 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 3.60e-01 -0.177 0.193 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 6.27e-01 -0.08 0.164 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0729 0.205 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 3.10e-03 0.542 0.181 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 3.04e-01 -0.189 0.183 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0118 0.165 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0681 0.175 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 5.94e-01 0.102 0.19 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00865 0.125 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 2.64e-02 -0.428 0.191 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 3.83e-01 -0.177 0.203 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 9.84e-01 0.00381 0.192 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.25e-01 -0.315 0.204 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 7.98e-02 0.385 0.219 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 1.87e-01 -0.278 0.21 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 8.55e-01 0.0338 0.184 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 9.07e-01 0.0237 0.203 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0367 0.0696 0.054 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 1.41e-02 -0.476 0.192 0.054 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 4.90e-01 0.131 0.19 0.054 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 3.78e-01 -0.149 0.168 0.054 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 3.72e-01 0.181 0.202 0.054 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 5.93e-01 -0.11 0.206 0.054 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 6.43e-02 -0.316 0.17 0.054 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 5.57e-02 0.371 0.193 0.054 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 2.85e-01 -0.204 0.19 0.054 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 4.39e-01 0.131 0.169 0.054 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 6.50e-01 0.0964 0.212 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 8.99e-01 0.0196 0.153 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 2.56e-01 -0.201 0.177 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 9.60e-01 0.0103 0.207 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 9.99e-01 0.000156 0.202 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 3.04e-01 -0.188 0.182 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 7.24e-02 -0.344 0.191 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 1.91e-01 -0.265 0.202 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0771 0.193 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 7.46e-01 0.0614 0.189 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 6.19e-02 -0.266 0.142 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 1.40e-01 0.293 0.197 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 5.20e-01 -0.124 0.192 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0731 0.164 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 5.12e-01 0.131 0.199 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 2.58e-01 0.254 0.224 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 9.20e-02 -0.334 0.198 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 4.51e-01 -0.154 0.204 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 5.03e-01 -0.11 0.164 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 6.75e-01 0.09 0.214 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 8.59e-01 -0.039 0.219 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 8.57e-01 0.0367 0.204 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0975 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 8.08e-02 0.358 0.204 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0828 0.193 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00301 0.18 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0736 0.137 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 4.38e-01 0.148 0.191 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 7.13e-01 0.0709 0.192 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 2.07e-01 -0.191 0.151 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 3.68e-01 0.178 0.197 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0897 0.213 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0414 0.136 0.067 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 3.99e-01 -0.155 0.183 0.067 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 2.43e-01 -0.166 0.141 0.067 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 4.44e-01 0.157 0.204 0.067 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 3.59e-01 -0.216 0.234 0.067 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 2.94e-01 0.151 0.144 0.067 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 2.67e-01 -0.185 0.166 0.067 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 1.70e-01 -0.232 0.168 0.067 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 6.59e-02 -0.359 0.193 0.067 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00421 0.18 0.067 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 3.38e-01 -0.16 0.166 0.067 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 7.55e-01 -0.022 0.0704 0.052 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0158 0.142 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 2.62e-01 -0.211 0.188 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 3.28e-01 -0.136 0.139 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 3.92e-01 0.17 0.199 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 4.95e-01 -0.103 0.15 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 6.96e-01 0.064 0.164 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 4.44e-01 -0.107 0.14 0.052 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0551 0.13 0.052 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 5.16e-01 0.0925 0.142 0.052 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 7.12e-01 0.0734 0.199 0.053 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 8.86e-01 0.0296 0.207 0.053 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.79e-01 -0.242 0.18 0.053 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 4.28e-02 0.397 0.195 0.053 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 5.71e-01 -0.116 0.203 0.053 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 2.71e-01 -0.182 0.165 0.053 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 8.95e-02 -0.331 0.194 0.051 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00961 0.19 0.051 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.88e-02 -0.574 0.242 0.051 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 