logo

Genes within 1Mb (chr12:101788264:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0213 0.0645 0.077 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 6.82e-02 -0.204 0.111 0.077 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 3.34e-03 0.198 0.0668 0.077 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 7.26e-02 -0.177 0.098 0.077 B L1
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0375 0.112 0.077 B L1
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.02e-01 -0.158 0.0958 0.077 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 1.25e-01 0.118 0.0768 0.077 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0755 0.0874 0.077 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 7.30e-03 0.371 0.137 0.077 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 3.56e-01 -0.123 0.133 0.077 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 1.71e-01 -0.17 0.124 0.077 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 5.28e-01 0.065 0.103 0.077 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 2.18e-06 0.642 0.132 0.077 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 5.75e-07 -0.468 0.0908 0.077 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 3.29e-02 -0.226 0.105 0.077 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.20e-01 0.162 0.104 0.077 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 1.96e-01 0.0942 0.0727 0.077 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 3.06e-01 0.129 0.126 0.077 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.77e-05 0.576 0.131 0.077 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 9.74e-02 -0.149 0.0894 0.077 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 8.64e-01 0.0195 0.114 0.077 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 3.61e-01 -0.114 0.125 0.077 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 6.70e-01 0.038 0.0889 0.077 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 1.68e-01 0.176 0.127 0.077 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 6.84e-01 0.0572 0.14 0.079 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.20e-01 0.199 0.128 0.079 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0925 0.141 0.079 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 6.74e-02 -0.276 0.15 0.079 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 2.66e-01 -0.174 0.156 0.079 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 6.95e-01 -0.053 0.135 0.079 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 9.78e-01 0.00312 0.111 0.079 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 4.77e-01 -0.104 0.146 0.079 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 3.19e-01 0.119 0.119 0.077 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 7.59e-03 0.268 0.0994 0.077 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 6.92e-01 0.0502 0.127 0.077 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 6.53e-01 0.0637 0.141 0.077 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 6.26e-01 0.0634 0.13 0.077 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 1.94e-01 0.148 0.114 0.077 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 8.53e-01 0.0173 0.0933 0.077 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 9.06e-01 0.0152 0.129 0.077 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 5.76e-06 0.53 0.114 0.077 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00457 0.0867 0.077 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 4.58e-01 0.104 0.139 0.077 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.66e-01 -0.177 0.128 0.077 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 2.31e-01 0.116 0.0963 0.077 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 1.26e-01 0.21 0.137 0.077 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 7.81e-01 0.045 0.161 0.077 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0322 0.0491 0.077 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 7.91e-01 0.0248 0.0936 0.077 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.32e-03 0.434 0.133 0.077 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 1.19e-01 -0.154 0.0981 0.077 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0579 0.154 0.077 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 6.94e-01 0.0442 0.112 0.077 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 7.64e-01 -0.03 0.0998 0.077 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0149 0.12 0.077 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 2.72e-01 0.11 0.0995 0.077 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 1.59e-02 0.278 0.114 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 4.72e-01 0.0219 0.0304 0.079 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 3.79e-01 -0.139 0.157 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 3.34e-02 0.247 0.115 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 1.30e-01 -0.25 0.164 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 1.60e-01 0.225 0.159 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0862 0.165 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 3.74e-01 0.14 0.157 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 2.72e-01 -0.174 0.158 0.079 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 3.94e-01 0.111 0.13 0.079 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0808 0.131 0.079 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 6.98e-01 0.0477 0.123 0.079 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00243 0.0643 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 3.18e-01 -0.16 0.16 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.07e-02 0.218 0.0846 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0368 0.127 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0204 0.141 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.15e-02 -0.399 0.156 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 9.32e-01 0.0112 0.131 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 4.00e-01 -0.119 0.141 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 5.24e-01 0.0945 0.148 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0814 0.155 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 4.35e-01 -0.116 0.149 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 4.44e-01 0.045 0.0587 0.078 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0428 0.155 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 2.27e-04 0.368 0.0981 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 9.07e-01 0.0163 0.139 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 3.47e-01 -0.143 0.152 