Genes within 1Mb (chr12:101768742:ACTC:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0166 0.0447 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0251 0.0778 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0486 0.0472 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.46e-03 0.216 0.0668 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 7.50e-01 0.0249 0.0778 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0544 0.0668 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0339 0.0535 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 2.37e-02 0.137 0.06 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 1.01e-01 -0.158 0.0959 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0221 0.0924 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 4.65e-01 0.063 0.0861 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 3.72e-02 -0.147 0.07 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 8.91e-04 -0.314 0.093 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 3.93e-07 0.326 0.0623 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0232 0.0732 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0114 0.0716 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 4.13e-01 0.0411 0.0501 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 5.47e-01 0.0534 0.0886 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 7.09e-04 -0.321 0.0935 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 2.97e-01 0.0657 0.0629 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 3.15e-04 -0.283 0.0772 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0697 0.0877 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0211 0.0624 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00788 0.0894 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 2.30e-01 0.119 0.0986 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 9.65e-01 -0.004 0.0905 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.04e-02 0.253 0.0979 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 1.01e-02 0.273 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 2.19e-01 -0.136 0.11 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 7.37e-01 0.032 0.095 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 1.49e-01 -0.113 0.078 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 7.65e-01 0.0309 0.103 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 9.14e-03 -0.214 0.0814 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 6.90e-01 0.028 0.07 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0967 0.0876 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 7.53e-01 0.0308 0.098 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 3.70e-01 0.0808 0.09 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 2.74e-01 0.0867 0.0791 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 1.44e-02 0.157 0.0638 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0985 0.0884 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 1.13e-04 -0.312 0.0794 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 6.38e-01 0.0281 0.0596 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 9.63e-01 0.00451 0.0959 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 2.91e-01 0.093 0.088 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0925 0.0662 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 8.91e-03 0.246 0.0931 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 1.32e-01 0.167 0.11 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00212 0.0341 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0345 0.065 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 3.40e-02 -0.2 0.094 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.09e-02 0.173 0.0675 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 1.85e-01 -0.142 0.107 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0431 0.078 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 4.40e-01 0.0535 0.0692 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 8.02e-01 0.0209 0.0831 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0457 0.0692 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0527 0.0805 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0209 0.0209 0.204 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0369 0.109 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 4.53e-01 0.0604 0.0803 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 5.27e-02 0.221 0.113 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 3.15e-01 -0.111 0.11 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0825 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 9.28e-01 0.00991 0.109 0.204 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 6.44e-02 0.201 0.108 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0303 0.0897 0.204 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0914 0.09 0.204 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 7.48e-02 0.151 0.0841 0.204 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0132 0.0444 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 5.20e-01 0.0713 0.111 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0789 0.0592 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 8.12e-02 0.153 0.0872 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 7.66e-01 0.0291 0.0976 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 9.30e-01 0.00967 0.11 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 7.06e-01 0.0343 0.0907 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 6.92e-02 0.176 0.0966 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 1.45e-01 -0.149 0.102 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000183 0.107 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 2.32e-01 0.123 0.103 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0536 0.0408 0.198 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 8.65e-02 -0.185 0.107 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0615 0.0704 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 3.66e-01 0.0873 0.0964 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 4.42e-01 0.0815 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 9.29e-01 0.00937 0.105 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 5.75e-01 0.053 0.0943 0.198 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00151 0.0989 0.198 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0929 0.102 0.198 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 9.19e-02 -0.175 0.103 0.198 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 2.42e-01 -0.111 0.0945 0.198 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 4.34e-01 0.044 0.0561 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00371 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0189 0.0529 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.18e-01 0.117 0.0744 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0682 0.0887 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0816 0.099 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0602 0.0749 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 2.57e-01 0.0921 0.0811 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0832 0.11 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0436 0.107 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 9.53e-01 0.00592 0.101 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00811 0.0492 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0115 0.101 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0435 0.0539 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 3.18e-02 0.179 0.0828 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 5.12e-01 0.0637 0.097 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 8.73e-01 0.0171 0.107 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 9.93e-01 0.000842 0.0928 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 5.49e-02 0.176 0.0911 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0233 0.0968 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 4.01e-01 0.0938 0.111 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 2.88e-01 0.102 0.096 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 3.31e-01 -0.105 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 4.42e-04 -0.375 0.105 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 6.79e-02 0.172 0.0938 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0096 