logo

Genes within 1Mb (chr12:101835853:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 9.60e-01 0.00223 0.0447 0.19 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0237 0.0778 0.19 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0402 0.0472 0.19 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 4.93e-03 0.191 0.0672 0.19 B L1
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 5.81e-01 0.043 0.0778 0.19 B L1
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0787 0.0667 0.19 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0419 0.0535 0.19 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 3.55e-02 0.127 0.0601 0.19 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 1.31e-01 -0.145 0.096 0.19 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0541 0.0923 0.19 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 5.21e-01 0.0553 0.0861 0.19 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 3.06e-02 -0.153 0.0704 0.19 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 6.87e-03 -0.258 0.0944 0.19 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 8.20e-08 0.346 0.0622 0.19 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0382 0.0736 0.19 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0211 0.072 0.19 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.63e-01 0.037 0.0503 0.19 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 5.60e-01 0.0518 0.0888 0.19 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 4.91e-03 -0.269 0.0945 0.19 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 3.42e-01 0.0601 0.0631 0.19 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 1.29e-04 -0.301 0.0771 0.19 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.27e-01 -0.106 0.0877 0.19 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0212 0.0625 0.19 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0252 0.0896 0.19 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 2.15e-01 0.123 0.0992 0.189 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 7.10e-01 0.0339 0.091 0.189 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 2.57e-02 0.222 0.0989 0.189 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 2.75e-02 0.235 0.106 0.189 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.86e-01 -0.118 0.111 0.189 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00804 0.0956 0.189 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0783 0.0787 0.189 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 9.13e-01 0.0114 0.104 0.189 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 5.83e-03 -0.228 0.0818 0.19 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 7.85e-01 0.0192 0.0705 0.19 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 1.05e-01 -0.143 0.0878 0.19 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 9.26e-01 0.00919 0.0986 0.19 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 4.11e-01 0.0747 0.0906 0.19 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 3.12e-01 0.0808 0.0796 0.19 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 1.74e-02 0.154 0.0642 0.19 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 1.35e-01 -0.133 0.0887 0.189 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 9.93e-04 -0.269 0.0807 0.189 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0306 0.06 0.189 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 7.06e-01 0.0364 0.0965 0.189 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 3.99e-01 0.075 0.0886 0.189 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0816 0.0667 0.189 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 9.89e-03 0.244 0.0937 0.189 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 4.71e-02 0.221 0.111 0.189 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 5.79e-01 -0.019 0.0343 0.19 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 5.71e-01 -0.037 0.0653 0.19 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 1.99e-01 -0.122 0.095 0.19 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 2.88e-02 0.15 0.0681 0.19 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0611 0.107 0.19 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 5.92e-01 -0.042 0.0783 0.19 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 6.65e-01 0.0302 0.0696 0.19 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 9.65e-01 0.00363 0.0835 0.19 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0678 0.0694 0.19 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0429 0.0809 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0179 0.021 0.194 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0111 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 5.59e-01 0.0472 0.0805 0.194 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 3.13e-02 0.245 0.113 0.194 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 1.80e-01 -0.148 0.11 0.194 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 4.37e-01 -0.089 0.114 0.194 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0205 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 7.94e-02 0.191 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0623 0.0898 0.194 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0853 0.0903 0.194 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 7.43e-02 0.151 0.0843 0.194 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00238 0.0447 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 4.67e-01 0.081 0.111 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0764 0.0595 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.21e-02 0.164 0.0875 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 4.88e-01 0.0681 0.098 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 9.28e-01 -0.01 0.11 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 9.69e-01 0.00355 0.0912 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 6.99e-02 0.177 0.0971 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 2.09e-01 -0.129 0.102 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0832 0.108 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 3.69e-01 0.093 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0437 0.0409 0.19 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 3.73e-02 -0.225 0.107 0.19 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0543 0.0706 0.19 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 4.88e-01 0.0672 0.0967 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 3.02e-01 0.11 0.106 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 9.73e-01 0.00363 0.106 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.23e-01 0.0758 0.0944 0.19 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 6.78e-01 0.0411 0.0991 0.19 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 2.01e-01 -0.13 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 4.68e-02 -0.207 0.103 0.19 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0934 0.0948 0.19 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 3.52e-01 0.0529 0.0566 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 8.98e-01 0.0131 0.103 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0174 0.0533 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 2.21e-01 0.0922 0.0752 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0616 0.0895 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 3.14e-01 -0.101 0.0998 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0464 0.0756 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 1.43e-01 0.12 0.0816 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 3.53e-01 -0.104 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 7.40e-01 -0.036 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 9.48e-01 0.00664 0.102 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 9.87e-01 0.000805 0.0496 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00877 0.102 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0236 0.0544 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 3.34e-02 0.179 0.0835 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 3.38e-01 0.0937 0.0976 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0332 0.107 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0224 0.0935 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 1.99e-01 0.119 0.0923 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 9.34e-01 0.00809 0.0975 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 3.34e-01 0.109 0.112 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 4.50e-01 0.0732 0.0968 