logo

Genes within 1Mb (chr12:101784778:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00295 0.0449 0.188 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0231 0.0781 0.188 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0369 0.0474 0.188 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 4.06e-03 0.196 0.0673 0.188 B L1
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 7.20e-01 0.028 0.0781 0.188 B L1
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0756 0.0669 0.188 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0419 0.0536 0.188 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 3.86e-02 0.126 0.0603 0.188 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.0964 0.188 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0611 0.0926 0.188 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 5.45e-01 0.0524 0.0864 0.188 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 3.65e-02 -0.149 0.0706 0.188 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 6.59e-03 -0.26 0.0946 0.188 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.25e-07 0.342 0.0625 0.188 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0265 0.0738 0.188 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0099 0.0722 0.188 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.69e-01 0.0367 0.0505 0.188 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 4.92e-01 0.0613 0.0891 0.188 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 4.55e-03 -0.272 0.0949 0.188 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 3.20e-01 0.0631 0.0633 0.188 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 1.74e-04 -0.296 0.0775 0.188 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0812 0.0882 0.188 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0289 0.0628 0.188 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0481 0.0899 0.188 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 2.00e-01 0.128 0.0995 0.187 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 7.40e-01 0.0304 0.0913 0.187 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 2.02e-02 0.232 0.0991 0.187 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 2.49e-02 0.24 0.106 0.187 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 2.79e-01 -0.121 0.111 0.187 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 9.83e-01 0.00207 0.0959 0.187 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0899 0.0789 0.187 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 8.56e-01 0.019 0.104 0.187 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 5.05e-03 -0.232 0.082 0.188 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 6.98e-01 0.0275 0.0707 0.188 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 9.61e-02 -0.147 0.0881 0.188 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 8.42e-01 0.0197 0.0989 0.188 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 3.86e-01 0.079 0.0909 0.188 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 3.35e-01 0.0772 0.0799 0.188 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 2.42e-02 0.146 0.0645 0.188 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 1.53e-01 -0.128 0.0891 0.187 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 1.01e-03 -0.27 0.081 0.187 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0364 0.0602 0.187 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 5.88e-01 0.0525 0.0968 0.187 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 3.75e-01 0.079 0.0889 0.187 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0898 0.0668 0.187 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 1.19e-02 0.239 0.0941 0.187 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 4.44e-02 0.224 0.111 0.187 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0171 0.0344 0.188 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0445 0.0655 0.188 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 1.86e-01 -0.126 0.0953 0.188 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 2.37e-02 0.156 0.0682 0.188 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0493 0.108 0.188 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0353 0.0786 0.188 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 6.70e-01 0.0298 0.0699 0.188 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00376 0.0838 0.188 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0637 0.0697 0.188 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0385 0.0812 0.188 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 4.18e-01 -0.017 0.021 0.191 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0201 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 4.96e-01 0.0548 0.0804 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 2.91e-02 0.248 0.113 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 1.94e-01 -0.144 0.11 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0915 0.114 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0156 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 1.24e-01 0.168 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0581 0.0897 0.191 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0831 0.0902 0.191 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 8.04e-02 0.148 0.0842 0.191 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0021 0.0448 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 4.81e-01 0.0787 0.111 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 2.70e-01 -0.066 0.0597 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.04e-01 0.144 0.088 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 6.31e-01 0.0473 0.0983 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 9.62e-01 0.00522 0.111 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 9.47e-01 0.0061 0.0915 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 6.91e-02 0.178 0.0974 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 2.29e-01 -0.124 0.103 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0782 0.108 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 3.25e-01 0.102 0.104 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0426 0.041 0.188 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 5.12e-02 -0.211 0.108 0.188 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0627 0.0707 0.188 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 5.44e-01 0.0589 0.0969 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 4.24e-01 0.0852 0.106 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 8.66e-01 0.0179 0.106 0.188 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 5.12e-01 0.0622 0.0946 0.188 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 6.95e-01 0.039 0.0993 0.188 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 2.20e-01 -0.125 0.102 0.188 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 3.37e-02 -0.221 0.103 0.188 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 2.17e-01 -0.118 0.0949 0.188 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 3.07e-01 0.0582 0.0568 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 9.25e-01 0.0097 0.103 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0101 0.0536 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 2.02e-01 0.0966 0.0755 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0784 0.0898 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 3.00e-01 -0.104 0.1 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 6.17e-01 -0.038 0.0759 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 1.74e-01 0.112 0.082 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 3.96e-01 -0.095 0.112 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0431 0.109 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 9.19e-01 0.0103 0.102 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 9.61e-01 0.00246 0.0497 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 9.23e-01 0.0098 0.102 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0148 0.0545 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 5.43e-02 0.162 0.0837 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 3.52e-01 0.0911 0.0978 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0296 0.107 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0204 0.0936 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 1.71e-01 0.127 0.0923 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00638 0.0977 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 3.66e-01 0.102 0.112 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 4.34e-01 0.0759 0.0969 