logo

Genes within 1Mb (chr12:101793441:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 8.94e-01 0.00593 0.0442 0.19 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0256 0.0769 0.19 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0428 0.0467 0.19 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 7.30e-03 0.18 0.0665 0.19 B L1
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 7.24e-01 0.0271 0.0769 0.19 B L1
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0775 0.0659 0.19 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0489 0.0528 0.19 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 3.84e-02 0.124 0.0594 0.19 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 2.21e-01 -0.117 0.095 0.19 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0456 0.0913 0.19 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 6.04e-01 0.0442 0.0851 0.19 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 2.64e-02 -0.156 0.0696 0.19 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 5.82e-03 -0.26 0.0933 0.19 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 7.30e-08 0.343 0.0615 0.19 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0394 0.0728 0.19 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0158 0.0712 0.19 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 4.62e-01 0.0367 0.0498 0.19 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 4.28e-01 0.0699 0.0879 0.19 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 4.53e-03 -0.269 0.0936 0.19 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 3.19e-01 0.0625 0.0625 0.19 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 2.23e-04 -0.288 0.0766 0.19 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0735 0.0871 0.19 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0245 0.0619 0.19 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0461 0.0887 0.19 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 1.90e-01 0.129 0.0979 0.189 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 7.09e-01 0.0335 0.0898 0.189 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 2.24e-02 0.225 0.0976 0.189 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 4.06e-02 0.216 0.105 0.189 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 2.99e-01 -0.114 0.109 0.189 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 9.96e-01 0.000422 0.0944 0.189 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0911 0.0776 0.189 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 8.90e-01 0.0143 0.103 0.189 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 4.72e-03 -0.23 0.0806 0.19 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 5.91e-01 0.0374 0.0695 0.19 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 9.24e-02 -0.146 0.0866 0.19 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 9.00e-01 0.0122 0.0973 0.19 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 4.31e-01 0.0705 0.0894 0.19 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 3.54e-01 0.073 0.0786 0.19 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.71e-02 0.152 0.0633 0.19 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 1.94e-01 -0.115 0.0879 0.189 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 6.30e-04 -0.276 0.0796 0.189 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 6.25e-01 -0.029 0.0593 0.189 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 5.36e-01 0.0592 0.0954 0.189 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 4.09e-01 0.0725 0.0876 0.189 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0834 0.0659 0.189 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.02e-02 0.24 0.0927 0.189 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 4.08e-02 0.225 0.109 0.189 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0173 0.0339 0.19 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 5.26e-01 -0.041 0.0646 0.19 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 1.52e-01 -0.135 0.0939 0.19 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 2.87e-02 0.148 0.0673 0.19 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0565 0.106 0.19 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0404 0.0775 0.19 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 7.34e-01 0.0235 0.0689 0.19 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00225 0.0827 0.19 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 3.31e-01 -0.067 0.0687 0.19 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0415 0.08 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 4.18e-01 -0.017 0.021 0.191 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0201 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 4.96e-01 0.0548 0.0804 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 2.91e-02 0.248 0.113 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 1.94e-01 -0.144 0.11 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0915 0.114 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0156 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.24e-01 0.168 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0581 0.0897 0.191 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0831 0.0902 0.191 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 8.04e-02 0.148 0.0842 0.191 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00278 0.0441 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 4.43e-01 0.0843 0.11 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0674 0.0588 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 9.59e-02 0.145 0.0866 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 6.56e-01 0.0431 0.0968 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 9.07e-01 0.0128 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00192 0.09 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 7.50e-02 0.172 0.0959 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 2.34e-01 -0.121 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0709 0.106 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 2.95e-01 0.107 0.102 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0405 0.0403 0.19 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 4.30e-02 -0.215 0.106 0.19 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0686 0.0696 0.19 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 5.75e-01 0.0535 0.0954 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 4.88e-01 0.0727 