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 2.68e-01 -0.12 0.108 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 9.70e-04 -0.355 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 8.08e-02 0.166 0.0946 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.105 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0053 0.111 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 2.32e-01 0.127 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 1.85e-01 -0.108 0.0816 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 9.56e-03 -0.243 0.093 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.31e-08 0.381 0.0679 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0525 0.0793 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 9.71e-01 0.00317 0.086 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 7.50e-01 0.0191 0.06 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 2.48e-02 -0.192 0.0852 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 2.21e-03 -0.301 0.0972 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.43e-03 0.208 0.0756 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0111 0.0963 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 1.03e-01 -0.147 0.0896 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0379 0.0591 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 3.02e-01 -0.107 0.103 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 2.31e-03 -0.301 0.0976 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 1.57e-01 0.136 0.0956 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00896 0.104 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0351 0.0982 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 8.35e-02 0.152 0.0873 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 7.41e-02 0.17 0.0949 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 3.93e-02 -0.201 0.097 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 9.51e-01 0.00483 0.0784 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 2.39e-01 -0.125 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0766 0.105 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0763 0.0893 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 2.18e-01 -0.137 0.111 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0662 0.0984 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 9.99e-03 -0.251 0.0964 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 1.66e-03 0.274 0.0859 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0821 0.0933 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0915 0.101 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 3.91e-01 0.0573 0.0667 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 6.13e-01 0.0522 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0921 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 2.92e-01 -0.1 0.0949 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 2.31e-02 0.223 0.0972 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 5.30e-02 -0.207 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 6.76e-01 0.0441 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0958 0.0943 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00864 0.103 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 5.03e-01 0.0754 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 6.47e-02 -0.196 0.105 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 1.62e-02 0.272 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 1.07e-01 -0.197 0.121 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0069 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.05e-02 -0.209 0.101 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 3.87e-01 0.0324 0.0373 0.188 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 1.46e-01 -0.152 0.104 0.188 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0622 0.102 0.188 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.86e-04 0.304 0.0881 0.188 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 1.89e-01 -0.143 0.108 0.188 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.51e-01 -0.127 0.11 0.188 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0697 0.092 0.188 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 4.13e-03 0.297 0.102 0.188 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 9.47e-02 -0.171 0.102 0.188 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 2.62e-01 0.102 0.0903 0.188 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00732 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0963 0.0821 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 3.20e-02 -0.203 0.0941 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 8.47e-01 0.0215 0.111 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 6.58e-02 0.199 0.108 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0202 0.0982 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 2.96e-01 0.108 0.103 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 7.32e-01 0.0373 0.109 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 4.31e-01 0.0776 0.0983 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 1.54e-04 -0.359 0.093 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0364 0.0727 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 7.56e-01 0.0315 0.101 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 5.43e-01 0.0595 0.0976 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 2.25e-01 -0.101 0.0834 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 2.26e-02 0.23 0.1 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 4.02e-02 0.234 0.113 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0334 0.104 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 7.97e-02 -0.186 0.106 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0789 0.0854 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0892 0.112 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0716 0.114 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 8.75e-01 0.0167 0.106 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 9.79e-03 0.28 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 1.91e-01 0.14 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 5.18e-03 -0.273 0.0968 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 3.37e-02 -0.195 0.0913 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 3.84e-01 0.061 0.0699 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 8.54e-01 -0.018 0.0977 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 8.83e-01 0.0145 0.0983 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0745 0.0773 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 6.40e-01 0.0472 0.101 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 6.19e-01 0.0542 0.109 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 7.85e-02 -0.14 0.0789 0.204 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 4.43e-02 0.215 0.106 0.204 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 6.76e-01 0.035 0.0835 0.204 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 2.35e-01 0.142 0.119 0.204 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0388 0.138 0.204 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.14e-01 0.105 0.0842 0.204 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 2.07e-01 0.123 0.0971 0.204 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00389 0.0993 0.204 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 8.21e-01 0.0262 0.115 0.204 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00587 0.106 0.204 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 9.40e-01 0.00734 0.0978 0.204 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 8.52e-01 0.00711 0.038 0.191 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0562 0.0765 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 1.66e-01 -0.141 0.101 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 9.79e-01 0.00196 0.0751 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 3.61e-01 -0.098 0.107 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0168 0.0811 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 2.81e-01 0.0952 0.088 0.191 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00796 0.0756 0.191 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 8.79e-01 0.0107 0.0701 0.191 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0681 0.0765 0.191 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 2.23e-01 -0.131 0.107 0.19 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 5.38e-02 -0.215 0.111 0.19 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 