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0721 0.151 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 7.21e-01 0.0483 0.135 0.078 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 4.06e-01 -0.118 0.142 0.078 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 1.65e-01 0.203 0.146 0.078 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 2.39e-01 -0.176 0.149 0.078 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 1.21e-01 0.211 0.135 0.078 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0162 0.0808 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 4.16e-01 -0.119 0.146 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 2.14e-02 0.174 0.075 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 1.09e-01 -0.172 0.107 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0696 0.128 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.93e-01 -0.185 0.142 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 6.92e-01 0.0428 0.108 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 6.34e-01 0.0557 0.117 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 7.58e-03 0.421 0.156 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 8.59e-01 0.0275 0.154 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0581 0.145 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0404 0.0713 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 2.30e-01 -0.175 0.146 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 2.39e-01 0.0921 0.0781 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 3.79e-01 -0.107 0.121 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 8.76e-01 0.0219 0.141 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0214 0.154 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 7.11e-01 0.0498 0.134 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 9.22e-02 -0.224 0.132 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 8.57e-01 0.0253 0.14 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 2.13e-01 -0.201 0.161 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 1.47e-01 -0.202 0.139 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0832 0.156 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.58e-02 0.375 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 7.92e-02 -0.24 0.136 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 1.03e-01 -0.245 0.149 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 3.83e-01 0.139 0.159 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 6.87e-01 0.0617 0.153 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 5.16e-01 0.077 0.118 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 5.76e-06 0.606 0.13 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 4.91e-07 -0.515 0.0993 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 5.99e-02 -0.215 0.114 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 2.79e-01 0.135 0.124 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 2.53e-01 0.0994 0.0866 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0592 0.124 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.11e-07 0.734 0.134 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 5.11e-03 -0.307 0.108 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 2.05e-01 -0.175 0.138 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 3.95e-01 0.11 0.129 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 4.23e-01 0.0681 0.0848 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0431 0.148 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 2.54e-04 0.515 0.138 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 3.27e-01 -0.135 0.137 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0262 0.149 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 6.30e-01 0.0679 0.141 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 4.29e-01 0.0997 0.126 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 6.46e-01 0.0616 0.134 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 7.04e-06 0.604 0.131 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0423 0.11 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 6.07e-02 0.278 0.147 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 4.30e-01 -0.116 0.147 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0989 0.125 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 5.03e-01 0.104 0.156 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 3.92e-01 0.123 0.143 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 6.04e-06 0.631 0.136 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 5.85e-04 -0.435 0.125 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 1.09e-01 -0.218 0.135 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 4.79e-01 0.105 0.148 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0187 0.0975 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0171 0.15 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 3.96e-01 0.131 0.154 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 8.02e-03 0.364 0.136 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 4.46e-01 -0.109 0.143 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0458 0.156 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 2.08e-03 -0.468 0.15 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 7.62e-01 0.0417 0.137 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 2.21e-01 -0.183 0.149 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 9.06e-01 0.0179 0.151 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 3.93e-02 0.294 0.142 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0725 0.153 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 3.23e-01 0.163 0.164 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 3.31e-01 0.153 0.157 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 4.48e-01 -0.105 0.137 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00521 0.152 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0422 0.0544 0.078 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 8.73e-01 0.0244 0.153 0.078 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 6.19e-03 0.405 0.146 0.078 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00408 0.132 0.078 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 8.49e-01 0.0303 0.158 0.078 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.83e-01 0.215 0.161 0.078 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 3.15e-01 -0.135 0.134 0.078 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 5.66e-01 0.0875 0.152 0.078 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0452 0.149 0.078 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 