logo

Genes within 1Mb (chr12:101838311:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 9.60e-01 0.00223 0.0447 0.19 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0237 0.0778 0.19 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0402 0.0472 0.19 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 4.93e-03 0.191 0.0672 0.19 B L1
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 5.81e-01 0.043 0.0778 0.19 B L1
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0787 0.0667 0.19 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0419 0.0535 0.19 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 3.55e-02 0.127 0.0601 0.19 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 1.31e-01 -0.145 0.096 0.19 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0541 0.0923 0.19 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 5.21e-01 0.0553 0.0861 0.19 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 3.06e-02 -0.153 0.0704 0.19 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 6.87e-03 -0.258 0.0944 0.19 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 8.20e-08 0.346 0.0622 0.19 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0382 0.0736 0.19 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0211 0.072 0.19 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.63e-01 0.037 0.0503 0.19 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 5.60e-01 0.0518 0.0888 0.19 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 4.91e-03 -0.269 0.0945 0.19 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 3.42e-01 0.0601 0.0631 0.19 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 1.29e-04 -0.301 0.0771 0.19 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.27e-01 -0.106 0.0877 0.19 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0212 0.0625 0.19 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0252 0.0896 0.19 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 2.15e-01 0.123 0.0992 0.189 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 7.10e-01 0.0339 0.091 0.189 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 2.57e-02 0.222 0.0989 0.189 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 2.75e-02 0.235 0.106 0.189 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.86e-01 -0.118 0.111 0.189 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00804 0.0956 0.189 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0783 0.0787 0.189 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 9.13e-01 0.0114 0.104 0.189 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 5.83e-03 -0.228 0.0818 0.19 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 7.85e-01 0.0192 0.0705 0.19 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 1.05e-01 -0.143 0.0878 0.19 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 9.26e-01 0.00919 0.0986 0.19 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 4.11e-01 0.0747 0.0906 0.19 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 3.12e-01 0.0808 0.0796 0.19 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 1.74e-02 0.154 0.0642 0.19 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 1.35e-01 -0.133 0.0887 0.189 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 9.93e-04 -0.269 0.0807 0.189 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0306 0.06 0.189 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 7.06e-01 0.0364 0.0965 0.189 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 3.99e-01 0.075 0.0886 0.189 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0816 0.0667 0.189 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 9.89e-03 0.244 0.0937 0.189 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 4.71e-02 0.221 0.111 0.189 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 5.79e-01 -0.019 0.0343 0.19 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 5.71e-01 -0.037 0.0653 0.19 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 1.99e-01 -0.122 0.095 0.19 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 2.88e-02 0.15 0.0681 0.19 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0611 0.107 0.19 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 5.92e-01 -0.042 0.0783 0.19 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 6.65e-01 0.0302 0.0696 0.19 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 9.65e-01 0.00363 0.0835 0.19 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0678 0.0694 0.19 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0429 0.0809 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0179 0.021 0.194 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0111 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 5.59e-01 0.0472 0.0805 0.194 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 3.13e-02 0.245 0.113 0.194 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 1.80e-01 -0.148 0.11 0.194 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 4.37e-01 -0.089 0.114 0.194 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0205 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 7.94e-02 0.191 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0623 0.0898 0.194 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0853 0.0903 0.194 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 7.43e-02 0.151 0.0843 0.194 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00238 0.0447 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 4.67e-01 0.081 0.111 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0764 0.0595 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.21e-02 0.164 0.0875 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 4.88e-01 0.0681 0.098 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 9.28e-01 -0.01 0.11 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 9.69e-01 0.00355 0.0912 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 6.99e-02 0.177 0.0971 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 2.09e-01 -0.129 0.102 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0832 0.108 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 3.69e-01 0.093 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0437 0.0409 0.19 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 3.73e-02 -0.225 0.107 0.19 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0543 0.0706 0.19 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 4.88e-01 0.0672 0.0967 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 3.02e-01 0.11 0.106 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 