Genes within 1Mb (chr12:101813585:AT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00371 0.0448 0.186 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0277 0.0779 0.186 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 4.35e-01 -0.037 0.0473 0.186 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 2.71e-03 0.203 0.0671 0.186 B L1
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 6.09e-01 0.0399 0.0778 0.186 B L1
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0719 0.0668 0.186 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0371 0.0535 0.186 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 2.06e-02 0.14 0.06 0.186 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 2.14e-01 -0.12 0.0962 0.186 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 4.30e-01 -0.073 0.0923 0.186 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 4.44e-01 0.0661 0.0861 0.186 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 3.62e-02 -0.149 0.0706 0.186 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 7.52e-03 -0.255 0.0946 0.186 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 2.12e-07 0.336 0.0626 0.186 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0259 0.0738 0.186 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00687 0.0722 0.186 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 4.28e-01 0.0401 0.0504 0.186 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 6.24e-01 0.0437 0.0891 0.186 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 5.02e-03 -0.269 0.0948 0.186 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.06e-01 0.0649 0.0632 0.186 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 2.78e-04 -0.287 0.0775 0.186 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 3.24e-01 -0.087 0.0881 0.186 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 6.33e-01 -0.03 0.0627 0.186 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0495 0.0898 0.186 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 2.80e-01 0.108 0.0994 0.185 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 7.41e-01 0.0302 0.0911 0.185 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 1.80e-02 0.236 0.0988 0.185 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 2.54e-02 0.239 0.106 0.185 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 3.26e-01 -0.109 0.111 0.185 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 9.69e-01 0.00377 0.0957 0.185 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0858 0.0787 0.185 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 7.96e-01 0.027 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 7.81e-03 -0.22 0.082 0.186 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 7.56e-01 0.0219 0.0706 0.186 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 4.14e-02 -0.18 0.0876 0.186 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 8.04e-01 0.0245 0.0987 0.186 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 3.08e-01 0.0926 0.0906 0.186 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 4.03e-01 0.0669 0.0798 0.186 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 2.59e-02 0.144 0.0644 0.186 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 1.98e-01 -0.115 0.0891 0.185 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 1.31e-03 -0.264 0.081 0.185 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0367 0.0601 0.185 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 7.09e-01 0.0362 0.0968 0.185 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 4.63e-01 0.0653 0.0889 0.185 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 2.00e-01 -0.086 0.0668 0.185 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 1.44e-02 0.232 0.0941 0.185 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 6.03e-02 0.21 0.111 0.185 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0102 0.0344 0.186 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0401 0.0655 0.186 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 1.94e-01 -0.124 0.0953 0.186 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 2.25e-02 0.157 0.0682 0.186 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0552 0.108 0.186 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0402 0.0786 0.186 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 6.28e-01 0.0338 0.0698 0.186 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00107 0.0838 0.186 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0634 0.0697 0.186 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0401 0.0812 0.186 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0156 0.0209 0.189 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00505 0.109 0.189 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 5.40e-01 0.0493 0.0803 0.189 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.20e-02 0.244 0.113 0.189 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 2.36e-01 -0.131 0.11 0.189 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 4.78e-01 -0.081 0.114 0.189 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0114 0.109 0.189 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 9.54e-02 0.182 0.108 0.189 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0502 0.0896 0.189 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0965 0.0899 0.189 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 6.16e-02 0.158 0.0839 0.189 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00472 0.0448 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 4.69e-01 0.0808 0.111 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0694 0.0597 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 1.05e-01 0.143 0.0879 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 6.35e-01 0.0467 0.0983 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00439 0.111 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 8.81e-01 0.0137 0.0914 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 6.55e-02 0.18 0.0973 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 2.12e-01 -0.129 0.103 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0841 0.108 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 3.08e-01 0.106 0.104 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0426 0.041 0.188 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 5.12e-02 -0.211 0.108 0.188 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0627 0.0707 0.188 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 5.44e-01 0.0589 0.0969 