Genes within 1Mb (chr12:101805551:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 9.78e-01 0.00123 0.0441 0.192 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000257 0.0768 0.192 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0341 0.0466 0.192 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 3.88e-03 0.193 0.0662 0.192 B L1
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 5.96e-01 0.0407 0.0767 0.192 B L1
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0701 0.0658 0.192 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0354 0.0528 0.192 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 2.89e-02 0.13 0.0592 0.192 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 1.61e-01 -0.133 0.0947 0.192 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0541 0.0911 0.192 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 3.71e-01 0.076 0.0848 0.192 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 3.36e-02 -0.148 0.0694 0.192 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 3.03e-03 -0.278 0.0927 0.192 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 3.55e-07 0.325 0.0617 0.192 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0261 0.0726 0.192 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0142 0.071 0.192 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 4.02e-01 0.0417 0.0496 0.192 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 4.51e-01 0.0661 0.0874 0.192 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 2.88e-03 -0.28 0.0929 0.192 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 3.54e-01 0.0577 0.0622 0.192 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 1.23e-04 -0.297 0.0759 0.192 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0749 0.0866 0.192 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0242 0.0616 0.192 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0583 0.0882 0.192 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 1.63e-01 0.137 0.0978 0.191 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 7.95e-01 0.0234 0.0898 0.191 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 2.87e-02 0.215 0.0976 0.191 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 3.46e-02 0.223 0.105 0.191 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 2.95e-01 -0.115 0.109 0.191 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00563 0.0943 0.191 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0908 0.0776 0.191 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 9.32e-01 0.00878 0.103 0.191 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 5.98e-03 -0.225 0.0809 0.192 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 9.63e-01 0.00325 0.0697 0.192 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 6.66e-02 -0.16 0.0867 0.192 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 8.40e-01 0.0197 0.0975 0.192 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 4.19e-01 0.0726 0.0896 0.192 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 4.11e-01 0.0649 0.0788 0.192 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.98e-02 0.149 0.0635 0.192 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 2.03e-01 -0.112 0.0876 0.191 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 6.24e-04 -0.276 0.0794 0.191 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0255 0.0592 0.191 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 6.20e-01 0.0472 0.0952 0.191 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 4.32e-01 0.0688 0.0874 0.191 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0843 0.0657 0.191 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.08e-02 0.238 0.0924 0.191 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 4.39e-02 0.221 0.109 0.191 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00295 0.0339 0.192 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0578 0.0644 0.192 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 1.28e-01 -0.143 0.0937 0.192 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 2.44e-02 0.152 0.0672 0.192 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0738 0.106 0.192 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0118 0.0774 0.192 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 4.18e-01 0.0557 0.0687 0.192 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00234 0.0825 0.192 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0488 0.0687 0.192 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0386 0.0799 0.192 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 4.18e-01 -0.017 0.021 0.191 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0201 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 4.96e-01 0.0548 0.0804 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 2.91e-02 0.248 0.113 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 1.94e-01 -0.144 0.11 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0915 0.114 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0156 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.24e-01 0.168 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0581 0.0897 0.191 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0831 0.0902 0.191 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 8.04e-02 0.148 0.0842 0.191 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00691 0.044 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 4.29e-01 0.0867 0.109 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0525 0.0587 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 7.57e-02 0.154 0.0864 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 4.51e-01 0.073 0.0966 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.88e-01 0.0153 0.109 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 8.58e-01 -0.016 0.0899 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 7.16e-02 0.173 0.0957 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 2.57e-01 -0.115 0.101 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0958 0.106 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 3.11e-01 0.103 0.102 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0408 0.0403 0.192 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 5.25e-02 -0.206 0.106 0.192 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0596 0.0695 0.192 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 6.12e-01 0.0484 0.0952 0.192 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 