logo

Genes within 1Mb (chr12:101784972:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00295 0.0449 0.188 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0231 0.0781 0.188 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0369 0.0474 0.188 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 4.06e-03 0.196 0.0673 0.188 B L1
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 7.20e-01 0.028 0.0781 0.188 B L1
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0756 0.0669 0.188 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0419 0.0536 0.188 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 3.86e-02 0.126 0.0603 0.188 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.0964 0.188 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0611 0.0926 0.188 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 5.45e-01 0.0524 0.0864 0.188 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 3.65e-02 -0.149 0.0706 0.188 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 6.59e-03 -0.26 0.0946 0.188 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.25e-07 0.342 0.0625 0.188 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0265 0.0738 0.188 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0099 0.0722 0.188 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.69e-01 0.0367 0.0505 0.188 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 4.92e-01 0.0613 0.0891 0.188 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 4.55e-03 -0.272 0.0949 0.188 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 3.20e-01 0.0631 0.0633 0.188 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 1.74e-04 -0.296 0.0775 0.188 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0812 0.0882 0.188 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0289 0.0628 0.188 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0481 0.0899 0.188 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 2.00e-01 0.128 0.0995 0.187 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 7.40e-01 0.0304 0.0913 0.187 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 2.02e-02 0.232 0.0991 0.187 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 2.49e-02 0.24 0.106 0.187 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 2.79e-01 -0.121 0.111 0.187 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 9.83e-01 0.00207 0.0959 0.187 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0899 0.0789 0.187 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 8.56e-01 0.019 0.104 0.187 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 5.05e-03 -0.232 0.082 0.188 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 6.98e-01 0.0275 0.0707 0.188 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 9.61e-02 -0.147 0.0881 0.188 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 8.42e-01 0.0197 0.0989 0.188 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 3.86e-01 0.079 0.0909 0.188 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 3.35e-01 0.0772 0.0799 0.188 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 2.42e-02 0.146 0.0645 0.188 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 1.53e-01 -0.128 0.0891 0.187 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 1.01e-03 -0.27 0.081 0.187 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0364 0.0602 0.187 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 5.88e-01 0.0525 0.0968 0.187 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 3.75e-01 0.079 0.0889 0.187 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0898 0.0668 0.187 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 1.19e-02 0.239 0.0941 0.187 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 4.44e-02 0.224 0.111 0.187 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0171 0.0344 0.188 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0445 0.0655 0.188 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 1.86e-01 -0.126 0.0953 0.188 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 2.37e-02 0.156 0.0682 0.188 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0493 0.108 0.188 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0353 0.0786 0.188 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 6.70e-01 0.0298 0.0699 0.188 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00376 0.0838 0.188 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0637 0.0697 0.188 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0385 0.0812 0.188 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 4.18e-01 -0.017 0.021 0.191 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0201 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 4.96e-01 0.0548 0.0804 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 2.91e-02 0.248 0.113 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 1.94e-01 -0.144 0.11 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0915 0.114 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0156 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 1.24e-01 0.168 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0581 0.0897 0.191 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0831 0.0902 0.191 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 8.04e-02 0.148 0.0842 0.191 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0021 0.0448 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 4.81e-01 0.0787 0.111 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 2.70e-01 -0.066 0.0597 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.04e-01 0.144 0.088 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 6.31e-01 0.0473 0.0983 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 9.62e-01 0.00522 0.111 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 9.47e-01 0.0061 0.0915 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 6.91e-02 0.178 0.0974 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 2.29e-01 -0.124 0.103 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0782 0.108 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 3.25e-01 0.102 0.104 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0426 0.041 0.188 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 5.12e-02 -0.211 0.108 0.188 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0627 0.0707 0.188 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 5.44e-01 0.0589 0.0969 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 4.24e-01 0.0852 0.106 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 8.66e-01 0.0179 0.106 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 5.12e-01 0.0622 0.0946 0.188 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 6.95e-01 0.039 0.0993 0.188 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 2.20e-01 -0.125 0.102 0.188 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 3.37e-02 -0.221 0.103 0.188 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 2.17e-01 -0.118 0.0949 0.188 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 3.07e-01 0.0582 0.0568 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 9.25e-01 0.0097 0.103 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0101 0.0536 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 2.02e-01 0.0966 0.0755 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0784 0.0898 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 3.00e-01 -0.104 0.1 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 6.17e-01 -0.038 0.0759 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 1.74e-01 0.112 0.082 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 3.96e-01 -0.095 0.112 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0431 0.109 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 9.19e-01 0.0103 0.102 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 9.61e-01 0.00246 0.0497 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 9.23e-01 0.0098 0.102 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0148 0.0545 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 5.43e-02 0.162 0.0837 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 3.52e-01 0.0911 0.0978 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0296 0.107 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0204 0.0936 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 1.71e-01 0.127 0.0923 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00638 0.0977 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 3.66e-01 0.102 0.112 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 4.34e-01 0.0759 0.0969 