3.00e-01 0.137 0.132 0.078 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 9.42e-01 0.0118 0.162 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.21e-01 0.182 0.117 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 3.52e-01 0.126 0.135 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 2.45e-01 0.184 0.158 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0246 0.155 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 1.57e-02 0.336 0.138 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0238 0.147 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 5.48e-01 0.0936 0.155 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 4.19e-01 0.115 0.143 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 4.79e-05 0.557 0.134 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0764 0.105 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 4.06e-01 -0.122 0.146 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 2.59e-01 -0.16 0.141 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 6.92e-01 0.0481 0.121 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 1.92e-01 0.192 0.147 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0555 0.166 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 1.81e-02 -0.337 0.141 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 2.31e-02 0.332 0.145 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 9.37e-01 0.00937 0.118 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 5.50e-02 0.296 0.153 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 3.60e-01 0.144 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 3.25e-01 -0.144 0.146 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 3.82e-01 -0.132 0.15 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 5.73e-01 0.0836 0.148 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 4.57e-01 0.106 0.143 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.10e-04 0.509 0.129 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 5.95e-01 -0.054 0.102 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 8.48e-01 0.0272 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.54e-01 -0.203 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 3.11e-01 0.114 0.112 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 2.60e-01 0.165 0.146 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 9.84e-01 0.00309 0.158 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 5.68e-01 0.0712 0.124 0.07 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 5.88e-02 -0.315 0.165 0.07 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 2.03e-01 0.165 0.129 0.07 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 8.35e-01 0.0389 0.187 0.07 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 7.23e-01 0.0762 0.214 0.07 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0235 0.132 0.07 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 4.57e-01 0.113 0.152 0.07 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 4.63e-01 -0.113 0.154 0.07 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 4.07e-01 -0.149 0.179 0.07 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00944 0.164 0.07 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 4.27e-01 0.121 0.151 0.07 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0332 0.0542 0.074 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0293 0.109 0.074 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.26e-02 0.359 0.143 0.074 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 2.86e-01 -0.114 0.107 0.074 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 4.09e-01 -0.127 0.153 0.074 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 3.19e-03 -0.339 0.113 0.074 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 7.25e-01 0.0444 0.126 0.074 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 7.74e-02 -0.19 0.107 0.074 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 2.30e-02 0.226 0.0988 0.074 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 5.30e-01 0.0688 0.109 0.074 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 6.13e-01 0.0766 0.151 0.077 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 7.42e-04 0.524 0.153 0.077 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 2.37e-01 -0.162 0.137 0.077 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 4.36e-01 -0.117 0.149 0.077 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 3.73e-01 0.138 0.155 0.077 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 6.11e-01 -0.064 0.126 0.077 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 1.00e+00 2.89e-07 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 4.45e-01 0.104 0.136 0.08 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 9.58e-01 0.00934 0.176 0.08 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 2.63e-01 -0.179 0.159 0.08 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 3.91e-01 -0.142 0.165 0.08 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 1.11e-01 0.247 0.155 0.08 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 9.58e-01 0.00638 0.121 0.08 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 2.15e-01 -0.171 0.138 0.08 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 5.46e-02 0.263 0.136 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.86e-02 0.242 0.102 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 4.65e-01 0.1 0.137 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 4.52e-01 0.116 0.154 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 6.26e-01 0.0674 0.138 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 8.13e-01 0.0282 0.119 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0106 0.102 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0267 0.148 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 8.38e-02 0.196 0.113 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0419 0.138 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0711 0.162 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0329 0.152 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 6.23e-01 0.0692 0.14 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 9.55e-01 0.00616 0.11 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 2.80e-01 0.204 0.188 0.088 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.72e-01 0.242 0.176 0.088 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 2.99e-01 0.139 0.133 0.088 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 5.91e-01 0.0948 0.176 0.088 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.26e-02 0.457 0.181 0.088 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 