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 2.68e-01 -0.12 0.108 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 9.70e-04 -0.355 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 8.08e-02 0.166 0.0946 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.105 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0053 0.111 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 2.32e-01 0.127 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 2.07e-01 -0.104 0.0818 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 8.82e-03 -0.246 0.0932 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.20e-07 0.375 0.0683 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0481 0.0795 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 8.62e-01 0.015 0.0862 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 7.57e-01 0.0187 0.0602 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 3.21e-02 -0.185 0.0855 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 2.56e-03 -0.298 0.0976 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 5.83e-03 0.211 0.0758 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 9.55e-01 0.00542 0.0966 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 1.80e-01 -0.121 0.09 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0319 0.0593 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0965 0.104 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 1.69e-03 -0.311 0.0977 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.59e-01 0.136 0.0958 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 9.65e-01 0.00452 0.104 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0289 0.0984 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 1.18e-01 0.137 0.0876 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 7.92e-02 0.168 0.0952 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 3.15e-02 -0.211 0.0972 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 9.38e-01 0.00609 0.0786 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 2.92e-01 -0.112 0.106 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0624 0.105 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0753 0.0896 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 1.41e-01 -0.164 0.111 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0444 0.0987 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 1.12e-02 -0.247 0.0966 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.76e-03 0.273 0.0861 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0892 0.0935 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0976 0.101 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 3.29e-01 0.0654 0.0669 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 7.19e-01 0.0373 0.103 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0727 0.106 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 2.74e-01 -0.104 0.0952 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.72e-02 0.234 0.0973 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 5.66e-02 -0.205 0.107 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 4.11e-01 0.0871 0.106 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 1.97e-01 -0.122 0.0944 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 9.62e-01 0.00495 0.103 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 5.03e-01 0.0754 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 6.47e-02 -0.196 0.105 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.62e-02 0.272 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 1.07e-01 -0.197 0.121 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0069 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.05e-02 -0.209 0.101 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 3.92e-01 0.0321 0.0374 0.186 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 1.52e-01 -0.15 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0583 0.102 0.186 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 6.31e-04 0.306 0.0882 0.186 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 1.91e-01 -0.142 0.108 0.186 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 2.61e-01 -0.125 0.111 0.186 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.41e-01 -0.071 0.0921 0.186 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 6.95e-03 0.28 0.103 0.186 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 8.67e-02 -0.175 0.102 0.186 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 2.77e-01 0.0985 0.0905 0.186 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00942 0.114 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0925 0.0826 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 3.96e-02 -0.196 0.0947 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 7.96e-01 0.0289 0.112 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 8.53e-02 0.187 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0466 0.0987 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 2.04e-01 0.132 0.103 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 9.89e-01 0.00146 0.11 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 3.71e-01 0.0885 0.0986 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 1.14e-04 -0.367 0.0932 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0406 0.073 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 6.79e-01 0.042 0.101 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 5.41e-01 0.06 0.098 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 2.12e-01 -0.105 0.0837 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 2.63e-02 0.226 0.101 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 4.01e-02 0.235 0.114 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0379 0.104 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 5.72e-02 -0.202 0.106 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0889 0.0856 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0822 0.112 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0764 0.115 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 9.08e-01 0.0123 0.106 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 1.43e-02 0.266 0.108 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 1.50e-01 0.155 0.107 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 4.00e-03 -0.282 0.0969 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 3.46e-02 -0.195 0.0915 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 3.87e-01 0.0608 0.0701 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0138 0.0979 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 8.10e-01 0.0237 0.0985 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0822 0.0774 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 6.15e-01 0.0509 0.101 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 5.86e-01 0.0595 0.109 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 7.40e-02 -0.143 0.0792 0.2 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 4.57e-02 0.215 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 7.19e-01 0.0303 0.0839 0.2 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.97e-01 0.155 0.12 0.2 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0498 0.138 0.2 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 2.21e-01 0.104 0.0846 0.2 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 3.18e-01 0.0982 0.0978 0.2 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00713 0.0997 0.2 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.2 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00571 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 9.46e-01 0.00662 0.0982 0.2 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 7.80e-01 0.0107 0.0382 0.189 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0638 0.0769 0.189 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 1.65e-01 -0.142 0.102 0.189 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 9.82e-01 0.00171 0.0756 0.189 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0921 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0171 0.0816 0.189 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 3.08e-01 0.0904 0.0885 0.189 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0107 0.0761 0.189 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 8.35e-01 0.0147 0.0705 0.189 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0668 0.077 0.189 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 2.03e-01 -0.137 0.107 0.188 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 6.66e-02 -0.205 0.111 0.188 