logo

Genes within 1Mb (chr12:101790726:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 8.62e-02 -0.133 0.0771 0.051 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 2.57e-01 -0.153 0.135 0.051 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 2.37e-01 -0.097 0.0818 0.051 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0424 0.119 0.051 B L1
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 3.64e-01 -0.123 0.135 0.051 B L1
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 2.01e-01 0.148 0.116 0.051 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0684 0.0928 0.051 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 2.15e-01 0.131 0.105 0.051 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 51254 sc-eQTL 3.89e-01 -0.144 0.167 0.051 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 1.98e-01 0.206 0.16 0.051 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 6.27e-01 0.0727 0.149 0.051 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0878 0.121 0.051 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 6.88e-06 -0.718 0.156 0.051 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 1.53e-02 -0.273 0.112 0.051 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 2.86e-01 0.133 0.125 0.051 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0655 0.122 0.051 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0254 0.0857 0.051 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0256 0.151 0.051 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 6.88e-05 -0.639 0.157 0.051 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0821 0.107 0.051 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 2.62e-01 0.152 0.135 0.051 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 3.40e-01 0.143 0.149 0.051 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 6.56e-01 0.0473 0.106 0.051 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 1.70e-01 0.208 0.151 0.051 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 6.34e-01 0.0808 0.169 0.052 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.155 0.052 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 2.58e-01 0.192 0.17 0.052 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0244 0.183 0.052 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 1.50e-01 0.272 0.188 0.052 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 9.72e-01 0.00564 0.163 0.052 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 4.62e-01 0.0988 0.134 0.052 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 6.10e-01 0.0903 0.177 0.052 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 1.92e-01 0.187 0.143 0.051 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0661 0.121 0.051 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 2.79e-01 0.165 0.152 0.051 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 1.92e-01 0.221 0.169 0.051 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0125 0.156 0.051 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 9.00e-01 0.0174 0.138 0.051 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 7.42e-03 0.298 0.11 0.051 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 5.48e-02 0.295 0.153 0.052 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 2.89e-04 -0.511 0.139 0.052 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 2.50e-02 0.231 0.102 0.052 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 2.17e-01 -0.206 0.166 0.052 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 8.72e-01 0.0248 0.153 0.052 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 2.52e-01 -0.132 0.115 0.052 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 8.77e-01 0.0255 0.164 0.052 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 8.90e-01 0.0268 0.193 0.052 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0638 0.0589 0.051 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0489 0.112 0.051 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 1.74e-05 -0.692 0.157 0.051 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 4.89e-01 0.082 0.118 0.051 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 2.32e-01 -0.221 0.185 0.051 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0385 0.135 0.051 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 2.37e-01 0.142 0.12 0.051 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00662 0.144 0.051 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 2.68e-01 0.133 0.12 0.051 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 3.77e-01 -0.123 0.139 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0383 0.0789 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 8.07e-03 -0.517 0.193 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0453 0.106 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 2.17e-01 0.193 0.156 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 4.92e-02 -0.34 0.172 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 3.11e-01 0.198 0.195 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 4.85e-02 -0.317 0.16 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 7.24e-02 0.31 0.172 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 51254 sc-eQTL 2.45e-03 -0.546 0.178 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 8.95e-01 0.0251 0.191 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0345 0.183 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00679 0.0705 0.052 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0261 0.186 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 2.49e-01 -0.14 0.121 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 5.57e-01 0.0978 0.166 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 4.45e-01 0.14 0.183 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 3.71e-01 -0.163 0.181 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 1.59e-01 0.229 0.162 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 1.29e-01 0.259 0.17 0.052 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 51254 sc-eQTL 2.08e-01 0.221 0.175 0.052 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 1.69e-01 0.247 0.179 0.052 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0659 0.163 0.052 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 2.21e-01 -0.119 0.0971 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0717 0.176 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0831 0.0915 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 9.46e-01 0.00871 0.13 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0227 0.154 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 4.53e-01 0.129 0.172 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 4.53e-01 0.0976 0.13 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00517 0.141 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 51254 sc-eQTL 3.12e-01 -0.193 0.191 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 4.71e-02 0.369 0.185 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00989 0.175 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 8.12e-01 0.0202 0.085 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 8.72e-01 0.0282 0.174 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0365 0.0933 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 9.34e-01 0.012 0.145 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 1.67e-01 -0.231 0.167 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 3.12e-01 0.186 0.184 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 6.99e-01 0.062 0.16 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 3.14e-01 0.16 0.158 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 51254 sc-eQTL 1.06e-01 0.27 0.166 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 7.78e-01 0.0544 0.193 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 1.44e-01 0.242 0.165 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 4.72e-01 0.133 0.184 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 1.14e-01 -0.292 0.184 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 9.28e-01 0.0147 0.161 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 5.40e-01 -0.109 0.177 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 3.89e-01 -0.162 0.188 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 