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 2.68e-01 -0.12 0.108 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 9.70e-04 -0.355 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 8.08e-02 0.166 0.0946 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.105 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0053 0.111 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 2.32e-01 0.127 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 2.07e-01 -0.104 0.0818 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 8.82e-03 -0.246 0.0932 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.20e-07 0.375 0.0683 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0481 0.0795 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 8.62e-01 0.015 0.0862 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 7.57e-01 0.0187 0.0602 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 3.21e-02 -0.185 0.0855 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 2.56e-03 -0.298 0.0976 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 5.83e-03 0.211 0.0758 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 9.55e-01 0.00542 0.0966 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 1.80e-01 -0.121 0.09 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0319 0.0593 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0965 0.104 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 1.69e-03 -0.311 0.0977 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.59e-01 0.136 0.0958 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 9.65e-01 0.00452 0.104 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0289 0.0984 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 1.18e-01 0.137 0.0876 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 7.92e-02 0.168 0.0952 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 3.15e-02 -0.211 0.0972 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 9.38e-01 0.00609 0.0786 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 2.92e-01 -0.112 0.106 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0624 0.105 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0753 0.0896 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 1.41e-01 -0.164 0.111 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0444 0.0987 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 1.12e-02 -0.247 0.0966 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.76e-03 0.273 0.0861 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0892 0.0935 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0976 0.101 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 3.29e-01 0.0654 0.0669 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 7.19e-01 0.0373 0.103 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0727 0.106 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 2.74e-01 -0.104 0.0952 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.72e-02 0.234 0.0973 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 5.66e-02 -0.205 0.107 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 4.11e-01 0.0871 0.106 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 1.97e-01 -0.122 0.0944 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 9.62e-01 0.00495 0.103 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 5.03e-01 0.0754 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 6.47e-02 -0.196 0.105 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.62e-02 0.272 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 1.07e-01 -0.197 0.121 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0069 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.05e-02 -0.209 0.101 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 3.92e-01 0.0321 0.0374 0.186 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 1.52e-01 -0.15 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0583 0.102 0.186 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 6.31e-04 0.306 0.0882 0.186 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 1.91e-01 -0.142 0.108 0.186 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 2.61e-01 -0.125 0.111 0.186 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.41e-01 -0.071 0.0921 0.186 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 6.95e-03 0.28 0.103 0.186 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 8.67e-02 -0.175 0.102 0.186 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 2.77e-01 0.0985 0.0905 0.186 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00942 0.114 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0925 0.0826 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 3.96e-02 -0.196 0.0947 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 7.96e-01 0.0289 0.112 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 8.53e-02 0.187 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0466 0.0987 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 2.04e-01 0.132 0.103 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 9.89e-01 0.00146 0.11 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 3.71e-01 0.0885 0.0986 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 1.14e-04 -0.367 0.0932 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0406 0.073 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 6.79e-01 0.042 0.101 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 5.41e-01 0.06 0.098 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 2.12e-01 -0.105 0.0837 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 2.63e-02 0.226 0.101 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 4.01e-02 0.235 0.114 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0379 0.104 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 5.72e-02 -0.202 0.106 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0889 0.0856 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0822 0.112 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0764 0.115 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 9.08e-01 0.0123 0.106 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 1.43e-02 0.266 0.108 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 1.50e-01 0.155 0.107 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 4.00e-03 -0.282 0.0969 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 3.46e-02 -0.195 0.0915 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 3.87e-01 0.0608 0.0701 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0138 0.0979 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 8.10e-01 0.0237 0.0985 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0822 0.0774 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 6.15e-01 0.0509 0.101 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 5.86e-01 0.0595 0.109 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 7.40e-02 -0.143 0.0792 0.2 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 4.57e-02 0.215 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 7.19e-01 0.0303 0.0839 0.2 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.97e-01 0.155 0.12 0.2 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0498 0.138 0.2 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 2.21e-01 0.104 0.0846 0.2 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 3.18e-01 0.0982 0.0978 0.2 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00713 0.0997 0.2 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.2 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00571 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 9.46e-01 0.00662 0.0982 0.2 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 7.80e-01 0.0107 0.0382 0.189 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0638 0.0769 0.189 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 1.65e-01 -0.142 0.102 0.189 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 9.82e-01 0.00171 0.0756 0.189 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0921 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0171 0.0816 0.189 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 3.08e-01 0.0904 0.0885 0.189 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0107 0.0761 0.189 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 8.35e-01 0.0147 0.0705 0.189 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0668 0.077 0.189 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 2.03e-01 -0.137 0.107 0.188 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 6.66e-02 -0.205 0.111 0.188 