3.69e-02 0.358 0.17 0.088 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0497 0.175 0.088 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 4.70e-01 -0.124 0.172 0.088 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 9.51e-03 0.404 0.154 0.088 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 2.01e-01 0.189 0.147 0.078 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.78e-01 0.182 0.135 0.078 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0257 0.159 0.078 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 8.65e-01 0.0253 0.149 0.078 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0817 0.154 0.078 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 1.14e-01 0.235 0.148 0.078 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 2.84e-01 0.139 0.13 0.078 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 3.62e-01 -0.135 0.148 0.077 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.54e-02 0.331 0.135 0.077 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 7.11e-02 -0.296 0.163 0.077 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 3.91e-01 -0.123 0.143 0.077 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 5.87e-01 0.0752 0.138 0.077 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 1.19e-02 0.332 0.131 0.077 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 6.67e-01 0.0533 0.124 0.077 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 5.35e-01 0.107 0.172 0.085 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 6.57e-02 0.274 0.148 0.085 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 6.04e-02 -0.296 0.157 0.085 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 2.06e-01 -0.199 0.157 0.085 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 6.69e-02 -0.303 0.164 0.085 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 2.94e-02 -0.313 0.142 0.085 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 1.50e-01 0.161 0.111 0.085 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0391 0.148 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00147 0.0743 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 2.71e-01 -0.164 0.149 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.75e-03 0.243 0.0768 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0569 0.123 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0835 0.127 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 1.16e-01 -0.226 0.143 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 5.11e-01 0.0706 0.107 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 8.71e-02 -0.22 0.128 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 4.78e-01 0.105 0.148 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 1.93e-01 -0.202 0.155 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 7.24e-01 0.0543 0.154 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -693480 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00589 0.0862 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 1.73e-01 -0.192 0.14 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 2.92e-02 0.151 0.0688 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 2.62e-01 -0.112 0.0994 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0235 0.122 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 2.31e-01 -0.167 0.139 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 4.76e-01 0.0744 0.104 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0264 0.109 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 48792 sc-eQTL 1.01e-02 0.403 0.155 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0774 0.161 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -409321 sc-eQTL 2.24e-01 -0.178 0.146 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 1.70e-01 0.173 0.126 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.82e-02 0.24 0.101 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 5.60e-01 0.0766 0.131 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 6.49e-01 0.0708 0.155 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 7.82e-01 0.0368 0.133 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 5.08e-01 0.0767 0.116 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 8.96e-01 0.0124 0.0949 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 8.58e-01 0.0255 0.143 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 1.21e-02 0.311 0.123 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 4.60e-01 -0.112 0.151 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0426 0.145 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0719 0.144 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 1.24e-03 0.4 0.122 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 1.61e-01 0.151 0.107 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -331856 sc-eQTL 9.07e-01 0.0159 0.136 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 91317 sc-eQTL 4.58e-06 0.594 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -42695 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0193 0.0908 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 508159 sc-eQTL 7.10e-01 0.052 0.139 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 380492 sc-eQTL 2.04e-01 -0.164 0.129 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -273885 sc-eQTL 5.67e-01 0.06 0.105 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -89316 sc-eQTL 2.82e-01 0.151 0.14 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -331921 sc-eQTL 9.75e-01 0.00513 0.166 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 -693480 eQTL 0.026 0.0813 0.0365 0.0 0.0 0.079
ENSG00000111666 CHPT1 91317 eQTL 4.59e-13 0.309 0.0421 0.0 0.0 0.079

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 IGF1 -693480 3.62e-07 1.83e-07 6.45e-08 2.26e-07 1.02e-07 8.85e-08 2.63e-07 6.2e-08 2.04e-07 1.11e-07 2.07e-07 1.62e-07 3.04e-07 8.54e-08 7.79e-08 1.13e-07 5.42e-08 2.15e-07 7.42e-08 8e-08 1.23e-07 1.9e-07 1.69e-07 4.15e-08 2.74e-07 1.65e-07 1.33e-07 1.54e-07 1.34e-07 1.17e-07 1.27e-07 5.32e-08 4.34e-08 9.72e-08 6.87e-08 3.5e-08 6.04e-08 7.63e-08 5.95e-08 6.55e-08 4.68e-08 1.62e-07 3.4e-08 1.43e-08 3.4e-08 9.86e-09 7.61e-08 2.1e-09 4.83e-08
ENSG00000111666 CHPT1 91317 7.25e-06 9.1e-06 1.35e-06 4.31e-06 2.16e-06 3.41e-06 9.71e-06 1.77e-06 7.74e-06 4.62e-06 1.03e-05 4.76e-06 1.15e-05 3.81e-06 2.12e-06 6.35e-06 3.71e-06 4.99e-06 2.56e-06 2.79e-06 4.51e-06 7.85e-06 6.69e-06 2.8e-06 1.22e-05 2.92e-06 4.74e-06 3.38e-06 7.82e-06 7.58e-06 4.38e-06 8.06e-07 1.1e-06 2.91e-06 3.5e-06 2.04e-06 1.71e-06 1.46e-06 1.64e-06 1.04e-06 9.92e-07 9.44e-06 1.14e-06 1.44e-07 7.72e-07 1.62e-06 1.28e-06 7.34e-07 4.89e-07