9.73e-01 0.00363 0.106 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.23e-01 0.0758 0.0944 0.19 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 6.78e-01 0.0411 0.0991 0.19 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 2.01e-01 -0.13 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 4.68e-02 -0.207 0.103 0.19 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0934 0.0948 0.19 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 3.52e-01 0.0529 0.0566 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 8.98e-01 0.0131 0.103 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0174 0.0533 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 2.21e-01 0.0922 0.0752 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0616 0.0895 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 3.14e-01 -0.101 0.0998 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0464 0.0756 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 1.43e-01 0.12 0.0816 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 3.53e-01 -0.104 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 7.40e-01 -0.036 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 9.48e-01 0.00664 0.102 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 9.87e-01 0.000805 0.0496 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00877 0.102 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0236 0.0544 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 3.34e-02 0.179 0.0835 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 3.38e-01 0.0937 0.0976 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0332 0.107 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0224 0.0935 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 1.99e-01 0.119 0.0923 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 9.34e-01 0.00809 0.0975 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 3.34e-01 0.109 0.112 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 4.50e-01 0.0732 0.0968 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 2.68e-01 -0.12 0.108 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 9.70e-04 -0.355 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 8.08e-02 0.166 0.0946 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.105 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0053 0.111 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 2.32e-01 0.127 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 1.85e-01 -0.108 0.0816 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 9.56e-03 -0.243 0.093 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.31e-08 0.381 0.0679 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0525 0.0793 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 9.71e-01 0.00317 0.086 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 7.50e-01 0.0191 0.06 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 2.48e-02 -0.192 0.0852 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 2.21e-03 -0.301 0.0972 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.43e-03 0.208 0.0756 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0111 0.0963 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 1.03e-01 -0.147 0.0896 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0379 0.0591 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 3.02e-01 -0.107 0.103 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 2.31e-03 -0.301 0.0976 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 1.57e-01 0.136 0.0956 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00896 0.104 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0351 0.0982 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 8.35e-02 0.152 0.0873 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 7.41e-02 0.17 0.0949 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 3.93e-02 -0.201 0.097 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 9.51e-01 0.00483 0.0784 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 2.39e-01 -0.125 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0766 0.105 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0763 0.0893 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 2.18e-01 -0.137 0.111 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0662 0.0984 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 9.99e-03 -0.251 0.0964 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 1.66e-03 0.274 0.0859 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0821 0.0933 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0915 0.101 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 3.91e-01 0.0573 0.0667 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 6.13e-01 0.0522 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0921 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 2.92e-01 -0.1 0.0949 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 2.31e-02 0.223 0.0972 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 5.30e-02 -0.207 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 6.76e-01 0.0441 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0958 0.0943 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00864 0.103 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 5.03e-01 0.0754 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 6.47e-02 -0.196 0.105 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 1.62e-02 0.272 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 1.07e-01 -0.197 0.121 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0069 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.05e-02 -0.209 0.101 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 3.87e-01 0.0324 0.0373 0.188 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 1.46e-01 -0.152 0.104 0.188 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0622 0.102 0.188 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.86e-04 0.304 0.0881 0.188 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 1.89e-01 -0.143 0.108 0.188 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.51e-01 -0.127 0.11 0.188 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0697 0.092 0.188 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 4.13e-03 0.297 0.102 0.188 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 9.47e-02 -0.171 0.102 0.188 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 2.62e-01 0.102 0.0903 0.188 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00732 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0963 