0.105 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 9.84e-01 0.00214 0.104 0.19 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 5.43e-01 0.0567 0.0931 0.19 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 6.68e-01 0.042 0.0977 0.19 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 2.39e-01 -0.118 0.1 0.19 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 3.81e-02 -0.213 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 1.85e-01 -0.124 0.0933 0.19 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 3.20e-01 0.0557 0.0559 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 9.50e-01 0.00634 0.101 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0181 0.0527 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 2.90e-01 0.079 0.0744 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0793 0.0884 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0998 0.0986 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0408 0.0748 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.54e-01 0.115 0.0807 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0856 0.11 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0169 0.107 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00185 0.1 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 8.76e-01 0.00773 0.0493 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 9.50e-01 0.00636 0.101 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0166 0.0541 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 4.78e-02 0.165 0.0831 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 3.50e-01 0.0909 0.097 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0363 0.107 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 7.72e-01 -0.027 0.0929 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.81e-01 0.123 0.0917 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 9.22e-01 0.00946 0.0969 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 3.66e-01 0.101 0.112 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 4.28e-01 0.0764 0.0962 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 2.77e-01 -0.116 0.107 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 9.48e-04 -0.35 0.104 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 8.32e-02 0.162 0.0931 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0143 0.103 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00682 0.109 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 2.75e-01 0.114 0.105 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 1.31e-01 -0.122 0.0806 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 7.61e-03 -0.248 0.0919 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 5.60e-08 0.379 0.0672 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0536 0.0784 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 9.36e-01 0.00686 0.0851 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 7.81e-01 0.0166 0.0594 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 3.43e-02 -0.18 0.0844 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 2.36e-03 -0.296 0.0963 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 4.44e-03 0.215 0.0747 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0174 0.0953 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 1.67e-01 -0.123 0.0888 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0292 0.0585 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 3.26e-01 -0.101 0.102 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 1.45e-03 -0.31 0.0962 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 1.78e-01 0.128 0.0945 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0026 0.103 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0305 0.097 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 9.61e-02 0.144 0.0863 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 8.50e-02 0.162 0.0939 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 3.31e-02 -0.206 0.0959 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 9.53e-01 0.00453 0.0776 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 2.31e-01 -0.126 0.105 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0649 0.104 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0812 0.0883 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.57e-01 -0.156 0.11 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0307 0.0974 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 1.10e-02 -0.244 0.0953 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 1.87e-03 0.268 0.085 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 3.58e-01 -0.085 0.0923 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0932 0.1 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 3.24e-01 0.0652 0.066 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 6.91e-01 0.0405 0.102 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0658 0.105 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 2.55e-01 -0.107 0.0936 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 1.24e-02 0.242 0.0957 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 5.81e-02 -0.2 0.105 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 3.82e-01 0.0911 0.104 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 2.31e-01 -0.112 0.0929 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000321 0.102 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 4.22e-01 0.0886 0.11 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 6.94e-02 -0.189 0.103 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 1.26e-02 0.277 0.11 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 1.13e-01 -0.19 0.119 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 9.05e-01 0.0138 0.115 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 5.94e-02 -0.188 0.0993 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 2.89e-01 -0.117 0.11 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 4.18e-01 0.0299 0.0368 0.188 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 1.65e-01 -0.143 0.103 0.188 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0629 0.101 0.188 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 9.31e-04 0.292 0.0871 0.188 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 1.48e-01 -0.155 0.107 0.188 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 2.34e-01 -0.13 0.109 0.188 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0708 0.0907 0.188 