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 4.24e-01 0.0852 0.106 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 8.66e-01 0.0179 0.106 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 5.12e-01 0.0622 0.0946 0.188 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 6.95e-01 0.039 0.0993 0.188 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 2.20e-01 -0.125 0.102 0.188 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 3.37e-02 -0.221 0.103 0.188 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 2.17e-01 -0.118 0.0949 0.188 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 3.06e-01 0.0583 0.0568 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 9.45e-01 0.00712 0.103 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 8.74e-01 -0.00852 0.0536 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 1.97e-01 0.0977 0.0755 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0762 0.0899 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 2.82e-01 -0.108 0.1 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0396 0.076 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 1.50e-01 0.119 0.082 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0887 0.112 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0447 0.109 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 9.52e-01 0.00614 0.102 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 9.61e-01 0.00246 0.0497 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 9.23e-01 0.0098 0.102 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0148 0.0545 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 5.43e-02 0.162 0.0837 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 3.52e-01 0.0911 0.0978 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0296 0.107 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0204 0.0936 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 1.71e-01 0.127 0.0923 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00638 0.0977 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 3.66e-01 0.102 0.112 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 4.34e-01 0.0759 0.0969 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 3.29e-01 -0.107 0.109 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 2.05e-03 -0.333 0.107 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 8.65e-02 0.163 0.0949 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 9.84e-01 0.00212 0.105 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.111 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 2.21e-01 0.131 0.106 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 1.98e-01 -0.106 0.0819 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 9.08e-03 -0.246 0.0933 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.41e-07 0.362 0.0688 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 5.14e-01 -0.052 0.0796 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 9.22e-01 0.0085 0.0863 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 6.99e-01 0.0233 0.0603 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 2.66e-02 -0.19 0.0852 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 2.81e-03 -0.294 0.0973 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 6.51e-03 0.208 0.0756 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 8.07e-01 0.0235 0.0963 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 1.96e-01 -0.116 0.0898 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0409 0.0591 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0781 0.103 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 1.99e-03 -0.304 0.0972 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 1.36e-01 0.142 0.0952 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000483 0.104 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0232 0.0978 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 1.03e-01 0.142 0.0871 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 1.11e-01 0.152 0.0953 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 3.57e-02 -0.206 0.0973 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 8.69e-01 0.013 0.0786 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0803 0.106 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0442 0.105 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0892 0.0895 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 2.29e-01 -0.134 0.111 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0551 0.0988 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 1.20e-02 -0.245 0.0968 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.25e-03 0.257 0.0865 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0874 0.0936 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 2.82e-01 -0.11 0.102 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 3.26e-01 0.0659 0.067 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 8.12e-01 0.0247 0.104 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0727 0.106 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 2.74e-01 -0.104 0.0952 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 1.72e-02 0.234 0.0973 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 5.66e-02 -0.205 0.107 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 4.11e-01 0.0871 0.106 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 1.97e-01 -0.122 0.0944 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 9.62e-01 0.00495 0.103 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 4.13e-01 0.0923 0.113 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 8.33e-02 -0.184 0.106 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 2.31e-02 0.258 0.113 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 9.45e-02 -0.204 0.122 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0202 0.117 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 5.53e-02 -0.196 0.102 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 3.18e-01 -0.113 0.113 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 3.77e-01 0.0331 0.0374 0.184 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 2.39e-01 -0.124 0.105 0.184 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0647 0.102 0.184 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.43e-04 0.321 0.0881 0.184 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 1.98e-01 -0.14 0.108 0.184 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 2.55e-01 -0.126 0.111 0.184 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0496 0.0923 