0.0821 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 3.20e-02 -0.203 0.0941 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 8.47e-01 0.0215 0.111 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 6.58e-02 0.199 0.108 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0202 0.0982 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 2.96e-01 0.108 0.103 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 7.32e-01 0.0373 0.109 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 4.31e-01 0.0776 0.0983 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 1.54e-04 -0.359 0.093 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0364 0.0727 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 7.56e-01 0.0315 0.101 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 5.43e-01 0.0595 0.0976 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 2.25e-01 -0.101 0.0834 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 2.26e-02 0.23 0.1 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 4.02e-02 0.234 0.113 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0334 0.104 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 7.97e-02 -0.186 0.106 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0789 0.0854 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0892 0.112 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0716 0.114 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 8.75e-01 0.0167 0.106 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 9.79e-03 0.28 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 1.91e-01 0.14 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 5.18e-03 -0.273 0.0968 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 3.37e-02 -0.195 0.0913 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 3.84e-01 0.061 0.0699 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 8.54e-01 -0.018 0.0977 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 8.83e-01 0.0145 0.0983 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0745 0.0773 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 6.40e-01 0.0472 0.101 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 6.19e-01 0.0542 0.109 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 7.85e-02 -0.14 0.0789 0.204 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 4.43e-02 0.215 0.106 0.204 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 6.76e-01 0.035 0.0835 0.204 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 2.35e-01 0.142 0.119 0.204 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0388 0.138 0.204 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.14e-01 0.105 0.0842 0.204 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 2.07e-01 0.123 0.0971 0.204 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00389 0.0993 0.204 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 8.21e-01 0.0262 0.115 0.204 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00587 0.106 0.204 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 9.40e-01 0.00734 0.0978 0.204 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 8.52e-01 0.00711 0.038 0.191 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0562 0.0765 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 1.66e-01 -0.141 0.101 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 9.79e-01 0.00196 0.0751 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 3.61e-01 -0.098 0.107 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0168 0.0811 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 2.81e-01 0.0952 0.088 0.191 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00796 0.0756 0.191 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 8.79e-01 0.0107 0.0701 0.191 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0681 0.0765 0.191 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 2.23e-01 -0.131 0.107 0.19 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 5.38e-02 -0.215 0.111 0.19 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 3.70e-02 0.203 0.0966 0.19 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0597 0.106 0.19 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.11 0.19 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 1.60e-01 0.125 0.0889 0.19 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 2.31e-02 0.217 0.095 0.19 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0086 0.0939 0.19 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 5.89e-02 0.228 0.12 0.19 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 5.96e-02 0.206 0.109 0.19 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0928 0.114 0.19 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 5.71e-01 0.0607 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0263 0.0833 0.19 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00796 0.095 0.19 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 1.18e-01 -0.148 0.0945 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 6.80e-01 0.0296 0.0717 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 7.51e-02 -0.169 0.0944 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 1.60e-01 -0.15 0.106 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 5.36e-01 0.0593 0.0957 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.57e-01 0.0616 0.0825 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 1.30e-02 0.174 0.0694 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 6.76e-02 -0.188 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 2.41e-01 0.0926 0.0787 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 7.83e-01 0.0265 0.096 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 3.12e-01 0.114 0.112 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.05e-01 0.134 0.105 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 6.22e-01 0.0482 0.0977 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 7.38e-02 0.136 0.0756 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00152 0.132 0.179 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 5.49e-02 -0.237 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 5.19e-01 0.0604 0.0934 0.179 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0768 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 7.53e-01 0.0409 0.129 0.179 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0819 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 8.22e-02 -0.213 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 5.38e-02 0.231 0.119 0.179 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 