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 9.86e-03 0.264 0.101 0.188 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 6.89e-02 -0.183 0.1 0.188 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 2.16e-01 0.111 0.0891 0.188 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 9.64e-01 0.00513 0.113 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0964 0.0813 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 3.02e-02 -0.203 0.0931 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 6.60e-01 0.0484 0.11 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 1.21e-01 0.167 0.107 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0495 0.0971 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.84e-01 0.136 0.102 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 9.88e-01 0.00166 0.108 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 3.28e-01 0.0953 0.0971 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 9.69e-05 -0.365 0.0918 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0288 0.0719 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 6.44e-01 0.0462 0.0999 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 6.21e-01 0.0478 0.0966 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 2.21e-01 -0.101 0.0825 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 2.16e-02 0.23 0.0992 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 3.82e-02 0.234 0.112 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0474 0.102 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 4.89e-02 -0.206 0.104 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0768 0.0842 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0828 0.11 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0946 0.113 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 9.34e-01 0.00867 0.105 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.65e-02 0.257 0.106 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 2.03e-01 0.135 0.105 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 4.98e-03 -0.271 0.0956 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 2.44e-02 -0.204 0.0901 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 3.33e-01 0.0671 0.0691 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00697 0.0965 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 7.30e-01 0.0335 0.0971 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0656 0.0764 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 6.45e-01 0.046 0.0996 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 5.39e-01 0.0662 0.108 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 7.40e-02 -0.143 0.0792 0.2 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 4.57e-02 0.215 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 7.19e-01 0.0303 0.0839 0.2 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 1.97e-01 0.155 0.12 0.2 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0498 0.138 0.2 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 2.21e-01 0.104 0.0846 0.2 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 3.18e-01 0.0982 0.0978 0.2 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00713 0.0997 0.2 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.2 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00571 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 9.46e-01 0.00662 0.0982 0.2 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 7.80e-01 0.0105 0.0376 0.191 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0762 0.0757 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 1.41e-01 -0.148 0.1 0.191 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 8.98e-01 0.00956 0.0744 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0898 0.106 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00988 0.0803 0.191 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 3.06e-01 0.0894 0.0871 0.191 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0182 0.0749 0.191 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 9.41e-01 0.00514 0.0694 0.191 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0751 0.0757 0.191 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 2.61e-01 -0.12 0.106 0.19 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 7.36e-02 -0.197 0.11 0.19 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 2.22e-02 0.22 0.0954 0.19 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0434 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 3.44e-01 0.103 0.109 0.19 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 1.53e-01 0.126 0.088 0.19 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 1.54e-02 0.229 0.0935 0.19 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0245 0.0926 0.19 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 4.20e-02 0.242 0.118 0.19 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 8.00e-02 0.189 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0999 0.112 0.19 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 4.83e-01 0.0741 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0534 0.0821 0.19 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 9.60e-01 0.00476 0.0937 0.19 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 9.03e-02 -0.159 0.0932 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 5.27e-01 0.0448 0.0707 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 7.01e-02 -0.17 0.0932 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 2.10e-01 -0.132 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 6.09e-01 0.0485 0.0946 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 4.32e-01 0.0642 0.0815 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.60e-02 0.167 0.0686 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 6.00e-02 -0.191 0.101 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 1.58e-01 0.11 0.0776 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 8.59e-01 0.0169 0.0948 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 3.60e-01 0.102 0.111 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 1.84e-01 0.139 0.104 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 6.50e-01 0.0438 0.0965 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 6.88e-02 0.137 0.0747 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00275 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 4.72e-02 -0.239 0.119 0.182 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 5.41e-01 0.0558 0.0911 0.182 