3.70e-02 0.203 0.0966 0.19 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0597 0.106 0.19 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.11 0.19 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 1.60e-01 0.125 0.0889 0.19 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 2.31e-02 0.217 0.095 0.19 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0086 0.0939 0.19 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 5.89e-02 0.228 0.12 0.19 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 5.96e-02 0.206 0.109 0.19 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0928 0.114 0.19 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 5.71e-01 0.0607 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0263 0.0833 0.19 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00796 0.095 0.19 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 1.18e-01 -0.148 0.0945 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 6.80e-01 0.0296 0.0717 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 7.51e-02 -0.169 0.0944 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 1.60e-01 -0.15 0.106 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 5.36e-01 0.0593 0.0957 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.57e-01 0.0616 0.0825 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 1.30e-02 0.174 0.0694 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 6.76e-02 -0.188 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 2.41e-01 0.0926 0.0787 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 7.83e-01 0.0265 0.096 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 3.12e-01 0.114 0.112 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.05e-01 0.134 0.105 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 6.22e-01 0.0482 0.0977 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 7.38e-02 0.136 0.0756 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00152 0.132 0.179 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 5.49e-02 -0.237 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 5.19e-01 0.0604 0.0934 0.179 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0768 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 7.53e-01 0.0409 0.129 0.179 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0819 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 8.22e-02 -0.213 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 5.38e-02 0.231 0.119 0.179 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 7.22e-01 0.0393 0.11 0.179 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 1.97e-01 -0.133 0.103 0.187 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0378 0.0942 0.187 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.05e-02 -0.207 0.11 0.187 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 8.42e-01 0.0207 0.104 0.187 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.65e-01 -0.12 0.107 0.187 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 2.71e-01 0.114 0.103 0.187 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 3.48e-01 0.085 0.0904 0.187 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 8.94e-01 0.0142 0.106 0.183 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0097 0.0978 0.183 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0402 0.117 0.183 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 2.57e-01 0.116 0.102 0.183 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 4.06e-01 0.0817 0.0983 0.183 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00318 0.0946 0.183 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 7.97e-02 0.154 0.0875 0.183 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 7.58e-02 -0.218 0.122 0.184 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 8.39e-01 0.0219 0.107 0.184 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 7.67e-01 0.0336 0.113 0.184 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 6.35e-01 0.0537 0.113 0.184 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0402 0.119 0.184 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 6.17e-01 0.0519 0.104 0.184 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0795 0.0799 0.184 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 8.71e-01 0.0174 0.106 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0152 0.052 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 1.98e-01 -0.134 0.104 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 6.36e-01 -0.026 0.0549 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.81e-02 0.157 0.0857 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 5.45e-01 0.0538 0.0889 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0544 0.101 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 7.81e-01 0.0209 0.0751 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 5.27e-02 0.174 0.0892 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 7.97e-02 -0.181 0.103 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 9.41e-02 -0.181 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 4.29e-01 0.0851 0.107 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -645891 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00491 0.0599 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 8.80e-01 0.0148 0.0979 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 9.85e-01 -0.000917 0.0483 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 4.39e-02 0.139 0.0686 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 7.73e-01 0.0245 0.0847 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 1.82e-01 -0.129 0.0963 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0566 0.0723 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 5.47e-02 0.145 0.0753 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 96381 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0639 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 8.30e-01 0.024 0.112 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -361732 sc-eQTL 6.77e-01 0.0423 0.102 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 3.04e-02 -0.189 0.0867 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 4.64e-01 0.052 0.0708 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 2.61e-01 -0.103 0.091 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0527 0.108 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 2.05e-01 0.117 0.092 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 4.84e-01 0.0562 0.0802 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 8.49e-03 0.172 0.0648 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 5.56e-01 -0.059 0.1 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0186 0.0874 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0895 0.106 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 2.75e-01 0.111 0.102 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0599 0.101 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 8.42e-01 0.0175 0.0878 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 1.61e-01 0.106 0.0754 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -284267 sc-eQTL 1.04e-01 -0.153 0.0935 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 138906 sc-eQTL 2.29e-04 -0.333 0.0889 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 4894 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0263 0.0629 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 555748 sc-eQTL 9.47e-01 0.00644 0.0965 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 428081 sc-eQTL 8.06e-01 0.0221 0.0895 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -226296 sc-eQTL 8.79e-02 -0.123 0.072 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 sc-eQTL 4.33e-03 0.276 0.0955 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -284332 sc-eQTL 4.45e-02 0.229 0.113 0.188 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 138906 eQTL 3.28e-02 -0.0707 0.0331 0.0 0.0 0.165
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 eQTL 4.02e-12 0.128 0.0182 0.0 0.0 0.165
ENSG00000139351 SYCP3 96384 eQTL 0.0234 0.107 0.047 0.0 0.0 0.165

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -41727 2.55e-05 2.43e-05 4.32e-06 1.27e-05 4.49e-06 1.01e-05 3.09e-05 3.72e-06 2.17e-05 1.19e-05 2.88e-05 1.33e-05 3.42e-05 9.29e-06 6.69e-06 1.34e-05 1.11e-05 1.75e-05 6.14e-06 4.81e-06 9.78e-06 2.47e-05 2.49e-05 6.97e-06 3.39e-05 6.51e-06 1.05e-05 9.23e-06 2.16e-05 1.81e-05 1.31e-05 1.67e-06 1.96e-06 5.89e-06 1.03e-05 4.56e-06 2.6e-06 2.98e-06 4.1e-06 2.82e-06 1.72e-06 2.9e-05 2.71e-06 3.63e-07 1.85e-06 3.29e-06 3.63e-06 1.5e-06 1.15e-06