7.22e-01 0.0393 0.11 0.179 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 1.97e-01 -0.133 0.103 0.187 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0378 0.0942 0.187 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.05e-02 -0.207 0.11 0.187 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 8.42e-01 0.0207 0.104 0.187 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.65e-01 -0.12 0.107 0.187 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 2.71e-01 0.114 0.103 0.187 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 3.48e-01 0.085 0.0904 0.187 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 8.94e-01 0.0142 0.106 0.183 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0097 0.0978 0.183 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0402 0.117 0.183 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 2.57e-01 0.116 0.102 0.183 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 4.06e-01 0.0817 0.0983 0.183 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00318 0.0946 0.183 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 7.97e-02 0.154 0.0875 0.183 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 7.58e-02 -0.218 0.122 0.184 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 8.39e-01 0.0219 0.107 0.184 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 7.67e-01 0.0336 0.113 0.184 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 6.35e-01 0.0537 0.113 0.184 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0402 0.119 0.184 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 6.17e-01 0.0519 0.104 0.184 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0795 0.0799 0.184 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 8.71e-01 0.0174 0.106 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0152 0.052 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 1.98e-01 -0.134 0.104 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 6.36e-01 -0.026 0.0549 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.81e-02 0.157 0.0857 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 5.45e-01 0.0538 0.0889 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0544 0.101 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 7.81e-01 0.0209 0.0751 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 5.27e-02 0.174 0.0892 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 7.97e-02 -0.181 0.103 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 9.41e-02 -0.181 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 4.29e-01 0.0851 0.107 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -643433 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00491 0.0599 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 8.80e-01 0.0148 0.0979 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 9.85e-01 -0.000917 0.0483 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 4.39e-02 0.139 0.0686 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 7.73e-01 0.0245 0.0847 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 1.82e-01 -0.129 0.0963 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0566 0.0723 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 5.47e-02 0.145 0.0753 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 98839 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0639 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 8.30e-01 0.024 0.112 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -359274 sc-eQTL 6.77e-01 0.0423 0.102 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 3.04e-02 -0.189 0.0867 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 4.64e-01 0.052 0.0708 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 2.61e-01 -0.103 0.091 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0527 0.108 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 2.05e-01 0.117 0.092 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 4.84e-01 0.0562 0.0802 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 8.49e-03 0.172 0.0648 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 5.56e-01 -0.059 0.1 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0186 0.0874 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0895 0.106 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 2.75e-01 0.111 0.102 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0599 0.101 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 8.42e-01 0.0175 0.0878 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 1.61e-01 0.106 0.0754 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -281809 sc-eQTL 1.04e-01 -0.153 0.0935 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 141364 sc-eQTL 2.29e-04 -0.333 0.0889 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 7352 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0263 0.0629 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 558206 sc-eQTL 9.47e-01 0.00644 0.0965 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 430539 sc-eQTL 8.06e-01 0.0221 0.0895 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -223838 sc-eQTL 8.79e-02 -0.123 0.072 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 sc-eQTL 4.33e-03 0.276 0.0955 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -281874 sc-eQTL 4.45e-02 0.229 0.113 0.188 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 141364 eQTL 3.67e-02 -0.0692 0.0331 0.0 0.0 0.165
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 eQTL 1.89e-12 0.129 0.0181 0.0 0.0 0.165
ENSG00000139351 SYCP3 98842 eQTL 0.0191 0.11 0.0469 0.0 0.00101 0.165

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 \N -223838 1.41e-06 1.01e-06 3.32e-07 1.14e-06 3.17e-07 6.38e-07 1.46e-06 3.31e-07 1.52e-06 4.52e-07 1.89e-06 7.84e-07 2.46e-06 2.92e-07 5.28e-07 9.13e-07 8.49e-07 7.05e-07 7.73e-07 6.34e-07 5.47e-07 1.63e-06 8.95e-07 6.23e-07 2.25e-06 4.23e-07 9.02e-07 7.08e-07 1.47e-06 1.24e-06 7.64e-07 1.82e-07 1.98e-07 6.68e-07 5.6e-07 4.5e-07 5.22e-07 1.55e-07 4.12e-07 3.02e-07 2.79e-07 1.58e-06 6.21e-08 2.63e-08 1.69e-07 1.17e-07 2.26e-07 8.66e-08 8e-08
ENSG00000136048 DRAM1 -39269 1.11e-05 1.04e-05 1.43e-06 5.82e-06 2.42e-06 4.74e-06 1.16e-05 1.79e-06 9.65e-06 5.11e-06 1.23e-05 5.61e-06 1.56e-05 3.63e-06 2.83e-06 6.36e-06 4.73e-06 7.69e-06 2.6e-06 2.78e-06 5.35e-06 9.86e-06 9.02e-06 3.3e-06 1.53e-05 3.98e-06 4.73e-06 3.81e-06 1.02e-05 9.19e-06 5.8e-06 1.05e-06 1.25e-06 3.29e-06 4.48e-06 2.59e-06 1.78e-06 1.89e-06 2.18e-06 9.68e-07 1.04e-06 1.31e-05 1.49e-06 1.44e-07 7.98e-07 1.66e-06 1.56e-06 7.44e-07 4.57e-07