0.104 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0254 0.11 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 1.77e-01 0.143 0.105 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 1.43e-01 -0.119 0.0812 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 1.07e-03 -0.304 0.0917 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 5.95e-07 0.352 0.0684 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0345 0.079 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 9.00e-01 0.0107 0.0856 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 7.56e-01 0.0186 0.0598 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 8.66e-02 -0.147 0.0851 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 4.31e-04 -0.343 0.096 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.44e-02 0.186 0.0755 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 7.75e-01 0.0274 0.0957 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 2.04e-01 -0.114 0.0893 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0339 0.0588 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0557 0.103 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 3.33e-04 -0.349 0.0958 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 9.66e-02 0.158 0.0945 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0226 0.103 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 5.93e-01 -0.052 0.0971 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 8.30e-02 0.151 0.0864 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 8.11e-02 0.165 0.0943 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 9.25e-03 -0.252 0.0959 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 7.95e-01 0.0203 0.0779 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0918 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0591 0.104 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0943 0.0887 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 1.54e-01 -0.157 0.11 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0462 0.0978 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 1.26e-03 -0.31 0.0948 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 2.49e-03 0.262 0.0854 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0822 0.0927 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0752 0.101 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 1.66e-01 0.0919 0.0661 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 4.53e-01 0.077 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0729 0.105 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 1.79e-01 -0.127 0.0939 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 5.13e-02 0.19 0.0967 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 1.71e-02 -0.252 0.105 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 4.55e-01 0.0782 0.104 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 1.38e-01 -0.139 0.0931 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 6.51e-01 0.0462 0.102 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 4.53e-01 0.0826 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 6.42e-02 -0.192 0.103 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.90e-02 0.26 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 2.55e-01 -0.136 0.119 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0165 0.114 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 6.60e-02 -0.183 0.0991 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0775 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 1.08e-01 0.0596 0.0369 0.197 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 2.79e-01 -0.113 0.104 0.197 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 2.52e-01 -0.116 0.101 0.197 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 7.44e-04 0.3 0.0875 0.197 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 3.20e-02 -0.23 0.107 0.197 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 2.63e-01 -0.123 0.11 0.197 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0938 0.0912 0.197 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 9.81e-03 0.266 0.102 0.197 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 1.61e-01 -0.142 0.101 0.197 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 4.33e-01 0.0706 0.0898 0.197 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0134 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 1.40e-01 -0.121 0.0817 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.30e-01 -0.144 0.0944 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00305 0.111 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 1.92e-01 0.141 0.108 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0753 0.0978 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 6.38e-02 0.19 0.102 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0132 0.109 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 3.57e-01 0.0899 0.0974 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 2.93e-05 -0.391 0.0914 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 8.11e-01 0.0173 0.0721 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 9.13e-01 -0.011 0.1 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 2.89e-01 0.103 0.0966 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 1.91e-01 -0.108 0.0826 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 1.75e-02 0.238 0.0994 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 9.12e-02 0.191 0.113 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0659 0.104 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 2.54e-02 -0.237 0.105 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 7.62e-01 -0.026 0.0857 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 5.04e-01 -0.075 0.112 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 3.12e-01 -0.116 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 7.24e-01 0.0376 0.106 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 9.78e-03 0.28 0.108 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 2.22e-01 0.131 0.107 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 2.82e-02 -0.215 0.0971 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 9.82e-03 -0.236 0.0904 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.48e-01 0.101 0.0694 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0555 0.0972 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 7.76e-01 0.0278 0.0979 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0707 0.077 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 7.97e-01 0.0258 0.1 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 9.79e-01 0.00286 0.108 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 6.00e-02 -0.151 0.0797 0.215 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 3.43e-02 0.229 0.107 0.215 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 7.92e-01 0.0224 0.0845 0.215 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 2.29e-01 0.146 0.121 0.215 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0267 0.14 0.215 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 3.29e-01 0.0837 0.0854 0.215 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 3.13e-01 0.0999 0.0985 0.215 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 9.52e-01 0.00603 0.1 0.215 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0403 0.117 0.215 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 8.09e-01 0.0258 0.107 0.215 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 8.17e-01 0.0229 0.0989 0.215 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 6.22e-01 0.0187 0.0378 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0771 0.0761 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 8.57e-02 -0.173 0.1 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00304 0.0748 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 2.32e-01 -0.128 0.107 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0194 0.0808 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 2.49e-01 0.101 0.0876 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 7.83e-01 0.0208 0.0753 0.2 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 8.42e-01 0.0139 0.0698 0.2 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0767 0.0762 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 1.81e-01 -0.143 0.107 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 9.21e-03 -0.288 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 