0.184 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 7.61e-03 0.278 0.103 0.184 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 1.16e-01 -0.161 0.102 0.184 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 2.67e-01 0.101 0.0906 0.184 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0186 0.114 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0928 0.0825 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 5.10e-02 -0.186 0.0947 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 7.35e-01 0.0378 0.112 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 7.97e-02 0.191 0.108 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0554 0.0985 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 2.25e-01 0.126 0.103 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 9.44e-01 0.00765 0.11 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 3.46e-01 0.0932 0.0987 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 9.31e-05 -0.371 0.0932 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0467 0.073 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 7.82e-01 0.0281 0.101 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 6.21e-01 0.0486 0.0981 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0969 0.0838 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 2.82e-02 0.223 0.101 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 6.44e-02 0.212 0.114 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 9.09e-01 -0.012 0.104 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 9.47e-02 -0.178 0.106 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0954 0.0856 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 3.46e-01 -0.106 0.112 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0811 0.115 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 9.05e-01 0.0127 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 2.29e-02 0.248 0.108 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 1.94e-01 0.14 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 9.39e-03 -0.255 0.0973 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 4.31e-02 -0.187 0.0917 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.60e-01 0.0644 0.0701 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0262 0.098 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 9.04e-01 0.0119 0.0986 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0695 0.0775 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 6.51e-01 0.0458 0.101 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 5.63e-01 0.0633 0.109 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 1.17e-01 -0.125 0.079 0.196 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 2.49e-02 0.239 0.105 0.196 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 6.26e-01 0.0408 0.0834 0.196 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 1.97e-01 0.155 0.119 0.196 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0282 0.138 0.196 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 2.00e-01 0.108 0.084 0.196 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 3.10e-01 0.0992 0.0973 0.196 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 8.05e-01 0.0245 0.0991 0.196 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 8.45e-01 0.0225 0.115 0.196 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 9.43e-01 0.00756 0.106 0.196 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 7.94e-01 0.0256 0.0976 0.196 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 6.58e-01 0.0169 0.0382 0.187 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0617 0.077 0.187 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 2.01e-01 -0.13 0.102 0.187 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000711 0.0756 0.187 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0981 0.108 0.187 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0231 0.0816 0.187 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 3.20e-01 0.0883 0.0885 0.187 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00755 0.0761 0.187 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 9.27e-01 0.00651 0.0705 0.187 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0685 0.077 0.187 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 1.95e-01 -0.139 0.107 0.186 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 6.84e-02 -0.204 0.111 0.186 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.12e-02 0.21 0.0968 0.186 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0505 0.107 0.186 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 3.78e-01 0.0973 0.11 0.186 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 1.90e-01 0.117 0.0892 0.186 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 3.40e-02 0.204 0.0953 0.185 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0133 0.0941 0.185 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.96e-02 0.249 0.12 0.185 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 5.18e-02 0.213 0.109 0.185 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0881 0.114 0.185 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 4.09e-01 0.0885 0.107 0.185 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0491 0.0834 0.185 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00495 0.0952 0.185 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 1.04e-01 -0.155 0.0946 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 6.48e-01 0.0328 0.0717 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.40e-02 -0.201 0.0942 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 1.66e-01 -0.148 0.107 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 4.17e-01 0.078 0.0958 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 3.90e-01 0.0711 0.0826 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 1.92e-02 0.164 0.0696 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 1.33e-01 -0.155 0.103 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 3.10e-01 0.0806 0.0791 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 8.20e-01 0.022 0.0964 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 2.36e-01 0.134 0.113 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 1.93e-01 0.138 0.106 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 8.50e-01 0.0186 0.0981 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 1.25e-01 0.117 0.0761 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00152 0.132 0.179 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 5.49e-02 -0.237 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 5.19e-01 0.0604 0.0934 0.179 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0768 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 7.53e-01 0.0409 0.129 0.179 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0819 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 8.22e-02 -0.213 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 5.38e-02 0.231 0.119 0.179 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 7.22e-01 0.0393 0.11 0.179 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 1.11e-01 -0.164 0.102 0.182 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0256 0.094 0.182 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 3.41e-02 -0.233 0.109 0.182 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 7.57e-01 0.032 0.103 0.182 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 3.22e-01 -0.106 0.107 0.182 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 3.75e-01 0.0918 0.103 0.182 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 4.35e-01 0.0706 0.0902 0.182 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 6.63e-01 0.0461 0.106 0.179 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 9.40e-01 0.00738 0.0978 0.179 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0784 0.117 0.179 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 1.98e-01 0.132 0.102 0.179 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 3.80e-01 0.0864 0.0982 0.179 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0254 0.0946 0.179 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 1.18e-01 0.138 0.0876 0.179 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 7.49e-02 -0.219 0.122 0.181 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 7.94e-01 0.0281 0.107 0.181 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 6.90e-01 0.0453 0.114 0.181 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 5.65e-01 0.0652 0.113 0.181 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0377 0.119 0.181 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 6.03e-01 0.054 0.104 0.181 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0813 0.08 0.181 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 8.02e-01 0.0268 0.107 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0114 0.0522 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 2.58e-01 -0.119 0.105 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0217 0.0551 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 1.41e-01 0.127 0.0862 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 5.30e-01 0.0561 0.0892 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0271 0.101 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 7.12e-01 0.0278 0.0754 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 4.63e-02 0.179 0.0894 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 2.14e-01 -0.129 0.104 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 7.96e-02 -0.19 0.108 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 3.58e-01 0.0993 0.108 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -668159 sc-eQTL 9.87e-01 0.000953 0.0601 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 8.72e-01 0.0158 0.0983 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 8.63e-01 0.00837 0.0485 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 4.53e-02 0.139 0.0688 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 8.61e-01 0.015 0.085 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 1.80e-01 -0.13 0.0966 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0527 0.0726 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 5.39e-02 0.146 0.0755 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 74113 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0587 0.11 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 9.70e-01 0.00428 0.112 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -384000 sc-eQTL 6.52e-01 0.0461 0.102 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 4.75e-02 -0.173 0.087 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 5.25e-01 0.0452 0.071 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 1.49e-01 -0.132 0.091 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0456 0.108 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 1.59e-01 0.13 0.092 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 5.36e-01 0.0499 0.0804 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 1.35e-02 0.162 0.0651 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0572 0.1 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00338 0.0874 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 2.45e-01 -0.123 0.106 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 2.06e-01 0.129 0.101 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0413 0.101 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00542 0.0878 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 2.26e-01 0.0916 0.0755 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -306535 sc-eQTL 1.81e-01 -0.126 0.094 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 116638 sc-eQTL 2.07e-04 -0.336 0.0891 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -17374 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0307 0.063 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 533480 sc-eQTL 9.60e-01 0.0049 0.0967 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 405813 sc-eQTL 8.44e-01 0.0177 0.0898 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -248564 sc-eQTL 9.49e-02 -0.121 0.0722 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 sc-eQTL 7.83e-03 0.258 0.096 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -306600 sc-eQTL 5.87e-02 0.217 0.114 0.183 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 116638 eQTL 1.92e-02 -0.0781 0.0333 0.0 0.0 0.163
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 eQTL 5.44e-12 0.128 0.0183 0.0 0.0 0.163
ENSG00000139351 SYCP3 74116 eQTL 0.0303 0.103 0.0473 0.0 0.0 0.163


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -63995 3.59e-05 1.54e-05 7.06e-06 8.12e-06 4e-06 7.88e-06 2.14e-05 2.08e-06 1.73e-05 7.65e-06 2.04e-05 8.05e-06 3.3e-05 6.95e-06 5.16e-06 1.06e-05 5.03e-06 1.26e-05 6.61e-06 6.54e-06 8.31e-06 1.98e-05 1.9e-05 6.42e-06 2.07e-05 4.43e-06 8.26e-06 7.72e-06 1.48e-05 1.02e-05 9.59e-06 1.18e-06 2.25e-06 5.59e-06 6.13e-06 4.57e-06 1.89e-06 2.76e-06 2.95e-06 1.76e-06 1.55e-06 2.55e-05 6.23e-06 1.59e-07 2.07e-06 6.71e-06 2.21e-06 1.47e-06 1.69e-06