3.42e-01 0.0994 0.104 0.192 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.13e-01 0.0247 0.104 0.192 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 6.60e-01 0.0409 0.093 0.192 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 6.68e-01 0.0419 0.0975 0.192 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 2.11e-01 -0.126 0.1 0.192 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 4.47e-02 -0.205 0.102 0.192 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 2.42e-01 -0.109 0.0932 0.192 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 3.07e-01 0.0571 0.0558 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 6.67e-01 0.0436 0.101 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0105 0.0526 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 2.12e-01 0.0929 0.0742 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 3.90e-01 -0.076 0.0883 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 2.22e-01 -0.12 0.0983 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0257 0.0747 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.23e-01 0.125 0.0805 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0937 0.11 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0298 0.107 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 8.47e-01 0.0194 0.1 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 9.52e-01 0.00295 0.0488 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000152 0.1 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0149 0.0535 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 4.60e-02 0.165 0.0821 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 3.89e-01 0.0828 0.096 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00397 0.106 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000538 0.0919 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 9.91e-02 0.15 0.0905 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 9.08e-01 0.0111 0.0959 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 3.26e-01 0.109 0.11 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 2.18e-01 0.117 0.0949 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 2.65e-01 -0.119 0.106 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 9.43e-04 -0.349 0.104 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 8.00e-02 0.163 0.0927 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000307 0.103 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0183 0.109 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 2.46e-01 0.121 0.104 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0904 0.0805 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 4.09e-03 -0.265 0.0913 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 2.65e-07 0.359 0.0674 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0391 0.0781 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.63e-01 0.0146 0.0847 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 5.98e-01 0.0312 0.0592 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 2.30e-02 -0.192 0.084 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 9.47e-04 -0.32 0.0956 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 1.18e-02 0.19 0.0748 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00956 0.095 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 1.39e-01 -0.131 0.0884 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0324 0.0583 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 2.99e-01 -0.106 0.102 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 1.09e-03 -0.317 0.0957 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 1.61e-01 0.132 0.094 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00793 0.102 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0469 0.0965 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 9.22e-02 0.145 0.0859 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 8.47e-02 0.162 0.0934 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 1.61e-02 -0.231 0.0951 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 9.28e-01 0.00702 0.0771 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0923 0.104 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0468 0.103 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0659 0.0879 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.62e-01 -0.153 0.109 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 7.34e-01 -0.033 0.0969 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 7.88e-03 -0.254 0.0947 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 4.24e-03 0.245 0.0848 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 2.47e-01 -0.106 0.0917 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0963 0.0996 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 3.34e-01 0.0635 0.0656 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 8.23e-01 0.0228 0.101 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0638 0.105 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 2.58e-01 -0.106 0.0936 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 2.03e-02 0.224 0.0958 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 4.69e-02 -0.21 0.105 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 3.77e-01 0.092 0.104 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 1.59e-01 -0.131 0.0927 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0112 0.102 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 5.03e-01 0.0738 0.11 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 5.82e-02 -0.197 0.103 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 1.77e-02 0.263 0.11 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 5.43e-02 -0.23 0.119 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0276 0.114 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 4.87e-02 -0.197 0.0991 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 2.79e-01 -0.119 0.11 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 3.75e-01 0.0326 0.0367 0.19 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 1.49e-01 -0.149 0.103 0.19 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0755 0.1 0.19 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 5.87e-04 0.302 0.0865 0.19 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 1.21e-01 -0.165 0.106 0.19 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0973 0.109 0.19 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0385 0.0905 0.19 