4.32e-02 0.196 0.0964 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0527 0.106 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 1.15e-01 0.173 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 9.69e-02 0.148 0.0885 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 1.60e-02 0.23 0.0945 0.2 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0299 0.0936 0.2 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.61e-02 0.289 0.119 0.2 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 3.12e-02 0.235 0.108 0.2 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0981 0.113 0.2 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 2.61e-01 0.12 0.106 0.2 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0628 0.083 0.2 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0103 0.0948 0.2 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 1.22e-01 -0.146 0.094 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 6.06e-01 0.0367 0.0712 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.69e-01 -0.13 0.0941 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 2.84e-01 -0.114 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 5.07e-01 0.0633 0.0952 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 3.94e-01 0.07 0.082 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 1.24e-02 0.174 0.069 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 9.56e-02 -0.17 0.102 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 2.29e-01 0.0943 0.0781 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 6.47e-01 0.0437 0.0953 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 3.73e-01 0.0994 0.111 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.105 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 3.89e-01 0.0836 0.0969 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 7.36e-02 0.135 0.0751 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 8.25e-01 0.0292 0.132 0.191 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 4.38e-02 -0.248 0.122 0.191 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 4.93e-01 0.0639 0.093 0.191 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0608 0.123 0.191 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 8.01e-01 0.0325 0.129 0.191 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0699 0.12 0.191 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 7.98e-02 -0.213 0.121 0.191 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 9.12e-02 0.202 0.119 0.191 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 9.35e-01 0.00903 0.11 0.191 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 1.82e-01 -0.136 0.102 0.196 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 8.66e-01 0.0158 0.0936 0.196 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.29e-01 -0.167 0.109 0.196 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 9.78e-01 0.0029 0.103 0.196 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0844 0.106 0.196 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 2.76e-01 0.112 0.103 0.196 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 3.45e-01 0.0849 0.0898 0.196 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 6.16e-01 0.0529 0.105 0.192 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0225 0.0974 0.192 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00345 0.117 0.192 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 1.41e-01 0.15 0.101 0.192 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 2.82e-01 0.105 0.0977 0.192 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0397 0.0942 0.192 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 4.09e-02 0.179 0.0868 0.192 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 3.68e-02 -0.253 0.12 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 7.06e-01 -0.04 0.106 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 6.84e-01 0.0456 0.112 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 5.52e-01 0.0664 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0306 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 5.68e-01 0.0585 0.102 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0848 0.0789 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 5.94e-01 0.0562 0.105 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0278 0.0519 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 2.60e-01 -0.118 0.104 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0254 0.0549 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 8.67e-02 0.147 0.0857 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 6.62e-01 0.0389 0.0888 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0364 0.1 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 6.06e-01 0.0388 0.075 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 6.64e-02 0.164 0.0891 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 1.44e-01 -0.151 0.103 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 2.80e-01 -0.117 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 3.11e-01 0.109 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -713002 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0163 0.0594 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00795 0.0973 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 8.46e-01 -0.00935 0.048 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 1.88e-02 0.161 0.0679 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 9.87e-01 0.00133 0.0842 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0909 0.0958 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0587 0.0718 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 4.95e-02 0.148 0.0747 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 29270 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0688 0.109 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 9.36e-01 0.00886 0.111 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -428843 sc-eQTL 5.88e-01 0.0546 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 4.05e-02 -0.178 0.0863 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 4.28e-01 0.0559 0.0704 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0629 0.0907 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0335 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 2.48e-01 0.106 0.0915 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 3.36e-01 0.0769 0.0797 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 7.04e-03 0.175 0.0644 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0297 0.0998 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 9.86e-01 0.00158 0.0872 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0565 0.105 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 2.14e-01 0.126 0.101 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0117 0.101 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00654 0.0875 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 1.29e-01 0.115 0.0751 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -351378 sc-eQTL 2.19e-01 -0.115 0.0931 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 71795 sc-eQTL 2.08e-05 -0.38 0.0873 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -62217 sc-eQTL 6.15e-01 0.0315 0.0624 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 488637 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0259 0.0958 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 360970 sc-eQTL 5.62e-01 0.0516 0.0888 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -293407 sc-eQTL 9.54e-02 -0.12 0.0715 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 sc-eQTL 5.38e-03 0.267 0.0949 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -351443 sc-eQTL 1.02e-01 0.186 0.113 0.196 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 71795 eQTL 1.78e-02 -0.0786 0.0331 0.0 0.0 0.169
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 eQTL 8.58e-14 0.137 0.0181 0.0 0.0 0.169


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -108838 4.47e-05 2.7e-05 5.66e-06 7.07e-06 2.4e-06 5.6e-06 2.5e-05 1.05e-06 1.24e-05 5.47e-06 1.58e-05 6.41e-06 2.57e-05 4.55e-06 4.13e-06 6.93e-06 7.73e-06 1.07e-05 3.31e-06 2.01e-06 5.1e-06 1.3e-05 2.05e-05 3.36e-06 2.59e-05 5.12e-06 4.92e-06 2.5e-06 1.67e-05 1.05e-05 7.97e-06 4.56e-07 7.94e-07 2.99e-06 4.62e-06 2.84e-06 1.85e-06 1.3e-06 1.63e-06 6.18e-07 4.48e-07 2.55e-05 2.63e-06 1.64e-07 7.05e-07 1.81e-06 1.82e-06 7.23e-07 4.39e-07