5.56e-01 0.106 0.18 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 2.12e-01 -0.175 0.139 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 5.83e-06 -0.715 0.154 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 9.00e-03 -0.323 0.122 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 1.34e-01 0.203 0.135 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0453 0.147 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0415 0.103 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 6.39e-01 0.0695 0.148 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 1.32e-05 -0.727 0.163 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0521 0.132 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 3.55e-01 0.153 0.165 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0305 0.154 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 4.63e-01 0.0745 0.101 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 3.08e-01 0.179 0.175 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 8.93e-04 -0.553 0.164 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 5.68e-01 0.0928 0.162 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 6.00e-01 0.092 0.175 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 4.29e-01 -0.131 0.166 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0344 0.148 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 1.70e-01 -0.22 0.16 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 8.07e-03 -0.433 0.162 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 2.11e-01 0.165 0.131 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 6.37e-01 0.0842 0.178 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 7.05e-02 0.318 0.175 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 8.30e-01 0.0322 0.15 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 4.58e-02 0.372 0.185 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 2.05e-01 -0.216 0.17 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 6.55e-06 -0.748 0.162 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 3.37e-02 -0.322 0.151 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 2.84e-01 0.174 0.162 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 2.18e-01 0.217 0.175 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 1.65e-01 0.161 0.115 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 1.52e-02 0.432 0.176 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 5.55e-01 0.118 0.2 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 1.55e-05 -0.758 0.171 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 4.38e-01 -0.144 0.185 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 7.63e-01 0.0611 0.202 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 8.53e-02 -0.341 0.197 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0675 0.178 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 2.82e-01 -0.209 0.194 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 1.61e-01 0.244 0.173 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 1.88e-02 -0.385 0.162 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 8.37e-02 -0.304 0.175 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 9.84e-01 0.00388 0.189 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 3.11e-01 0.183 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 4.14e-01 -0.129 0.158 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 8.52e-01 0.0326 0.174 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0352 0.0642 0.052 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0422 0.18 0.052 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 3.45e-06 -0.795 0.167 0.052 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0372 0.156 0.052 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0614 0.186 0.052 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0589 0.19 0.052 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 2.43e-01 0.185 0.158 0.052 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 2.41e-02 -0.403 0.177 0.052 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 2.55e-01 0.2 0.175 0.052 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 2.26e-01 -0.188 0.155 0.052 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 2.60e-01 0.229 0.202 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 1.66e-01 -0.203 0.146 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 6.00e-01 0.0892 0.17 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 9.22e-01 0.0194 0.198 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0515 0.194 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 3.78e-01 0.154 0.175 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0132 0.184 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 4.37e-01 -0.151 0.194 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 9.76e-01 0.0052 0.171 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 8.43e-03 -0.437 0.164 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 2.74e-03 0.375 0.124 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0956 0.175 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 4.39e-01 0.131 0.169 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 5.29e-01 0.0916 0.145 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0638 0.176 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 3.57e-01 0.183 0.198 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 9.48e-02 0.293 0.174 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 4.65e-02 -0.358 0.178 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 2.05e-01 0.183 0.144 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 3.73e-01 -0.169 0.189 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 9.00e-01 0.0245 0.194 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0288 0.18 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 4.86e-01 0.129 0.185 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 2.82e-01 -0.196 0.181 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 1.53e-01 0.248 0.173 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 4.14e-04 -0.566 0.158 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 1.73e-01 0.168 0.123 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 1.04e-01 -0.279 0.171 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 1.69e-01 -0.238 0.172 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 1.74e-03 -0.422 0.133 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0269 0.178 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0206 0.192 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 4.18e-01 0.0989 0.122 0.063 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0762 0.164 0.063 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 3.31e-01 -0.124 0.127 0.063 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 4.96e-01 -0.125 0.183 0.063 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 3.40e-01 0.201 0.21 0.063 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00649 0.129 0.063 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 9.74e-02 -0.246 0.147 0.063 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 2.95e-01 0.159 0.151 0.063 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 51254 sc-eQTL 2.50e-01 -0.202 0.175 0.063 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0364 0.161 0.063 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 2.37e-02 0.334 0.146 0.063 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0826 0.0641 0.052 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0972 0.13 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 1.02e-02 -0.439 0.169 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 5.44e-02 0.244 0.126 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 9.60e-01 0.00915 0.182 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00615 0.137 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0364 0.149 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 7.92e-01 0.0338 0.128 0.052 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 8.60e-01 0.021 0.119 0.052 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 9.28e-01 0.0117 0.13 0.052 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 8.96e-01 