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 3.20e-02 0.209 0.0969 0.188 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0495 0.107 0.188 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 3.65e-01 0.1 0.11 0.188 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 1.73e-01 0.122 0.0892 0.188 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 1.79e-02 0.227 0.0952 0.188 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0133 0.0943 0.188 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 4.67e-02 0.241 0.12 0.188 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 6.07e-02 0.206 0.109 0.188 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0933 0.114 0.188 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.75e-01 0.0768 0.107 0.188 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0436 0.0836 0.188 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0017 0.0954 0.188 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 9.69e-02 -0.158 0.0948 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 5.99e-01 0.0378 0.0719 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 6.73e-02 -0.174 0.0947 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 1.89e-01 -0.141 0.107 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 5.38e-01 0.0593 0.0961 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.45e-01 0.0634 0.0828 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 2.12e-02 0.162 0.0698 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 6.94e-02 -0.187 0.103 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 1.99e-01 0.102 0.0789 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 8.39e-01 0.0196 0.0964 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 2.87e-01 0.12 0.113 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 1.89e-01 0.139 0.106 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 6.56e-01 0.0438 0.0981 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 8.91e-02 0.13 0.0759 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00152 0.132 0.179 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 5.49e-02 -0.237 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 5.19e-01 0.0604 0.0934 0.179 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0768 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 7.53e-01 0.0409 0.129 0.179 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0819 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 8.22e-02 -0.213 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 5.38e-02 0.231 0.119 0.179 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 7.22e-01 0.0393 0.11 0.179 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 2.08e-01 -0.13 0.103 0.184 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0309 0.0945 0.184 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 7.47e-02 -0.197 0.11 0.184 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 8.42e-01 0.0208 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 3.11e-01 -0.109 0.107 0.184 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 3.37e-01 0.0998 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 4.03e-01 0.076 0.0907 0.184 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 8.02e-01 0.0266 0.106 0.181 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00626 0.0981 0.181 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0436 0.117 0.181 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 2.60e-01 0.116 0.102 0.181 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 4.36e-01 0.0769 0.0986 0.181 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0075 0.0949 0.181 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 8.30e-02 0.153 0.0877 0.181 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 7.49e-02 -0.219 0.122 0.181 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 7.94e-01 0.0281 0.107 0.181 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 6.90e-01 0.0453 0.114 0.181 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 5.65e-01 0.0652 0.113 0.181 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0377 0.119 0.181 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 6.03e-01 0.054 0.104 0.181 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0813 0.08 0.181 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 8.02e-01 0.0268 0.107 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0128 0.0522 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 1.69e-01 -0.144 0.104 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0193 0.0551 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 1.07e-01 0.139 0.0861 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 7.19e-01 0.0322 0.0892 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0415 0.101 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 8.40e-01 0.0153 0.0754 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 7.17e-02 0.162 0.0896 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 1.26e-01 -0.159 0.103 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 1.07e-01 -0.175 0.108 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 4.72e-01 0.0777 0.108 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -696966 sc-eQTL 9.92e-01 0.000602 0.06 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 8.43e-01 0.0195 0.0982 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 8.72e-01 0.00785 0.0485 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 4.83e-02 0.137 0.0688 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 9.08e-01 0.00986 0.085 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 1.85e-01 -0.129 0.0966 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0511 0.0726 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 6.58e-02 0.14 0.0755 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 45306 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0656 0.11 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 9.15e-01 0.012 0.112 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -412807 sc-eQTL 6.58e-01 0.0452 0.102 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 2.61e-02 -0.195 0.087 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 3.94e-01 0.0607 0.0711 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 2.30e-01 -0.11 0.0913 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0426 0.108 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 1.95e-01 0.12 0.0923 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 4.88e-01 0.0559 0.0805 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 1.36e-02 0.162 0.0652 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0515 0.1 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0156 0.0877 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0865 0.106 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 2.74e-01 0.112 0.102 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0523 0.101 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 9.52e-01 0.00528 0.088 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 1.88e-01 0.0999 0.0756 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -335342 sc-eQTL 1.13e-01 -0.149 0.0938 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 87831 sc-eQTL 1.74e-04 -0.34 0.0891 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -46181 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0299 0.0631 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 504673 sc-eQTL 8.25e-01 0.0215 0.0968 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 377006 sc-eQTL 7.45e-01 0.0292 0.0898 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -277371 sc-eQTL 7.35e-02 -0.13 0.0722 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 sc-eQTL 5.58e-03 0.269 0.0959 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -335407 sc-eQTL 3.65e-02 0.239 0.114 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 87831 eQTL 1.28e-02 -0.0835 0.0335 0.0 0.0 0.162
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 eQTL 2.17e-11 0.125 0.0184 0.0 0.0 0.162
ENSG00000139351 SYCP3 45309 eQTL 0.0308 0.103 0.0476 0.0 0.0 0.162

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -92802 1.26e-05 1.4e-05 2.45e-06 9.8e-06 2.85e-06 4.2e-06 2.42e-05 2.18e-06 1.07e-05 5.43e-06 1.75e-05 5.76e-06 2.24e-05 4.51e-06 4.18e-06 8.06e-06 5.34e-06 1.16e-05 3.78e-06 3.86e-06 7.26e-06 1.28e-05 1.77e-05 5.06e-06 1.73e-05 4.42e-06 6.66e-06 6.3e-06 1.58e-05 9.87e-06 7.63e-06 1.42e-06 1.23e-06 3.64e-06 5.33e-06 3.78e-06 1.79e-06 2.16e-06 1.99e-06 1.01e-06 1.01e-06 1.43e-05 2.34e-06 2.52e-07 1.6e-06 2.47e-06 1.82e-06 7.48e-07 5.7e-07