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 3.20e-02 0.209 0.0969 0.188 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0495 0.107 0.188 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 3.65e-01 0.1 0.11 0.188 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 1.73e-01 0.122 0.0892 0.188 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 1.79e-02 0.227 0.0952 0.188 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0133 0.0943 0.188 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 4.67e-02 0.241 0.12 0.188 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 6.07e-02 0.206 0.109 0.188 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0933 0.114 0.188 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.75e-01 0.0768 0.107 0.188 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0436 0.0836 0.188 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0017 0.0954 0.188 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 9.69e-02 -0.158 0.0948 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 5.99e-01 0.0378 0.0719 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 6.73e-02 -0.174 0.0947 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 1.89e-01 -0.141 0.107 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 5.38e-01 0.0593 0.0961 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.45e-01 0.0634 0.0828 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 2.12e-02 0.162 0.0698 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 6.94e-02 -0.187 0.103 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 1.99e-01 0.102 0.0789 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 8.39e-01 0.0196 0.0964 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 2.87e-01 0.12 0.113 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 1.89e-01 0.139 0.106 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 6.56e-01 0.0438 0.0981 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 8.91e-02 0.13 0.0759 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00152 0.132 0.179 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 5.49e-02 -0.237 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 5.19e-01 0.0604 0.0934 0.179 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0768 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 7.53e-01 0.0409 0.129 0.179 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0819 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 8.22e-02 -0.213 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 5.38e-02 0.231 0.119 0.179 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 7.22e-01 0.0393 0.11 0.179 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 2.08e-01 -0.13 0.103 0.184 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0309 0.0945 0.184 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 7.47e-02 -0.197 0.11 0.184 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 8.42e-01 0.0208 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 3.11e-01 -0.109 0.107 0.184 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 3.37e-01 0.0998 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 4.03e-01 0.076 0.0907 0.184 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 8.02e-01 0.0266 0.106 0.181 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00626 0.0981 0.181 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0436 0.117 0.181 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 2.60e-01 0.116 0.102 0.181 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 4.36e-01 0.0769 0.0986 0.181 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0075 0.0949 0.181 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 8.30e-02 0.153 0.0877 0.181 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 7.49e-02 -0.219 0.122 0.181 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 7.94e-01 0.0281 0.107 0.181 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 6.90e-01 0.0453 0.114 0.181 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 5.65e-01 0.0652 0.113 0.181 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0377 0.119 0.181 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 6.03e-01 0.054 0.104 0.181 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0813 0.08 0.181 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 8.02e-01 0.0268 0.107 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0128 0.0522 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 1.69e-01 -0.144 0.104 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0193 0.0551 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 1.07e-01 0.139 0.0861 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 7.19e-01 0.0322 0.0892 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0415 0.101 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 8.40e-01 0.0153 0.0754 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 7.17e-02 0.162 0.0896 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 1.26e-01 -0.159 0.103 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 1.07e-01 -0.175 0.108 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 4.72e-01 0.0777 0.108 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -696772 sc-eQTL 9.92e-01 0.000602 0.06 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 8.43e-01 0.0195 0.0982 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 8.72e-01 0.00785 0.0485 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 4.83e-02 0.137 0.0688 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 9.08e-01 0.00986 0.085 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 1.85e-01 -0.129 0.0966 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0511 0.0726 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 6.58e-02 0.14 0.0755 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 45500 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0656 0.11 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 9.15e-01 0.012 0.112 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -412613 sc-eQTL 6.58e-01 0.0452 0.102 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 2.61e-02 -0.195 0.087 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 3.94e-01 0.0607 0.0711 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 2.30e-01 -0.11 0.0913 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0426 0.108 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 1.95e-01 0.12 0.0923 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 4.88e-01 0.0559 0.0805 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 1.36e-02 0.162 0.0652 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0515 0.1 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0156 0.0877 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0865 0.106 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 2.74e-01 0.112 0.102 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0523 0.101 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 9.52e-01 0.00528 0.088 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 1.88e-01 0.0999 0.0756 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335148 sc-eQTL 1.13e-01 -0.149 0.0938 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 88025 sc-eQTL 1.74e-04 -0.34 0.0891 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -45987 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0299 0.0631 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504867 sc-eQTL 8.25e-01 0.0215 0.0968 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377200 sc-eQTL 7.45e-01 0.0292 0.0898 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277177 sc-eQTL 7.35e-02 -0.13 0.0722 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 sc-eQTL 5.58e-03 0.269 0.0959 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -335213 sc-eQTL 3.65e-02 0.239 0.114 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 88025 eQTL 1.28e-02 -0.0835 0.0335 0.0 0.0 0.162
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 eQTL 2.17e-11 0.125 0.0184 0.0 0.0 0.162
ENSG00000139351 SYCP3 45503 eQTL 0.0308 0.103 0.0476 0.0 0.0 0.162

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -92608 4.89e-06 5.83e-06 6.5e-07 3.36e-06 1.75e-06 1.52e-06 8.17e-06 1.18e-06 4.5e-06 2.86e-06 7.42e-06 3.33e-06 9.47e-06 1.98e-06 9.52e-07 4.06e-06 2.51e-06 3.71e-06 1.58e-06 1.41e-06 2.77e-06 5.66e-06 4.84e-06 1.91e-06 9.03e-06 2.11e-06 2.33e-06 1.67e-06 6.21e-06 6.57e-06 2.93e-06 4.18e-07 7.92e-07 2.16e-06 1.9e-06 1.32e-06 1.03e-06 5e-07 9.13e-07 5.62e-07 6.17e-07 7.76e-06 5.98e-07 1.52e-07 7.7e-07 1.2e-06 1.13e-06 6.9e-07 6.17e-07