0.0236 0.18 0.051 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 1.22e-04 -0.707 0.181 0.051 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 3.84e-01 -0.142 0.163 0.051 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 8.18e-01 -0.041 0.178 0.051 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0636 0.184 0.051 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 5.99e-01 0.0788 0.149 0.051 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 4.22e-01 0.131 0.163 0.054 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 4.43e-01 0.122 0.159 0.054 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 1.40e-01 0.303 0.204 0.054 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0127 0.186 0.054 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 4.44e-01 0.148 0.193 0.054 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0129 0.181 0.054 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 9.26e-01 0.0132 0.141 0.054 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0124 0.161 0.054 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 8.32e-01 0.0347 0.163 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0493 0.123 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 7.53e-01 0.0514 0.163 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 1.79e-02 0.432 0.181 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 5.97e-01 -0.087 0.164 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 1.15e-01 -0.223 0.141 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 3.26e-02 0.257 0.119 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 4.14e-01 0.144 0.177 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0945 0.135 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 6.74e-01 0.0694 0.165 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0237 0.193 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 4.97e-01 0.123 0.181 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 1.29e-01 0.254 0.167 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 7.42e-02 0.233 0.13 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 7.97e-01 0.0452 0.175 0.053 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 4.46e-01 -0.122 0.16 0.053 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 4.87e-01 0.131 0.188 0.053 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0673 0.176 0.053 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 4.47e-01 0.139 0.182 0.053 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 4.62e-01 0.13 0.176 0.053 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 2.15e-01 0.191 0.154 0.053 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 8.13e-01 0.0422 0.179 0.052 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0916 0.165 0.052 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 2.67e-01 0.219 0.197 0.052 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0203 0.173 0.052 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 3.31e-01 -0.161 0.166 0.052 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 6.41e-01 0.0744 0.159 0.052 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 4.83e-02 0.292 0.147 0.052 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 3.02e-01 -0.21 0.203 0.059 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 2.30e-02 -0.401 0.174 0.059 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 5.35e-01 0.117 0.188 0.059 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 4.92e-01 -0.129 0.187 0.059 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 3.59e-01 0.18 0.196 0.059 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 6.36e-01 0.0814 0.171 0.059 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 3.49e-01 0.124 0.132 0.059 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 4.48e-01 0.134 0.176 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0473 0.0917 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 4.56e-01 -0.138 0.184 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0843 0.0968 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 3.87e-01 0.132 0.152 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 9.79e-01 0.00405 0.157 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0843 0.177 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0694 0.132 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 1.41e-02 0.387 0.156 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 51254 sc-eQTL 3.09e-01 -0.186 0.182 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 7.69e-01 0.0562 0.191 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 4.00e-01 -0.16 0.189 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -691018 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0418 0.103 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0629 0.169 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0709 0.0834 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0672 0.12 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 2.72e-01 -0.161 0.146 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 1.07e-01 0.269 0.166 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 7.46e-01 0.0405 0.125 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 8.72e-01 0.0212 0.131 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 51254 sc-eQTL 5.82e-01 -0.104 0.189 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 7.39e-02 0.344 0.191 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -406859 sc-eQTL 2.98e-01 0.183 0.175 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 4.68e-01 0.109 0.15 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0741 0.121 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 4.13e-01 0.128 0.156 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 8.26e-02 0.32 0.184 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0372 0.158 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00768 0.138 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 1.28e-02 0.279 0.111 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 3.79e-01 0.152 0.172 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0891 0.151 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 4.75e-01 0.13 0.182 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 4.98e-01 -0.119 0.175 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 4.66e-01 0.127 0.174 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 3.48e-01 0.142 0.151 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 9.57e-02 0.217 0.13 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -329394 sc-eQTL 9.19e-02 0.275 0.162 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 93779 sc-eQTL 7.93e-04 -0.528 0.155 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -40233 sc-eQTL 1.16e-02 0.274 0.107 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 510621 sc-eQTL 1.52e-01 -0.24 0.167 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 382954 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00449 0.155 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -271423 sc-eQTL 1.53e-01 -0.18 0.125 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -86854 sc-eQTL 9.65e-01 0.00738 0.169 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -329459 sc-eQTL 6.23e-01 0.0978 0.199 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 \N 93779 1.77e-05 1.9e-05 3.08e-06 1.17e-05 2.97e-06 7.79e-06 2.42e-05 3.72e-06 1.78e-05 8.86e-06 2.39e-05 9.14e-06 2.89e-05 7.03e-06 5.23e-06 1.01e-05 8.79e-06 1.52e-05 4.51e-06 4.99e-06 8.37e-06 1.68e-05 1.61e-05 5.62e-06 2.59e-05 5.5e-06 8.26e-06 7.92e-06 1.82e-05 1.36e-05 1.24e-05 1.45e-06 1.71e-06 4.35e-06 8.41e-06 3.82e-06 1.87e-06 2.73e-06 3.25e-06 2.6e-06 1.64e-06 1.93e-05 2.67e-06 3.18e-07 1.98e-06 2.64e-06 3.43e-06 1.5e-06 1.32e-06
ENSG00000136048 \N -86854 2.06e-05 2.11e-05 3.55e-06 1.24e-05 3.16e-06 8.67e-06 2.73e-05 3.74e-06 1.97e-05 9.82e-06 2.66e-05 9.95e-06 3.19e-05 7.85e-06 5.36e-06 1.09e-05 9.72e-06 1.68e-05 5.04e-06 5.35e-06 9.17e-06 1.91e-05 1.77e-05 6.27e-06 2.78e-05 5.48e-06 8.97e-06 8.42e-06 2.05e-05 1.52e-05 1.29e-05 1.58e-06 1.92e-06 4.93e-06 8.76e-06 4.2e-06 2.12e-06 2.72e-06 3.44e-06 2.77e-06 1.67e-06 2.15e-05 2.68e-06 3.6e-07 2.04e-06 2.68e-06 3.38e-06 1.5e-06 1.38e-06