1.79e-01 -0.299 0.222 0.051 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 1.64e-01 -0.321 0.23 0.051 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 6.64e-01 0.0942 0.217 0.051 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 5.47e-01 -0.102 0.169 0.051 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 2.04e-01 0.245 0.192 0.051 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 4.61e-01 0.13 0.175 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 3.76e-01 -0.117 0.132 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 2.24e-01 0.214 0.175 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 1.79e-01 -0.265 0.197 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 1.13e-01 -0.28 0.176 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 2.25e-02 -0.347 0.151 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0936 0.13 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 4.43e-01 -0.149 0.194 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0423 0.149 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0755 0.181 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 3.21e-02 -0.452 0.21 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 5.75e-01 -0.112 0.199 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 8.34e-01 0.0387 0.184 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 4.93e-01 0.0985 0.143 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 3.42e-02 0.417 0.196 0.053 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 7.33e-01 0.0616 0.181 0.053 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.87e-01 0.28 0.211 0.053 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0166 0.199 0.053 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 6.03e-02 -0.385 0.204 0.053 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0771 0.199 0.053 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0615 0.174 0.053 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 2.86e-01 0.255 0.238 0.051 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.03e-01 -0.339 0.206 0.051 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 3.83e-01 -0.193 0.22 0.051 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 2.52e-01 0.251 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0837 0.231 0.051 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0734 0.201 0.051 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 3.38e-01 -0.149 0.155 0.051 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 1.37e-01 0.307 0.205 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0257 0.102 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 7.29e-01 0.0709 0.204 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.60e-01 -0.151 0.107 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 3.53e-01 0.157 0.169 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 8.77e-01 0.027 0.174 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 9.33e-02 0.329 0.195 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0602 0.176 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 5.69e-01 0.115 0.203 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 6.39e-01 0.0995 0.212 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 8.15e-01 0.0494 0.21 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -639770 sc-eQTL 2.88e-01 0.123 0.116 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 6.35e-01 0.0901 0.19 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 7.76e-02 -0.165 0.0929 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.42e-01 0.197 0.133 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 2.20e-01 -0.201 0.164 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 2.29e-01 -0.225 0.187 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0951 0.14 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0348 0.147 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 102502 sc-eQTL 9.88e-01 0.0032 0.212 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 4.20e-01 0.174 0.216 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -355611 sc-eQTL 3.23e-01 -0.194 0.196 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 6.97e-01 0.0638 0.164 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 4.32e-01 -0.104 0.132 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 6.00e-01 0.0893 0.17 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 1.47e-01 -0.292 0.2 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 2.23e-01 -0.21 0.172 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 1.14e-01 -0.236 0.149 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0377 0.123 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 2.50e-01 0.227 0.197 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 1.88e-01 -0.227 0.172 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 1.02e-01 0.341 0.208 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 2.01e-01 0.257 0.2 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 1.13e-01 -0.316 0.199 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 6.00e-01 -0.091 0.173 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 8.86e-01 0.0216 0.15 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278146 sc-eQTL 5.39e-01 -0.113 0.183 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 145027 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00121 0.179 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 sc-eQTL 8.42e-02 -0.211 0.122 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561869 sc-eQTL 4.33e-01 0.147 0.188 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 434202 sc-eQTL 7.95e-01 0.0453 0.174 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220175 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0478 0.141 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 sc-eQTL 5.44e-01 0.115 0.19 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -278211 sc-eQTL 2.41e-01 0.262 0.223 0.054 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 145027 eQTL 4.34e-10 -0.295 0.0468 0.0 0.0 0.0672
ENSG00000111670 GNPTAB 11015 eQTL 1.97e-03 -0.0813 0.0262 0.0 0.0 0.0672
ENSG00000136048 DRAM1 -35606 eQTL 8.95e-06 -0.118 0.0265 0.0 0.0 0.0672
ENSG00000258230 AC063950.1 68219 eQTL 0.0443 -0.105 0.052 0.0 0.0 0.0672

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 145027 3.59e-05 1.33e-05 2.63e-06 9.48e-06 2.22e-06 6.96e-06 1.56e-05 1.22e-06 1.41e-05 5.31e-06 1.61e-05 7.82e-06 1.56e-05 8.55e-06 5.53e-06 6.6e-06 6.37e-06 9.78e-06 2.55e-06 2.59e-06 6.26e-06 1.28e-05 1.29e-05 2.85e-06 1.9e-05 4.41e-06 5.33e-06 4.06e-06 1.48e-05 1.2e-05 7.01e-06 4.38e-07 9.52e-07 3.14e-06 5.21e-06 2.19e-06 1.62e-06 1.87e-06 9.23e-07 6.03e-07 2.4e-07 2.41e-05 2.72e-06 4.28e-07 7.72e-07 2.34e-06 1.79e-06 6.21e-07 4.54e-07