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 5.22e-03 0.285 0.101 0.19 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 1.14e-01 -0.159 0.1 0.19 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 2.47e-01 0.103 0.0888 0.19 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0156 0.112 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0842 0.0811 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 5.23e-02 -0.182 0.0931 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 7.95e-01 0.0286 0.11 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 7.57e-02 0.19 0.106 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0379 0.0969 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 2.06e-01 0.129 0.102 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 9.58e-01 0.00567 0.108 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 2.91e-01 0.102 0.0969 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 5.19e-05 -0.377 0.0913 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0357 0.0717 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 6.62e-01 0.0436 0.0996 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 6.21e-01 0.0477 0.0963 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 2.40e-01 -0.097 0.0823 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 2.01e-02 0.232 0.099 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 5.66e-02 0.215 0.112 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0169 0.102 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 3.63e-02 -0.219 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0631 0.0842 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0802 0.11 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0975 0.112 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00103 0.105 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 2.74e-02 0.236 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 7.48e-02 0.188 0.105 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 4.56e-03 -0.274 0.0954 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 2.51e-02 -0.203 0.0899 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 3.01e-01 0.0715 0.069 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0193 0.0964 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.13e-01 0.0229 0.097 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0764 0.0762 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 6.78e-01 0.0413 0.0994 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 5.82e-01 0.0591 0.107 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 7.40e-02 -0.143 0.0792 0.2 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 4.57e-02 0.215 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 7.19e-01 0.0303 0.0839 0.2 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 1.97e-01 0.155 0.12 0.2 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0498 0.138 0.2 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 2.21e-01 0.104 0.0846 0.2 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 3.18e-01 0.0982 0.0978 0.2 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00713 0.0997 0.2 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.2 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00571 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 9.46e-01 0.00662 0.0982 0.2 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 5.20e-01 0.0241 0.0375 0.193 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0732 0.0755 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 1.23e-01 -0.154 0.0998 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 8.62e-01 0.0129 0.0742 0.193 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 3.10e-01 -0.108 0.106 0.193 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0152 0.0802 0.193 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 2.87e-01 0.0928 0.0869 0.193 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 6.79e-01 -0.031 0.0747 0.193 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 8.80e-01 0.0105 0.0692 0.193 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0761 0.0756 0.193 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 1.54e-01 -0.151 0.106 0.192 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 4.11e-02 -0.224 0.109 0.192 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 3.30e-02 0.205 0.0953 0.192 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0574 0.105 0.192 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 3.01e-01 0.112 0.108 0.192 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 3.02e-01 0.091 0.088 0.192 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 1.02e-02 0.243 0.0934 0.193 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0109 0.0928 0.193 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 5.45e-02 0.229 0.119 0.193 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 9.77e-02 0.179 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 3.19e-01 -0.112 0.112 0.193 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 4.64e-01 0.0774 0.105 0.193 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0568 0.0822 0.193 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 9.25e-01 0.00887 0.0939 0.193 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 8.73e-02 -0.16 0.0934 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 7.66e-01 0.0211 0.0709 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 6.32e-02 -0.174 0.0933 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 1.60e-01 -0.149 0.105 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 5.60e-01 0.0553 0.0947 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 5.02e-01 0.0549 0.0817 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.77e-02 0.164 0.0688 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 9.81e-02 -0.168 0.101 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 3.15e-01 0.0787 0.0781 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 9.66e-01 0.004 0.0952 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 3.03e-01 0.115 0.111 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 2.72e-01 0.115 0.104 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 7.56e-01 0.0301 0.0969 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.54e-01 0.108 0.0752 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0123 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 4.34e-02 -0.243 0.119 0.182 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 