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0781 0.12 0.182 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 8.80e-01 0.0191 0.126 0.182 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0882 0.118 0.182 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.04e-01 -0.194 0.119 0.182 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 5.98e-02 0.22 0.116 0.182 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 8.12e-01 0.0256 0.108 0.182 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 2.13e-01 -0.126 0.101 0.187 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0193 0.0929 0.187 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 7.85e-02 -0.192 0.108 0.187 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 8.99e-01 0.0129 0.102 0.187 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 3.20e-01 -0.105 0.105 0.187 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 3.43e-01 0.097 0.102 0.187 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 3.55e-01 0.0826 0.0891 0.187 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 8.56e-01 0.019 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 9.49e-01 0.00615 0.0963 0.183 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0498 0.115 0.183 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 2.84e-01 0.108 0.101 0.183 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 4.68e-01 0.0703 0.0968 0.183 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0109 0.0932 0.183 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 7.97e-02 0.152 0.0861 0.183 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 7.27e-02 -0.216 0.12 0.184 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 7.01e-01 0.0405 0.105 0.184 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 7.37e-01 0.0375 0.111 0.184 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 7.01e-01 0.0427 0.111 0.184 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0252 0.117 0.184 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 6.25e-01 0.0497 0.102 0.184 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0724 0.0785 0.184 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 8.13e-01 0.0248 0.104 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0133 0.0514 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 1.92e-01 -0.135 0.103 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0225 0.0543 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 1.01e-01 0.14 0.0849 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 7.71e-01 0.0256 0.088 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 6.95e-01 -0.039 0.0995 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 9.46e-01 0.00501 0.0743 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 6.74e-02 0.162 0.0883 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 1.36e-01 -0.153 0.102 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 1.21e-01 -0.166 0.107 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 4.75e-01 0.0761 0.106 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -688303 sc-eQTL 9.87e-01 0.000995 0.0592 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 9.17e-01 0.0101 0.0968 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 9.68e-01 0.00195 0.0478 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 9.10e-02 0.115 0.068 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 8.30e-01 0.018 0.0838 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.0951 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0568 0.0715 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 5.93e-02 0.141 0.0744 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 53969 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0409 0.108 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 7.46e-01 0.0357 0.11 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -404144 sc-eQTL 7.95e-01 0.0261 0.1 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 2.47e-02 -0.194 0.0856 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 3.37e-01 0.0673 0.0699 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 2.17e-01 -0.111 0.0899 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0443 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 2.22e-01 0.111 0.0909 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 4.88e-01 0.055 0.0793 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 9.24e-03 0.168 0.0641 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0553 0.0986 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 9.99e-01 0.000149 0.0862 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0849 0.104 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 3.14e-01 0.101 0.1 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0544 0.0996 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 9.65e-01 0.00382 0.0865 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 1.56e-01 0.106 0.0743 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -326679 sc-eQTL 1.38e-01 -0.138 0.0925 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 96494 sc-eQTL 1.22e-04 -0.343 0.0876 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -37518 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0201 0.0622 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 513336 sc-eQTL 7.86e-01 0.0259 0.0954 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 385669 sc-eQTL 7.59e-01 0.0272 0.0885 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -268708 sc-eQTL 9.64e-02 -0.119 0.0712 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 sc-eQTL 4.99e-03 0.268 0.0945 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -326744 sc-eQTL 3.34e-02 0.24 0.112 0.188 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 96494 eQTL 1.31e-02 -0.0833 0.0335 0.0 0.0 0.162
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 eQTL 2.13e-11 0.125 0.0184 0.0 0.0 0.162
ENSG00000139351 SYCP3 53972 eQTL 0.0305 0.103 0.0476 0.0 0.0 0.162

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -84139 8.56e-06 9.98e-06 9.7e-07 6.54e-06 1.51e-06 4.37e-06 9.59e-06 1.21e-06 8.84e-06 4.73e-06 1.2e-05 4.92e-06 1.36e-05 3.67e-06 1.2e-06 5.7e-06 3.7e-06 4.99e-06 2.23e-06 1.54e-06 3.6e-06 7.71e-06 6.69e-06 1.99e-06 1.52e-05 2.3e-06 4.45e-06 2.11e-06 6.95e-06 6.6e-06 5.48e-06 9.58e-07 7.37e-07 2.89e-06 3.75e-06 1.33e-06 1.31e-06 1.53e-06 1.34e-06 8.66e-07 8.4e-07 1.24e-05 1.43e-06 1.64e-07 3.7e-07 1.32e-06 9.16e-07 7.36e-07 2.09e-07