4.81e-01 0.0644 0.0911 0.182 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0772 0.12 0.182 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 7.43e-01 0.0415 0.126 0.182 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0744 0.118 0.182 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.01e-01 -0.196 0.119 0.182 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 5.97e-02 0.22 0.116 0.182 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 8.42e-01 0.0215 0.108 0.182 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 1.91e-01 -0.133 0.101 0.189 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0073 0.0931 0.189 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 6.80e-02 -0.199 0.108 0.189 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 8.27e-01 0.0224 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 3.06e-01 -0.108 0.106 0.189 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 4.04e-01 0.0856 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 4.92e-01 0.0616 0.0894 0.189 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 7.93e-01 0.0273 0.104 0.186 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 7.71e-01 -0.028 0.0962 0.186 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0654 0.115 0.186 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 2.06e-01 0.127 0.1 0.186 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 4.08e-01 0.0801 0.0967 0.186 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0103 0.0931 0.186 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 5.68e-02 0.165 0.0859 0.186 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 7.20e-02 -0.217 0.12 0.186 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 8.58e-01 0.019 0.105 0.186 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 7.64e-01 0.0335 0.112 0.186 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 6.12e-01 0.0565 0.111 0.186 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0187 0.117 0.186 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 7.14e-01 0.0374 0.102 0.186 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0745 0.0786 0.186 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00203 0.105 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0175 0.0512 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 1.86e-01 -0.136 0.102 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00895 0.0541 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 1.02e-01 0.139 0.0845 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 4.33e-01 0.0688 0.0875 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0308 0.099 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00524 0.074 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 8.14e-02 0.154 0.088 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 1.29e-01 -0.155 0.102 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 9.42e-02 -0.178 0.106 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 4.69e-01 0.0768 0.106 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -676193 sc-eQTL 9.99e-01 -8.07e-05 0.0591 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 6.75e-01 0.0406 0.0966 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 8.64e-01 0.00816 0.0477 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 5.19e-02 0.132 0.0677 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 9.12e-01 0.00924 0.0837 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 2.05e-01 -0.121 0.0951 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0352 0.0714 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 3.59e-02 0.157 0.0742 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 66079 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0637 0.108 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 8.51e-01 0.0207 0.11 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -392034 sc-eQTL 4.72e-01 0.0721 0.1 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 3.21e-02 -0.186 0.086 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 5.97e-01 0.0372 0.0702 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 1.83e-01 -0.12 0.0901 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0552 0.107 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 2.53e-01 0.105 0.0912 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 5.96e-01 0.0422 0.0795 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.62e-02 0.156 0.0644 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0487 0.0988 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0291 0.0863 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0969 0.104 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 2.28e-01 0.121 0.1 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0459 0.0998 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 9.99e-01 0.000138 0.0867 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 1.43e-01 0.109 0.0744 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -314569 sc-eQTL 1.70e-01 -0.127 0.0924 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 108604 sc-eQTL 8.13e-05 -0.351 0.0872 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -25408 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0183 0.062 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 525446 sc-eQTL 8.36e-01 0.0197 0.0951 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 397779 sc-eQTL 8.67e-01 0.0148 0.0883 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -256598 sc-eQTL 7.73e-02 -0.126 0.071 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 sc-eQTL 5.31e-03 0.266 0.0943 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -314634 sc-eQTL 3.74e-02 0.234 0.112 0.19 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 108604 eQTL 7.34e-03 -0.089 0.0331 0.0 0.0 0.166
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 eQTL 8.67e-12 0.126 0.0182 0.0 0.0 0.166
ENSG00000139351 SYCP3 66082 eQTL 0.0345 0.0997 0.0471 0.0 0.0 0.166


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -72029 8.64e-06 9.04e-06 9.56e-07 3.85e-06 1.69e-06 3.88e-06 9.17e-06 1.05e-06 4.7e-06 3.16e-06 8.47e-06 3.23e-06 1.12e-05 3.47e-06 9.41e-07 3.93e-06 2.92e-06 3.86e-06 1.65e-06 1.39e-06 2.77e-06 6.84e-06 5.12e-06 1.81e-06 9.79e-06 2.1e-06 3.09e-06 1.55e-06 6.94e-06 7.59e-06 3.5e-06 5.26e-07 5.4e-07 2.19e-06 2.22e-06 1.15e-06 1.06e-06 4.36e-07 8.51e-07 5.77e-07 4.32e-07 8.28e-06 7.18e-07 1.81e-07 6.07e-07 7.95e-07 1.16e-06 5.05e-07 3.75e-07